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鸡蛔虫线粒体cox1和nad4基因的遗传变异分析 被引量:16
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作者 郝桂英 何学谦 万润 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2017年第1期113-122,共10页
为探究鸡蛔虫的种内遗传变异和系统发育关系,对分离自四川省西昌市的15个鸡蛔虫分离株的线粒体细胞色素c氧化酶第Ⅰ亚基(cox1)基因部分序列和烟酰胺腺嘌呤二核苷酸脱氢酶亚单位Ⅳ(nad4)基因全序列进行PCR扩增、序列测定及分析,并用cox1... 为探究鸡蛔虫的种内遗传变异和系统发育关系,对分离自四川省西昌市的15个鸡蛔虫分离株的线粒体细胞色素c氧化酶第Ⅰ亚基(cox1)基因部分序列和烟酰胺腺嘌呤二核苷酸脱氢酶亚单位Ⅳ(nad4)基因全序列进行PCR扩增、序列测定及分析,并用cox1和nad4基因部分序列构建鸡蛔虫与其他蛔虫的NJ树和贝叶斯树。测序结果显示,所获得的鸡蛔虫cox1和nad4基因全序列长度分别为1 152和1 236bp,分别有33和40个变异位点,碱基变异率分别为0~2.1%和0~2.3%;分别检测到8和11个单倍型,总的单倍型多样性分别为0.733±0.124和0.933±0.054,核苷酸多样性分别为0.00433±0.00153和0.00541±0.00157,平均遗传距离分别为0.004和0.005。构建的种系发育树均显示15个鸡蛔虫西昌分离株与其他国家/地区的鸡蛔虫分离株聚类形成一个分支,与鸽蛔虫的亲缘关系最近,与其他蛔虫所属的分支相隔较远。研究结果表明鸡蛔虫西昌分离株的遗传变异程度低,且nad4基因比cox1基因更适合作为研究鸡蛔虫分离株遗传变异的分子标记。 展开更多
关键词 鸡蛔虫 cox1基因 nad4基因 遗传变异
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湖南省山羊脑多头蚴的线粒体nad1和nad4基因的序列测定及种系发育分析 被引量:6
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作者 何德肆 徐平源 彭运潮 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第12期1763-1767,共5页
本研究旨在阐明脑多头蚴湖南分离株线粒体烟酰胺腺嘌呤二核苷酸(NADH)脱氢酶亚单位1基因(nad1)部分序列(pnad1)和烟酰胺腺嘌呤二核苷酸(NADH)脱氢酶亚单位4基因(nad4)部分序列(pnad4)的遗传变异情况,并用pnad1和pnad4序列重构脑多头蚴... 本研究旨在阐明脑多头蚴湖南分离株线粒体烟酰胺腺嘌呤二核苷酸(NADH)脱氢酶亚单位1基因(nad1)部分序列(pnad1)和烟酰胺腺嘌呤二核苷酸(NADH)脱氢酶亚单位4基因(nad4)部分序列(pnad4)的遗传变异情况,并用pnad1和pnad4序列重构脑多头蚴与其它带科绦虫的种群遗传关系。利用聚合酶链反应(PCR)扩增脑多头蚴的pnad1和pnad4,应用ClustalX 1.81程序对序列进行比对,再用Phylip3.67程序MP法和Mage4.0程序NJ法绘制种系发育树,并用Puzzle5.2程序构建最大似然树,同时利用DNAstar5.0中的Megalign程序进行同源性分析。结果显示所获得的pnad1和pnad4序列长度分别均为666和887bp,湖南分离株与已知多头带绦虫位于同一分枝。由于脑多头蚴pnad1和pnad4序列种内相对保守,种间差异较大,故均可作为种间遗传变异研究的标记,从而为脑多头蚴的分子流行病学和其相关疾病的诊断奠定基础。 展开更多
关键词 多头带绦虫 线粒体DNA nad1基因 nad4基因 种系发育关系
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鸡蛔虫COX2和NAD4rDNA的序列测定及分析 被引量:9
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作者 李淼 侯强红 +3 位作者 蔡丝丝 李奔 李林波 侯利兰 《中国兽医杂志》 CAS 北大核心 2013年第1期19-21,共3页
本试验旨在阐明湖南省鸡蛔虫分离株线粒体细胞色素C氧化酶第Ⅱ亚基(cox2)基因部分序列(pcox2)和烟酰胺腺嘌呤二核苷酸(NADH)脱氢酶亚单位IV基因(nad4)部分序列(pnad4)的遗传变异情况。利用聚合酶链式反应(PCR)扩增鸡蛔虫的pcox2and pna... 本试验旨在阐明湖南省鸡蛔虫分离株线粒体细胞色素C氧化酶第Ⅱ亚基(cox2)基因部分序列(pcox2)和烟酰胺腺嘌呤二核苷酸(NADH)脱氢酶亚单位IV基因(nad4)部分序列(pnad4)的遗传变异情况。利用聚合酶链式反应(PCR)扩增鸡蛔虫的pcox2and pnad4,应用clustalx1.81程序对序列进行比对,结果显示,所获得的cox2(pcox2)and nad4(pnad4)序列长度一致,为350bp(pcox2)and 400bp(pnad4)。由于鸡蛔虫pcox2and pnad4序列种内相对保守,种间差异较大,故可作为种间遗传变异研究的标记,从而为鸡蛔虫的分类鉴定及进一步的分子流行病学调查提供了基础。 展开更多
