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RNA m6A dynamic modification mediated by nucleuslocalized FTO is involved in follicular reserve
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作者 Jiao-Na Zhang Rui-Ting Wang +3 位作者 Francesca-Gioia Klinger Shun-Feng Cheng Wei Shen Xiao-Feng Sun 《Zoological Research》 SCIE CSCD 2024年第2期415-428,共14页
In eukaryotic organisms,the most common internal modification of messenger RNA(m RNA)is N6-methyladenosine(m6A).This modification can be dynamically and reversibly controlled by specific enzymes known as m6A writers a... In eukaryotic organisms,the most common internal modification of messenger RNA(m RNA)is N6-methyladenosine(m6A).This modification can be dynamically and reversibly controlled by specific enzymes known as m6A writers and erasers.The fat-mass and obesity-associated protein(FTO)catalyzes RNA demethylation and plays a critical role in various physiological and pathological processes.Our research identified dynamic alterations in both m6A and FTO during the assembly of primordial follicles,with an inverse relationship observed for m6A levels and nuclear-localized FTO expression.Application of Fto small interfering RNA(si RNA)altered the expression of genes related to cell proliferation,hormone regulation,and cell chemotaxis,and affected RNA alternative splicing.Overexpression of the full-length Fto gene led to changes in m6A levels,alternative splicing of Cdk5,cell proliferation,cell cycle progression,and proportion of primordial follicles.Conversely,overexpression of Fto lacking a nuclear localization signal(NLS)did not significantly alter m6A levels or primordial follicle assembly.These findings suggest that FTO,localized in the nucleus but not in the cytoplasm,regulates RNA m6A demethylation and plays a role in cell proliferation,cell cycle progression,and primordial follicle assembly.These results highlight the potential of m6A and its eraser FTO as possible biomarkers and therapeutic targets. 展开更多
关键词 m6a FTO OVARY Primordial follicle assembly Alternative splicing
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m6A基因模型预测胶质母细胞瘤患者的预后
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作者 朱勇 李波 《神经损伤与功能重建》 2024年第8期441-445,共5页
目的:构建m6A相关胶质母细胞瘤(glioblastoma,GBM)预后模型,识别受m6A调控的潜在预后生物标志物。方法:从TCGA和GEO中分别收集了GBM的表达、临床表型和生存数据,m6A2Target中获取m6A调控因子。获得m6A调控因子与TCGA-GBM基因交集。根据T... 目的:构建m6A相关胶质母细胞瘤(glioblastoma,GBM)预后模型,识别受m6A调控的潜在预后生物标志物。方法:从TCGA和GEO中分别收集了GBM的表达、临床表型和生存数据,m6A2Target中获取m6A调控因子。获得m6A调控因子与TCGA-GBM基因交集。根据TCGA-GBM表达,计算正常-癌症间差异的基因。基于差异的m6A调控因子进行一致性聚类,识别亚型,构建亚型间差异的预后相关基因模型,并进行验证。结果:从m6A2Target中获取了21个m6A调控因子,与TCGA-GBM包含的基因交集有19个。其中6个m6A调控因子在GBM显著上调。基于差异的m6A调控因子的表达进行一致性聚类,得到cluster1/2共2个亚型。且cluster2亚型中患者的免疫评分以及基质评分均显著高于cluster1,但cluster1的整体肿瘤纯度显著高于cluster2。生存分析发现,cluster2生存预后更差。cluster1和cluster2之间显著差异表达的基因共6591个,单因素cox回归和多因素cox回归筛选到171个显著预后相关基因。LASSO-cox回归构建预后风险模型显示在训练集(TCGA-GBM)及测试集(GSE121720)中均具有较好的模型效能。结论:多个m6A因子在GBM患者中存在显著差异,且基于m6A分型的2组患者存在预后不同,并基于m6A的组间差异构建了预后模型可指导患者的5年生存率。 展开更多
