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纳升级反相液相色谱-串联质谱法分析蜈蚣提取蛋白质 被引量:18
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作者 陈霞 文红梅 +4 位作者 刘睿 朱栋 李伟 周红光 吴勉华 《分析化学》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2014年第2期239-243,共5页
结合聚丙烯酰胺凝胶电泳和纳升级反相液相色谱-串联质谱(nanoRPLC-MS/MS)法系统分析了蜈蚣提取蛋白质胶内酶解和直接酶解产物,并进行数据库检索鉴定蛋白质。建立的nanoLC分析条件为:上样8μL,经Chrom XP-C18毛细管柱(350μm×0.5 m... 结合聚丙烯酰胺凝胶电泳和纳升级反相液相色谱-串联质谱(nanoRPLC-MS/MS)法系统分析了蜈蚣提取蛋白质胶内酶解和直接酶解产物,并进行数据库检索鉴定蛋白质。建立的nanoLC分析条件为:上样8μL,经Chrom XP-C18毛细管柱(350μm×0.5 mm,3μm),2%乙腈(0.1%甲酸)-98%乙腈(0.1%甲酸)梯度洗脱90 min;采用ESI-Q-TOF MS,并在IDA采集模式下分析鉴定蜈蚣提取蛋白质。胶内酶解鉴定到72种蛋白质,直接酶解鉴定到97种蛋白质,二者含26种相同的蛋白质。通过数据库比对,分析了蜈蚣提取蛋白质的生物进程、细胞组分以及功能活性。得到蜈蚣蛋白质具有结合、酶催化、肌动等功能活性,其中结合活性的蛋白质占的比例较大,且多为能量代谢进程中的相关酶类。 展开更多
关键词 纳升级反相液相色谱-串联质谱 蜈蚣 蛋白质 聚丙烯酰胺凝胶电泳
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纳升级反相液相色谱-串联质谱法分析锦灯笼提取物中的蛋白质 被引量:6
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作者 于海洋 晏嘉泽 +1 位作者 郭明 靳艳 《色谱》 CAS CSCD 北大核心 2013年第4期362-366,共5页
通过水提、酸沉法得到锦灯笼果实提取物,其中蛋白质含量为188 mg/g(以提取物干重计),共含有18种氨基酸,其中8种人体必需氨基酸占氨基酸总量的31%。基于鸟枪法蛋白质组学的分析方法,用纳升级反相液相色谱-串联质谱(nano-RPLC-MS/MS)系统... 通过水提、酸沉法得到锦灯笼果实提取物,其中蛋白质含量为188 mg/g(以提取物干重计),共含有18种氨基酸,其中8种人体必需氨基酸占氨基酸总量的31%。基于鸟枪法蛋白质组学的分析方法,用纳升级反相液相色谱-串联质谱(nano-RPLC-MS/MS)系统分析锦灯笼果实提取物中蛋白质的酶解产物,结合数据库检索,共鉴定得到60种蛋白质;通过生物信息学分析,得到锦灯笼提取物中的蛋白质具有催化活性、抗氧化活性、酶调节活性、养分贮液囊活性、运输活性、结合活性六大生物活性,其中鉴定到与抗氧化相关的蛋白质有3种,为锦灯笼中蛋白质的功能性质的进一步研究奠定了基础。 展开更多
关键词 纳升级反相液相色谱-串联质谱 蛋白质 锦灯笼
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纳升级反相液相色谱-串联质谱法分析麦氏弧菌蛋白质组
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作者 李正义 贾俊涛 +6 位作者 姜英辉 王骏 罗继 崔淑华 徐彪 梁成珠 张铁军 《安徽农业科学》 CAS 2015年第33期156-158,183,共4页
[目的]较系统地研究分析麦氏弧菌提取蛋白质。[方法]利用SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)和纳升级反相液相色谱-串联质谱(nano-RPLC-MS/MS)法系统分析了来源于美国龙虾的一株麦氏弧菌F5-1提取总蛋白和总蛋白直接酶解产物,并进行数据... [目的]较系统地研究分析麦氏弧菌提取蛋白质。[方法]利用SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)和纳升级反相液相色谱-串联质谱(nano-RPLC-MS/MS)法系统分析了来源于美国龙虾的一株麦氏弧菌F5-1提取总蛋白和总蛋白直接酶解产物,并进行数据库检索鉴定蛋白质。纳升级反相液相色谱分析条件为:上样量为5μl,经C18预柱(200μm×0.5 mm,3μm,120)脱盐10 min,再经过Chrom XP C_(18)-CL毛细管柱(75μm×15 cm,3μm,120)分析,2%乙腈(0.1%甲酸)-98%乙腈(0.1%甲酸)梯度洗脱90 min,采用ESI-Q-TOF MS,在IDA采集模式下分析鉴定麦氏弧菌提取总蛋白酶解产物。[结果]直接酶解鉴定到1 538种蛋白质,通过Gene Ontology分析了麦氏弧菌F5-1提取总蛋白的分子功能、生物进程和细胞组分。提取的麦氏弧菌蛋白具有催化、结合、结构分子、转录调节因子等功能活性,其中催化活性的蛋白比例较大,且多为参与代谢进程的相关酶类。[结论]研究可为麦氏弧菌蛋白质组学的深入研究奠定基础。 展开更多