关键词 鸡蛔虫 线粒体DNA cox2基因 nad4基因 种系发育关系
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羊毛尾线虫线粒体nad4基因的序列变异分析 被引量:3
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作者 王燕 杨言川 +3 位作者 张悦文 李佳缘 朱兴全 刘国华 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2013年第4期81-84,共4页
本研究旨在阐明中国羊毛尾线虫(Trichuris ovis)广东分离株线粒体NADH脱氢酶亚单位4(nad4)基因部分序列(pnad4)的遗传变异情况,并用pnad4序列构建其与其他鞭虫的进化关系。应用PCR扩增羊鞭虫虫株的pnad4,将所获得的序列应用ClustalX 1.8... 本研究旨在阐明中国羊毛尾线虫(Trichuris ovis)广东分离株线粒体NADH脱氢酶亚单位4(nad4)基因部分序列(pnad4)的遗传变异情况,并用pnad4序列构建其与其他鞭虫的进化关系。应用PCR扩增羊鞭虫虫株的pnad4,将所获得的序列应用ClustalX 1.81程序进行比对,然后用Mega 5.0程序NJ法绘制种系发育树。本试验扩增所获得的pnad4序列长度一致,均为827bp,种内变异在0~1.5%之间。种系发育分析结果表明,12个羊鞭虫分离株位于同一分支。由于羊鞭虫nad4序列种内相对保守,种间差异较大(37.8%~45.6%),故可作为种间鉴定检测研究的遗传标记,本研究结果为进一步研究羊鞭虫的群体遗传结构奠定了基础。 展开更多
关键词 羊鞭虫 线粒体DNA nad4基因 种系发育关系
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猬裂头蚴线粒体nad4基因的克隆及序列分析 被引量:7
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作者 伍慧兰 《动物医学进展》 CSCD 北大核心 2010年第12期61-63,共3页
以从湖南长沙和湘西黑斑蛙大腿肌肉中采集的2条猬裂头蚴作为研究对象,用引物ND4F及ND4R扩增猬裂头蚴的pnad4片段,应用ClustalX1.81程序对序列进行比对,同时利用DNA Star5.0中的Megalign程序进行同源性分析。结果显示,来自湖南长沙和湘西... 以从湖南长沙和湘西黑斑蛙大腿肌肉中采集的2条猬裂头蚴作为研究对象,用引物ND4F及ND4R扩增猬裂头蚴的pnad4片段,应用ClustalX1.81程序对序列进行比对,同时利用DNA Star5.0中的Megalign程序进行同源性分析。结果显示,来自湖南长沙和湘西的2条猬裂头蚴的pnad4序列均为640 bp。研究结果为猬裂头蚴进一步的分类、鉴定和遗传变异研究奠定了基础。 展开更多
关键词 猬裂头蚴 线粒体DNA nad4基因 序列分析
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猪囊尾蚴西昌分离株线粒体Cytb和nad4基因的序列测定与种系发育分析 被引量:6
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作者 郝桂英 《动物医学进展》 北大核心 2015年第5期59-63,共5页
利用PCR技术对2个猪囊尾蚴西昌分离株的线粒体细胞色素b(Cytb)基因全序列和烟酰胺腺嘌呤二核苷酸脱氢酶亚单位4(nad4)基因部分序列(pnad4)进行扩增,分析其遗传变异,并用MEGA 5.0程序NJ法绘制种系发育树,探讨不同地区来源的猪囊尾蚴种系... 利用PCR技术对2个猪囊尾蚴西昌分离株的线粒体细胞色素b(Cytb)基因全序列和烟酰胺腺嘌呤二核苷酸脱氢酶亚单位4(nad4)基因部分序列(pnad4)进行扩增,分析其遗传变异,并用MEGA 5.0程序NJ法绘制种系发育树,探讨不同地区来源的猪囊尾蚴种系发育关系。测序结果显示,2个猪囊尾蚴分离株的Cytb基因全序列长度均为1 068bp,nad4基因部分序列长度均为815bp,核苷酸序列同源性均为99.8%。种系发育分析结果显示,所有猪囊尾蚴分离株形成一个分支,2个西昌分离株均属于猪带绦虫亚洲基因型。结果表明,Cytb和nad4基因均可用于猪带绦虫的分子分类,为猪带绦虫病/猪囊尾蚴病的分子诊断奠定基础。 展开更多
关键词 猪囊尾蚴 CYTB基因 nad4基因 种系发育
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Pseudoterranova decipiens复合种的几个姊妹种在线粒体nad4序列的差异
