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健康女性阴道乳酸杆菌MLST分型及其对宫颈癌细胞抑制作用的体外实验研究 被引量:1
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作者 王克迪 苏建荣 《现代检验医学杂志》 CAS 2023年第1期100-106,共7页
目的通过检测健康女性阴道乳酸杆菌(Lactobacillus)对宫颈癌细胞株CaSki细胞体外增殖的影响,并进行多位点序列分型(multi-locus sequence typing,MLST),探讨不同基因型乳酸杆菌对宫颈癌细胞作用的差异性。方法收集2021年1~2月就诊于北... 目的通过检测健康女性阴道乳酸杆菌(Lactobacillus)对宫颈癌细胞株CaSki细胞体外增殖的影响,并进行多位点序列分型(multi-locus sequence typing,MLST),探讨不同基因型乳酸杆菌对宫颈癌细胞作用的差异性。方法收集2021年1~2月就诊于北京友谊医院健康体检中心的健康育龄期妇女生殖道分泌物212份,分离培养鉴定乳酸杆菌,并制备乳酸杆菌提取液。对分离的乳酸杆菌进行多位点序列分型,并采用噻唑蓝(methyl thiazolyl tetrazolium,MTT)比色法检测不同乳酸杆菌菌株提取液对宫颈癌CaSki细胞的抑制作用,探讨不同基因分型的菌株对细胞抑制作用的差异性。结果该研究共分离乳酸杆菌172株,其中卷曲乳杆菌(L.crispatus)88株,格氏乳杆菌(L.gasseri)46株,詹氏乳杆菌(L.jensenii)15株,干酪乳酸杆菌(L.casei)7株,德氏乳杆菌(L.delbrueckii)8株,植物乳杆菌(L.plantarum)5株,唾液乳杆菌(L.salivarius)2株和弯曲乳杆菌(L.curvatus)1株。88株L.crispatus共分出11个ST型,其中ST1最多,56株,占总数的63.64%。46株L.gasseri共分出10个ST型,其中ST15最多,20株,占总数的43.48%。比较不同菌种乳酸杆菌对CaSki细胞抑制率发现,MRS和MRL对细胞的抑制率均值±标准差分别为7.50%±0.26%和19.55%±1.23%。L.crispatus和L.gasseri对细胞的抑制率均值±标准差分别为29.6%±13.2%和32.1%±13.2%。独立样本t检验显示L.crispatus和L.gasseri对CaSki细胞的抑制作用显著高于MRL组,差异有统计学意义(t=7.735,6.922,均P<0.001)。单因素方差分析显示gyrB,gpmA,lepA和recA不同分型等位基因的细胞抑制率不同,差异有统计学意义(F=4.596~5.007,均P<0.05)。结论乳酸杆菌提取液对宫颈癌CaSki细胞有显著的抑制作用,不同等位基因分型的乳酸杆菌对宫颈癌细胞的抑制率不同。 展开更多
关键词 乳酸杆菌 宫颈癌 细胞毒性作用 多位点序列分型(mlst)
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三类禽源碳青霉烯类耐药大肠杆菌流行病学调查及全基因组测序分析 被引量:5
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作者 李翠函 曲志娜 +12 位作者 高玉斌 李彦 王娟 段笑笑 王琳 张喜悦 赵格 黄秀梅 赵建梅 张青青 王君玮 黄保续 刘俊辉 《中国畜牧兽医》 CAS CSCD 北大核心 2023年第4期1653-1662,共10页
【目的】研究不同禽源碳青霉烯类耐药大肠杆菌(carbapenem-resistant Escherichia coli,CREC)的群间分布、耐药特征及菌株间亲缘关系,为阻断CREC的潜在危害提供技术支持。【方法】在胶东地区采集肉鸡、蛋鸡、水禽三类家禽泄殖腔拭子1131... 【目的】研究不同禽源碳青霉烯类耐药大肠杆菌(carbapenem-resistant Escherichia coli,CREC)的群间分布、耐药特征及菌株间亲缘关系,为阻断CREC的潜在危害提供技术支持。【方法】在胶东地区采集肉鸡、蛋鸡、水禽三类家禽泄殖腔拭子1131份,利用选择性分离培养、质谱鉴定、PCR、微量肉汤稀释法、多位点序列分型(MLST)及全基因组测序(WGS)等方法进行CREC菌株鉴定与分析。【结果】共分离出364株bla NDM基因阳性的CREC菌株,分离率为32.18%,阳性场总体占比为76.32%,肉鸡场和个体阳性率均最高,分别为93.33%和55.56%。三类禽源菌株均多重耐药,83.65%菌株对8类及以上药物同时耐药,对多数测试药物耐药率在80%以上。肉鸡多重耐药问题最严重,水禽次之,蛋鸡相对较轻。45株全基因组测序的CREC菌株携带12类52种耐药基因,4种bla NDM变异体,以bla NDM-5(77.78%)为主,三类家禽对同类耐药基因的检出率存在差异。共检出46种ST型,多样性比为44.23%。三类家禽CREC菌株间单核苷酸多态性(SNPs)差异位点为82~71307个,且携带的优势型不同。【结论】携带bla NDM的CREC在不同家禽养殖场尤其是肉鸡场广泛存在,以bla NDM-5亚型最为常见,对多种抗菌药普遍耐药,且携带大量耐药基因,以质粒传播为主。CREC菌株在三类家禽中呈多样化分布,且多数菌株间亲缘关系相差较远。提示应针对不同动物群体,加强监测和影响因素研究,以降低CREC的潜在风险。 展开更多