关键词 m6a 胶质母细胞瘤 预后模型
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线粒体氧化应激及m6A表观遗传调控TRPC6钙通道在肾病综合征发病中的作用研究
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作者 姜丽娜 孔玮晶 丁瑛雪 《临床和实验医学杂志》 2024年第8期785-789,共5页
目的 初步探讨N6-甲基腺嘌呤(m6A)表观遗传修饰瞬时受体电位阳离子通道6(TRPC6)通道失调在肾病综合征发病中的作用及潜在机理。方法 按照随机数字表法将小鼠足细胞分为4组:对照组、叔丁基对苯二酚(TBHQ)组、嘌呤霉素氨基核苷(PAN)处理组... 目的 初步探讨N6-甲基腺嘌呤(m6A)表观遗传修饰瞬时受体电位阳离子通道6(TRPC6)通道失调在肾病综合征发病中的作用及潜在机理。方法 按照随机数字表法将小鼠足细胞分为4组:对照组、叔丁基对苯二酚(TBHQ)组、嘌呤霉素氨基核苷(PAN)处理组、TBHQ+PAN处理组。对照组为正常完全培养液,TBHQ组培养液中加入10 nmol/L TBHQ,PAN处理组培养液中加入PAN 50μg/mL,TBHQ+PAN处理组培养液中加入10 nmol/L TBHQ以及PAN 50μg/mL,刺激24 h收集细胞。应用膜片钳证实PAN损伤诱导TRPC6通道激活机理及1,4,5-肌醇三磷酸(IP3)受体拮抗剂TBHQ对电流的影响,检测对照组、PAN处理组、TBHQ组和TBHQ+PAN处理组细胞TRPC6通道电流变化。通过葡萄糖氧化酶(GO)建立足细胞氧化应激模型。另外按照随机数字表法将足细胞分为4组:空白对照组、GO组、姜黄素组、姜黄素+GO组。GO组给予GO 3.5 kU/L,姜黄素组给予Nrf2激动剂(姜黄素)40μmol/L,姜黄素+GO组给予姜黄素40μmol/L和GO 3.5 kU/L处理,给药处理8~12 h后收集细胞。检测各组Nrf2和特异性调控蛋白NAD(P)H:醌氧化还原酶1(NQO-1)、TRPC6及Transgelin蛋白和线粒体调控蛋白表达变化。通过SRAMP对TRPC6通道m6A位点进行精准预测,对PAN诱导足细胞损伤模型公共数据库GSE124622进行2次生物信息学分析。结果 对照组与TBHQ组电流比较,差异无统计学意义(P>0.05);与对照组比较,PAN处理组电流升高,而TBHQ+PAN组电流减小,差异均有统计学意义(P<0.05)。与空白对照组比较,GO组Nrf2、NQO-1、TRPC6及Transgelin蛋白表达均升高,差异均有统计学意义(P<0.01);与GO组比较,姜黄素+GO组Nrf2、NQO-1、TRPC6及Transgelin蛋白表达均降低,差异均有统计学意义(P<0.05)。与空白对照组比较,GO组线粒体调控蛋白Mfn2、Opa1蛋白表达均降低,Drp1蛋白表达升高,差异均有统计学意义(P<0.05);与GO组比较,姜黄素+GO组粒体调控蛋白Mfn2、Opa1蛋白表达升高,Drp1蛋白表达降低,差异均有统计学意义(P<0.05);空白对照组与姜黄素组TRPC6/Transgelin及线粒体调控蛋白表达比较,差异均无统计学意义(P>0.05)。TRPC6通道序列存在多个m6A修饰位点,均具有被甲基转移酶(METTL)3、METTL14、肾母细胞肿瘤1相关蛋白(WTAP)和去甲基化酶ALKB同源蛋白(ALKBH)、m6A去甲基化酶(FTO)调控的潜在可能。对12个m6A调节基因进行表达分析,发现m6A调节基因的表达在PAN诱导足细胞损伤中发生显著差异。结论 TRPC6介导钙离子内流可被氧化应激激活参与足细胞损伤,激活Nrf2可以减少钙过负荷所致线粒体损伤而保护足细胞。TRPC6序列中存在多个高m6A修饰靶点,肾病综合征发病机理可能通过m6A修饰足细胞TRPC6离子通道,m6A相关调控基因在肾病足细胞损伤中发生明显变化。 展开更多
关键词 肾病综合征 嘌呤霉素 氨基核苷 瞬时受体电位阳离子通道6 线粒体功能异常 N6-甲基腺嘌呤 m6a转移酶样3抑制剂
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m6A甲基转移酶ZC3H13在肿瘤中的研究进展
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作者 陈丹 鄢文 《临床医学进展》 2024年第7期647-652,共6页
N6-甲基腺苷(m6A) RNA修饰在肿瘤的发生发展中起着非常重要的作用。m6A的写入器、擦除器和读取器在m6A修饰中发挥重要的生物学作用。越来越多的研究证实m6A基因的异常跟癌症的发生发展密切相关。ZC3H13在多种系统肿瘤中异常表达,且与肿... N6-甲基腺苷(m6A) RNA修饰在肿瘤的发生发展中起着非常重要的作用。m6A的写入器、擦除器和读取器在m6A修饰中发挥重要的生物学作用。越来越多的研究证实m6A基因的异常跟癌症的发生发展密切相关。ZC3H13在多种系统肿瘤中异常表达,且与肿瘤的恶性程度密切相关。本研究就m6A甲基转移酶ZC3H13在各系统肿瘤中的研究进展进行综述。 展开更多
关键词 m6a ZC3H13 肿瘤
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m6A甲基化修饰非编码RNA调控病理性心脏重塑的作用 被引量:1
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作者 尹功华 徐若瑶 +3 位作者 张丽娟 张一凡 齐洁 张钧 《中国组织工程研究》 CAS 北大核心 2024年第20期3252-3258,共7页
