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题名基于NTO类型图解苏氨酸分子体系的价层激发
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作者
鲍捷
欧仁侠
祝颖
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机构
吉林医药学院生物医学工程学院
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出处
《吉林大学学报(理学版)》
CAS
北大核心
2021年第1期156-161,共6页
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基金
吉林省教育厅“十三五”科学技术研究项目(批准号:吉教科合字[JJKH20180825KJ]).
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文摘
在B3LYP/6-31G(d)基组水平上优化隐式溶剂甲醇下右旋体苏氨酸(R-Thr)分子的几何构型,根据该结构,在Mo6-2X/6-311G(d)、TZVP和def2-TZVP基组水平上,用含时密度泛函理论(TDDFT)方法进行电子激发计算,并通过指认自然跃迁轨道(NTO)类型方法研究R-Thr-CH 3OH分子体系价层电子激发类型.结果表明:TZVP基组与def2-TZVP基组激发类型判断结果基本一致,6-311G(d)基组与其他两种基组水平对比,激发类型判断结果差异较大;NTO类型分析与理论数据Δr指数分析配合使用,对R-Thr-CH 3OH分子体系电子激发类型和激发模式指认具有实际意义.
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关键词
苏氨酸
电子激发类型
自然跃迁轨道
隐式溶剂甲醇
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Keywords
threonine
electronic excitation type
natural transition orbit(nto)
implicit solvent methanol
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分类号
O561.4
[理学—原子与分子物理]
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题名苯丙氨酸电荷转移百分数的理论计算
被引量:1
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作者
祝颖
陈洪斌
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机构
吉林医药学院生物医学工程学院
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出处
《吉林大学学报(理学版)》
CAS
北大核心
2019年第2期417-422,共6页
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基金
吉林省教育厅"十三五"科学技术研究项目(批准号:吉教科合字[JJKH20180825KJ])
吉林省教育厅"十二五"科学技术研究项目(批准号:吉教科合字[2014545])
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文摘
采用密度泛函理论中的CAM-B3LYP方法,在6-31G(d)基组水平上优化不同条件下左旋体苯丙氨酸(S-Phe)分子的几何构型.结果表明:在隐式溶剂甲醇与气相条件下,S-Phe分子体系电荷转移的定性结果基本一致,定量结果略有差别,其中各片段的S2激发态基本一致,仅COOH片段的S2激发态差别为2.2%,S4激发态差别为0.4%~2.8%;在不同环境下,定性分析缺少一个S5激发态,由Becke方法计算的激发态S2和S4电荷转移相差分别约为2.5%~8%.
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关键词
苯丙氨酸
自然跃迁轨道
电荷转移
轨道片段
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Keywords
phenylalanine
natural transition orbit(nto)
charge transfer
orbital fragment
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分类号
O561.4
[理学—原子与分子物理]
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题名基于分子轨道隐式溶剂H2O下苏氨酸的电荷转移
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作者
祝颖
陈洪斌
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机构
吉林医药学院生物医学工程学院
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出处
《吉林大学学报(理学版)》
CAS
北大核心
2019年第4期951-956,共6页
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基金
吉林省教育厅“十三五”科学技术研究项目(批准号:吉教科合字[JJKH20180825KJ])
吉林省教育厅“十二五”科学技术研究项目(批准号:吉教科合字[2014545])
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文摘
基于分子轨道(MO)和自然跃迁轨道(NTO)成分计算分子片段间的电荷转移.先用密度泛函理论(DFT)中的CAM-B3LYP方法,在6-31G(d)基组水平上优化隐式溶剂H2O下苏氨酸(Thr)分子的几何构型,再在相同理论方法下进行含时密度泛函理论(TDDFT)的电子激发计算,给出隐式溶剂H2O下Thr分子体系电子激发过程中片段间电荷转移特征的对比结果.结果表明:在S1~S5激发态中,仅S2中有一对MO32→MO33跃迁轨道占绝对优势,可通过分析该轨道的成分讨论电荷转移;其他激发态可通过NTO分析方法讨论电荷转移;S0向激发态S1,S3和S4电荷转移的主要贡献为NTO32→NTO33轨道,与Hirshfeld和Becke方法的定性结果一致,定量结果略有差别。
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关键词
苏氨酸(Thr)
分子轨道
自然跃迁轨道
电荷转移
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Keywords
threonine (Thr)
molecular orbit (MO)
natural transiti on orbit (nto)
charge transfer
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分类号
O561.4
[理学—原子与分子物理]
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