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细颈囊尾蚴四川和云南分离株线粒体nadl和coxl基因的序列测定与种系发育分析
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作者 郝桂英 杨应东 +4 位作者 古小彬 阳爱国 郭莉 王淑贤 杨光友 《寄生虫与医学昆虫学报》 CAS 2012年第4期204-212,共9页
用PCR方法扩增分离自我国四川和云南2省5地山羊和猪共24个细颈囊尾蚴标本的线粒体烟酰胺腺嘌呤二核苷酸还原酶第1亚基(nadl)基因部分序列(pnadl)和细胞色素c氧化酶第1亚基(coxl)基因全序列,分析其遗传变异,并用MEGA4.0程序NJ法... 用PCR方法扩增分离自我国四川和云南2省5地山羊和猪共24个细颈囊尾蚴标本的线粒体烟酰胺腺嘌呤二核苷酸还原酶第1亚基(nadl)基因部分序列(pnadl)和细胞色素c氧化酶第1亚基(coxl)基因全序列,分析其遗传变异,并用MEGA4.0程序NJ法和Bayesian3.1程序贝叶斯推理法绘制种系发育树,探讨不同地区来源的细颈囊尾蚴种群间的遗传相似性及其他带科带属绦虫的亲缘关系。测序结果显示,细颈囊尾蚴的pnadl序列长度为780bp,coxl基因全序列长度为1620bp。pnadl和coxl基因序列均存在一定的遗传变异,且pnadl序列的变异高于coxl基因序列。系统发育树显示,所有细颈囊尾蚴构成一个分支,可分为3个亚群,均未形成明显的地理分支或宿主分支。因此nadl基因是更适合于研究细颈囊尾蚴系统发生的遗传标记,同时两者在种内均相对保守,与其他带科绦虫种间差异较大,故均可用于细颈囊尾蚴的分子分类。 展开更多
关键词 细颈囊尾蚴 nad1基因 cox1基因 遗传变异 种系发育
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湖南省泡状带绦虫线粒体nad1基因的序列测定及分析 被引量:1
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作者 伍慧兰 《湖南第一师范学院学报》 2011年第4期137-140,共4页
以从我国湖南长沙和湘西犬小肠中采集的2条泡状带绦虫作为研究对象,用引物JB11及JB12扩增泡状带绦虫的pnad1片段,应用ClustalX 1.81程序对序列进行比对,同时利用DNAstar5.0中的Megalign程序进行同源性分析。结果显示来自湖南长沙和湘西... 以从我国湖南长沙和湘西犬小肠中采集的2条泡状带绦虫作为研究对象,用引物JB11及JB12扩增泡状带绦虫的pnad1片段,应用ClustalX 1.81程序对序列进行比对,同时利用DNAstar5.0中的Megalign程序进行同源性分析。结果显示来自湖南长沙和湘西的2条泡状带绦虫的pnad1序列均为391bp。研究结果为泡状带绦虫进一步的分类、鉴定和遗传变异研究奠定了基础。 展开更多
关键词 泡状带绦虫 线粒体DNA nad1基因 序列分析
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基于线粒体cox1和nad1基因对青海牦牛种系发育关系的研究 被引量:4
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作者 钱建新 钱和平 +1 位作者 徐志伟 袁彬彬 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2013年第2期151-154,共4页
本研究选取4头青海牦牛作为研究对象,用2对引物扩增青海牦牛的线粒体细胞色素c氧化酶第1亚基(cox1)基因部分序列(pcox1)和烟酰胺腺嘌呤二核苷酸(NADH)脱氢酶亚单位1基因(nad1)部分序列(pnad1),并用pcox1和pnad1序列重构青海牦牛与其他... 本研究选取4头青海牦牛作为研究对象,用2对引物扩增青海牦牛的线粒体细胞色素c氧化酶第1亚基(cox1)基因部分序列(pcox1)和烟酰胺腺嘌呤二核苷酸(NADH)脱氢酶亚单位1基因(nad1)部分序列(pnad1),并用pcox1和pnad1序列重构青海牦牛与其他牛的进化关系。对测定获得序列应用ClustalX 1.81程序进行比对,然后用Phylip 3.67程序MP法,并用Puzzle 5.2程序构建最大似然树。结果表明,所获得的4头牦牛样品pcox1和pnad1基因序列分别为823和837bp,种系发育分析表明,青海牦牛样品与GenBank已知的牦牛位于同一分支,与其他牛所属分支相隔较远。 展开更多