关键词 纳升及反相液相色谱-串联质谱 麦氏弧菌 蛋白质组
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亲水作用-反相二维液相色谱串联质谱法鉴定水稻蛋白质 被引量:5
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作者 高欢欢 马有宁 +5 位作者 林晓燕 柴爽爽 秦美玲 张涵彤 何巧 陈铭学 《分析化学》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2018年第5期650-657,共8页
建立了亲水作用-反相二维液相色谱串联质谱分析水稻叶片蛋白质组学的方法。利用标准肽段系统分析了液相色谱流动相酸碱度对二维亲水作用-反相色谱系统正交性的影响。结果表明,第一维亲水作用色谱在碱性(pH 9.3)和第二维反相色谱在酸性(p... 建立了亲水作用-反相二维液相色谱串联质谱分析水稻叶片蛋白质组学的方法。利用标准肽段系统分析了液相色谱流动相酸碱度对二维亲水作用-反相色谱系统正交性的影响。结果表明,第一维亲水作用色谱在碱性(pH 9.3)和第二维反相色谱在酸性(pH 3.3)的条件下,正交性最佳(R^2=0.34113)。在此基础上,结合馏分收集技术进一步评价了本测试系统在水稻叶片蛋白质分析中的正交性。结果表明,在所有馏分收集组分中,鉴定次数小于2次的水稻叶片肽段占总肽段数目的 50%以上,且一维液相色谱馏分收集的肽段在第二维色谱及质谱分离分析中,可以较好地分布在不同时间段的洗脱窗口,表明本研究建立的亲水作用-反相二维液相色谱串联质谱结合馏分收集技术在复杂水稻叶片蛋白质分离鉴定中可提供良好的的分离正交性。结合水稻蛋白质数据库检索,共鉴定出207345个肽段,归属于2930个蛋白质簇。 展开更多
关键词 亲水作用-反相二维液相色谱 蛋白质 水稻叶片 纳升级液相色谱串联质谱 正交性
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新型亲和去垢小柱净化-液相色谱-串联质谱法分析水稻叶片蛋白质组 被引量:7
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作者 曹晓林 巩佳第 +3 位作者 陈铭学 于莎莎 卞英芳 曹赵云 《色谱》 CAS CSCD 北大核心 2014年第11期1181-1186,共6页
采用亲和去垢小柱净化,建立了水稻叶片蛋白质组的纳升液相色谱-串联质谱分析方法。水稻叶片蛋白质分别采用酚提取法结合十二烷基硫酸钠(sodium dodecyl sulfate,SDS)裂解,裂解液经亲和去垢小柱净化,酶解肽段用纳升液相色谱-线性离子阱/... 采用亲和去垢小柱净化,建立了水稻叶片蛋白质组的纳升液相色谱-串联质谱分析方法。水稻叶片蛋白质分别采用酚提取法结合十二烷基硫酸钠(sodium dodecyl sulfate,SDS)裂解,裂解液经亲和去垢小柱净化,酶解肽段用纳升液相色谱-线性离子阱/静电场轨道阱组合式高分辨质谱(nanoLC-LTQ/Orbitrap MS)分析,相关数据库检索鉴定。比较了超滤辅助样品制备法(FASP法)、亲和去垢小柱法和丙酮沉淀法对SDS去除效率及对蛋白质鉴定结果的影响。结果表明:3种方法均有较好的SDS去除效果(去除效率均大于95%);尽管3种方法鉴定的蛋白质种类具有一定的互补性,但以亲和去垢小柱法鉴定的蛋白质数目最多,为563种,远多于FASP法和丙酮沉淀法的196和306种;此外,亲和去垢小柱法适合于各种相对分子质量和不同pI值蛋白质的净化,而FASP法和丙酮沉淀法中不同相对分子质量和pI值蛋白质均有类似程度的损失。采用本文建立的方法,一次进样分析可鉴定出水稻叶片蛋白质多达588种;肽段匹配数≥2的296个蛋白质的生物学功能主要分为结合活性、酶活性、转移运输活性和结构组成等。该蛋白质分析方法可为开展水稻蛋白质组学研究提供技术参考。 展开更多
关键词 亲和去垢小柱 纳升液相色谱-线性离子阱/ 静电场轨道阱组合式高分辨质谱 鸟枪法 蛋白质组学 水稻叶片 十二烷基硫酸钠
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纳流液相分离与电感耦合等离子体质谱联用技术研究新进展 被引量:6
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作者 丁芳芳 朱珏 +1 位作者 郭睿 张博 《色谱》 CAS CSCD 北大核心 2019年第2期132-142,共11页
