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四倍体野生种花生A.monticola全基因组SSR的开发与特征分析 被引量:11
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作者 王玉龙 黄冰艳 +7 位作者 王思雨 杜培 齐飞艳 房元瑾 孙子淇 郑峥 董文召 张新友 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2019年第15期2567-2585,共19页
【目的】通过对四倍体野生种花生Arachis monticola(AABB,2n=4x=40)全基因组SSR位点搜索,研究其全基因组SSR分布特征及规律,开发并验证其全基因组SSR引物,为花生属植物遗传进化分析及重要性状分子标记开发提供依据。【方法】在华大基因G... 【目的】通过对四倍体野生种花生Arachis monticola(AABB,2n=4x=40)全基因组SSR位点搜索,研究其全基因组SSR分布特征及规律,开发并验证其全基因组SSR引物,为花生属植物遗传进化分析及重要性状分子标记开发提供依据。【方法】在华大基因GigaScience数据库下载A.monticola全基因组序列,并利用生物信息学软件MISA进行SSR位点搜索,Primer 3进行引物设计,通过电子PCR进行单位点SSR分析,并随机合成100对SSR引物验证通用性。【结果】SSR在四倍体野生种花生A.monticola基因组上共搜索到SSR位点676 878个,平均每3.8 kb就会出现一个SSR,分布于5 127条scaffold中,单核苷酸至六核苷酸均有分布,且数量上差异较大,以单碱基、二碱基、三碱基为主,三者占SSR总数的94.28%,其中单碱基重复数量最多,占46.71%,密度最高;六核苷酸重复数目最少,分布最稀疏。大多数SSR分布在基因间区,基因区SSR多分布于内含子区域;全基因组共鉴定出395个不同的重复基元,其中A亚基因组342种,B亚基因组356种;A/T是最丰富的重复基元;在1—6个核苷酸的重复基元中,数量最多的依次是A/T、AT/AT、AAT/ATT,AAAT/ATTT、AAAAT/ATTTT、AAAAAT/ATTTTT;整体来看,重复基元的重复次数多集中在50次以内,不同类型的motif的重复次数差异很大;同一种类型重复基元的SSR位点,随着motif重复次数增加,SSR的数量逐渐降低;B03染色体上SSR数量最多,A08染色体中SSR密度最高。A.monticola全基因组SSR比A.duranensis、A.ipaensis基因组SSR数量多,密度也更高,A.monticola单核苷酸重复最丰富,2个野生种二核苷酸数量最多。共设计出SSR引物192 303对,单位点SSR标记检出率50.35%,单点SSR标记在基因组上的分布呈现两端密集,中间稀疏的特点;随机合成的100对引物中,90对能在A. monticola中扩增出稳定清晰的条带,且在4份不同的花生基因组DNA中扩增目的条带表现出不同的特点。【结论】A.monticola基因组内SSR种类和数量丰富,单核苷酸至六核苷酸均有分布,单核苷酸重复基元数量最多,且最密,六核苷酸重复基元数量最少,出现频率最低,不同重复基元频数高低与核苷酸数量没有严格相关性,SSR多分布在基因间区,基因区内含子区域SSR数量最多;A.monticola A、B亚基因组具有其各自特异的重复基元类型;单个类型重复基元数量最多的均为AT富集的重复基元,而GC富集的重复基元相对较少;同一种类型重复基元的SSR位点,随着motif重复次数增加,SSR的数量逐渐降低;A.monticola全基因组SSR较2个二倍体野生种数量更多,密度也更高且重复基元分布规律不同;经过初步验证,开发的SSR引物在4份花生材料中表现出部分通用性。 展开更多
关键词 花生 ARACHIS monticola 全基因组序列 SSR位点 基序
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甘肃民勤连古城自然保护区2种鸟类新记录——石鸡Alectoris chukar、白背矶鸫Monticola saxatilis
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作者 赵多明 马存世 +4 位作者 张杰 贾斌斌 胡生新 高万林 李锐 《甘肃林业科技》 2016年第4期1-3,共3页
报道了甘肃民勤连古城国家级自然保护区的首次发现的石鸡Alectoris chukar和白背矶鸫Monticola saxatilis 2种鸟类新记录,为进一步开展该保护区鸟类资源调查研究奠定了基础。
关键词 石鸡 白背矶鸫 新记录 甘肃民勤连古城国家级自然保护区
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Assessing genetic diversity and structure of fragmented populations of eastern white pine(Pinus strobus)and western white pine(P.monticola)for conservation management 被引量:5