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作者 曹湛 林瑞庆 +4 位作者 吴绍强 邹丰才 宋慧群 李国清 朱兴全 《中国兽医杂志》 CAS 北大核心 2006年第3期7-9,共3页
本实验用PCR扩增了来自世界各地的P.decipiens复合种共6个姊妹种的线粒体NADH脱氢酶亚单位Ⅳ基因(nad4),并进行了克隆、测序和序列分析。结果显示,PdOe与Pd为同一种,nad4基因序列种内的变异为0.7%,种间差异为2.4~13.2%。... 本实验用PCR扩增了来自世界各地的P.decipiens复合种共6个姊妹种的线粒体NADH脱氢酶亚单位Ⅳ基因(nad4),并进行了克隆、测序和序列分析。结果显示,PdOe与Pd为同一种,nad4基因序列种内的变异为0.7%,种间差异为2.4~13.2%。种间差异远大于种内变异,能提供准确的遗传标记。可用于P.decipiens复合种姊妹种的鉴定。这些结果有助于P.decipiens复合种的生活史、传播途径、流行病学、种群遗传学的研究和其所引起的相关疾病的诊断。 展开更多
关键词 P.decipiens复合种 nad4 PCR 多态性
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枝睾阔盘吸虫凉山州分离株nad4基因部分序列测定与种系发育分析
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作者 郝桂英 易利 +1 位作者 潘用清 何学谦 《现代农业科技》 2019年第12期200-201,208,共3页
为探究山羊源枝睾阔盘吸虫的种内遗传变异和系统发育关系,对采集自四川省凉山州的5个吸虫样品nad4基因部分序列进行PCR扩增、序列测定及分析,并构建种系发育树。测序结果显示,所测得的5个山羊源枝睾阔盘吸虫nad4基因部分序列长度均为789... 为探究山羊源枝睾阔盘吸虫的种内遗传变异和系统发育关系,对采集自四川省凉山州的5个吸虫样品nad4基因部分序列进行PCR扩增、序列测定及分析,并构建种系发育树。测序结果显示,所测得的5个山羊源枝睾阔盘吸虫nad4基因部分序列长度均为789bp,核苷酸同源性为99.5%~100.0%,共检测到4个单倍型、4个变异位点。系统发育树显示,5个山羊源枝睾阔盘吸虫凉山州分离株聚在同一小支上,未与胰阔盘吸虫聚类在一支上,能与其他吸虫相鉴别。本研究结果为枝睾阔盘吸虫的分子分类和种群遗传的进一步研究奠定了基础。 展开更多
关键词 枝睾阔盘吸虫 山羊 nad4基因 种系发育
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玉米花粉发育过程中线粒体nad4基因的转录规律
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作者 李晨东 陈德富 张俊 《河北工业大学学报》 CAS 2000年第1期91-93,共3页
以玉米花粉为材料,提取总RNA后通过定量斑点杂交技术研究花粉发育过程中线 粒体nad4基因的转录规律.结果表明,在幼叶及不同发育时期的花粉中,线粒体nad4基 因的转录不存在其他线粒体基因那样的高度时空特异性;而是表现... 以玉米花粉为材料,提取总RNA后通过定量斑点杂交技术研究花粉发育过程中线 粒体nad4基因的转录规律.结果表明,在幼叶及不同发育时期的花粉中,线粒体nad4基 因的转录不存在其他线粒体基因那样的高度时空特异性;而是表现出等量转录规律.因此 我们认为花粉发育过程中线粒体基因的转录随基因种类、组织种类及植物种类而不同,或 表现时空特异性,或表现稳定的转录规律,同时对玉米不同发育阶段花粉总RNA的分离 技术进行了研究. 展开更多
关键词 玉米 花粉 发育过程 线粒体 nad4基因 转录规律
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基于线粒体nad4基因探讨土耳其斯坦东毕吸虫的系统发生位置
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作者 王宇 肖景莹 +2 位作者 王春仁 高俊峰 朱兴全 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第3期218-220,共3页
为探讨土耳其斯坦东毕吸虫在血吸虫中的系统发生位置,本研究设计一对特异性引物,通过PCR方法对土耳其斯坦东毕吸虫(绵羊源)线粒体烟酰胺脱氢酶亚基Ⅳ基因(nad4)进行扩增和测序分析,并与GenBank中相关血吸虫nad4基因进行比对。结果显示,... 为探讨土耳其斯坦东毕吸虫在血吸虫中的系统发生位置,本研究设计一对特异性引物,通过PCR方法对土耳其斯坦东毕吸虫(绵羊源)线粒体烟酰胺脱氢酶亚基Ⅳ基因(nad4)进行扩增和测序分析,并与GenBank中相关血吸虫nad4基因进行比对。结果显示,本研究克隆的该吸虫线粒体nad4基因序列大小约为1030bp,与已发表的其它血吸虫线粒体nad4基因的同源性为51.6%~66.7%,其系统发生位置属于非洲血吸虫种群。 展开更多
关键词 土耳其斯坦东毕吸虫 线粒体DNA 烟酰胺脱氢酶亚基Ⅳ基因 系统发生