高效微纳液相分离技术如纳流液相色谱、毛细管电泳、微芯片色谱/电泳等与电感耦合等离子体质谱(ICP-MS)检测技术联用,既具有前端分离技术高选择性、高灵敏度、快速、低样品消耗的特点,又结合了后端ICP-MS检测分辨率高、动态范围宽、可... 高效微纳液相分离技术如纳流液相色谱、毛细管电泳、微芯片色谱/电泳等与电感耦合等离子体质谱(ICP-MS)检测技术联用,既具有前端分离技术高选择性、高灵敏度、快速、低样品消耗的特点,又结合了后端ICP-MS检测分辨率高、动态范围宽、可绝对定量等优势,正在发展成为一种重要的高内涵联用分析手段。该文对近年来纳流液相分离与ICP-MS联用装置的发展作一系统介绍,对其在化学与生物化学分析等领域的应用予以综述,并展望了该联用技术的发展前景。 展开更多
关键词 纳流液相分离 液相色谱-质谱联用 接口技术 电感耦合等离子体质谱 综述
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填充型纳流液相色谱长柱的蛋白质组学分析性能考察 被引量:1
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作者 王晓飞 秦飞 +1 位作者 郭睿 张博 《分析化学》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2019年第3期388-393,共6页
纳流液相色谱长柱用于蛋白质组学分析中,可以显著提高多肽的分离度和检出率,进而提高蛋白质的鉴定数目和可信度。本研究基于纳流液相色谱-电喷雾质谱联用平台,考察了柱床长度为1.5 m的超长纳流液相色谱柱,将其用于蛋白质组学分析中。与... 纳流液相色谱长柱用于蛋白质组学分析中,可以显著提高多肽的分离度和检出率,进而提高蛋白质的鉴定数目和可信度。本研究基于纳流液相色谱-电喷雾质谱联用平台,考察了柱床长度为1.5 m的超长纳流液相色谱柱,将其用于蛋白质组学分析中。与常规纳流色谱柱相比,使用长柱时,复杂多肽样品得到了优良的分离效果。蛋白质组学数据检索结果表明,使用1.5 m长柱进行前端的色谱分离,采用质谱识别肽段数提升了83.6%,肽段数目提升了74.4%,唯一肽段数目提升了75.0%,蛋白质鉴定数目提升了38.4%。研究结果表明,这类填充型纳流液相色谱长柱为高分辨蛋白质组学提供了一种新的分离工具。 展开更多
关键词 纳流液相色谱 毛细管液相色谱 填充柱 蛋白质组学 质谱
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Flow Field-Flow Fractionation with Mass Spectrometry for Top-Down and Bottom-Up Lipidomics
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作者 Seul Kee Byeon Myeong Hee Moon 《Journal of Analysis and Testing》 EI 2017年第3期193-201,共9页
As lipidomics has attracted increased attention in life science,advanced mass spectrometry(MS)technologies have been combined with other separation techniques to improve and expand the branch of study.This review inte... As lipidomics has attracted increased attention in life science,advanced mass spectrometry(MS)technologies have been combined with other separation techniques to improve and expand the branch of study.This review intends to provide general knowledge of offline and online coupling of flow field-flow fractionation(FlFFF)—a technique that encompasses the separation of nano-to micro-scale biomolecules—with MS for analysis of blood plasma lipoproteins,processes that are considered bottomup and top-down approaches,respectively.The first part of