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作者 Melanie Mehes Kabwe K.Nkongolo Paul Michael 《Journal of Plant Ecology》 SCIE 2009年第3期143-151,共9页
Aims Many pine populations in Canada have fragmented distributions resulting from the effects of glaciations,overharvesting and white pine blister rust infections.Forest fragmentation can modify gene flow and reduce g... Aims Many pine populations in Canada have fragmented distributions resulting from the effects of glaciations,overharvesting and white pine blister rust infections.Forest fragmentation can modify gene flow and reduce genetic diversity.Selective logging can reduce the density of trees,thereby altering mating patterns and increasing inbreeding.The hypothesis of the present study is that forest fragmentation will not increase inbreeding and will have no effect on genetic diversity parameters in the Canadian Pinus moniticola and P.strobus populations targeted because of(i)the long life span of the pine species,(ii)outbreeding and self-incompatibility of P.monticola and P.strobus and(iii)wind pollination resulting in high gene flow among populations.We studied the genetic diversity of P.strobus across its range in Canada,and we completed a detailed analysis of the genetic structure of P.monticola populations from western Canada using microsatellites genetic markers.Methods Seed samples from 10 P.monticola populations and 10 P.strobus populations were collected from western and eastern Canada,respectively.The mother trees included in seed lots were representative of each stand.Genomic DNA extracted from each sample was amplified with microsatellite primers.The intra-and interpopulation genetic diversity parameters were assessed using Popgene and Genepop softwares and the genetic distances among populations within each species using the PowerMarker software. 展开更多
关键词 Pinus strobus Pinus monticola MICROSATELLITE genetic diversity forest fragmentation
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利用远缘杂交培育半匍匐密枝型高产花生新品系 被引量:5
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作者 彭振英 单雷 +7 位作者 田海莹 孟静静 郭峰 王兴军 张智猛 丁红 万书波 李新国 《中国油料作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第4期490-496,共7页