背景:m6A甲基化修饰非编码RNA是病理性心脏重塑形成机制的研究热点,在心血管疾病的发生发展中起着重要作用。目的:总结m6A甲基化修饰非编码RNA对调控病理性心肌肥大、心肌细胞死亡、心肌纤维化与血管重塑等病理性心脏重塑主要过程的可... 背景:m6A甲基化修饰非编码RNA是病理性心脏重塑形成机制的研究热点,在心血管疾病的发生发展中起着重要作用。目的:总结m6A甲基化修饰非编码RNA对调控病理性心肌肥大、心肌细胞死亡、心肌纤维化与血管重塑等病理性心脏重塑主要过程的可能作用机制。方法:以“m6A甲基化修饰,非编码RNA,病理性心肌肥大,心肌细胞凋亡,心肌细胞焦亡,心肌细胞铁死亡,心肌纤维化,血管重塑”为中文主题词,以“m6A、non-coding RNA,pathological cardiac hypertrophy,cardiomyocyte apoptosis,cardiomyocyte pyroptosis,cardiomyocyte ferroptosis,myocardial fibrosis,vascular remodeling”为英文主题词,检索中国知网、PubMed、Web of Science数据库1974年1月至2023年4月发表的相关文献,对符合筛选标准的86篇文献进行综述。结果与结论:①m6A甲基化修饰是一种动态可逆的表观遗传修饰方式;②病理性心脏重塑主要包括病理性心肌肥大、心肌细胞死亡、心肌纤维化、血管重塑,m6A相关酶可调控病理性心脏重塑相关进程;③m6A甲基化修饰相关酶可通过多种非编码RNA与不同信号通路参与调控病理性心脏重塑过程,可作为心血管疾病新的潜在干预方式;④在病理性心脏重塑中,m6A甲基化修饰与非编码RNA之间的调控关系仍处于起步阶段,随着表观遗传学的发展,m6A甲基化修饰非编码RNA来调控病理性心脏重塑有望有新的发展。 展开更多
关键词 m6a甲基化修饰 病理性心脏重塑 非编码RNA 病理性心肌肥大 心肌细胞死亡 心肌纤维化 血管重塑 综述
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m6A RNA甲基化在骨关节炎发病机制的研究
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作者 陈威 徐玉德 +4 位作者 付志斌 叶丙霖 柴喜平 邓强 李盛华 《中国骨质疏松杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第8期1209-1214,共6页
N6-甲基腺嘌呤(N6-methyladenosine,m6A)RNA甲基化是生物体内最常见的信使RNA内部修饰,参与体内生理和病理过程。随着对m6A修饰的深入研究,其在多种疾病发病过程中的重要性备受关注。骨关节炎(osteoarthritis,OA)是一种关节软骨退行性疾... N6-甲基腺嘌呤(N6-methyladenosine,m6A)RNA甲基化是生物体内最常见的信使RNA内部修饰,参与体内生理和病理过程。随着对m6A修饰的深入研究,其在多种疾病发病过程中的重要性备受关注。骨关节炎(osteoarthritis,OA)是一种关节软骨退行性疾病,近年来OA相关研究迅速增加,对其发病机制的探索是主要的研究方向之一。目前有关m6A修饰在OA发病机制的研究主要集中在保护ECM免受降解、抑制OA程序性细胞死亡、调节脂肪质量和肥胖相关蛋白、与非编码RNA互作影响和改善免疫微环境等五个方面。因此,本文将从这几方面重点阐释,以期为OA发病机制中m6A修饰的深入研究和基于表观遗传机制的骨科疾病诊疗思路及理论参考提供一定的依据。 展开更多
关键词 m6a 骨关节炎 发病机制
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m6A甲基化调控骨代谢防治骨质疏松症的作用机制 被引量:1
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作者 陈相汕 刘桦 +1 位作者 孙伟康 李华南 《中国组织工程研究》 CAS 北大核心 2024年第28期4572-4577,共6页
背景:骨质疏松症发病机制复杂,其本质是各种原因导致的骨形成减弱和骨吸收增强,引起骨代谢失衡。近年来研究发现N6-甲基腺苷(N6-methyladenosine,m6A)甲基化可以通过调控骨代谢,达到防治骨质疏松的目的。目的:以m6A甲基化调控骨代谢作... 背景:骨质疏松症发病机制复杂,其本质是各种原因导致的骨形成减弱和骨吸收增强,引起骨代谢失衡。近年来研究发现N6-甲基腺苷(N6-methyladenosine,m6A)甲基化可以通过调控骨代谢,达到防治骨质疏松的目的。目的:以m6A甲基化调控骨代谢作为切入点,对m6A甲基化在骨质疏松症中的相关研究进展进行系统性的整理和归纳,为寻找骨质疏松症新的治疗靶点提供一定的理论参考依据。方法:查阅国内外数据库,从各数据库建立至2023年发表的相关文献,设置中文检索词为“骨质疏松症,m6A甲基化,骨代谢,骨髓间充质干细胞,成骨细胞,破骨细胞”等,英文检索词为“Osteoporosis,m6A methylation,Bone metabolism,bone marrow mesenchymal stem cells,osteoblasts,osteoclasts”等,检索中国知网、万方、维普、PubMed、MEDLINE、Nature及Cochrane数据库,排除重复及陈旧无参考意义的文献,通过纳入和排除标准共纳入73篇标准文献进行探讨。结果与结论:①m6A甲基化可以通过多种途径影响骨髓间充质干细胞、成骨细胞、破骨细胞的活性及分化过程,调节骨代谢防治骨质疏松症;②m6A甲基化的调节过程极为复杂,其相关蛋白在不同的细胞中发挥不同的作用,甚至在同种细胞内,同类型的蛋白也会发生截然不同的作用,调控着不同的生理及病理过程。 展开更多
关键词 m6a甲基化 骨代谢 骨质疏松症 骨髓间充质干细胞 成骨细胞 破骨细胞 研究进展
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m1A/m5C/m6A/m7G调控基因预测胃癌预后及免疫关联性
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作者 陈小梅 王安奇 +1 位作者 杨积祯 于淼 《实用医学杂志》 CAS 北大核心 2024年第9期1230-1237,共8页
