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Transcriptional Regulation of 10 Mitochondrial Genes in Different Tissues of NCa CMS System in Brassica napus L. and Their Relationship with Sterility 被引量:3
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作者 危文亮 王汉中 刘贵华 《Journal of Genetics and Genomics》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2007年第1期72-80,共9页
Northern blot analysis was conducted with mitochondrial RNA from seedling leaves, floral buds, and developing seeds of NCa CMS, maintainer line and fertile F1 using ten mitochondrial genes as probes. The results revea... Northern blot analysis was conducted with mitochondrial RNA from seedling leaves, floral buds, and developing seeds of NCa CMS, maintainer line and fertile F1 using ten mitochondrial genes as probes. The results revealed that 9 out of the 10 mitochondrial genes, except for atp6, showed no difference in different tissues of the corresponding materials of NCα CMS system and that they might be constitutively expressed genes. Eight genes, such as orf139, orf222, atpl, cox1, cox2, cob, rm5S, and rm26S, showed no difference among the three tissues of all the materials detected. So the expression of these eight genes was not regulated by nuclear genes and was not tissue-specific. The transcripts of atp9 were identical among different tissues, but diverse among different materials, indicating that transcription of atp9 was neither controlled by nuclear gene nor tissue-specific. Gene atp6 displayed similar transcripts with the same size among different tissues of all the materials but differed in abundance among tissues of corresponding materials and its expression might be tissue-specific under regulation of nuclear gene. Moreover, three transcripts of orf222 were detected in the floral buds of NCa cms and fertile F1, but no transcript was detected in floral buds of the maintainer line.The transcription of orf139 was similar to that of orf222 but only two transcripts of 0.8 kb and 0.6 kb were produced. The atp9 probe detected a single transcript of 0.6 kb in NCa cms and in maintainer line and an additional transcript of 1.2 kb in fertile F1. The relationship of expression of orf222, orf139, and atp9 with NCa sterility was discussed. 展开更多
