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鼻咽癌上皮细胞株HNE1差异表达基因的分离与鉴定
被引量:
2
1
作者
张必成
周洁
+7 位作者
朱诗国
龚佳蕾
聂新民
吕红斌
何显锋
李小玲
胡赓熙
李桂源
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2003年第6期743-750,共8页
为了分离鼻咽癌差异表达基因 ,应用抑制性扣除杂交技术 ,在正向抑制性扣除杂交中 ,以鼻咽癌上皮细胞株HNE1cDNA作为检测子 ,以人胚鼻咽上皮细胞cDNA作为驱赶子 ;在反向抑制性扣除杂交中 ,以人胚鼻咽上皮细胞cDNA作为检测子 ,以鼻咽癌上...
为了分离鼻咽癌差异表达基因 ,应用抑制性扣除杂交技术 ,在正向抑制性扣除杂交中 ,以鼻咽癌上皮细胞株HNE1cDNA作为检测子 ,以人胚鼻咽上皮细胞cDNA作为驱赶子 ;在反向抑制性扣除杂交中 ,以人胚鼻咽上皮细胞cDNA作为检测子 ,以鼻咽癌上皮细胞株HNE1cDNA作为驱赶子 ,分别通过抑制性扣除杂交 ,构建了鼻咽癌上皮细胞株HNE1表达下调和表达上调的两个扣除cDNA文库 .从鼻咽癌相关的扣除cDNA文库中随机挑取 1 2 0 0个克隆 ,采用菌落PCR扩增其插入cDNA片段 ,自动点膜制备成cDNA微阵列膜 ,分别用鼻咽癌上皮细胞株HNE1、人胚鼻咽上皮mRNA经逆转录标记cDNA探针 ,分别与cDNA微阵列膜杂交 ,通过杂交信号的自动扫描分析 ,对杂交信号存在 5倍差异的克隆进行测序 ,获得了 1 0个鼻咽癌差异表达基因的cDNA片段 ,其中 3个为新基因序列 ,其GenBank登录号为 :AF5 1 0 1 88、AF5 1 0 1 89和AF5 1 0 1 90 ,7个代表已知基因序列 .采用RT PCR证实S1 0 0A8,CK1 9和RBP1基因在人胚鼻咽上皮中高表达而在鼻咽癌细胞株HNE1中低表达 .
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关键词
鼻咽癌细胞株HNEl
抑制性扣除杂交
cdna
微阵列
差异表达基因
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职称材料
题名
鼻咽癌上皮细胞株HNE1差异表达基因的分离与鉴定
被引量:
2
1
作者
张必成
周洁
朱诗国
龚佳蕾
聂新民
吕红斌
何显锋
李小玲
胡赓熙
李桂源
机构
中南大学湘雅医学院肿瘤研究所
中国科学院上海生物化学和细胞生物学研究所
出处
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2003年第6期743-750,共8页
基金
国家 8 63项目 (No .2 0 0 1AA2 2 10 3 1)
973重点项目 (No .G19980 5 10 0 8)资助~~
文摘
为了分离鼻咽癌差异表达基因 ,应用抑制性扣除杂交技术 ,在正向抑制性扣除杂交中 ,以鼻咽癌上皮细胞株HNE1cDNA作为检测子 ,以人胚鼻咽上皮细胞cDNA作为驱赶子 ;在反向抑制性扣除杂交中 ,以人胚鼻咽上皮细胞cDNA作为检测子 ,以鼻咽癌上皮细胞株HNE1cDNA作为驱赶子 ,分别通过抑制性扣除杂交 ,构建了鼻咽癌上皮细胞株HNE1表达下调和表达上调的两个扣除cDNA文库 .从鼻咽癌相关的扣除cDNA文库中随机挑取 1 2 0 0个克隆 ,采用菌落PCR扩增其插入cDNA片段 ,自动点膜制备成cDNA微阵列膜 ,分别用鼻咽癌上皮细胞株HNE1、人胚鼻咽上皮mRNA经逆转录标记cDNA探针 ,分别与cDNA微阵列膜杂交 ,通过杂交信号的自动扫描分析 ,对杂交信号存在 5倍差异的克隆进行测序 ,获得了 1 0个鼻咽癌差异表达基因的cDNA片段 ,其中 3个为新基因序列 ,其GenBank登录号为 :AF5 1 0 1 88、AF5 1 0 1 89和AF5 1 0 1 90 ,7个代表已知基因序列 .采用RT PCR证实S1 0 0A8,CK1 9和RBP1基因在人胚鼻咽上皮中高表达而在鼻咽癌细胞株HNE1中低表达 .
关键词
鼻咽癌细胞株HNEl
抑制性扣除杂交
cdna
微阵列
差异表达基因
Keywords
nasopharyngeal carcinoma cell line hne1
,
suppression subtractive hybridization
,
cdna microarray
,
differentially expressed genes
分类号
R739.63 [医药卫生—肿瘤]
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题名
作者
出处
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1
鼻咽癌上皮细胞株HNE1差异表达基因的分离与鉴定
张必成
周洁
朱诗国
龚佳蕾
聂新民
吕红斌
何显锋
李小玲
胡赓熙
李桂源
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2003
2
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参考文献
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