关键词 家禽 碳青霉烯类耐药大肠杆菌(CREC) 群间分布 多位点序列分型(mlst) 全基因组测序(WGS)
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浙江省副溶血性弧菌O3∶K6血清型菌株多位点序列分型研究 被引量:6
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作者 梅玲玲 龚璞 +2 位作者 占利 张俊彦 张云怡 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第3期278-281,共4页
目的掌握浙江省不同来源的副溶血性弧菌O3∶K6血清型菌株的分子分型特征,为副溶血性弧菌食源性疾病的预防控制提供技术支持。方法选择副溶血性弧菌的7个管家基因dnaE、gyrB、recA、dtdS、pntA、pyrC及tnaA,对62株不同来源的副溶血性弧... 目的掌握浙江省不同来源的副溶血性弧菌O3∶K6血清型菌株的分子分型特征,为副溶血性弧菌食源性疾病的预防控制提供技术支持。方法选择副溶血性弧菌的7个管家基因dnaE、gyrB、recA、dtdS、pntA、pyrC及tnaA,对62株不同来源的副溶血性弧菌O3∶K6血清型菌株样本进行PCR扩增、测序,Chromas软件和DNA Star软件分析,核酸序列上传至MLST数据库进行比对,获得每株菌的序列型,绘制多位点序列分型遗传进化树并进行亲缘性分析。结果 62株副溶血性弧菌O3∶K6血清型菌株中,59株菌为ST-3型(3,4,19,4,29,4,22),1株菌为ST-121型(3,2,82,52,4,78,66),1株菌为新的ST型(5,10,34,27,77,49,23),1株菌仅gyrB基因第562位点由C突变为T,其余基因序列与ST4型(3,5,22,12,20,22,25)一致。结论浙江省副溶血性弧菌O3∶K6血清型菌株的主要MLST型别为ST-3型。 展开更多
关键词 副溶血性弧菌 03 K6血清型 多位点序列分型(mlst)
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浙江5个地区2010~2012年沙门菌流行特征及分子分型研究 被引量:11
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作者 杨燕 孙长贵 +2 位作者 陈晓 余斐 陈瑜 《临床检验杂志》 CAS CSCD 北大核心 2013年第8期621-624,共4页
目的了解浙江部分地区沙门菌感染的流行病学特点,为防治提供科学依据。方法收集浙江省杭州、宁波、嘉兴、衢州、绍兴5个地区2010~2012年临床分离的沙门菌94株,对其进行血清分型、K-B纸片法药物敏感性试验。用二重PCR法检测毒力岛基因inv... 目的了解浙江部分地区沙门菌感染的流行病学特点,为防治提供科学依据。方法收集浙江省杭州、宁波、嘉兴、衢州、绍兴5个地区2010~2012年临床分离的沙门菌94株,对其进行血清分型、K-B纸片法药物敏感性试验。用二重PCR法检测毒力岛基因invA和毒力质粒基因spvB,并进行多位点序列分型;用多位点序列分型软件Dna SP version 5.0对7个管家基因进行核苷酸多态性分析。结果 94株沙门菌共测出18种血清型,其中肠炎沙门菌29株(30.9%),鼠伤寒沙门菌27株(28.7%),甲型副伤寒沙门菌10株(10.6%),纽波特沙门菌和伊鲁慕沙门菌各5株(5.3%),猪霍乱沙门菌4株(4.3%),伤寒沙门菌和婴儿沙门菌各2株(2.1%),其余10种血清型均各分离到1株。94株沙门菌耐药率最高的为氨苄西林47株(50.0%),耐药率最低的为头孢吡肟1株(1.1%);非耐药菌株占所有菌株的46.8%(44/94)。毒力岛基因invA和毒力质粒基因spvB阳性率分别为97.9%(92/94)和45.7%(43/94)。94株沙门菌经MLST分析分为24种ST型,以ST11型菌株最多,占29.8%(28/94);上报网站http://mlst.ucc.ie/mlst/新ST型5型,分别为ST1746、ST1747、ST1748、ST1749和ST1750。结论浙江5个地区临床分离的沙门菌以肠炎沙门菌和鼠伤寒沙门菌为主,质粒毒力基因spvB在这两种主要血清型中有较多的分布。94株沙门菌的耐药情况尚好,非耐药株数量接近半数。血清分型与多位点序列分型存在一定的联系。 展开更多
关键词 沙门菌属 血清分型 多位点序列分型 流行病学特征
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非妊娠成人无乳链球菌感染临床特点及分子流行病学研究进展 被引量:2