this review focuses on the bottom-up method using multiplexed hollow fiber FlFFF(MxHF5)and nanoflow liquid chromatography electrospray-ionization tandem mass spectrometry(nLC-ESI–MS/MS)for non-targeted identification of lipids.In this protocol,plasma lipoproteins of different types are collected using MxHF5,and the lipids within the lipoproteins are then extracted and analyzed via nLC-ESI–MS/MS.The second part of the review describes the top-down approach,which uses online coupling of miniaturized FlFFF to ESI–MS for a fast screening of targeted lipids.Here,the separation of lipoproteins and detection of their component lipids are achieved simultaneously.While both methods aim to quantify the lipids within lipoproteins,the bottom-up approach provides an extensive lipidome,whereas the top-down method is suitable for high-speed targeted lipidomic analysis.This review discusses variants of FlFFF-ESI–MS/MS that offer effective analytical technologies for lipidomics. 展开更多
关键词 LIPIDS LIPOPROTEINS Flow field-flow fractionation nanoflow liquid chromatography electrospray-ionization tandem mass spectrometry
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基于NanoLC-Orbitrap MS技术分析牛乳中的乳脂肪球膜蛋白质 被引量:6
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作者 景萌娜 张咚咚 +4 位作者 姜铁民 魏京华 张毅 刘斌 陈历俊 《中国食品学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2018年第4期244-252,共9页
运用纳升高效液相色谱与静电场轨道阱组合式高分辨质谱(Nano LC-Orbitrap MS)技术对牛乳中的乳脂肪球膜蛋白质进行定性、定量分析。采用超高速离心提取的方法,从牛乳中分离提取乳脂肪球膜蛋白,经超滤管辅助酶解法前处理,用Nano LC-Orbit... 运用纳升高效液相色谱与静电场轨道阱组合式高分辨质谱(Nano LC-Orbitrap MS)技术对牛乳中的乳脂肪球膜蛋白质进行定性、定量分析。采用超高速离心提取的方法,从牛乳中分离提取乳脂肪球膜蛋白,经超滤管辅助酶解法前处理,用Nano LC-Orbitrap MS技术分析酶解后的肽段,与数据库检索比对识别蛋白质,并利用PANTHER数据库对所识别的肽段匹配数≥2的蛋白质进行基因本体功能注释和分类。运用两个技术重复和3次连续进样,验证方法的重复性和精确度;从比对结果中提取部分离子流色谱图和二级质谱图,显示出质谱的高可靠性和灵敏度。采用此方法一次进样分析,可识别的蛋白质多达658种,选取识别出611种蛋白质的数据进行分析,具有可靠定量信息的蛋白593种,特异性肽段匹配数≥2的蛋白244种,对这244种蛋白进行GO注释,结果显示这些蛋白主要分布在细胞部分、细胞器、细胞膜和一些高分子复合物中,参与代谢过程、细胞过程、定位、生物调节和免疫系统过程等生物途径,具有很多的分子功能,如催化活性、粘合作用、转运活性、酶调节活性和结构分子活性等。此方法可为基于质谱技术的蛋白组学在乳脂肪球膜蛋白质的应用中提供理论指导。 展开更多
关键词 乳脂肪球膜蛋白 纳升高效液相色谱-静电场轨道阱组合式高分辨质谱 超高速离心提取 超滤管辅助酶解 蛋白质组学
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