花生是我国重要的油料作物。为将野生花生的优异基因导入栽培花生,采用远缘杂交方法,将黑花生(A.hypogaeaL.)与野生花生A.monticola进行杂交,获得一个高产株系。该株系平均单株产量为普通花生的4倍,株型由亲本黑花生的直立、疏枝型转变... 花生是我国重要的油料作物。为将野生花生的优异基因导入栽培花生,采用远缘杂交方法,将黑花生(A.hypogaeaL.)与野生花生A.monticola进行杂交,获得一个高产株系。该株系平均单株产量为普通花生的4倍,株型由亲本黑花生的直立、疏枝型转变为半匍匐、密枝型。另外,该株系生育期稍长,花量大,花色深,荚果数量多,单枝有效结果范围大约20~25cm。不同株系间荚果果型差异明显,大部分株系果型与黑花生相似。种皮颜色由粉到紫各不相同。种子大小差异明显。研究认为利用半匍匐密枝株型培育高产花生品系(种)是可行的。 展开更多
关键词 黑花生(A.hypogaea L.) 野生花生(A.monticola) 远缘杂交 直立型 半匍匐密枝型 种皮颜色 高产
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宽口光唇鱼微卫星位点的筛选与特征分析 被引量:14
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作者 刘瑞成 张富铁 +2 位作者 但胜国 曹善茂 谭德清 《四川动物》 CSCD 北大核心 2013年第2期161-166,共6页
通过FIASCO法(Fast Isolation by AFLP Sequences Containing Repeats)筛选宽口光唇鱼Acrossocheilus monticola(Günter)基因组微卫星位点,利用生物素标记的寡核苷酸探针(AC)8、(CT)8、(GGT)8、(GATA)8和(GATT)7首次成功构建宽口... 通过FIASCO法(Fast Isolation by AFLP Sequences Containing Repeats)筛选宽口光唇鱼Acrossocheilus monticola(Günter)基因组微卫星位点,利用生物素标记的寡核苷酸探针(AC)8、(CT)8、(GGT)8、(GATA)8和(GATT)7首次成功构建宽口光唇鱼基因组微卫星富集文库。从文库中共筛选495个克隆测序,成功设计163对微卫星引物,经PCR扩增检测,获得了18个多态性微卫星标记。利用这18对多态性引物,分析了赤水河赤水市宽口光唇鱼种群的遗传多样性,数据显示:18对多态性微卫星引物的等位基因数为8~31个,平均等位基因数为19.6个,平均期望杂合度为0.8701,平均观测杂合度为0.8312,其中引物Am07、Am35、Am47、Am69、Am78和Am127显著偏离哈迪温伯格平衡(P<0.05),以上数据表明赤水河赤水市宽口光唇鱼种群的遗传多样性水平较高。筛选的微卫星标记对于宽口光唇鱼的遗传背景分析和生物种质资源的保护有重要作用。 展开更多
关键词 宽口光唇鱼 微卫星 特征分析 遗传多样性
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宽口光唇鱼胚胎发育的研究 被引量:20
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作者 严太明 何学福 贺吉胜 《水生生物学报》 CAS CSCD 北大核心 1999年第6期636-640,共5页
在涪江下游宽口光唇鱼的产卵时间为4—5月,自然产卵水温为17℃—23℃。产卵场位于底质为卵石和砾石的浅水滩,分散产卵,卵弱粘性,金黄色,沉性,卵径1.55—2.11mm,卵膜外径2.27-2.55mm。在水温19.5—21.2℃条件下,胚胎从受精到孵化出膜共历... 在涪江下游宽口光唇鱼的产卵时间为4—5月,自然产卵水温为17℃—23℃。产卵场位于底质为卵石和砾石的浅水滩,分散产卵,卵弱粘性,金黄色,沉性,卵径1.55—2.11mm,卵膜外径2.27-2.55mm。在水温19.5—21.2℃条件下,胚胎从受精到孵化出膜共历时56h30min,初孵仔鱼全长6.0-6.2mm,肛后长/全长=24.14%,卵黄囊前部为膨大的球形,后部为均匀的棒状。 展开更多
关键词 胚胎发育 宽口光唇鱼 涪江
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氯化钠浓度对宽口光唇鱼精子活力的影响 被引量:21
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作者 罗芬 何学福 《四川动物》 CSCD 1999年第2期70-71,共2页
本文观察了不同氯化钠浓度对宽口光唇鱼Acrosochilusmonticola精子活力的影响,并进一步建立数学模型进行分析论证,得出结论:在氯化钠浓度0—051%的范围内,精子快速运动时间和寿命相对延长,但在浓度超... 本文观察了不同氯化钠浓度对宽口光唇鱼Acrosochilusmonticola精子活力的影响,并进一步建立数学模型进行分析论证,得出结论:在氯化钠浓度0—051%的范围内,精子快速运动时间和寿命相对延长,但在浓度超过051%,精子活动开始受到抑制,活动强度减弱,寿命缩短。 展开更多
关键词 宽口光唇鱼 氯化钠 浓度 精子活力
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我国蛇类几个种与亚种的讨论 被引量:11
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作者 赵尔宓 《苏州科技学院学报(自然科学版)》 CAS 1995年第2期36-39,共4页