目的基于m1A/m5C/m6A/m7G甲基化调控基因建立胃癌预后风险预测模型,并分析该模型与免疫的关联性。方法通过癌症基因组图谱(TCGA)-胃癌数据集筛选表达具有显著差异的m1A/m5C/m6A/m7G调控基因,通过单基因Cox回归分析和LASSO算法构建预后... 目的基于m1A/m5C/m6A/m7G甲基化调控基因建立胃癌预后风险预测模型,并分析该模型与免疫的关联性。方法通过癌症基因组图谱(TCGA)-胃癌数据集筛选表达具有显著差异的m1A/m5C/m6A/m7G调控基因,通过单基因Cox回归分析和LASSO算法构建预后风险评分(risk score,RS)模型,使用Kaplan-Meier(K-M)统计进行RS模型验证,并应用细胞系进行RT-qPCR验证。利用单因素、多因素Cox回归分析建立nomogram模型。使用CIBERSORT算法和estimate包进行免疫关联性分析。结果建立了基于八个甲基化调控基因的预后RS模型,将胃癌患者分为高风险和低风险。这八个基因在胃癌细胞系中高表达(P<0.05)。在TCGA-胃癌训练集和GSE62254-验证集中,患者总生存率(OS)与分组状态之间存在显著相关性(P<0.001)。nomogram生存模型预测的1年(C-index=0.703)、3年(C-index=0.729)和5年(C-index=0.734)生存率与实际生存率的一致性较好。免疫关联性分析表明,与低风险患者组相比,高风险患者组免疫评分和免疫检查点相关基因的表达较高(P<0.05)。结论基于m1A/m5C/m6A/m7G调控基因的预后RS模型可预测胃癌预后并指导个体免疫治疗决策。 展开更多
关键词 m1A m5C m6a m7G 胃癌 预后 免疫浸润
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基于“胞脉络于心”探讨绞股蓝通过METTL3介导RNA m6A修饰调控糖酵解途径共治动脉粥样硬化与卵巢癌的理论研究
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作者 孙小扉 王莹 +7 位作者 闵冬雨 赵佼 王华文 李政 杨莹 赵卓 周立江 宋囡 《中华中医药学刊》 CAS 北大核心 2024年第4期180-183,I0038,共5页
心血管病和癌症,是导致人类患病和死亡的主要原因。研究发现,二者存在潜在联系。从中医角度而言,动脉粥样硬化(atherosclerosis,AS)病位在血管,与奇恒之腑“脉”对应,卵巢癌以脏腑功能紊乱、冲任失调为本,邪毒内生为标,阻于胞宫所致,又... 心血管病和癌症,是导致人类患病和死亡的主要原因。研究发现,二者存在潜在联系。从中医角度而言,动脉粥样硬化(atherosclerosis,AS)病位在血管,与奇恒之腑“脉”对应,卵巢癌以脏腑功能紊乱、冲任失调为本,邪毒内生为标,阻于胞宫所致,又《素问·评热病论篇》曰:“胞脉者,属心而络于胞中”。可见,两种疾病可以“脉”为桥梁构建联系。绞股蓝化痰止咳,健脾理气,益气活血,解毒利湿,具有调血脂、抗衰老、调节机体免疫以及抗肿瘤等多种药理作用,在心血管系统与肿瘤领域疾病中疗效显著。N 6-甲基腺苷(N6-methyladenosine,m6A)甲基化修饰是真核细胞mRNA最常见的一种表观遗传修饰方式。m6A甲基化修饰通过调控修饰mRNA,广泛参与细胞内RNA的许多生物学行为,从而影响疾病进展与肿瘤的发生。基于“胞脉络于心”理论,以中医异病同治观点为依据,构建“药物-成分-靶点”网络,以METTL3介导RNA m6A修饰调控糖酵解途径为切入点,对绞股蓝共治AS与卵巢癌的中医内涵及现代药理作用予以探讨。 展开更多
关键词 绞股蓝 m6a甲基化 卵巢癌 动脉粥样硬化 糖酵解
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METTL3介导的m6A甲基化调控脂多糖诱导的内皮细胞通透性变化
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作者 王建丰 余慧林 +4 位作者 余又新 宋均辉 孟承颖 蒋薇 胡德林 《安徽医科大学学报》 CAS 北大核心 2024年第6期1023-1028,共6页
目的探讨甲基化转移酶3(METTL3)介导的N6-甲基腺苷(m6A)甲基化修饰参与调控脂多糖(LPS)诱导的内皮细胞通透性变化的分子生物学机制。方法选用人脐静脉内皮细胞(HUVECs)进行体外培养,使用50、125、250、500、1000、2000 ng/ml的LPS干预HU... 目的探讨甲基化转移酶3(METTL3)介导的N6-甲基腺苷(m6A)甲基化修饰参与调控脂多糖(LPS)诱导的内皮细胞通透性变化的分子生物学机制。方法选用人脐静脉内皮细胞(HUVECs)进行体外培养,使用50、125、250、500、1000、2000 ng/ml的LPS干预HUVECs 24 h,应用Real-time PCR检测METTL3 mRNA的表达;选用500 ng/ml的LPS干预HUVECs 24 h,检测m6A甲基化水平,应用细胞通透性实验检测细胞通透性,应用Real-time PCR和Western blot检测细胞间连接蛋白(Claudin-5、Occludin和VE-caherin)mRNA和蛋白表达;构建METTL3过表达稳转细胞株,检测METTL3过表达时内皮细胞m6A甲基化水平及通透性的变化。结果与对照组相比,LPS抑制HUVECs METTL3 mRNA表达,使得内皮细胞m6A甲基化下调,细胞通透性升高,细胞间连接蛋白(Claudin-5、Occludin和VE-caherin)mRNA和蛋白表达下降;当METTL3过表达时,内皮细胞m6A甲基化水平增强,LPS诱导的内皮细胞通透性增加得以改善。结论METTL3介导的m6A甲基化能够改善脓毒症诱导的内皮细胞通透性增加。 展开更多
关键词 脓毒症 m6a METTL3 内皮细胞通透性 脂多糖
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m6A修饰调控酶及其结合蛋白在细胞自噬中作用的研究进展
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作者 陈思琪 郭帅杰 周明学 《中国病理生理杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第1期157-163,共7页
自噬可消除细胞内错误折叠或聚集的蛋白质、清除受损的细胞器以及降解不必要的细胞成分,对于维持细胞功能和新陈代谢十分重要[1]。自噬水平的异常在癌症、心血管、呼吸系统和神经退行性病变等疾病的发病机制中起到重要作用[2]。在过去... 自噬可消除细胞内错误折叠或聚集的蛋白质、清除受损的细胞器以及降解不必要的细胞成分,对于维持细胞功能和新陈代谢十分重要[1]。自噬水平的异常在癌症、心血管、呼吸系统和神经退行性病变等疾病的发病机制中起到重要作用[2]。在过去几十年,对自噬的研究主要集中在自噬的调控机制及自噬基因的生物学功能[3-4]。 展开更多