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基于线粒体nad1和nad4基因对四川省多头带绦虫种群遗传多样性的分析 被引量:2
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作者 郝桂英 杨应东 +1 位作者 周英姿 杨光友 《中国兽医科学》 CAS CSCD 北大核心 2014年第3期251-257,共7页
为探讨多头带绦虫的种群遗传多样性,应用PCR方法扩增20株分离自四川省攀枝花市、雅安市、成都市的山羊脑部和肌间的多头蚴的线粒体nadl基因和nad4基因的部分序列,并进行分析。序列分析结果显示,20株多头蚴的pnadl基因和pnad4基因序... 为探讨多头带绦虫的种群遗传多样性,应用PCR方法扩增20株分离自四川省攀枝花市、雅安市、成都市的山羊脑部和肌间的多头蚴的线粒体nadl基因和nad4基因的部分序列,并进行分析。序列分析结果显示,20株多头蚴的pnadl基因和pnad4基因序列分别有2个和8个变异位点,长度分别为753bp和801bp,变异率分别为0~0.3%和0~0.8%,检测出3个和6个单倍型,总的单倍型多样性分别为0.574±0.055和0.742±0.074,核苷酸多样性分别为0.00082±0.00053和0.00288±0.001,平均遗传距离分别为0.002和0.003。构建的种系发育树显示,四川分离株与已知多头带绦虫位于同一分支,且与分布的地理区域、寄生部位没有直接的相关性。结果表明,四川多头带绦虫的遗传多样性水平低,其中nadl基因的遗传多样性水平低于nad4基因的遗传多样性。 展开更多
关键词 多头带绦虫 nad1基因 nad4基因 遗传多样性 四川省
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湖南省怀化市鸡蛔虫流行情况调查及其遗传多样性与种系发育关系研究
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作者 向书涵 胡辉 李中波 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2024年第15期55-61,共7页
为调查湖南省怀化市鸡蛔虫的流行情况,探究其遗传多样性,阐述其种系发育关系,试验以采自湖南省怀化市不同地区的430份鸡粪便,用饱和盐水漂浮法检测虫卵,利用IBM SPSS Statistics 22软件统计、分析数据,并用χ^(2)法检验各地区、各类型... 为调查湖南省怀化市鸡蛔虫的流行情况,探究其遗传多样性,阐述其种系发育关系,试验以采自湖南省怀化市不同地区的430份鸡粪便,用饱和盐水漂浮法检测虫卵,利用IBM SPSS Statistics 22软件统计、分析数据,并用χ^(2)法检验各地区、各类型鸡感染鸡蛔虫的差异性;PCR扩增其cox1与nad4基因的部分序列并测序;运用Clustal X、DNAStar软件分析基因的碱基组成与遗传多样性;运用Clustal X、PhyML 3.0软件分析鸡蛔虫的种系发育关系。结果表明:湖南省怀化市鸡蛔虫的总感染率为56.98%,其中圈养鸡的感染率为9.07%,放养鸡的感染率为47.91%,各地区、各类型鸡对鸡蛔虫的感染存在一定程度的差异;鸡蛔虫cox1基因序列的长度为953 bp,A、T、G、C碱基含量分别为19.0%~19.3%、45.9%~46.5%、23.0%~23.2%、11.3%~12.0%,A+T及G+C含量分别为64.9%~65.8%和34.3%~35.2%,种内差异为0~2.1%,种间差异为13.12%~14.48%;nad4基因序列的长度为876 bp,A、T、G、C碱基含量分别为19.1%~19.4%、52.4%~52.9%、19.9%~20.2%、7.9%~8.3%,A+T及G+C含量分别为71.5%~72.3%和27.8%~28.5%,种内差异为0~2.0%,种间差异为26.37%~27.40%;来自于湖南省怀化市的鸡蛔虫均处于发育树的一个分支上。说明湖南省怀化市鸡蛔虫的流行情况较严重,其cox1、nad4基因序列均呈AT偏好,均具有种内差异小而种间差异大的特征,是一类良好的遗传标记,且其个体之间虽存在一定程度的基因变异和遗传多样性,但具有较近的亲缘关系。 展开更多
关键词 鸡蛔虫 流行情况 cox1 nad4 遗传多样性 种系发育
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湖南省蛇源裂头蚴线粒体nad4和nad5基因遗传多样性分析 被引量:7
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作者 龚腾芳 贺峻琳 +2 位作者 谭磊 谢李星 刘伟 《中国血吸虫病防治杂志》 CAS CSCD 北大核心 2021年第1期35-39,共5页
