香蕉枯萎病菌线粒体小亚基(mtSSU)rDNA的克隆及序列分析

为探讨镰刀菌属的系统发育情况,采用真核生物线粒体中核糖体小亚基基因(mtSSU rDNA)的通用引物,PCR扩增了2株不同生理小种(小种4和小种1)的香蕉枯萎病菌mtSSU rDNA序列,并对PCR产物进行了序列分析,同时利用MEGA4软件中的Neighbor-joining(N-J)法,对2个样品序列以及GenBank中登陆的镰刀菌属不同种及尖镰孢种不同专化型的mtSSU rDNA序列,构建聚类分析树状图。结果显示,所测的2株香蕉枯萎病菌mtSSU rDNA全长685bp,两者之间同源性为99.70%。聚类分析表明,所测的2个样品和Fusarium oxysporumf.sp.cubense专化型在一个聚类组中,镰刀菌不同种及同种不同专化型间的mtSSU rDNA序列变异较大,说明该菌不同种及同种不同专化型间的遗传多样性丰富。

我国旋毛虫地理株遗传变异与系统发生关系的研究

目的通过分析旋毛虫线粒体基因分子标记,研究我国旋毛虫地理株间的遗传变异与系统发生关系。方法应用旋毛虫线粒体核糖体小亚基DNA(mitochondrial small subunit ribosomal DNA,mtSSU)和线粒体细胞色素氧化酶Ⅰ基因(mitochondria cytochrome coxidase,COΙ)为分子标记,分别对我国7个旋毛虫地理株扩增后进行双向测序,利用DNAMAN软件将测序结果和GenBank中相应序列进行比对研究,并使用MEGA4.0程序包构建系统进化树。结果 PCR对7个旋毛虫地理株分别扩增出了649bp(mtSSU)和419bp(COΙ)的DNA片段,7个地理株的DNA片段与GenBank中T.spiralis的相应片段相比存在一定差异,其中mtSSU基因有4个变异位点(248、293、537和539位),而COI基因仅存在2个变异(273和382位),所有变异均为T-C或C-T的转换;进化树显示南阳株和云南株位于比较近的分枝,而西安株、广西株及西藏株亲缘关系较近。结论我国7个旋毛虫地理株的遗传变异较小,亲缘关系较近。

中国三省松口蘑遗传多样性分析

采用ITS、mt SSU rDNA的V4和V9区对采自西藏、吉林和云南3个省份30个地区的59个样本进行物种鉴定,并运用IGS1-RFLP和RAPD进行遗传多样性分析。结果表明:所有样本均为松口蘑(Tricholoma matsutake),松口蘑ITS序列存在明显的地域性;IGS1-RFLP分析表明,吉林样本属于A型,西藏和云南样本是2种新类型;聚类分析表明,在相似系数为0.702水平时将供试样本分为3大类群;我国松口蘑具有丰富的遗传多样性,并且自然种群遗传多样性地域性明显。

利用酵母双杂交筛选与PtCDD相互作用的生物大分子

为了筛选与杨树Ca2+依赖型DNase PtCDD相互作用的蛋白基因,构建杨树形成层区域的cDNA文库,以PtCDD为靶蛋白,通过酵母双杂交在已构建的文库中筛选得到两个片段,AD1-10和AD12-2,分别是银桦线粒体的核糖体RNA小亚基基因(mtSSU)和杨树叶片在干旱胁迫条件下得到的一种EST。利用凝胶阻滞实验在体外验证了PtCDD蛋白与AD1-10的结合作用,初步说明PtCDD可能对线粒体所参与的杨树细胞程序化死亡(PCD)有一定的调控作用。

中国肉盘衣属地衣新记录种

在对海南省叶生地衣资源的调查研究中发现了中国肉盘衣属地衣新记录种:乳头肉盘衣[Fellhanera mastothallina (Vain.)Lücking&Sérus.],描述了其形态学、解剖学及化学特征,提供了显微结构照片。主要识别特征为:地衣体壳状,布满灰绿色乳头状颗粒,子囊盘棕色,囊盘被外部由疏丝组织构成,子囊孢子(3~)7隔,26~36μm×2~3μm,呈末端变窄的细棍棒状。基于线粒体小亚基(mtSSU)序列构建的系统发育树表明该种与本属模式种F. fuscatula (Müll. Arg.) Vězda具有较近的亲缘关系。编制了中国该属地衣的分种检索表。