续随子醇L713,283二萜类化合物溶液构象的分子模拟

将续随子醇L713,283二萜类化合物放入甲醇和氯仿两种不同极性的溶液中,分别进行长时间的分子动力学模拟。结果表明,续随子醇L713,283二萜类化合物在氯仿溶液中更稳定,构象波动幅度更小;续随子醇L713,283二萜类化合物五元环和十一元环侧链上的O71及O15与甲醇羟基所形成的较稳定氢键是其易溶于含氧有机溶剂的重要驱动力。基于续随子醇L713,283二萜类化合物在氯仿溶液中的3个代表性构象,用密度泛函理论优化获得它们的稳定构象、静电势电荷及键参数。模拟结果与试验吻合较好,为基于配体结构的药物分子设计提供了理论基础。

红曲红素的分子动力模拟及其量化计算

采用分子力学及分子动力学理论,分子模拟红曲红素的化学结构,得到1 atm,298.15 K时的优势构象及其能量(-1 245.278 kcaL/mol)。应用密度泛函理论的量化计算,研究分子的电荷分布,结果表明,C1、C3、C4、C5、C6、C7、C9、C10、C11、C12、O21组成的共扼体系所含净电荷数为-0.418 45,约占分子总负电荷数的14.3%;正电荷主要分布于C3、C16、C19,其电荷数分别为0.129 57、0.116 4、0.156 964。借助理论计算可推测红曲红素分子有3个反应活性部位,即由C19-O20-O28-C2组成的内酯基,以及C3-O21、C16-O17构成的2对羰基;并解释了红曲红素分子的衍生化机理,为红曲红素衍生物的进一步开发提供理论指导。