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广州市公共场所中央空调冷却塔水中军团菌mip基因分型
被引量:
1
1
作者
巩向丽
张颖
+1 位作者
屈平华
陈守义
《微生物学通报》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第3期326-333,共8页
【目的】研究广州市公共场所中央空调冷却塔水中军团菌的基因特征和优势型别。【方法】采用军团菌巨噬细胞感染力增强因子(Macrophage infectivity potentiator,mip)基因分型方法。提取广州市2008-2010年分离的140株(119株嗜肺,21株非嗜...
【目的】研究广州市公共场所中央空调冷却塔水中军团菌的基因特征和优势型别。【方法】采用军团菌巨噬细胞感染力增强因子(Macrophage infectivity potentiator,mip)基因分型方法。提取广州市2008-2010年分离的140株(119株嗜肺,21株非嗜肺)军团菌基因组DNA,针对mip基因进行PCR扩增并测序,将核苷酸序列上传至欧洲军团菌感染工作组(EWGLI)数据库进行比对,得到mip型别,并构建系统发育进化树。【结果】140株军团菌均可扩增出700 bp左右的目的条带。119株嗜肺军团菌分为10个mip型别,L.pneumophila-phil-1为优势型别,占52.9%(63/119);21株非嗜肺军团菌分为6个mip型别,L.feeleii-D3131为优势型别,占47.6%(10/21)。【结论】广州市公共场所中央空调冷却塔水中军团菌具有多样性,mip分型技术可用于军团菌的快速基因分型。
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关键词
军团菌
分子
分型
mip基因分型
原文传递
三种分子分型技术在嗜肺军团菌分型中的应用与评价
2
作者
张颖
巩向丽
+5 位作者
张健
屈平华
庞杏林
陈守义
傅松哲
王鸣
《中国预防医学杂志》
CAS
2012年第7期515-519,共5页
目的对脉冲场凝胶电泳方法 (PFGE)、基因序列分型(SBT)和mip基因分型方法在嗜肺军团菌分型研究中的分辨力和潜在价值进行比较和论述。方法采用PFGE、SBT和mip基因分型方法对29株嗜肺军团菌和1株标准菌株ATCC33153进行分型比较。结果 PFG...
目的对脉冲场凝胶电泳方法 (PFGE)、基因序列分型(SBT)和mip基因分型方法在嗜肺军团菌分型研究中的分辨力和潜在价值进行比较和论述。方法采用PFGE、SBT和mip基因分型方法对29株嗜肺军团菌和1株标准菌株ATCC33153进行分型比较。结果 PFGE可将30株嗜肺军团菌分为5大类群,19个PFGE型,分辨力为0.9586;SBT可分为22个ST型,分辨力为0.9609;mip基因分型可分为9个型别,分辨力为0.8344。血清型LP1和LP14菌株具有相同的PFGE和mip基因型别,相同或相近的SBT型别。结论 SBT较PFGE具有稍高的分辨力,适用于全球数据库比对和进化亲缘关系的研究,结合PFGE和SBT分型方法有利于流行病学溯源分析。
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关键词
嗜肺军团菌
脉冲场凝胶电泳
基因
序列
分型
mip基因分型
原文传递
题名
广州市公共场所中央空调冷却塔水中军团菌mip基因分型
被引量:
1
1
作者
巩向丽
张颖
屈平华
陈守义
机构
广州市疾病预防控制中心
中山大学
广东省中医院
出处
《微生物学通报》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第3期326-333,共8页
基金
广州市科技与信息化局科技攻关项目(No.2010J-E391)
广州市医药卫生科技项目(No.201102A213249)
文摘
【目的】研究广州市公共场所中央空调冷却塔水中军团菌的基因特征和优势型别。【方法】采用军团菌巨噬细胞感染力增强因子(Macrophage infectivity potentiator,mip)基因分型方法。提取广州市2008-2010年分离的140株(119株嗜肺,21株非嗜肺)军团菌基因组DNA,针对mip基因进行PCR扩增并测序,将核苷酸序列上传至欧洲军团菌感染工作组(EWGLI)数据库进行比对,得到mip型别,并构建系统发育进化树。【结果】140株军团菌均可扩增出700 bp左右的目的条带。119株嗜肺军团菌分为10个mip型别,L.pneumophila-phil-1为优势型别,占52.9%(63/119);21株非嗜肺军团菌分为6个mip型别,L.feeleii-D3131为优势型别,占47.6%(10/21)。【结论】广州市公共场所中央空调冷却塔水中军团菌具有多样性,mip分型技术可用于军团菌的快速基因分型。
关键词
军团菌
分子
分型
mip基因分型
Keywords
Legionella, Molecular typing,
mip
genotyping
分类号
R378 [医药卫生—病原生物学]
原文传递
题名
三种分子分型技术在嗜肺军团菌分型中的应用与评价
2
作者
张颖
巩向丽
张健
屈平华
庞杏林
陈守义
傅松哲
王鸣
机构
广州市疾病预防控制中心
中山大学中山医学院
广东省中医院医院
南昌市疾病预防控制中心
出处
《中国预防医学杂志》
CAS
2012年第7期515-519,共5页
基金
广州市医药卫生科技项目(201102A213249)
广州市科技与信息化局科技攻关项目(2010J-E391)
文摘
目的对脉冲场凝胶电泳方法 (PFGE)、基因序列分型(SBT)和mip基因分型方法在嗜肺军团菌分型研究中的分辨力和潜在价值进行比较和论述。方法采用PFGE、SBT和mip基因分型方法对29株嗜肺军团菌和1株标准菌株ATCC33153进行分型比较。结果 PFGE可将30株嗜肺军团菌分为5大类群,19个PFGE型,分辨力为0.9586;SBT可分为22个ST型,分辨力为0.9609;mip基因分型可分为9个型别,分辨力为0.8344。血清型LP1和LP14菌株具有相同的PFGE和mip基因型别,相同或相近的SBT型别。结论 SBT较PFGE具有稍高的分辨力,适用于全球数据库比对和进化亲缘关系的研究,结合PFGE和SBT分型方法有利于流行病学溯源分析。
关键词
嗜肺军团菌
脉冲场凝胶电泳
基因
序列
分型
mip基因分型
Keywords
Legionella pneumophila
Pulsed-field gel electrophoresis
Sequence-based typing
mip
similarity
分类号
R378 [医药卫生—病原生物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
广州市公共场所中央空调冷却塔水中军团菌mip基因分型
巩向丽
张颖
屈平华
陈守义
《微生物学通报》
CAS
CSCD
北大核心
2012
1
原文传递
2
三种分子分型技术在嗜肺军团菌分型中的应用与评价
张颖
巩向丽
张健
屈平华
庞杏林
陈守义
傅松哲
王鸣
《中国预防医学杂志》
CAS
2012
0
原文传递
已选择
0
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参考文献
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