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作者 刘婧娴 陈星月 +1 位作者 赵晶 刘瑛 《检验医学》 CAS 2022年第8期793-797,共5页
无乳链球菌(Streptococcus agalactiae)是引起新生儿和孕产妇侵袭性感染的主要病原菌之一。近年来,非妊娠成人无乳链球菌感染率显著上升。目前,非妊娠成人无乳链球菌感染的临床特点和分离自这一人群的无乳链球菌分子流行病学特点尚不明... 无乳链球菌(Streptococcus agalactiae)是引起新生儿和孕产妇侵袭性感染的主要病原菌之一。近年来,非妊娠成人无乳链球菌感染率显著上升。目前,非妊娠成人无乳链球菌感染的临床特点和分离自这一人群的无乳链球菌分子流行病学特点尚不明确,文章对其进行综述,以期为此类疾病的诊治及预防控制提供参考。 展开更多
关键词 无乳链球菌 非妊娠成人 临床特点 分子流行病学 荚膜血清型 多位点序列分型
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2017—2018年我国部分地区牛支原体的分离鉴定及多位点序列分型 被引量:12
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作者 康浩然 刘重阳 +3 位作者 于勇 张俊杰 潘子豪 姚火春 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第9期1659-1665,共7页
旨在分离流行于我国部分地区的牛支原体,掌握我国牛支原体的种群结构和进化关系。本研究于2017-2018年采集黑龙江、河北、江苏、安徽、内蒙古等地规模化养殖场327份病牛样品,分离鉴定出20株牛支原体。采用adh1、gltX、gpsA、gyrB、pta2... 旨在分离流行于我国部分地区的牛支原体,掌握我国牛支原体的种群结构和进化关系。本研究于2017-2018年采集黑龙江、河北、江苏、安徽、内蒙古等地规模化养殖场327份病牛样品,分离鉴定出20株牛支原体。采用adh1、gltX、gpsA、gyrB、pta2、tdk、tkt 7个管家基因对分离株进行多位点序列分型(MLST),分析我国牛支原体种群结构并结合GenBank数据库公布的85株牛支原体进行最小生成树(MST)分析。结果显示,MycbPAN005为ST-6型,其余菌株均为ST-10型,分析表明ST-10型为我国的主要流行型。我国牛支原体属于CC1克隆复合体,且除ST-6型外,ST-32、ST-26和ST-43型与ST-10型仅有一个管家基因存在差异,表明我国牛支原体种群结构相对稳定单一。ST-6型中国株MycbPAN005为国内首次报道,可为牛支原体的流行病数据库研究提供新的资料。 展开更多
关键词 牛支原体 分离鉴定 多位点序列分型 最小生成树分析
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犊牛肺炎多杀性巴氏杆菌荚膜血清型和基因型的研究 被引量:6
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作者 梅朱园 邬琴 +7 位作者 柴迎锦 顾晓晓 陶乔孝慈 钟发刚 韩猛立 黄新 周霞 张星星 《中国动物传染病学报》 CAS 北大核心 2019年第5期44-49,共6页
从石河子及附近地区规模化牛场死于肺炎的犊牛肺脏中共分离8株多杀性巴氏杆菌(Pasteurella multocida,Pm),为了确定分离菌株的血清型和基因型,分别进行了多重荚膜特异基因PCR检测、脂多糖多重PCR(LPS-m PCR)分型和多位点序列分型(MLST)... 从石河子及附近地区规模化牛场死于肺炎的犊牛肺脏中共分离8株多杀性巴氏杆菌(Pasteurella multocida,Pm),为了确定分离菌株的血清型和基因型,分别进行了多重荚膜特异基因PCR检测、脂多糖多重PCR(LPS-m PCR)分型和多位点序列分型(MLST)鉴定和分析。结果显示8株分离菌中,7株为荚膜A型,1株为荚膜B型;LPS-m PCR结果显示其中7株菌为L2,1株为L3基因型;MLST技术将8株细菌中的7株分为ST1型,1株分为ST44型,且两者亲缘关系较近。结果表明8株Pm以荚膜血清A型为主,根据LPS基因特异性将其分为2个基因型,基于管家基因的MLST将8株Pm分为两种ST型。 展开更多
关键词 多杀性巴氏杆菌 荚膜分型 脂多糖多重PCR 多位点序列分型
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婴幼儿配方羊乳粉生产环节蜡样芽孢杆菌分离株多位点序列分型分析 被引量:2
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作者 刘阳 葛武鹏 +5 位作者 张静 郭春锋 梁秀珍 王智 张兴吉 王瑞 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2018年第14期166-171,共6页