关键词 m6a修饰 自噬 甲基转移酶 去甲基化酶 m6a结合蛋白
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m6A甲基化修饰在乳腺癌中作用及调控机制研究进展
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作者 贺紫薇 葛梦迪 +2 位作者 孙心悦 刘成祥 王宽宇 《医学研究杂志》 2024年第2期10-13,116,共5页
乳腺癌(breast cancer,BC)是全球女性发生率最高的恶性肿瘤,也是危及女性健康的主要危险因素。N6-甲基腺苷(N6-methyladenosine,m6A)是高等真核生物mRNA中富含的内部修饰物,对于mRNA代谢和多项生物过程都具有关键作用。近年来研究表明,... 乳腺癌(breast cancer,BC)是全球女性发生率最高的恶性肿瘤,也是危及女性健康的主要危险因素。N6-甲基腺苷(N6-methyladenosine,m6A)是高等真核生物mRNA中富含的内部修饰物,对于mRNA代谢和多项生物过程都具有关键作用。近年来研究表明,m6A与多种类型的肿瘤发展息息相关,但是其与BC之间的关联还不十分明确。本文综述了m6A甲基化修饰在癌症中作用的研究进展,包括m6A甲基转移酶、去甲基化酶、甲基识别蛋白各自的生物功能,以及m6A甲基化修饰在BC的增殖、侵袭、耐药及预后等方面的作用。开发针对m6A的化学调节剂为BC的治疗提供了一个全新的可能,同时m6A甲基化修饰因子有望成为BC诊断、预后以及疗效监测的重要治疗靶点。 展开更多
关键词 乳腺癌 m6a 甲基化修饰 研究进展
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激素性股骨头坏死中m6A相关基因差异性的鉴定
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作者 原天祎 刘洪江 +4 位作者 杨增强 卢兴宝 麦麦提依不巴吉 周治衡 崔泳 《中国组织工程研究》 CAS 北大核心 2024年第14期2159-2165,共7页
背景:已知m6A参与了多种疾病的发生与发展,研究推测其也参与了激素性股骨头坏死的病理改变,但m6A甲基化修饰在激素性股骨头坏死中的研究比较匮乏。目的:通过生物信息学的方法寻找m6A相关基因在激素性股骨头坏死中的差异性表达,并预测与... 背景:已知m6A参与了多种疾病的发生与发展,研究推测其也参与了激素性股骨头坏死的病理改变,但m6A甲基化修饰在激素性股骨头坏死中的研究比较匮乏。目的:通过生物信息学的方法寻找m6A相关基因在激素性股骨头坏死中的差异性表达,并预测与其相关的miRNA,以进一步阐明m6A甲基化在激素性股骨头坏死中所发挥的作用和机制。方法:从GSE123568基因表达谱中分析激素性股骨头坏死与对照组差异基因的表达,通过R语言‘limma’包进行差异基因鉴定,并对差异基因进行功能富集分析。用R语言的‘ggstatsplot’包对相关基因进行差异性分析。通过GSE74089数据集对差异基因进行交叉验证。构建mRNA-miRNA调控网络。采用共表达分析对共表达模块进行聚类并对模块基因进行富集分析。采用ssGSEA方法对激素性股骨头坏死与对照组之间免疫细胞浸润的差异进行量化分析。结果与结论:①通过相关性分析发现13个m6A相关基因,进行PPI网络识别和受试者操作特征曲线进一步分析发现YTHDF2有望成为早期生物标志物的核心差异基因;②富集分析发现差异基因主要参与炎症反应和免疫应答,并与破骨细胞关系密切;③交叉验证分析2个数据集差异基因表达结果一致;④mRNA-miRNA调控网络分析发现YTHDF2与miRNA-27a呈负相关;⑤免疫浸润分析发现激素性股骨头坏死中免疫细胞浸润水平上升,YTHDF2与免疫细胞CD4^(+)T细胞的浸润程度呈正相关;⑥结论:m6A相关基因YTHDF2可以作为激素性股骨头坏死潜在生物标志物,对激素性股骨头坏死的早期临床诊断和治疗具有一定的价值;验证了YTHDF2与miRNA-27a呈负相关,且与CD4^(+)T细胞的浸润程度呈正相关,为激素性股骨头坏死的早期诊断和治疗提供新的思路,并为进一步阐明m6A在激素性股骨头坏死中发挥的作用机制提出新的见解。 展开更多
关键词 m6a甲基化 激素性股骨头坏死 生信分析 差异基因 YTHDF2 富集分析
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m6A修饰与妇科恶性肿瘤相关性的研究进展
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作者 张海花 雷燕 +3 位作者 刘宇 唐松 王露 姚冬梅 《临床误诊误治》 CAS 2024年第1期147-152,共6页
N6-甲基腺苷(m6A)修饰是一种常见的表观遗传学修饰,动态调控RNA代谢的整个过程。m6A包括甲基转移酶、去甲基酶及m6A结合蛋白。m6A的甲基化修饰通过调节RNA的衰变、运输、剪切、翻译来调节细胞的增殖和分化,m6A与妇科恶性肿瘤的发生发展... N6-甲基腺苷(m6A)修饰是一种常见的表观遗传学修饰,动态调控RNA代谢的整个过程。m6A包括甲基转移酶、去甲基酶及m6A结合蛋白。m6A的甲基化修饰通过调节RNA的衰变、运输、剪切、翻译来调节细胞的增殖和分化,m6A与妇科恶性肿瘤的发生发展有关。笔者就近年来m6A甲基化修饰在宫颈癌、子宫内膜癌和卵巢癌中的相关研究进展进行回顾,分析m6A通过作用于RNA的修饰调节妇科恶性肿瘤发生发展的机制,为妇科恶性肿瘤的治疗、改善预后提供新的方向。 展开更多
关键词 m6a甲基化 生殖器肿瘤 女(雌)性妇科肿瘤 宫颈肿瘤 卵巢肿瘤 子宫内膜肿瘤 综述
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N^(6)-甲基腺苷(m6A)转移酶METTL3和m6A调控LINC01465在肝细胞癌增殖转移中的作用机制
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作者 刘肸琳 龙朴泽 +1 位作者 黄云美 罗春英 《遵义医科大学学报》 2024年第2期135-144,共10页