关键词 Brassica napus L. cytoplasmic male sterility (CMS) mitochondrial gene expression restorer gene transcriptional regulation
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组蛋白变体H2A.Z的转录调控功能与动态作用机制
2
作者 孙朝冉 吴旭东 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期279-289,共11页
H2A.Z是组蛋白H2A常见的组蛋白变体。近年来,人们通过多学科手段探究了H2A.Z对于基因转录的激活或抑制作用。本文在概述组蛋白变体和H2A.Z发展史的基础上,重点阐述了H2A.Z不同亚型、不同翻译后修饰和基因组分布在转录调控过程中的作用,... H2A.Z是组蛋白H2A常见的组蛋白变体。近年来,人们通过多学科手段探究了H2A.Z对于基因转录的激活或抑制作用。本文在概述组蛋白变体和H2A.Z发展史的基础上,重点阐述了H2A.Z不同亚型、不同翻译后修饰和基因组分布在转录调控过程中的作用,明确了其生物学意义和在肿瘤发生发展、神经系统分化发育过程中的病理生理学意义,并总结了H2A.Z在染色质沉积或者移除的动态调控机制方面的研究进展,以期为深入了解组蛋白变体的多样性,并为寻找相关疾病诊疗的新靶点提供参考。 展开更多
关键词 表观遗传调控 核小体 基因转录 组蛋白变体 H2A.Z
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非编码长链RNA与基因表达调控 被引量:17
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作者 史华俊 刘忠 郭俊明 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第9期781-787,共7页
近年来,在小鼠全长cDNA文库大规模测序中发现一类新的转录物——非编码长链RNA(long noncoding RNA,lncRNA),引起了科学界的关注.lncRNA长度大于200个核苷酸,无蛋白质编码功能,在真核细胞基因组中被普遍转录.lncRNA种类繁多,数量庞大,... 近年来,在小鼠全长cDNA文库大规模测序中发现一类新的转录物——非编码长链RNA(long noncoding RNA,lncRNA),引起了科学界的关注.lncRNA长度大于200个核苷酸,无蛋白质编码功能,在真核细胞基因组中被普遍转录.lncRNA种类繁多,数量庞大,占哺乳动物基因组转录物的绝大部分.相对于研究较多的非编码小RNA,lncRNA的功能目前尚不完全清楚.但越来越多的研究发现,lncRNA在多个水平调控基因的表达,在胚胎发育、物种进化、细胞分化和某些疾病如神经退行性疾病及肿瘤的发生过程中起着重要作用.本文在简要介绍lncRNA基本概念的基础上,结合当前研究成果,就lncRNA在转录水平、转录后水平和表观遗传水平调控基因表达的机制作一综述. 展开更多
关键词 非编码长链RNA 基因表达调控 转录调控 转录后调控 表观遗传学
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KAP-1:转录调控中的一个桥梁分子 被引量:9
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作者 杨冬 姜颖 贺福初 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2007年第2期131-136,共6页
KAP-1(又称TIF1β,TRIM28等)是一种转录中介因子,在诸多转录调控复合体中起桥梁作用。它通过其N端RBCC结构域与含KRAB结构域的锌指蛋白、MDM2、MM1、C/EBPβ等相互作用;通过C端的PHD及BrD结构域与SETDB1、Mi-2α等分子相互作用,参与形... KAP-1(又称TIF1β,TRIM28等)是一种转录中介因子,在诸多转录调控复合体中起桥梁作用。它通过其N端RBCC结构域与含KRAB结构域的锌指蛋白、MDM2、MM1、C/EBPβ等相互作用;通过C端的PHD及BrD结构域与SETDB1、Mi-2α等分子相互作用,参与形成具有组蛋白甲基化酶或组蛋白去乙酰化酶活性的复合体;通过中间的HP1BD区域与HP1蛋白相互作用,进而与组蛋白相结合。大量研究表明,KAP-1作为一个桥梁分子,主要以共抑制因子形式参与转录抑制复合体的形成,在某些复合体中也可作为共激活因子发挥作用。KAP-1参与形成的复合体在精细胞发育、胚胎早期发育等生理过程中发挥重要的调控作用,这种调控属于表观遗传调控范畴。 展开更多