为探讨我国婴幼儿配方羊乳粉生产环节阳性分离株的遗传多样性,并将其基因序列与已报道的乳源分离株的基因序列进行比对,确立其特征序列,为婴幼儿配方食品生产体系溯源提供依据,为探究其致病机理和有效防控提供参考依据。实验选取glpF、... 为探讨我国婴幼儿配方羊乳粉生产环节阳性分离株的遗传多样性,并将其基因序列与已报道的乳源分离株的基因序列进行比对,确立其特征序列,为婴幼儿配方食品生产体系溯源提供依据,为探究其致病机理和有效防控提供参考依据。实验选取glpF、gmk、ilvD、pta、pur、pycA、tpi 7个管家基因构建多位点序列分析分型方案,鉴定经随机扩增多态性DNA分型得到的42株Bacillus cereus的序列类型。结果表明:42株B.cereus分为7个序列类型(sequence type,ST),分别为ST-770(4.8%,2/42)、ST-1000(71.4%,30/42)、ST-1084(9.5%,4/42)、ST-1348(2.4%,1/42)、ST-1349(2.4%,1/42)、ST-1350(2.4%,1/42)和ST-1351(7.1%,3/42);所有分离株被识别为205、142、23三个不同克隆谱系,2个单态群(ST-770和ST-1351)和2个独株(ST-1348和ST-1349);发现4个新的ST型和4个新的等位基因,已上传至国际数据库得到新的序列号和等位基因号,分别为ST-1348、ST-1349、ST-1350、ST-1351和glp-253、glp-254、ilv-277、pyc-199。 展开更多
关键词 蜡样芽孢杆菌(Bacillus cereus) 婴幼儿配方羊乳粉 多位点序列分析分型(mlst) 基因序列(ST)
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江苏地区奶牛场bla NDM阳性大肠杆菌的分子流行病学 被引量:7
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作者 王警 张雪寒 +3 位作者 郭芸芸 张碧成 吴庆侠 何孔旺 《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2020年第2期391-397,共7页
为了调查江苏地区奶牛场大肠杆菌中blaNDM基因的分子流行病学特征。从江苏部分地区3个奶牛场采集样品134份,使用PCR和测序的方法筛选blaNDM阳性大肠杆菌,同时对其进行超广谱β-内酰胺酶类基因的检测,采用药敏试验检测blaNDM阳性大肠杆菌... 为了调查江苏地区奶牛场大肠杆菌中blaNDM基因的分子流行病学特征。从江苏部分地区3个奶牛场采集样品134份,使用PCR和测序的方法筛选blaNDM阳性大肠杆菌,同时对其进行超广谱β-内酰胺酶类基因的检测,采用药敏试验检测blaNDM阳性大肠杆菌对19种常用抗生素的敏感性,通过多位点序列分型(MLST)和脉冲场凝胶电泳(PFGE)对携带NDM基因的大肠杆菌进行亲缘关系分析,通过质粒结合试验验证blaNDM基因的可转移性。结果显示,从134份奶牛场样品中共分离15株blaNDM阳性大肠杆菌,包括NDM-1和NDM-52种变体。15株blaNDM阳性大肠杆菌对多种抗生素均呈现不同程度的耐药,奶牛场15株blaNDM阳性大肠杆菌包括7种ST型,分别是ST410、ST846、ST206、ST101、ST1642、ST3076、ST1626,同一种ST型在粪便样品和环境样品中同时存在,表明相同ST型blaNDM阳性大肠杆菌可在动物与环境间相互传播。PFGE试验结果表明,15株blaNDM阳性大肠杆菌可以分为11个簇,同一样品的分离株倾向于相同的簇,在比较小的范围内存在PFGE图谱相同的现象;对15株菌株的结合子进行blaNDM基因的转移性试验结果表明,15株大肠杆菌的blaNDM耐药基因均通过质粒结合转移至受体菌J53。表明,blaNDM阳性大肠杆菌在江苏省部分地区奶牛场中流行相对较为严重,存在多重耐药现象,推测blaNDM基因主要通过质粒结合转移的方式进行水平传播,这为食品源耐药菌的监测及风险评估提供了依据。 展开更多
关键词 NDM耐药基因 大肠杆菌 多位点序列分型 药敏试验
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婴幼儿食品源阪崎克罗诺杆菌的3种分型方法 被引量:5
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作者 杨秋萍 阎彦霏 +4 位作者 张艳 曹晨阳 盛焕精 崔生辉 杨保伟 《中国食品学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2022年第5期358-366,共9页