目的探讨甲基转移酶样3(METTL3)在肝癌细胞中调控m6A水平,影响长链非编码(lncRNA)LINC01465的表达,促进肝癌细胞增殖转移的机制。方法利用人类癌症基因组图谱(TCGA)数据库分析METTL3在肝癌组织和正常肝组织中的表达差异及与患者预后的关... 目的探讨甲基转移酶样3(METTL3)在肝癌细胞中调控m6A水平,影响长链非编码(lncRNA)LINC01465的表达,促进肝癌细胞增殖转移的机制。方法利用人类癌症基因组图谱(TCGA)数据库分析METTL3在肝癌组织和正常肝组织中的表达差异及与患者预后的关系;用Western blot、RT-qPCR分析验证METTL3在细胞、组织中的表达;用m6A比色法验证肝癌细胞及正常肝细胞中的m6A水平;敲低METTL3后进行CCK-8、克隆形成、Transwell迁移、侵袭实验,研究METTL3对肝癌增殖转移的调控作用;转录组RNA m6A甲基化测序确定METTL3的下游调控基因LINC01465。RT-qPCR验证沉默METTL3后LINC01465的表达量,以及LINC01465在肝细胞癌中的表达水平。结果METTL3在肝癌组织和细胞中明显高表达且与患者预后较差相关;高表达的METTL3促进HCC细胞增殖、迁移和侵袭;METTL3影响LINC01465的m6A水平及其表达量来促进肝细胞癌的发展进程。结论METTL3可通过m6A依赖的方式来影响LINC01465的表达水平,促进肝癌细胞增殖转移,METTL3可能成为肝癌预后及治疗的靶向标志物。 展开更多
关键词 甲基转移酶样3 m6a甲基化 LINC01465 肝细胞癌
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Elucidating the clinical and immunological value of m6A regulatormediated methylation modification patterns in adrenocortical carcinoma
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作者 WENHAO XU HAOMING LI +8 位作者 YASIR HAMEED MOSTAFA A.ABDEL-MAKSOUD SAEEDAH MUSAED ALMUTAIRI AYMAN MUBARAK MOHAMMED AUFY WAEL ALTURAIKI ABDULAZIZ J.ALSHALANI AYMAN M.MAHMOUD CHEN LI 《Oncology Research》 SCIE 2023年第5期819-831,共13页
N6-methyladenosine methylation(m6A)is a common type of epigenetic alteration that prominently affects the prognosis of tumor patients.However,it is unknown how the m6A regulator affects the tumor microenvironment(TME)... N6-methyladenosine methylation(m6A)is a common type of epigenetic alteration that prominently affects the prognosis of tumor patients.However,it is unknown how the m6A regulator affects the tumor microenvironment(TME)cell infiltration in adrenocortical carcinoma(ACC)and how it affects the prognosis of ACC patients yet.The m6A alteration patterns of 112 ACC patients were evaluated,furthermore,the association with immune infiltration cell features was investigated.The unsupervised clustering method was applied to typify the m6A alteration patterns of ACC patients.The principal component analysis(PCA)technique was taken to create the m6A score to assess the alteration pattern in specific malignancies.We found two independent patterns of m6A alteration in ACC patients.The TME cell infiltration features were significantly in accordance with phenotypes of tumor immune-inflamed and immune desert in both patterns.The m6Ascore also served as an independent predictive factor in ACC patients.The somatic copy number variation(CNV)and patients prognosis can be predicted by m6A alteration patterns.Moreover,the ACC patients with high m6A scores had better overall survival(OS)and higher efficiency in immune checkpoint blockade therapy.Our work demonstrated the significance of m6A alteration to the ACC patients immunotherapy.The individual m6A alteration patterns analysis might contribute to ACC patients prognosis prediction and immunotherapy choice. 展开更多