关键词 青海牦牛 线粒体DNA cox1基因 nad1基因 种系发育关系
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河北保定地区羊多头蚴和犬多头带绦虫的调查与鉴定 被引量:1
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作者 于合宅 《中国兽医杂志》 CAS 北大核心 2017年第6期18-20,共3页
为了解河北省山羊多头蚴和犬多头带绦虫的感染情况,本研究对河北省涞源县、阜平县和易县的山羊和犬进行绦蚴虫感染情况调查,并通过PCR技术对多头蚴与多头带绦虫分离株线粒体pnad1基因部分序列进行扩增与分析,确定多头蚴和多头带绦虫之... 为了解河北省山羊多头蚴和犬多头带绦虫的感染情况,本研究对河北省涞源县、阜平县和易县的山羊和犬进行绦蚴虫感染情况调查,并通过PCR技术对多头蚴与多头带绦虫分离株线粒体pnad1基因部分序列进行扩增与分析,确定多头蚴和多头带绦虫之间的种系发育关系。结果显示,调查区域山羊多头蚴与犬多头带绦虫感染率分别为2.38%和15.33%,通过DNAStar软件分析,所获得多头蚴和多头带绦虫分离株分别与四川多头带绦虫分离株的相似性分别为98.9%~99.5%和99.5%~99.8%,确定羊多头蚴为犬多头带绦虫的幼虫。 展开更多
关键词 多头蚴 多头带绦虫 调查 pnad1基因 鉴定
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青海天峻地区人和羊源细粒棘球蚴流行株基因分型及基因多态性研究 被引量:6
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作者 张学勇 简莹娜 +4 位作者 李秀萍 韩秀敏 才旦卓玛 李福寿 马利青 《中国血吸虫病防治杂志》 CAS CSCD 北大核心 2018年第2期173-178,共6页
目的解析青海天峻地区人和绵羊细粒棘球蚴流行株的基因型及基因多态性。方法根据Gen Bank公布的细粒棘球绦虫线粒体基因组序列,分别针对cox1和nad1基因设计特异性引物,对16份绵羊源和2份人源细粒棘球蚴分离株样品进行PCR扩增、测序及cox... 目的解析青海天峻地区人和绵羊细粒棘球蚴流行株的基因型及基因多态性。方法根据Gen Bank公布的细粒棘球绦虫线粒体基因组序列,分别针对cox1和nad1基因设计特异性引物,对16份绵羊源和2份人源细粒棘球蚴分离株样品进行PCR扩增、测序及cox1和nad1基因核苷酸序列多态性和单倍型分析。结果 18株细粒棘球蚴分离株均属于G1型。其中cox1基因单倍型共有9种,变异位点16个,单倍型序列之间碱基差异0~5个,变异率达0.31%;nad1基因单倍型共有7种,涉及变异位点共15个,单倍型序列之间碱基差异1~8个,变异率达0.89%。结论青海天峻地区人和绵羊细粒棘球蚴流行株为G1型,其cox1基因多态性较nad1基因多态性丰富;cox1基因用于细粒棘球蚴分离株间核苷酸多态性分析的分辨率较高。 展开更多
关键词 细粒棘球蚴 cox1基因 nad1基因 基因分型 基因多态性
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湖南省华支睾吸虫线粒体cox1和nad1基因的克隆及进化分析 被引量:5
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作者 伍慧兰 庄远红 黄文 《中国兽医科学》 CAS CSCD 北大核心 2012年第1期8-12,共5页