目的了解湖南省蛇源裂头蚴种群遗传多样性及其系统发生关系。方法采用PCR技术扩增湖南省7株蛇源裂头蚴线粒体nad4基因和nad5基因部分序列(pnad4和pnad5),扩增产物测序后用DNAMAN 7.0、Meg Align、Dna SP 5.0和MEGA 5.0软件进行同源性和... 目的了解湖南省蛇源裂头蚴种群遗传多样性及其系统发生关系。方法采用PCR技术扩增湖南省7株蛇源裂头蚴线粒体nad4基因和nad5基因部分序列(pnad4和pnad5),扩增产物测序后用DNAMAN 7.0、Meg Align、Dna SP 5.0和MEGA 5.0软件进行同源性和系统进化分析。结果湖南省7株蛇源裂头蚴pnad4和pnad5基因序列长度分别约为578 bp和484 bp,其碱基变异率分别为0~2.8%和0~0.8%;均检测到4个单倍型,总单倍型多样性分别为0.810±0.016和0.905±0.011,核苷酸多样性分别为0.006±0.005和0.004±0.003,平均核苷酸差异为3.960和1.905。构建的系统进化树显示,7株裂头蚴分离株与来自不同地区或不同宿主的猬迭宫绦虫同在一个分支,属于猬迭宫绦虫;与阔节迭宫绦虫相隔较近,与其他绦虫相隔较远。结论湖南省蛇源猬迭宫绦虫遗传变异程度低,pnad4基因和pnad5基因均可作为检测猬迭宫绦虫的分子遗传标记。 展开更多
关键词 蛇源裂头蚴 nad4基因 nad5基因 种系发育关系 湖南省
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DEK43 is a P-type pentatricopeptide repeat(PPR)protein responsible for the Cis-splicing of nad4 in maize mitochondria 被引量:7
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作者 Ru Chang Ren Li Li Wang +5 位作者 Lin Zhang Ya Jie Zhao Jia Wen Wu Yi Ming Wei Xian Sheng Zhang Xiang Yu Zhao 《Journal of Integrative Plant Biology》 SCIE CAS CSCD 2020年第3期299-313,共15页
Mitochondria, the main energy transducers in plant cells, require the proper assembly of respiratory chain complexes Ⅰ–Ⅴ for their function. The NADH dehydrogenase4(nad4) gene encodes mitochondrial respiratory chai... Mitochondria, the main energy transducers in plant cells, require the proper assembly of respiratory chain complexes Ⅰ–Ⅴ for their function. The NADH dehydrogenase4(nad4) gene encodes mitochondrial respiratory chain complex Ⅰ subunit Ⅳ, but the mechanism underlying nad4 transcript splicing is unclear. Here, we report that the P-type pentatricopeptide repeat(PPR) protein DEFECTIVE KERNEL 43(DEK43) is responsible for cis-splicing of the nad4 transcript in maize. We demonstrate that DEK43 localizes to both the nucleus and mitochondria. The mutation of Dek43 resulted in embryo-lethal and light-colored defective kernels. Among the 22 mitochondrial group Ⅱ introns, the splicing efficiency of nad4 introns 1 and 3 was reduced by up to 50% compared to the wild type. The levels of complex Ⅰ and supercomplex Ⅰ+Ⅲ2 were also reduced in dek43. Furthermore, in-gel NADH dehydrogenase assays indicated that the activities of these complexes were significantly reduced in dek43. Further, the mitochondrial ultrastructure was altered in the mutant. Together, our findings indicate that DEK43, a dual-localized PPR protein,plays an important role in maintaining mitochondrial function and maize kernel development. 展开更多