关键词 KAP-1 转录中介因子 基因表达调控 表观遗传学
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组蛋白甲基化修饰效应分子的研究进展 被引量:19
5
作者 宋博研 朱卫国 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2011年第4期285-292,共8页
作为一种重要的表观遗传学调控机制,组蛋白甲基化修饰在多种生命过程中发挥了重要的作用。细胞内有多种组蛋白甲基化酶和去甲基化酶共同调节组蛋白的修饰状态,在组蛋白甲基化状态确定后,多种效应分子特异的读取修饰信息,从而参与基因转... 作为一种重要的表观遗传学调控机制,组蛋白甲基化修饰在多种生命过程中发挥了重要的作用。细胞内有多种组蛋白甲基化酶和去甲基化酶共同调节组蛋白的修饰状态,在组蛋白甲基化状态确定后,多种效应分子特异的读取修饰信息,从而参与基因转录调控过程。文章从组蛋白甲基化效应分子的作用机制方面综述了这一领域的研究进展。 展开更多
关键词 表观遗传学 组蛋白修饰 组蛋白甲基化修饰效应蛋白:基因转录调控
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甘蓝型油菜NCa CMS育性相关候选线粒体基因及其恢复基因的转录调控 被引量:5
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作者 危文亮 王汉中 刘贵华 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第1期102-106,共5页
用10个线粒体基因为探针,对NCa不育系、保持系和可育F1幼蕾的线粒体RNA进行了Northern检测。结果表明,atp6、atp1、cox1c、ox2、cobr、rn5S和rrn26S等7个线粒体基因探针在不育系、保持系、可育F1中的转录没有差异,只有orf222、orf139和a... 用10个线粒体基因为探针,对NCa不育系、保持系和可育F1幼蕾的线粒体RNA进行了Northern检测。结果表明,atp6、atp1、cox1c、ox2、cobr、rn5S和rrn26S等7个线粒体基因探针在不育系、保持系、可育F1中的转录没有差异,只有orf222、orf139和atp9等3个探针检测到转录本的差异。orf222和orf139分别在不育系和可育F1中产生相同大小和丰度的转录本,但是在保持系中没有检测到转录本;orf222检测到的3条转录本分别为1.1、0.9和0.6 kb,orf139检测到0.8和0.6 kb 2条带。atp9探针在不育系和保持系中都检测到1条0.6 kb转录本,而在可育F1中检测到0.6和1.2 kb的转录本。NCaCMS不育的形成可能与orf222、orf139和atp9基因的表达有关。讨论了恢复基因在F1育性恢复过程中对育性相关候选基因的可能调控方式。 展开更多
关键词 甘蓝型油菜 细胞质雄性不育 线粒体基因表达 恢复基因 转录调控
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非编码DNA序列的功能及其鉴定 被引量:5
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作者 秦丹 徐存拴 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2013年第11期1253-1264,共12页
非编码DNA序列是指基因组中不编码蛋白质的DNA序列。这些序列可以结合调节因子、转录为功能性RNA、单独或协同地调节生理活动和病理过程。文章围绕基因表达调控作用,总结了近几年非编码DNA序列的研究成果,对其结构、功能和可能的作用机... 非编码DNA序列是指基因组中不编码蛋白质的DNA序列。这些序列可以结合调节因子、转录为功能性RNA、单独或协同地调节生理活动和病理过程。文章围绕基因表达调控作用,总结了近几年非编码DNA序列的研究成果,对其结构、功能和可能的作用机制进行了初步阐述,介绍了目前鉴定非编码DNA序列中功能元件的计算方法和实验技术,并对非编码DNA未来的研究进行了展望。 展开更多
关键词 非编码DNA序列 基因表达调控 功能元件 转录因子结合位点 非编码RNA 表观遗传学
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线粒体与神经退行性疾病 被引量:9
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作者 施蕴渝 张亮 《生物学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2022年第2期1-10,共10页
