不同地理种群的亚洲小车蝗mtDNA ND1基因序列及其相互关系

测定了7个不同地理种群的亚洲小车蝗Oedaleus asiaticus(Bienko)、1个近缘种及2个外群种共31个样本的mtDNA ND1基因序列,比较其同源性,计算核苷酸组成,并以槌角蝗科的宽须蚁蝗Myrmeleotettix palpalis和斑腿蝗科的鼓翅皱膝蝗Angaracris barabensis作外群构建UPGMA和NJ分子系统树。在获得的亚洲小车蝗347bp的序列中,A+T约占76.6%,其中22个核苷酸位点存在变异(约占所测核苷酸的7.26%)。就每个氨基酸密码子来看,第3位点的A+T含量最高。28个个体共检测出18个单倍型,单倍型多样性指数(H)为0.218,核苷酸多样性指数(Pi)为0.0018。分化系数为0.0128～0.1573,基因流Nm均大于1;AMOVA分析显示种群间的差异有72.36%存在于群体内部,27.64%存在于群体之间。分子系统树显示,亚洲小车蝗mtDNA ND1序列不同个体之间有一定的分歧,形成不同的簇类关系,其分枝与地理分布没有直接的对应关系,但总体上看,这种簇类关系基本上呈平行分布,没有明显的地域性差别。

云南保山、普洱带绦虫mtDNA-ND1基因序列测定及分析

目的对云南保山、普洱地区带绦虫标本进行鉴定。方法选取带绦虫成虫节片,抽提虫体基因组DNA,PCR扩增mtDNA-ND1基因序列,并测序;结合GenBank中已知的亚洲带绦虫、牛带绦虫、猪带绦虫mtDNA-ND1基因序列,经DNA MAN软件处理后构建系统发育树状图与同源树状图。结果带绦虫系统发育树与同源树状图显示P1、P2、B3、B6、B7、ND与N2的同源性最近。B1、B2、B4、B5、YZ与Y1的同源性最近。ZD与Z3的同源性最近。结论云南保山存在亚洲带绦虫与牛带绦虫;普洱存在牛带绦虫。mtDNA-ND1基因序列可用于三种带绦虫的分类鉴定。

暗纹东方鲀线粒体ND1及其侧翼tRNA基因的克隆及序列分析

利用提取纯化的暗纹东方鲀(Takifugu fasciatus)肝脏的mtDNA为模板,按红鳍东方鲀(Takifugu rubripes)mtDNA序列设计合成特异引物进行PCR扩增,首次克隆并测定了暗纹东方鲀mtDNA的ND1亚基及其侧翼的tRNA基因。运用DNA分析软件,对暗纹东方鲀与GenBank中选取的几种同目的鱼类的相应序列进行比较分析,显示暗纹东方鲀与这些鱼类的各个相应基因具有较高的同源性。利用分子生物学相关软件,对暗纹东方鲀及与其同目的6种鱼的ND1基因序列建立NJ和MP分子进化树,并与传统的分类地位进行比较,结果表明与传统的分类地位基本吻合。3个tRNA基因含有69～71个碱基,推定了各个tRNA的二级结构,均具有较为典型的三叶草型结构。

核苷类似物对小鼠肝细胞线粒体DNA ND1和ND4的影响

目的探讨长期使用核苷类似物(NAs)是否导致小鼠肝脏线粒体DNA(mt DNA)ND1和ND4区损伤。方法 7周龄雌性Balb/c小鼠25只,采用简单随机分组法分为5组,对照组和4种核苷类似物组,每组各5只。实验组司他夫定(D4T)50 mg/kg,齐多夫定(AZT)100 mg/kg,拉米夫定(3TC)50 mg/kg和去羟肌苷(DDI)50 mg/kg,对照组为双蒸水,分别腹腔内注射,每周5次,连续3个月。留取各组肝组织,应用激光捕获显微技术获取肝细胞,对mt DNA ND1和ND4区克隆和测序。结果其余各组肝细胞的mt DNA ND4序列距离与参考序列的平均距离与对照组比较,差异均有高度统计学意义(P<0.01);AZT组肝细胞的mt DNA ND4平均d N与对照组比较,差异有统计学意义(P<0.05);肝细胞mt DNA ND1的序列距离与参考序列的平均距离,AZT组和3TC组序列距离与对照组比较,差异均有统计学意义(P<0.01);DDI组肝组织mt DNA ND1的平均d S与对照组比较,差异有统计学意义(P<0.05);AZT组和3TC组肝细胞mt DNA ND1的平均d S与对照组比较,差异均有统计学意义(P<0.05)。结论长期暴露于NAs可导致小鼠肝细胞mt DNA ND1和ND4区病变。