阪崎克罗诺杆菌污染婴幼儿食品可能导致新生儿和婴幼儿脑膜炎、败血症和坏死性小肠结肠炎,对其健康造成严重威胁。采用脉冲场凝胶电泳(PFGE)、多位点序列分型(MLST)和肠杆菌间保守重复序列PCR(ERIC-PCR)对分离于婴幼儿配方乳粉、米粉和... 阪崎克罗诺杆菌污染婴幼儿食品可能导致新生儿和婴幼儿脑膜炎、败血症和坏死性小肠结肠炎,对其健康造成严重威胁。采用脉冲场凝胶电泳(PFGE)、多位点序列分型(MLST)和肠杆菌间保守重复序列PCR(ERIC-PCR)对分离于婴幼儿配方乳粉、米粉和辅食中的阪崎克罗诺杆菌进行分子分型,计算3种分型方法的辛普森多样性指数(DI)值,评价3种方法的分型效率,以便精确和快速开展阪崎克罗诺杆菌流行病学研究。PFGE、MLST和ERIC-PCR可分别将37株阪崎克罗诺杆菌分为35个PFGE基因型、28个ERIC-PCR型和23个序列(ST)型,分型结果的DI值分别为99.55%,96.40%和98.05%。3种方法对阪崎克罗诺杆菌均具有较高的分型能力,其中PFEG分型能力最高,分型效率最佳。 展开更多
关键词 阪崎克罗诺杆菌 脉冲场凝胶电泳 多位点序列分型 肠杆菌间保守重复序列PCR
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MALDI-TOF MS技术快速鉴定肺炎克雷伯菌效果及其耐药性分析
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作者 姜瑜 《齐齐哈尔医学院学报》 2019年第22期2855-2858,共4页
目的观察基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)技术快速鉴定肺炎克雷伯菌的效果,并分析肺炎克雷伯菌的耐药性。方法收集2018年6月—2019年5月本院3564例患者痰液或咽拭子及粪便或肛拭子送检标本中分离的89株肺炎克雷伯菌菌株... 目的观察基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)技术快速鉴定肺炎克雷伯菌的效果,并分析肺炎克雷伯菌的耐药性。方法收集2018年6月—2019年5月本院3564例患者痰液或咽拭子及粪便或肛拭子送检标本中分离的89株肺炎克雷伯菌菌株,均经16S rDNA基因序列分析证实,采用MALDI-TOF MS对其进行分离鉴定,并分析肺炎克雷伯菌耐药性。结果MALDI-TOF MS对肺炎克雷伯菌鉴定正确率为96.63%,与16S rDNA基因序列分析结果比较差异不具有统计学意义(P>0.05)。肺炎克雷伯菌主要分布在秋季(26.97%)和冬季(42.70%),夏季(12.36%)最少。肺炎克雷伯菌对美罗培南、亚胺培南、庆大霉素、左氧氟沙星、哌拉西林/他唑巴坦敏感性强,依次为97.75%、95.51%、89.89%、83.15%、80.90%,对哌拉西林、头孢唑林、头孢呋辛、头孢他啶耐药性强,依次为95.51%、69.66%、51.69%、34.83%。呼吸道分离肺炎克雷伯菌对氨曲南、头孢他啶耐药性高于肠道,差异具有统计学意义(P<0.05)。结论MALDI-TOF MS技术可快速鉴定肺炎克雷伯菌,且结果准确;肺炎克雷伯菌对美罗培南、亚胺培南敏感性最强,对哌拉西林耐药性最强。 展开更多
关键词 基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱 脉冲场凝胶电泳 多位点序列分型 肺炎克雷伯菌
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一株单核细胞增生李斯特菌分离株的分子分型鉴定及其生物学特性 被引量:6
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作者 辛永萍 单颖 夏叶 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第5期1101-1109,共9页
从上海某羊养殖场获得了一株单核细胞增生李斯特菌分离株CMG47。为了确定该单核细胞增生李斯特菌分离株的分子分型,了解其生物学特性,本研究通过多重PCR对该菌株进行谱系和血清型分析,利用多位点序列分型(MLST)方法鉴定其分子分型。采用... 从上海某羊养殖场获得了一株单核细胞增生李斯特菌分离株CMG47。为了确定该单核细胞增生李斯特菌分离株的分子分型,了解其生物学特性,本研究通过多重PCR对该菌株进行谱系和血清型分析,利用多位点序列分型(MLST)方法鉴定其分子分型。采用PCR方法对主要毒力基因进行检测,并通过体外观察和荧光定量PCR对菌株溶脂溶血特性进行分析。将菌株通过腹腔注射ICR小鼠和静脉注射斑马鱼,测定其毒力。研究结果表明该分离株属于谱系Ⅰ,1/2b血清型;序列分型为ST619;携带prfA、inlA、inlB、plcA、plcB、mpl、actA、hly等主要毒力因子;体外无明显溶脂活性,溶血活性较弱;小鼠和斑马鱼试验均显示,该分离株属于强毒株,与强毒参考株EGDe的毒力相当(P>0.05)。该分离株的谱系/血清型为引起李斯特菌病的主要型别,拥有整套主要毒力因子,为单增李斯特菌强毒株。本研究为李斯特菌病散发病例的流行和传播特征分析提供了分子生物学基础,对建立健全李斯特菌监测体系和风险评估意义重大。 展开更多
关键词 单核细胞增生李斯特菌 多位点序列分型 毒力
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20株亚胺培南耐药肺炎克雷伯菌耐药机制及分子流行病学研究 被引量:2