为了对神经退行性疾病有更深入地了解,以达到诊治的目的,从线粒体基因组及线粒体基因转录,翻译的遗传与表观遗传调控;线粒体动力学,融合,分裂,线粒体自噬;线粒体在神经突触上的输运;线粒体功能障碍-激活天然免疫系统-引起慢性炎症-导致... 为了对神经退行性疾病有更深入地了解,以达到诊治的目的,从线粒体基因组及线粒体基因转录,翻译的遗传与表观遗传调控;线粒体动力学,融合,分裂,线粒体自噬;线粒体在神经突触上的输运;线粒体功能障碍-激活天然免疫系统-引起慢性炎症-导致神经退行性疾病等4个方面进行阐述,以期对线粒体的生理功能,及与神经退行性病理有更深入地了解,为疾病的诊治奠定基础。 展开更多
关键词 衰老 神经退行性疾病 线粒体功能异常 线粒体基因表达及表观遗传调控 线粒体融合、分裂及自噬
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染色质可塑性动态调控的蛋白质机器及其作用机理
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作者 李国红 翁杰敏 +1 位作者 吴强 俞洋 《中国基础科学》 2018年第1期53-57,共5页
后基因组时代生命科学领域的一大关键科学问题是同一生物体中具有相同基因组的各种不同生理功能的细胞命运是如何决定的。表观遗传学正是为了回答这一关键科学问题而兴起的新兴学科,而表观遗传学的核心是染色质结构与功能层面的动态调... 后基因组时代生命科学领域的一大关键科学问题是同一生物体中具有相同基因组的各种不同生理功能的细胞命运是如何决定的。表观遗传学正是为了回答这一关键科学问题而兴起的新兴学科,而表观遗传学的核心是染色质结构与功能层面的动态调控。高等真核生物的基因组DNA通过缠绕组蛋白八聚体形成以核小体为重复单元的串珠结构,并经不同层次折叠如30 nm染色质纤维、长距离染色质环、异染色质等高级结构储存于细胞核中。现有研究表明,染色质而非孤立的DNA才是真核生物遗传信息的载体,同时也是基因转录、DNA复制与损伤修复、DNA重排和重组等生命活动赖以进行并得以精准调控的物质基础和信息整合平台。染色质结构及其功能的动态调控在生殖发育、细胞分化、代谢和衰老等过程中发挥至关重要的作用,其错误调控常导致基因表达异常并伴随多种疾病的发生。同时,国际上以染色质动态调控相关因子为靶标的药物研发方兴未艾,累计投入已超过数十亿美元,目前已有多种染色质修饰酶抑制剂被美国FDA批准成药。因此,染色质结构与功能的动态调控既是揭示生命现象本质、正确理解生命过程以及各种人类重要疾病发生发展的基础生物学问题之一,也是涉及国民健康和医药产业发展的重大战略需求。 展开更多
关键词 表观遗传 染色质动态调控 基因转录调控
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真菌次级代谢转录调控研究进展 被引量:8
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作者 徐新然 吕海宁 +1 位作者 周爽 尹文兵 《菌物研究》 CAS 2019年第3期125-137,共13页
真菌次级代谢产物具有多样复杂的结构和良好的生物活性,广泛应用于工业、农业、医疗等领域。次级代谢产物的产生受多个层级的调控,尤其是转录水平的调控至关重要。文中首先介绍了在真菌转录调控过程中参与次级代谢的代表性转录因子和蛋... 真菌次级代谢产物具有多样复杂的结构和良好的生物活性,广泛应用于工业、农业、医疗等领域。次级代谢产物的产生受多个层级的调控,尤其是转录水平的调控至关重要。文中首先介绍了在真菌转录调控过程中参与次级代谢的代表性转录因子和蛋白质复合体,进而举例说明了转录调控在挖掘真菌新颖次级代谢产物领域的重要作用;期望相关研究者全面认识真菌次级代谢产物的生物合成及转录调控,为发现新的具有良好生物活性的天然产物提供思路。 展开更多
关键词 真菌次级代谢 转录因子 基因簇 全局调控因子 表观遗传调控因子
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骨髓增生异常综合征相关基因研究进展 被引量:6
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作者 许红月 谢彦晖 《临床血液学杂志》 CAS 2017年第3期407-412,共6页
骨髓增生异常综合征(MDS)是一组起源于造血干细胞的异质性髓系克隆性疾病,主要表现为外周血细胞减少,病态造血和高风险向急性髓系白血病(AML)转化。80%以上的MDS患者都伴有相关基因突变,目前所知MDS中研究较多、较常见的基因突变主... 骨髓增生异常综合征(MDS)是一组起源于造血干细胞的异质性髓系克隆性疾病,主要表现为外周血细胞减少,病态造血和高风险向急性髓系白血病(AML)转化。80%以上的MDS患者都伴有相关基因突变,目前所知MDS中研究较多、较常见的基因突变主要有表观遗传基因(DNA甲基化基因和组蛋白修饰基因DNMT3A、TET2、IDH1/2、WT1、ASXL1、EZH2等),RNA剪接基因(SF3B1、SRSF2、U2AF1和ZRSR、PRPF8等),转录调节基因(RUNX1、TP53等),信号转导基因(NRAS、KRAS、JAK2、CBL等)及其余相关基因。 展开更多