关键词 nad4 function. TOGETHER
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陕西榆林地区鸡蛔虫的单倍型多态性、遗传分化及种系发育关系分析
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作者 崔巍山 李中波 《中国家禽》 北大核心 2023年第12期101-107,共7页
为探究陕西榆林地区鸡蛔虫单倍型多态性及遗传分化情况,并阐明其种系发育关系,试验以分离于榆林不同地区的30条鸡蛔虫为样品,采用PCR扩增其线粒体cox1与nad4基因,进行单倍型多态性、遗传分化与种系发育关系分析。结果显示:在所有的cox1... 为探究陕西榆林地区鸡蛔虫单倍型多态性及遗传分化情况,并阐明其种系发育关系,试验以分离于榆林不同地区的30条鸡蛔虫为样品,采用PCR扩增其线粒体cox1与nad4基因,进行单倍型多态性、遗传分化与种系发育关系分析。结果显示:在所有的cox1基因(953 bp)序列中,共含30个变异位点(4个转换、26个颠换),17个单倍型(h=17,Hd=0.936),其基因分化系数(Gst)为-0.01285,遗传分化系数(Fst)为-0.02995,基因流(Nm)为11.53;在所有的nad4基因(876bp)序列中,共含29个变异位点(2个转换、27个颠换),16个单倍型(h=16,Hd=0.9356),其Gst为-0.01238,Fst为-0.0409,Nm为17.05;在所有的cox1+nad4基因(1829 bp)序列中,共含59个变异位点(6个转换、53个颠换),24个单倍型(h=24,Hd=0.977),其Gst为-0.0039,Fst为-0.0365,Nm为14.77;在所有cox1、nad4及cox1+nad4基因的Network图中,均未发现有单倍型聚集成簇的现象,构建的种系发育树中30条鸡蛔虫均聚集于一起,共同形成种系发育树的一个分支。研究表明,分离于陕西榆林地区的30条鸡蛔虫之间虽存在一定程度的基因变异,但其个体及单倍型之间具有较近的亲缘关系,尚未出现遗传分化。 展开更多
关键词 鸡蛔虫 cox1 nad4 基因变异 单倍型多态性 遗传分化 种系发育关系
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不同地区褐黄血蜱的单倍型多态性、遗传分化和种系发育关系分析
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作者 李中波 侯强红 +1 位作者 舒鸣 程天印 《中国兽医杂志》 CAS 北大核心 2023年第9期60-66,共7页
为了探究不同地区褐黄血蜱的单倍型多态性、遗传分化和种系发育关系,本试验以采自于湖南、河南两省的褐黄血蜱(各10只,共20只)为研究对象,通过PCR扩增其细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ(cox1)和还原型烟酰胺腺嘌呤二核苷酸脱氢酶亚基Ⅳ(nad4)基... 为了探究不同地区褐黄血蜱的单倍型多态性、遗传分化和种系发育关系,本试验以采自于湖南、河南两省的褐黄血蜱(各10只,共20只)为研究对象,通过PCR扩增其细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ(cox1)和还原型烟酰胺腺嘌呤二核苷酸脱氢酶亚基Ⅳ(nad4)基因序列,对其单倍型多态性(Hd)、遗传分化和种系发育关系进行分析。结果显示,cox 1基因序列(849 bp)包含4个变异位点,5个单倍型(h=5,A1~A5,Hd=0.653),其基因分化系数(Gst)=0.061,遗传分化系数(Fst)=-0.047,基因流(Nm)=-5.625;nad 4基因序列(626 bp)包含3个变异位点,3个单倍型(h=3,B1~B3,Hd=0.363),其Gst=0.004,Fst=0.074,Nm=3.125;cox 1+nad 4基因序列包含7个变异位点,7个单倍型(h=7,C1~C7,Hd=0.768),其Gst=-0.010,Fst=-0.015,Nm=-16.560;在所构建的种系发育树中,20只褐黄血蜱均处于种系发育树的一个分支。结果表明,湖南、河南两省的褐黄血蜱个体之间虽表现出单倍型多态性,但它们之间具有较近的亲缘关系,尚未出现遗传分化。 展开更多
关键词 褐黄血蜱 cox 1 nad 4 基因变异 单倍型多态性 遗传分化 种系发育关系
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牛裂体吸虫线粒体DNA序列和基因排序分析 被引量:1