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作者 冯福英 洪宇 +4 位作者 郑宗富 曾琦 张薇 罗湘湘 杨湘越 《临床检验杂志》 CAS CSCD 2015年第12期942-945,共4页
目的对20株亚胺培南耐药肺炎克雷伯菌耐药机制和分子流行病学进行研究。方法改良Hodge试验检测碳青霉烯酶表型;PCR法检测碳青霉烯酶、Amp C酶和超广谱β-内酰胺酶(ESBLs)耐药基因及整合子,并进行测序及BLAST比对确定基因型;脉冲场凝胶电... 目的对20株亚胺培南耐药肺炎克雷伯菌耐药机制和分子流行病学进行研究。方法改良Hodge试验检测碳青霉烯酶表型;PCR法检测碳青霉烯酶、Amp C酶和超广谱β-内酰胺酶(ESBLs)耐药基因及整合子,并进行测序及BLAST比对确定基因型;脉冲场凝胶电泳(PFGE)和多位点序列分型(MLST)分析菌株同源性和遗传相关性;并进行药敏试验结果分析。结果20株菌均携带KPC-2、TEM-1、SHV和CTX-M型基因,未检测到IMP、VIM、OXA和NDM碳青霉烯酶基因和amp C酶基因;20株菌均有I类整合子,其中18株的整合子整合有耐药基因盒,主要整合基因是aad A2。20株菌中19株被PFGE分型为13个型别,其中P1型和P7型各有3株,P2和P 10型各有2株;20株菌中17株为ST11型,其余3株分别为ST290、ST147和ST967型;20株菌呈多重耐药或泛耐药。结论携带KPC-2是20株肺炎克雷伯菌耐亚胺培南的主要原因,多重耐药或泛耐药与其他β-内酰胺酶和整合子有关;院内存在克隆株流行;检出ST290和ST967型别产KPC肺炎克雷伯菌。 展开更多
关键词 肺炎克雷伯菌 耐药机制 脉冲场凝胶电泳 多位点序列分型 分子流行病学
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2018-2022年内蒙古自治区呼伦贝尔市阿荣旗人间布鲁氏菌病流行病学和病原学特征分析 被引量:2
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作者 高静 塔娜 +5 位作者 李昌 左柯铭 牛双丽 马德全 张琪瑶 范蒙光 《疾病监测》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期274-278,共5页
目的 分析内蒙古自治区呼伦贝尔市阿荣旗2018—2022年间布鲁氏菌病(布病)的流行特征,为制定有针对性的防控策略提供科学依据。方法 采用描述流行病学分析方法,用发病数、发病率等流行病学指标对2003—2022年间阿荣旗人间布病地区、时间... 目的 分析内蒙古自治区呼伦贝尔市阿荣旗2018—2022年间布鲁氏菌病(布病)的流行特征,为制定有针对性的防控策略提供科学依据。方法 采用描述流行病学分析方法,用发病数、发病率等流行病学指标对2003—2022年间阿荣旗人间布病地区、时间分布特点进行分析。同时,对该地区人间布病的病原菌进行分离培养、种型鉴定及多位点序列分型(MLST)分型。结果 2018-2022年间,阿荣旗报告本地布病病例1 554例,年平均发病率为115.13/10万,病例数及发病率逐年波动,2019年布病发病人数最多(466例);春夏季为报告病例高峰期;全旗12个乡镇均有布病病例报告,多分布在六合镇(281例);男女性别比为2.12∶1;病例主要集中在年龄为30~55岁(占比67.89%);职业以农民为主(占比86.81%)。分析数据表明,该地区人间布病呈现明显的季节性,30~55岁农民多发,应开展针对性的监测干预。2022年从9例患者中分离获得布鲁氏菌,生化鉴定结果显示9株菌均为羊种布鲁氏菌,其中2株羊1型、4株羊2型、2株羊3型、1株变异株;MLST分型显示7株MLST 8型、1株MLST 12型、1株由于gyrB基因突变导致产生了新序列型。结论 目前阿荣旗人间布病疫情仍十分严峻,农民由于饲住同区且缺乏动物饲养与防疫的相关知识,30~55岁的农民为布病感染高危人群。强化该地区人畜间布病监测和高危人群的干预,同时,推进布病防治相关知识的普及以遏制布病的流行。 展开更多
关键词 布鲁氏菌病 监测 生化鉴定 多位点序列分型
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广州市两例B群流脑病例分离株的MLST分型研究 被引量:2
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作者 张欣强 李孝权 +2 位作者 夏丹 张晶 崔敏 《中国预防医学杂志》 CAS 2013年第6期462-464,共3页