关键词 骨髓增生异常综合征 基因突变 表观遗传 RNA剪接 转录调节
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多组学大数据整合分析揭示早期胚胎发育过程中基因表达调控信息的变化规律
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作者 江琦 汤小晗 +4 位作者 陶欢 王军婷 白雪梅 李昊 卢美松 《现代生物医学进展》 CAS 2021年第12期2241-2244,共4页
目的:探究哺乳动物早期胚胎发育过程中基因表达调控信息的变化规律。方法:收集小鼠早期胚胎发育各时期的RNA-seq,ATAC-seq,MethylC-Seq和H3K4me3 ChIP-seq数据进行整合分析,观察小鼠早期胚胎发育各时期转录因子表达量的变化,计算各时期... 目的:探究哺乳动物早期胚胎发育过程中基因表达调控信息的变化规律。方法:收集小鼠早期胚胎发育各时期的RNA-seq,ATAC-seq,MethylC-Seq和H3K4me3 ChIP-seq数据进行整合分析,观察小鼠早期胚胎发育各时期转录因子表达量的变化,计算各时期基因表达量与转录因子结合位点数量及染色质可及性的相关性,筛选各时期表达量前10%的基因,统计其表达量和转录因子占比,并进行启动子可及性分析。根据前期报道的转录因子三节点调控网络,对早期胚胎各时期转录因子调控网络的富集模式进行分析。根据多组学数据分析结果,推测早期胚胎发育调控过程中转录因子和表观遗传修饰信息的共调控模型。结果:转录因子数量和调控关系变化以及染色质可及性、DNA甲基化修饰、组蛋白修饰等表观遗传修饰共同调控早期胚胎发育各时期的基因表达,这些因素在不同时期发挥不同程度的调控作用。结论:转录因子和表观遗传修饰在早期胚胎发育过程中动态调控基因表达。 展开更多
关键词 多组学整合分析 早期胚胎发育 转录因子 表观遗传修饰 基因表达调控
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PD-1的基因表达调控
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作者 邱法忠 徐宗珍 +1 位作者 单仕营 迟增德 《生命的化学》 CAS CSCD 2020年第6期890-895,共6页
程序化细胞死亡蛋白-1(programmed cell death protein-1, PD-1)是一个由Pdcd1编码的抑制性辅助受体(co-inhibitory receptor),它对T细胞的免疫应答具有重要的调节作用。PD-1信号通路在急性感染过程中可以防止T细胞的过度激活,但是在慢... 程序化细胞死亡蛋白-1(programmed cell death protein-1, PD-1)是一个由Pdcd1编码的抑制性辅助受体(co-inhibitory receptor),它对T细胞的免疫应答具有重要的调节作用。PD-1信号通路在急性感染过程中可以防止T细胞的过度激活,但是在慢性感染过程中可以引起T细胞耗竭(T cell exhaustion)。肿瘤浸润T细胞(tumor-infiltrating T cells)高表达PD-1可以导致肿瘤细胞的免疫逃逸,靶向PD-1信号通路的免疫治疗已经在肿瘤治疗方面取得了巨大的成功。Pdcd1在免疫细胞中的表达存在复杂的调控机制,本文将对这方面的研究进展作一综述。 展开更多
关键词 PD-1 基因表达调控 转录 表观遗传调控
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线粒体基因转录调控机制与人类疾病
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作者 高沛业 刘雯 《中国优生与遗传杂志》 2021年第6期754-757,共4页
人类的线粒体DNA编码了37个基因,这些基因在氧化磷酸化作用中都发挥着重要的作用,而他们表达的失调与人类的疾病和衰老有着密切的联系。除了线粒体基因编码的13个mRNA、12S rRNA、16S rRNA和22个tRNA之外,其他调控线粒体基因的转录、翻... 人类的线粒体DNA编码了37个基因,这些基因在氧化磷酸化作用中都发挥着重要的作用,而他们表达的失调与人类的疾病和衰老有着密切的联系。除了线粒体基因编码的13个mRNA、12S rRNA、16S rRNA和22个tRNA之外,其他调控线粒体基因的转录、翻译及RNA修饰的因子都由细胞核编码而后转运至线粒体基质中。本文详细讨论了线粒体基因转录的调控机制,并突出了这些调控因子与人类疾病存在的联系。 展开更多
关键词 线粒体基因 转录调控 人类疾病
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