本文对我国所产的云南竹叶青蛇、察隅烙铁头蛇、高原蝮雪山亚种和九龙颈槽蛇进行了分类的讨论。
关键词 云南竹叶青蛇 察隅烙铁头蛇 高原蝮雪山亚种 九龙颈槽蛇
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我国几种蛇的种下分类 被引量:17
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作者 赵尔宓 《四川动物》 CSCD 1995年第3期107-112,共6页
本文研究了海南闪鳞蛇、紫沙蛇、山烙铁头蛇与竹叶青蛇各地居群的鳞被特征,采用经典的亚种划分标准,描述了海南闪鳞蛇大陆亚种、紫沙蛇台湾亚种、山烙铁头蛇贡山亚种及竹叶青蛇海南亚种等4个新亚种。
关键词 蛇类 分类学 种下分类
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缙云山3种蛇半阴茎形态的研究
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作者 李振华 魏刚 +2 位作者 孔淋 肖训焰 张运明 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2010年第18期9847-9848,共2页
[目的]研究缙云山3种蛇的半阴茎形态。[方法]对重庆缙云山的3种蛇类,即山烙铁头、赤练蛇、白眉腹链蛇,采用外阴茎外翻较好的标本在双目解剖镜下进行描述和绘图,少数外翻不好的情况,采用人为方法将其外翻。[结果]山烙铁头有长度大于2 cm... [目的]研究缙云山3种蛇的半阴茎形态。[方法]对重庆缙云山的3种蛇类,即山烙铁头、赤练蛇、白眉腹链蛇,采用外阴茎外翻较好的标本在双目解剖镜下进行描述和绘图,少数外翻不好的情况,采用人为方法将其外翻。[结果]山烙铁头有长度大于2 cm的刺,肉眼清晰可见其形状且易数其数目,精沟也较明显;而赤练蛇、白眉腹链蛇的刺一般较小且多,肉眼一般无法辨认,且精沟不明显。[结论]为有毒蛇与无毒蛇的区分提供了参考。 展开更多
关键词 半阴茎 山烙铁头 赤练蛇 白眉腹链蛇
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江苏省鸟类一新记录──黄爪隼
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作者 唐伯平 吕士诚 《苏州科技学院学报(自然科学版)》 CAS 1995年第3期47-47,共1页
江苏省鸟类一新记录──黄爪隼唐伯平(江苏盐城师专生物系,盐城224002)吕士诚(江苏盐城国家自然保护区,盐城224333)1992年12月8日笔者于江苏省射阳县新洋港滩涂(33.6°N,120.5°E)捕获... 江苏省鸟类一新记录──黄爪隼唐伯平(江苏盐城师专生物系,盐城224002)吕士诚(江苏盐城国家自然保护区,盐城224333)1992年12月8日笔者于江苏省射阳县新洋港滩涂(33.6°N,120.5°E)捕获1只雌性黄瓜隼(Falconaumanni... 展开更多
关键词 TRIMERESURUS yunnanensis Ovophis zayuensis Golydius strauchii monticola Rhabdophis pentasupralabialis
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中国鸟类一新记录——大长嘴地鸫 被引量:1
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作者 罗平钊 王吉衣 +1 位作者 韩联宪 张国良 《四川动物》 CSCD 北大核心 2007年第3期489-489,F0002,共2页
关键词 大长嘴地鸫 新记录 中国
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中药混乱品种鉴别研究——7. 蕲蛇及其混淆品鉴别之二 被引量:1
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作者 李振荣 黄泽崧 +1 位作者 胡晓 常广敬 《河北医学院学报》 1990年第2期74-77,共4页
作者前已报道蕲蛇及其伪品滑鼠蛇的鉴别,又据报道有些省发现蕲蛇商品药材中混有烙铁头、山烙铁头两种蛇的干燥体。作者对这两种混淆品与蕲蛇在体表花纹、鳞片以及骨骼的形态与组织特征等方面进行了鉴别研究。
关键词 蕲蛇 烙铁头 山烙铁头 鉴别
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贵州茂兰自然保护区猎蝽昆虫种类调查 被引量:5
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作者 张雁泉 高景梅 《贵州林业科技》 2009年第2期35-38,共4页
文中记述了贵州省茂兰自然保护区的猎蝽6亚科32属49种,其中包括2个贵州新记录种,即:毛足菱猎蝽Isyndus pilosipes Reuter和锥头长头猎蝽Henricohahnia monticola Hsiao et Ren。
关键词 贵州茂兰 猎蝽科 名录
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