目的对从广州市报告的两例B群流行性脑脊髓膜炎(流脑)病例中分离的4株脑膜炎奈瑟菌(Neisseria meningitidis,Nm)进行多位点序列分型(multi-locus sequence typing,MLST)研究。方法分纯并提取菌株DNA、运用MLST分析对7个管家基因进行扩... 目的对从广州市报告的两例B群流行性脑脊髓膜炎(流脑)病例中分离的4株脑膜炎奈瑟菌(Neisseria meningitidis,Nm)进行多位点序列分型(multi-locus sequence typing,MLST)研究。方法分纯并提取菌株DNA、运用MLST分析对7个管家基因进行扩增并测序,确定菌株的序列型,对其相关性进行分析。结果两例病例分离株7个管家基因位点序列均不相同,第一例病例分离株的序列型为ST-7型,属高致病性ST-5complex/subgroup III克隆系;第二例病例分离株的序列型为新发现的ST-9804型。结论广州两例B群流脑病例虽然发生时间相近,但分属不同的序列型,无同源性。MLST分型技术对研究不同流脑病例间的流行病学关系有重要意义。 展开更多
关键词 流行性脑脊髓膜炎 脑膜炎奈瑟菌 多位点序列分型(mlst)
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2018-2019年福建省人感染布鲁氏菌分离株种型鉴定及分子特征分析 被引量:7
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作者 韩腾伟 林代华 +4 位作者 陈志平 刘菁 刘维俊 肖方震 邓艳琴 《中国病原生物学杂志》 CSCD 北大核心 2021年第9期1001-1007,共7页
目的探讨福建省人感染布鲁氏菌分离株主要流行株的种型和分子特征,为制定预防控制策略提供依据。方法将布鲁氏菌分离株转种培养并提取基因组DNA,采用传统生物学鉴定和BCSP31-PCR、AMOS-PCR、MLST及MLVA-16等方法进行布鲁氏菌分离株分子... 目的探讨福建省人感染布鲁氏菌分离株主要流行株的种型和分子特征,为制定预防控制策略提供依据。方法将布鲁氏菌分离株转种培养并提取基因组DNA,采用传统生物学鉴定和BCSP31-PCR、AMOS-PCR、MLST及MLVA-16等方法进行布鲁氏菌分离株分子鉴定和分型,通过Bionumerics 6.6软件对其进行聚类分析。结果2018-2019年福建省人感染布鲁氏菌22株分离株分子检测结果与传统分型基本相符,为2个种(羊种和猪种)和2个生物型(羊3型和猪3型),其中羊种布鲁氏菌占多数(95.45%);20株布鲁氏菌分离株MLST基因型为ST8,1株为ST17型,1株为新的ST型:ST99的gap基因与已报道的等位基因型不同,被定义为一个新的等位基因型gap(32)。MLVA-16分型为羊种和猪种2个种群,21株羊种布鲁氏菌分为17种基因型,1株猪种布鲁氏菌分为1种基因型,其中15种基因型为单分离株,3种基因型为共享基因型(共7株,占31.82%)。聚类分析显示福建分离株与内蒙古、辽宁、山东和广东地区存在4种共享基因型,均为羊种布鲁氏菌,其他部分菌株与外省菌株遗传距离较近。结论福建省布鲁氏菌主要流行株为ST8型,且MLVA-16分型显示呈高度基因多样性。MLST/MLVA作为传统生物学鉴定补充技术方法,可用于布鲁氏菌遗传多样性分析和分子流行病学溯源调查,以提高布鲁氏菌病监测能力。 展开更多
关键词 布鲁氏菌 多位点序列分型(mlst) 多位点可变数目串联重复序列分析(MLVA-16) 福建省
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贵州省不明原因发热病例钩端螺旋体病原体分离鉴定研究 被引量:4
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作者 刘英 黄荷 +7 位作者 张翠彩 姚光海 徐飞 马青 王月 唐光鹏 王定明 李世军 《中华流行病学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2020年第7期1110-1114,共5页
目的对贵州省钩端螺旋体(钩体)病疫区不明原因发热病例进行钩体分离鉴定和分子分型,了解其病原学特征,为当地钩体病的防治提供病原学依据。方法采集贵州省钩体病疫区黔东南州黎平县不明原因发热病例血液和尿液标本进行钩体分离培养,对... 目的对贵州省钩端螺旋体(钩体)病疫区不明原因发热病例进行钩体分离鉴定和分子分型,了解其病原学特征,为当地钩体病的防治提供病原学依据。方法采集贵州省钩体病疫区黔东南州黎平县不明原因发热病例血液和尿液标本进行钩体分离培养,对分离的钩体疑似菌株通过致病性钩体G1/G2-PCR方法进行初步鉴定,进一步采用钩体血清群特异PCR进行分群鉴定,然后采用多位点序列分型(MLST)技术对其进行分子分型,并与国内常见血清群参考菌株进行聚类分析。结果从35例发热病例血液中分离得到3株钩体疑似菌株,分离率为8.6%,分别命名为17BX002、17BX003和17AJX008;3株菌株经钩体特异性G1/G2-PCR鉴定为致病性钩体;钩体血清群PCR鉴定显示,17BX002株为流感伤寒群钩体,其余2株菌为阴性(排除其为黄疸出血群、赛罗群、犬型、秋季群、流感伤寒群和七日热群);进一步的MLST显示,17BX002株为ST106型,与流感伤寒群聚类最近,而其余2株为ST96型,与巴达维亚群菌株一致。结论高发季节贵州省疫区不明原因发热病例中存在钩体感染病例,流感伤寒群和巴达维亚群为贵州省新发现钩体菌群。 展开更多
关键词 钩端螺旋体 发热病例 聚合酶链式反应 多位点序列分型