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作者 肖景莹 蔡连顺 +5 位作者 長瀧充 德弘慎治 Jarilla Blanca R. 嶋田雅暁 David Blair 吾妻健 《中国寄生虫学与寄生虫病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2010年第4期252-256,共5页
目的为探讨牛裂体吸虫(Schistosoma bovis)在裂体属内的系统发生位置,测定牛裂体吸虫线粒体基因部分序列,并分析该编码区域的基因序列和基因排序。方法以GNT-K法抽提牛裂体吸虫成虫基因组DNA,用兼并和特异引物扩增目的基因。扩增产物经... 目的为探讨牛裂体吸虫(Schistosoma bovis)在裂体属内的系统发生位置,测定牛裂体吸虫线粒体基因部分序列,并分析该编码区域的基因序列和基因排序。方法以GNT-K法抽提牛裂体吸虫成虫基因组DNA,用兼并和特异引物扩增目的基因。扩增产物经纯化后克隆于pGEM1T质粒载体,并转化大肠埃希菌。抽提和纯化阳性质粒DNA,并测序。以纯化后的阳性质粒DNA为模板,根据已获得的序列设计内部特异引物,采用引物步移法获得全长目的片段。在GenBank中查找曼氏血吸虫等相关血吸虫线粒体基因序列,作基因排序及比较分析后,以邻接法绘制系统发生树。结果测定了牛裂体吸虫线粒体烟酰胺腺嘌呤二核苷酸脱氢酶亚基Ⅳ~Ⅰ基因序列(nicotinamide adeninedinucleotide dehydrogenase subunit4-1gene,nad4-nad1),其长度为2214bp。分析该编码区基因排序为nad4-trnQ(Gln)-trnK(Lys)-nad3-trnD(Asp)-nad1。牛裂体吸虫在该区域的线粒体基因排序与非洲支系血吸虫相似,与亚洲支系血吸虫有很大的不同;根据牛裂体吸虫与其他8种吸虫部分nad4,nad3,部分nad1和部分nad4+nad3+nad1基因序列比对结果,分别构建系统发生树。结果表明,牛裂体吸虫与埃及血吸虫位于同一簇,归属于非洲血吸虫支系,这与由基因排序推测的牛裂体吸虫的系统发生位置结果相一致。结论牛裂体吸虫属于非洲支系而非亚洲支系血吸虫。 展开更多
关键词 牛裂体吸虫 nad4 nad3 nad1 基因排序 系统发生关系
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芝麻素和维生素E通过调节内皮型一氧化氮合酶和NAD(P)H氧化酶4改善D-半乳糖和三氯化铝诱导的大鼠主动脉内皮功能障碍 被引量:4
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作者 张俊秀 姚海 +2 位作者 王欢 杨解人 郑书国 《中国药理学与毒理学杂志》 CAS 北大核心 2021年第7期493-501,共9页
目的观察芝麻素(Ses)和维生素E(Vit E)联用对D-半乳糖(D-gal)和三氯化铝(AlCl_(3))致大鼠主动脉内皮功能障碍的保护作用,并探讨其可能机制。方法大鼠ip给予D-ga(l180 mg·kg^(-1))+ig给予AlCl_(3)(15 mg·kg^(-1))连续84 d,建... 目的观察芝麻素(Ses)和维生素E(Vit E)联用对D-半乳糖(D-gal)和三氯化铝(AlCl_(3))致大鼠主动脉内皮功能障碍的保护作用,并探讨其可能机制。方法大鼠ip给予D-ga(l180 mg·kg^(-1))+ig给予AlCl_(3)(15 mg·kg^(-1))连续84 d,建立大鼠主动脉内皮功能障碍模型。将模型大鼠随机分为模型组、模型+VitE10 mg·kg^(-1)组、模型+Ses 160 mg·kg^(-1)组和模型+Ses 160 mg·kg^(-1)+Vit E 10 mg·kg^(-1)组,同时设正常对照组。连续给药70 d后,尾袖法测量大鼠的收缩压(SBP)、舒张压(DBP)和平均压(MBP)。戊巴比妥钠(30 mg·kg^(-1),ip)麻醉后,取胸主动脉制备2段3 mm动脉环,离体灌流法观察主动脉环对乙酰胆碱(ACh)和硝普钠的舒张反应。HE染色观察主动脉病理变化;化学比色法测定血清总抗氧化能力(T-AOC)、过氧化氢(H_(2)O_(2))和一氧化氮(NO)含量;免疫组化法观察主动脉内皮型一氧化氮合酶(eNOS)蛋白表达。Western印迹法观察主动脉eNOS和NAD(P)H氧化酶4(NOX4)蛋白表达。结果与模型组比较,模型+Ses+Vit E组离体主动脉对ACh(1×10^(-7)~1×10^(-4)mol·L^(-1))的舒张反应显著升高(P<0.01);模型+Ses和模型+Vit E组的SBP、DBP和MBP降低(P<0.01)、血清T-AOC和NO含量升高(P<0.01)、H_(2)O_(2)含量降低(P<0.01)、主动脉eNOS表达增加(P<0.01)及NOX4表达减少(P<0.01)。与模型+Ses比较,模型+Ses+Vit E组SBP、DBP和MBP均降低(P<0.01或P<0.05)、NO含量升高(P<0.01)和H_(2)O_(2)含量降低(P<0.01)、主动脉eNOS蛋白表达增加(P<0.01),NOX4蛋白表达降低(P<0.05)。与模型+Vit E组比较,模型+Ses+Vit E组血清T-AOC和NO含量升高(P<0.01)、H_(2)O_(2)含量降低(P<0.01)、主动脉eNOS蛋白表达增加(P<0.01),NOX4表达降低(P<0.01)。结论联用Ses和Vit E通过上调eNOS和下调NOX4蛋白表达,改善D-gal和AlCl_(3)诱导的大鼠主动脉内皮功能障碍。 展开更多
