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夏南牛与13个黄牛群体mtDNA及微卫星DNA遗传多样性比较研究
被引量:
7
1
作者
王彦环
吴慧
+2 位作者
房兴堂
陈宏
张春雷
《家畜生态学报》
北大核心
2018年第3期17-23,共7页
采用mtDNA和微卫星DNA两种标记方法,对夏南牛与13个黄牛群体的179个个体进行遗传多样性和群体间的亲缘关系及母系起源分析。通过测定14个黄牛群体179条mtDNA D-loop区序列,共发现124个变异位点和60种单倍型,表明14个黄牛群体具有丰富的...
采用mtDNA和微卫星DNA两种标记方法,对夏南牛与13个黄牛群体的179个个体进行遗传多样性和群体间的亲缘关系及母系起源分析。通过测定14个黄牛群体179条mtDNA D-loop区序列,共发现124个变异位点和60种单倍型,表明14个黄牛群体具有丰富的遗传多样性。夏南牛群体mtDNA D-loop区序列共发现49个变异位点和7种单倍型,单倍型多样度(Hd)为0.732±0.017,其单倍型多样度较中国地方牛种低,中国黄牛具有更丰富的遗传多样性。通过测定9个具有高度多态性的微卫星座位的等位基因数(Na)、平均杂合度(H)和多态信息含量(PIC),表明9个微卫星位点在60个夏南牛个体中共发现47个等位基因,平均每个位点的有效等位基因数为1.229~6.584。总群体的PIC和H分别为0.608~0.798和0.695~0.837,夏南牛的PIC和H分别为0.692和0.715,夏南牛的遗传多样性较中国黄牛低,中国黄牛群体的遗传多样性高于外来牛种,这一结果和群体间mtDNA D-loop区研究结果一致。构建的NJ系统进化树显示14个黄牛群体主要起源于普通牛和瘤牛,夏南牛受瘤牛的影响更大,具有瘤牛和普通牛的种质特征。本研究为夏南牛遗传资源的保护、合理利用和选育改良提供了理论依据。
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关键词
夏南牛
MTDNA
D-LOOP
微卫星DNA
遗传多样性
母系起源
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职称材料
题名
夏南牛与13个黄牛群体mtDNA及微卫星DNA遗传多样性比较研究
被引量:
7
1
作者
王彦环
吴慧
房兴堂
陈宏
张春雷
机构
江苏师范大学细胞与分子生物学研究所生命科学学院
出处
《家畜生态学报》
北大核心
2018年第3期17-23,共7页
基金
国家自然科学基金项目(31772558
31472077)
文摘
采用mtDNA和微卫星DNA两种标记方法,对夏南牛与13个黄牛群体的179个个体进行遗传多样性和群体间的亲缘关系及母系起源分析。通过测定14个黄牛群体179条mtDNA D-loop区序列,共发现124个变异位点和60种单倍型,表明14个黄牛群体具有丰富的遗传多样性。夏南牛群体mtDNA D-loop区序列共发现49个变异位点和7种单倍型,单倍型多样度(Hd)为0.732±0.017,其单倍型多样度较中国地方牛种低,中国黄牛具有更丰富的遗传多样性。通过测定9个具有高度多态性的微卫星座位的等位基因数(Na)、平均杂合度(H)和多态信息含量(PIC),表明9个微卫星位点在60个夏南牛个体中共发现47个等位基因,平均每个位点的有效等位基因数为1.229~6.584。总群体的PIC和H分别为0.608~0.798和0.695~0.837,夏南牛的PIC和H分别为0.692和0.715,夏南牛的遗传多样性较中国黄牛低,中国黄牛群体的遗传多样性高于外来牛种,这一结果和群体间mtDNA D-loop区研究结果一致。构建的NJ系统进化树显示14个黄牛群体主要起源于普通牛和瘤牛,夏南牛受瘤牛的影响更大,具有瘤牛和普通牛的种质特征。本研究为夏南牛遗传资源的保护、合理利用和选育改良提供了理论依据。
关键词
夏南牛
MTDNA
D-LOOP
微卫星DNA
遗传多样性
母系起源
Keywords
Xianan cattle
mtdnand-loop
microsatellite DNA
genetic diversity
maternal origin
分类号
S811.5 [农业科学—畜牧学]
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题名
作者
出处
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被引量
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1
夏南牛与13个黄牛群体mtDNA及微卫星DNA遗传多样性比较研究
王彦环
吴慧
房兴堂
陈宏
张春雷
《家畜生态学报》
北大核心
2018
7
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