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沙门氏菌的分子分型方法 被引量:6
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作者 刘雯静 邱少富 +1 位作者 刘雪林 宋宏彬 《现代生物医学进展》 CAS 2010年第20期3948-3950,共3页
沙门氏菌是一类危害人和动物健康的重要致病菌,是引起食物中毒的最常见病原菌之一。本文对目前常用的3种分子分型方法脉冲场凝胶电泳(Pulsed-field gel electrophoresis,PFGE),多位点序列分析(Multi-locus sequence analysis,MLST)及多... 沙门氏菌是一类危害人和动物健康的重要致病菌,是引起食物中毒的最常见病原菌之一。本文对目前常用的3种分子分型方法脉冲场凝胶电泳(Pulsed-field gel electrophoresis,PFGE),多位点序列分析(Multi-locus sequence analysis,MLST)及多位点可变数串联重复分析(Multiple-locus variable number tandem repeats analysis,MLVA)在沙门氏菌分子分型的应用做了阐述和比较,为沙门氏菌分型研究提供一定的参考。 展开更多
关键词 脉冲场凝胶电泳 多位点序列分析 多位点可变数串联重复分析
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米面食品中呕吐型蜡样芽胞杆菌的分子分型及耐药性分析 被引量:5
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作者 李文涓 石一 +5 位作者 张铮 李雪梅 张璐 孙亮 王安礼 关蓉晖 《实用预防医学》 CAS 2019年第5期518-520,共3页
目的了解陕西米面食品中呕吐型蜡样芽胞杆菌的分子分型和耐药性。方法对近5年(2012-2016年)陕西地区的米面食品中收集到的208株蜡样芽胞杆菌用PCR方法进行呕吐型菌株的鉴别,用多位点序列分型(multi-locus sequence typing,MLST)技术对... 目的了解陕西米面食品中呕吐型蜡样芽胞杆菌的分子分型和耐药性。方法对近5年(2012-2016年)陕西地区的米面食品中收集到的208株蜡样芽胞杆菌用PCR方法进行呕吐型菌株的鉴别,用多位点序列分型(multi-locus sequence typing,MLST)技术对鉴别的呕吐型菌株分子分型,用微量肉汤稀释法测定其药物敏感性。结果鉴别出8株呕吐型蜡样芽胞杆菌,分为ST-1050、ST-1606和ST-26三个ST型。呕吐型蜡样芽胞杆菌对氨苄西林、青霉素、苯唑西林、复方新诺明耐药率100%。对头孢西丁、头孢唑林,耐药率分别为62.5%、50.0%。对红霉素、克林霉素、四环素,敏感率均为87.5%,对环丙沙星、达托霉素、万古霉素、氯霉素、庆大霉素100%敏感。结论陕西地区米面食品中存在呕吐型蜡样芽胞杆菌的污染,ST-26是优势型别,应作为陕西防控工作的重点。氨苄西林、青霉素、苯唑西林、复方新诺明耐药率高不应作为临床治疗用药。 展开更多
关键词 米面制品 呕吐型蜡样芽胞杆菌 多位点序列分型(mlst) 耐药性
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南京市羊种布鲁菌分子特征分析 被引量:3
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作者 张颖 张之峰 +4 位作者 洪捷 周伟忠 鲍倡俊 周明浩 谈忠鸣 《中华地方病学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第4期278-281,共4页
目的分析从南京市分离的布鲁菌菌株分子特征,了解菌株基因分型和聚类,为布鲁菌病的防治提供依据。方法对南京大学医学院附属鼓楼医院2011-2016年分离的7株羊种布鲁菌(来自7例散发病例),运用多位点序列分型(MLST)和多位点可变数目串联重... 目的分析从南京市分离的布鲁菌菌株分子特征,了解菌株基因分型和聚类,为布鲁菌病的防治提供依据。方法对南京大学医学院附属鼓楼医院2011-2016年分离的7株羊种布鲁菌(来自7例散发病例),运用多位点序列分型(MLST)和多位点可变数目串联重复序列分析(MLVA)两种方法进行分子分型,并与江苏省的参考株数据进行聚类分析。结果分离到的7株羊种布鲁菌均为序列型(ST)8型菌株,并被MLVA分为7个基因型,且聚类在"中地中海簇"中。1株菌(NJ-2011-1株)与江苏省其他地区分离的2株菌基因位点完全相同。结论ST8型羊种布鲁菌为南京地区的优势菌,MLVA聚类在"中地中海簇"内。病例均为散发,传播途径及危险因素较为复杂,应加强各部门合作,从源头上作好布鲁菌病的防治工作。 展开更多
关键词 布鲁杆菌属 多位点序列分型 多位点可变数目串联重复序列分析
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