Study on Genetic Marker Bi-PASA of Porcine STCH Gene

[Objectives] This study was conducted to establish the genetic marker Bi-PASA of STCH gene in Jinfen white pig and New Shanxi black pig. [Methods] The polymorphism of STCH gene was detected in Jinfen white pig and New Shanxi black pig by bidirectional PCR amplification of specific alleles. [Results] There were two alleles(A, B) and three genotypes(AA, AB and BB) in Jinfen white pig and New Shanxi black pig. The PopGene32 analysis showed that the polymorphic site of STCH gene in Jinfen white pig accorded with the Hardy-Weinberg equilibrium(P>0.05), while that of new Shanxi black pig did not meet the Hardy-Weinberg equilibrium(P<0.01). The results of chi-square test showed that the polymorphic site of STCH gene was significantly different in genotype distribution between the two pig breeds(P<0.01). [Conclusions] The establishment of the genetic marker Bi-PASA of STCH gene in Jinfen white pig and new Shanxi black pig could provide basic biological data for improving disease resistance of pigs and establishing disease-resistant populations.

猪MyoG基因外显子1的多态性分析

MyoG基因对成肌细胞的融合和肌纤维的形成有影响,因此对肌肉的分化起重要作用。本实验采用PCR-SSCP技术分析MyoG基因在晋汾白猪和新山西黑猪中的多态性,并对基因型进行统计分析。结果显示,MyoG基因在晋汾白猪中有三种基因型:AB、BB、AA,其中A等位基因为优势等位基因,新山西黑猪中也存在AB、BB、AA三种基因型,且B等位基因为优势等位基因。群体遗传学分析得出,晋汾白猪和新山西黑猪中MyoG基因多态性位点均不符合Hardy-Weinberg平衡(p<0.05);晋汾白猪的香农指数为0.6928,新山西黑猪的香农指数为0.6903,说明晋汾白猪的遗传多态性高于新山西黑猪。用SAS8.1软件进行基因型分布差异分析,MyoG基因多态位点在晋汾白猪和新山西黑猪中基因型分布差异极显著(χ2=36.2080,p<0.0001)。通过分析两个猪种MyoG基因的多态性,为提高猪肉肉质和猪的人工选育提供依据。

晋汾白猪和新山西黑猪TAP1基因多态性和组织表达谱研究

抗原处理相关转运体1(Transporter associated with antigen processing 1,TAP1)属于ABC转运体超家族的成员,在免疫反应中起着重要的作用。通过采用PCR-RFLP的方法,对猪TAP1基因外显子3的单核苷酸多态性进行检测和分析,结果表明:在晋汾白猪中检测到三种基因型(AA,AG,GG),而在新山西黑猪中检测到两种基因型(AG,GG),晋汾白猪和新山西黑猪在TAP1基因的多态位点的基因型分布差异极显著(P<0.01)。采用RT-PCR半定量方法检测猪TAP1基因在晋汾白猪和新山西黑猪18个组织中的特异性表达,结果显示TAP1基因在晋汾白猪的心、肝、脾、肾、胃、卵巢、皮肤、肌肉、脂肪、大脑、小脑、支气管、盲肠中表达量较高,而在新山西黑猪的18个组织中表达量均较高。研究成功建立了TAP1基因变异信息及其组织表达情况,将为进一步分析猪TAP1基因的分子标记与免疫调控提供基础资料。

IL1RN基因在晋汾白猪仔猪和新山西黑猪仔猪不同组织和细胞中的表达特征分析

白细胞介素1受体拮抗剂(interleukin 1 receptor antagonist,IL1RN)是一种重要的宿主免疫调节因子,是天然存在的IL-1拮抗剂。为了解IL1RN基因在断奶仔猪不同组织和细胞中表达的特征,利用Trizol法提取晋汾白猪仔猪和新山西黑猪仔猪的心脏、肝脏、脾脏、淋巴细胞、巨噬细胞等18种组织和细胞的总RNA,采用RT-PCR方法检测IL1RN基因在不同组织和细胞中的表达情况,应用SPSS 19.0软件分析IL1RN基因在晋汾白猪仔猪和新山西黑猪仔猪4种免疫组织和细胞(脾脏、淋巴结、巨噬细胞、白细胞)中的表达差异情况。结果显示:IL1RN基因在晋汾白猪仔猪和新山西黑猪仔猪的脂肪组织中均不表达,在其余各组织和细胞中均表达;IL1RN基因在晋汾白猪仔猪的巨噬细胞与淋巴结、脾脏、白细胞之间的表达差异极显著(P<0.01),且在淋巴结与脾脏、白细胞之间的表达差异极显著(P<0.01);IL1RN基因在新山西黑猪仔猪的脾脏、淋巴结、巨噬细胞、白细胞的表达两两之间均呈极显著差异(P<0.01);IL1RN基因在2个猪种的脾脏、巨噬细胞、白细胞之间的表达呈极显著差异(P<0.01),在淋巴结中的表达呈显著差异(P<0.05)。该研究结果为进一步揭示2个猪种的IL1RN基因在疾病抵抗方面的作用及相关机制提供了依据。