关键词 m6a Tumor microenvironment Adrenocortical carcinoma IMMUNOTHERAPY PROGNOSIS
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MELLT3 protects against cerebral ischemia-reperfusion (I/R) injury through up-regulation of m6A modification
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作者 JING JIN XINGHUA WANG +6 位作者 XIAOXIAO ZHENG JIAHUA LAN LI ZHENG YING CAI HUI CHEN HONGWEI WANG LIFANG ZHENG 《BIOCELL》 SCIE 2023年第3期619-626,共8页
Ischemic cerebrovascular disease is a leading cause of death globally and is often exacerbated by cerebral ischemic/reperfusion injury(CIRI).The exact mechanisms underlying I/R injury are unclear.In this study,we aime... Ischemic cerebrovascular disease is a leading cause of death globally and is often exacerbated by cerebral ischemic/reperfusion injury(CIRI).The exact mechanisms underlying I/R injury are unclear.In this study,we aimed to determine the role of m6A-modified methylase complex methyltransferase-like 3(METTL3)in cerebral ischemiareperfusion(I/R)injury.We found that m6A and METTL3 levels increased in OGD/RX-induced mouse astrocytescerebellar(MA-C)and the brain of middle cerebral artery occlusion(MCAO)model mice.METTL3 siRNA treatment reduced OGD-RX-induced MAC cell viability and proliferation,which increased with METTL3 over-expression.Flow cytometry analysis showed that silencing METTL3 significantly enhanced OGD/RX-induced MAC apoptosis,which was significantly reduced with METTL3 up-regulation.In an MCAO model,METTL3 overexpression significantly reduced cerebral infarction area and decreased brain cell apoptosis,indicating that METTL3 OE treatment could ameliorate brain edema and injury.Thus,METTL3 could be used as a target to treat I/R injury. 展开更多
关键词 METTL3 m6a Cerebral ischemia-reperfusion
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METTL14 upregulates m6A modification of pri‑miR‑141 inhibiting ZEB1 to promote proliferation and inflammation of lung fibroblasts
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作者 YANG Yi‑xiu CHEN Jie +2 位作者 LI Quan‑ni LIN Mei DING Yi‑peng 《Journal of Hainan Medical University》 2023年第2期43-48,共6页
Objective: To explore whether METTL14 is involved in regulating the fibroblast proliferation and inflammatory cytokine secretion by regulating the m6A modification of pri‑miR‑141. Methods: MRC‑5 cells were transfected... Objective: To explore whether METTL14 is involved in regulating the fibroblast proliferation and inflammatory cytokine secretion by regulating the m6A modification of pri‑miR‑141. Methods: MRC‑5 cells were transfected via METTL14 overexpression lentivirus to increase METTL14 expression. Levels of METTL14 and ZEB1 were measured by qPCR and western