为了研究湖南省华支睾吸虫分离株线粒体细胞色素c氧化酶第Ⅰ亚基(cox1)基因部分序列(pcox1)和烟酰胺腺嘌呤二核苷酸脱氢酶亚单位Ⅰ基因(nad1)部分序列(pnad1)的遗传变异情况,并用pcox1和pnad1序列构建华支睾吸虫与其他吸虫的种群遗传进... 为了研究湖南省华支睾吸虫分离株线粒体细胞色素c氧化酶第Ⅰ亚基(cox1)基因部分序列(pcox1)和烟酰胺腺嘌呤二核苷酸脱氢酶亚单位Ⅰ基因(nad1)部分序列(pnad1)的遗传变异情况,并用pcox1和pnad1序列构建华支睾吸虫与其他吸虫的种群遗传进化树。应用聚合酶链反应扩增华支睾吸虫虫株的pcox1和pnad1,应用ClustalX 1.81程序对序列进行比对,然后用Phylip3.67程序中的MP法和MEGA4.0程序NJ法绘制种系发育树,并用Puzzle5.2程序构建最大似然树。结果显示,所获得的pcox1和pnad1序列长度分别为1 100bp和790bp,种系发育进化表分析表明,25个华支睾吸虫分离株位于同一分枝。证实华支睾吸虫pcox1和pnad1序列种内相对保守,种间差异较大,故可作为种间遗传变异研究的标记,从而为华支睾吸虫的分类鉴定以及进一步的分子流行病学调查和群体遗传研究奠定基础。 展开更多
关键词 华支睾吸虫 线粒体DNA cox1基因 nad1基因 种系发育关系
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基于线粒体nad1和nad4基因对四川省多头带绦虫种群遗传多样性的分析 被引量:2
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作者 郝桂英 杨应东 +1 位作者 周英姿 杨光友 《中国兽医科学》 CAS CSCD 北大核心 2014年第3期251-257,共7页
为探讨多头带绦虫的种群遗传多样性,应用PCR方法扩增20株分离自四川省攀枝花市、雅安市、成都市的山羊脑部和肌间的多头蚴的线粒体nadl基因和nad4基因的部分序列,并进行分析。序列分析结果显示,20株多头蚴的pnadl基因和pnad4基因序... 为探讨多头带绦虫的种群遗传多样性,应用PCR方法扩增20株分离自四川省攀枝花市、雅安市、成都市的山羊脑部和肌间的多头蚴的线粒体nadl基因和nad4基因的部分序列,并进行分析。序列分析结果显示,20株多头蚴的pnadl基因和pnad4基因序列分别有2个和8个变异位点,长度分别为753bp和801bp,变异率分别为0~0.3%和0~0.8%,检测出3个和6个单倍型,总的单倍型多样性分别为0.574±0.055和0.742±0.074,核苷酸多样性分别为0.00082±0.00053和0.00288±0.001,平均遗传距离分别为0.002和0.003。构建的种系发育树显示,四川分离株与已知多头带绦虫位于同一分支,且与分布的地理区域、寄生部位没有直接的相关性。结果表明,四川多头带绦虫的遗传多样性水平低,其中nadl基因的遗传多样性水平低于nad4基因的遗传多样性。 展开更多
关键词 多头带绦虫 nad1基因 nad4基因 遗传多样性 四川省
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细粒棘球绦虫G3基因型(水牛株)的研究进展 被引量:1
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作者 刘全元 闫鸿斌 +5 位作者 娄忠子 李立 史万贵 刘聪暖 殷宏 贾万忠 《中国兽医科学》 CAS CSCD 北大核心 2013年第11期1206-1210,共5页
论述了细粒棘球绦虫G3基因型(水牛株)的分子遗传标记特征及变异情况、宿主范围、地理分布、流行病学意义,分析了G3基因型研究中存在的挑战,预测了G3基因型的未来研究方向,旨在给从事该领域研究的学者提供丰富的分子流行病学信息,为棘球... 论述了细粒棘球绦虫G3基因型(水牛株)的分子遗传标记特征及变异情况、宿主范围、地理分布、流行病学意义,分析了G3基因型研究中存在的挑战,预测了G3基因型的未来研究方向,旨在给从事该领域研究的学者提供丰富的分子流行病学信息,为棘球蚴病分子流行病学调查和防治策略的制定提供理论依据和技术指导。 展开更多
关键词 细粒棘球绦虫 G3基因型 cox1基因 nad1基因 流行病学
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