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Large-scale study of long non-coding RNA functions based on structure and expression features 被引量:1
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作者 ZHAO Yi WANG Jian +4 位作者 CHEN XiaoWei LUO HaiTao ZHAO YunJie XIAO Yi CHEN RenSheng 《Science China(Life Sciences)》 SCIE CAS 2013年第10期953-959,共7页
Mammals and other complex organisms can transcribe an abundance of long non-coding RNAs(lncRNAs)that fulfill a wide variety of regulatory roles in many biological processes.These roles,including as scaffolds and as gu... Mammals and other complex organisms can transcribe an abundance of long non-coding RNAs(lncRNAs)that fulfill a wide variety of regulatory roles in many biological processes.These roles,including as scaffolds and as guides for protein-coding genes,mainly depend on the structure and expression level of lncRNAs.In this review,we focus on the current methods for analyzing lncRNA structure and expression,which is basic but necessary information for in-depth,large-scale analysis of lncRNA functions. 展开更多
关键词 非编码rna 结构 基础 大规模分析 调控作用 生物过程 哺乳动物 编码基因
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卫星RNA研究新进展:结构与功能表达 被引量:1
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作者 叶寅 郝麟惠 田波 《中国病毒学》 CSCD 1992年第4期367-374,共8页
植物病毒卫星通常是指那些如果没有特定辅助病毒的帮助就不能复制,而它本身对于辅助病毒的复制是不必需的,且与辅助病毒的基因组无序列同源性的一类RNA分子。到目前为止,已报道有六组共26种植物病毒带有卫星。这些植物病毒卫星有的具有... 植物病毒卫星通常是指那些如果没有特定辅助病毒的帮助就不能复制,而它本身对于辅助病毒的复制是不必需的,且与辅助病毒的基因组无序列同源性的一类RNA分子。到目前为止,已报道有六组共26种植物病毒带有卫星。这些植物病毒卫星有的具有编码自身外壳蛋白的遗传信息,称卫星病毒;有的无此编码功能称为病毒卫星RNA。病毒卫星RNA在其发现的早期,其生物学功能尚不为人重视。然而,七十年代早期,在法国阿尔萨斯爆发的由黄瓜花叶病毒(Cucumber Mosaic Virus,CMV)侵染引起的番茄作物坏死病被确定与CMV卫星RNA有关,至此。 展开更多
关键词 卫星rna 结构 功能表达 植物病毒
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木薯中lncRNA-CRR5在低温胁迫下的功能分析 被引量:2
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作者 沈婕 董世满 +1 位作者 李淑霞 彭明 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2021年第1期40-46,共7页
低温胁迫严重影响木薯的生长、产量以及块根品质。长链非编码RNAs(lncRNAs)作为关键的调节因子,在植物响应非生物胁迫过程中发挥重要的功能。然而,lncRNAs在木薯中的功能和调控机制尚无报道。因此,为了研究木薯lncRNAs在低温胁迫应答中... 低温胁迫严重影响木薯的生长、产量以及块根品质。长链非编码RNAs(lncRNAs)作为关键的调节因子,在植物响应非生物胁迫过程中发挥重要的功能。然而,lncRNAs在木薯中的功能和调控机制尚无报道。因此,为了研究木薯lncRNAs在低温胁迫应答中的功能,本研究以木薯主栽品种‘60444’为材料,利用低温处理前后的叶片转录组数据,鉴定到一个受低温胁迫调控的lncRNA(cold-responsive lncRNA5,CRR5)。通过对其序列比对进行同源性分析,RNA二级结构预测和共表达分析鉴定来分析lncRNA-CRR5响应低温胁迫的分子功能。并根据基因的共表达分析推测CRR5的顺式作用和反式作用靶基因。这些结果为更进一步研究CRR5的功能提供了理论依据。 展开更多
关键词 木薯 低温胁迫 lncrna 功能分析 同源性分析 rna二级结构预测 共表达基因分析 靶基因
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宏转录组学在环境微生物生态学中的应用 被引量:6
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作者 李莹 吴兴杰 +3 位作者 贺治斌 贝水宽 马可 彭静静 《中国环境科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2021年第9期4341-4348,共8页
系统总结了宏转录组学实验操作及数据分析流程,概述了宏转录组学在环境微生物生态学的研究策略和最新进展,并指出其应用前景.宏转录组学在解析环境微生物群落功能上具有广阔的前景,为了解微生物群落的动态演化及其与环境因素和生态系统... 系统总结了宏转录组学实验操作及数据分析流程,概述了宏转录组学在环境微生物生态学的研究策略和最新进展,并指出其应用前景.宏转录组学在解析环境微生物群落功能上具有广阔的前景,为了解微生物群落的动态演化及其与环境因素和生态系统功能的关系提供了强有力的工具. 展开更多
关键词 宏转录组 微生物组 群落结构 功能基因 mrna富集 rna
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