blot. The effect of METTL14 on MRC‑5 proliferation and apoptosis was determined by CCK‑8 and flow cytometry, respectively. The ELISA kits of IL‑2, IL6 and TNF‑α were used to detect the effect of METTL14 on MRC‑5 inflammatory secretion. m6A modification site on pri‑miR‑141 was detected by meRIP. The binding site between pri‑miR‑141 and METTL14 was determined by RIP. Results: We successfully upregulated METTL14 expression in MRC‑5 cells. Elevated METTL14 promoted MRC‑5 cell proliferation, suppressed its apoptosis and promoted inflammatory factors secretion in MRC‑5 cells. pri‑miR‑141 had m6A modification sites. pri‑miR‑141 can directly bind to METTL14. METTL14 upregulation increased miR‑141 while suppressed ZEB1 expression. Conclusion: METTL14 can promote the expression of miR‑141 by increasing the m6A modification site of pri‑miR‑141, and inhibit ZEB1, thereby promoting the proliferation of fibroblasts and the secretion of inflammatory factors. 展开更多
关键词 FIBROBLASTS PROLIFERATION Inflammatory factors METTL14 m6a
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RNA m6A甲基化在卒中后认知障碍中的研究进展 被引量:1
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作者 肖雨倩 孙可心 +4 位作者 万俊 陈淑颖 陈丽敏 王岩 白艳杰 《天津医药》 CAS 2024年第3期331-336,共6页
卒中后认知障碍(PSCI)主要表现为学习、记忆等方面的障碍。哺乳动物大脑中高度富集的RNA m6A甲基化修饰,参与神经胶质细胞介导的神经炎症。鉴于神经炎症是PSCI神经损伤以及空间和记忆能力下降的主要机制,推测RNA m6A甲基化修饰可调节脑... 卒中后认知障碍(PSCI)主要表现为学习、记忆等方面的障碍。哺乳动物大脑中高度富集的RNA m6A甲基化修饰,参与神经胶质细胞介导的神经炎症。鉴于神经炎症是PSCI神经损伤以及空间和记忆能力下降的主要机制,推测RNA m6A甲基化修饰可调节脑卒中后神经胶质细胞炎症反应,进而改善PSCI。该文就RNA m6A甲基化修饰在PSCI发展中的作用及其调控神经胶质细胞介导的炎症的详细机制进行总结分析,为该领域的研究者提供参考。 展开更多
关键词 卒中 认知障碍 炎症 小神经胶质细胞 星形细胞 m6a甲基化
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m6A去甲基化酶ALKBH5在形觉剥夺性近视豚鼠中的表达变化及其意义
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作者 向小玲 廖萱 +3 位作者 孟茄玉 周桂梅 周红 周羡媚 《中华实验眼科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期315-321,共7页
目的探讨形觉剥夺性近视(FDM)豚鼠视网膜中m6A去甲基化酶AlkB同源蛋白5(ALKBH5)表达变化及其参与近视的作用机制。方法采用随机数字表法将30只健康SPF级3周龄三色豚鼠分为正常对照组和实验组,每组15只。实验组中眼罩遮盖右眼作为FDM组,... 目的探讨形觉剥夺性近视(FDM)豚鼠视网膜中m6A去甲基化酶AlkB同源蛋白5(ALKBH5)表达变化及其参与近视的作用机制。方法采用随机数字表法将30只健康SPF级3周龄三色豚鼠分为正常对照组和实验组,每组15只。实验组中眼罩遮盖右眼作为FDM组,暴露左眼为自身对照组。分别于实验前及实验1、2、3和4周时进行豚鼠眼生物学参数测量。采用带状光检影镜测量屈光度,采用A型超声仪测量眼轴长度。实验4周,通过免疫组织化学染色和免疫荧光染色检测ALKBH5在豚鼠视网膜中的表达分布。采用实时荧光定量PCR和Western blot法检测豚鼠视网膜中ALKBH5 mRNA和蛋白表达情况。结果与正常对照组和自身对照组相比,实验2、3和4周,FDM组豚鼠近视屈光度明显增加,眼轴显著增长,差异均有统计学意义(均P<0.001)。免疫组织化学染色和免疫荧光染色显示,ALKBH5分布在视网膜神经纤维层、视锥视杆细胞层和视网膜色素上皮(RPE)层,其中以神经纤维层和RPE层为主。正常对照组、自身对照组和FDM组豚鼠ALKBH5蛋白相对荧光强度值分别为1.000±0.204、0.874±0.076和0.571±0.053,FDM组视网膜中ALKBH5蛋白荧光强度值明显小于正常对照组和自身对照组,差异均有统计学意义(t=4.069,P=0.006;t=5.176,P=0.014)。造模后4周,FDM组豚鼠视网膜中ALKBH5 mRNA和蛋白相对表达量明显低于正常对照组和自身对照组,差异均有统计学意义(均P<0.01)。结论FDM组豚鼠视网膜中m6A去甲基化酶ALKBH5表达下降,ALKBH5及相关m6A甲基化修饰可能参与了近视的发生和发展。 展开更多
关键词 近视 豚鼠 AlkB同源蛋白5 RNA去甲基酶 m6a甲基化 发病机制
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