关键词 内皮功能障碍 芝麻素 维生素E 内皮型一氧化氮合酶 NAD(P)H氧化酶4
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湖南娄底市犬弓首蛔虫流行状况及线粒体cox 1和nad 4序列变异分析 被引量:2
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作者 王先坤 李静 《中国兽医杂志》 CAS 北大核心 2022年第4期40-44,共5页
为了解湖南省娄底市犬弓首蛔虫流行状况及虫株遗传变异情况,本试验于2021年3—9月对该地区368份犬粪便和104份环境(土壤和水源)样品的犬弓首蛔虫污染情况进行调查;对9个犬弓首蛔虫分离株线粒体cox 1和nad 4序列进行扩增、测序与分析。... 为了解湖南省娄底市犬弓首蛔虫流行状况及虫株遗传变异情况,本试验于2021年3—9月对该地区368份犬粪便和104份环境(土壤和水源)样品的犬弓首蛔虫污染情况进行调查;对9个犬弓首蛔虫分离株线粒体cox 1和nad 4序列进行扩增、测序与分析。结果显示:被调查的犬粪便和环境样品的犬弓首蛔虫虫卵检出率分别为13.59%(50/368)和18.27%(19/104);其中宠物犬(11.74%)较流浪犬(17.36%)来源粪便样品检出率低,公园来源土壤样品(9.09%)较小区来源样品(3.92%)检出率高;9个犬弓首蛔虫分离株线粒体cox 1和nad 4序列长度分别为424 bp和1197 bp,核苷酸序列同源性为99.4%~100.0%和98.7%~100.0%,与其他具有代表性蛔虫分离株对应序列同源性均低于90%;9个犬弓首蛔虫分离株线粒体cox 1和nad 4序列核苷酸多样性分别为0.007±0.002和0.006±0.003。结果表明湖南娄底市犬弓首蛔虫分离株遗传变异较低,但虫卵流行状况严重,且存在于公共环境中,对人类健康造成潜在威胁。 展开更多
关键词 犬弓首蛔虫 流行情况 线粒体cox 1和nad 4 遗传变异
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福建省蛇源裂头蚴的分子鉴定及遗传分析 被引量:1
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作者 宋肇程 陈育琪 +4 位作者 黄潇航 魏坤亚 张龙 殷光文 黄志坚 《动物医学进展》 北大核心 2021年第1期37-45,共9页
裂头蚴病是由于裂头蚴感染引起的一种人兽共患病,为了对福建省养殖蛇类的裂头蚴感染情况进行调查并鉴定虫种,对采自福建省三明市、漳州市和南平市等地蛇场的蛇类进行剖检,分离得到了裂头蚴,记录寄生部位和数量。提取裂头蚴虫体基因组,采... 裂头蚴病是由于裂头蚴感染引起的一种人兽共患病,为了对福建省养殖蛇类的裂头蚴感染情况进行调查并鉴定虫种,对采自福建省三明市、漳州市和南平市等地蛇场的蛇类进行剖检,分离得到了裂头蚴,记录寄生部位和数量。提取裂头蚴虫体基因组,采用PCR对虫体ITS、NAD4和COX3基因进行了扩增。同时,将扩增得到的目的基因连接到pEASY-Blunt Simple载体上,转化Trans I-T1感受态细胞,培养得到单菌落,对菌落进行扩增测序。将测序结果与NCBI公布的裂头蚴ITS、NAD4和COX3基因序列进行比对分析,测定突变率和位点,并且进行样本之间的同源性分析和测定遗传距离。结果发现,三明市、漳州市和南平市某蛇场裂头蚴的感染率分别为75%、20%和0。分离到的裂头蚴ITS基因序列长为1360 bp~1380 bp,与NCBI中Spirometra erinaceieuropaei(FJ886747.1)的ITS基因同源性为95.70%~98.68%,样本之间平均遗传距离为0.0016;分离到的裂头蚴NAD4基因序列长为356 bp~650 bp,与NCBI中Spirometra erinaceieuropaei(HM475076.1)的NAD4基因同源性为96.73%~100%,样本之间平均遗传距离为0.0041;分离到的裂头蚴COX3基因序列总长为379 bp~408 bp,与NCBI中Spirometra erinaceieuropaei(HM475033.1)的COX3基因同源性为98.94%~100%,样本之间平均遗传距离为0.0038。结果表明,此次分离得到的裂头蚴虫体的ITS基因、NAD4基因和COX3基因与欧猥迭宫绦虫裂头蚴同源性较近,证明此次分离的蛇源裂头蚴属于欧猥迭宫绦虫裂头蚴。同时,经过对各虫体间NAD4和COX3基因分析发现,不同地区的裂头蚴虫体在进化树上存在分支。 展开更多
关键词 蛇源裂头蚴 内部转录间隔区 烟酰胺腺嘌呤二核苷酸脱氢酶亚单位4 线粒体细胞色素C氧化酶第Ⅲ亚基
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