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An Improved Strategy for Efficient Expression and Purification of Soluble HIV-1 Tat Protein in E.coli 被引量:2
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作者 Shi-meng ZHANG Rong FAN +4 位作者 Tian-yi YANG Yi SUN Jing-yun LI Qin-zhi XU Ping-kun ZHOU 《Virologica Sinica》 SCIE CAS CSCD 2009年第6期518-528,共11页
Although the endogenous function of Tat has been elucidated in the past twenty years, the study of its exogenous activity has been hampered due to the difficulty of large scale preparation of the active Tat protein. T... Although the endogenous function of Tat has been elucidated in the past twenty years, the study of its exogenous activity has been hampered due to the difficulty of large scale preparation of the active Tat protein. To express the full-length Tat protein in E.coli, the tat gene was cloned from an HIV infected patient by overlapping PCR. Rare codon usage analysis showed that rare E.coli codons, especially consecutive rare codons for Arg, account for 14% (14 of 101) rare E.coli codons in the tat gene. The expression of the HIV-1 tat gene was verified to be very poor in strain BL21 (DE3) due to the abundance of rare codons; however, tat gene expression was found to be very efficient in the host strain of Rosetta-gami B (DE3), which was supplemented with six rare tRNAs for Arg, Leu, Ile and Pro. Subsequent purification revealed that the proteins are soluble and unusually, the tagged Tat can form dimers independent of cystine disulfide bonds. The purity, integrity and molecular weight of the Tat protein were demonstrated by MALDI-TOF mass spectrometry. Reporter gene activating assay was further confirmed by investigating the transactivation activity of the recombinant Tat protein. Our improved strategy for efficient high level expression and purification of soluble Tat protein has paved the way to fully investigate its exogenous function. 展开更多
关键词 HIV tat gene e.coli Protein expression codon usage
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透明颤菌血红蛋白基因的植物化改造合成及其在大肠杆菌中功能的鉴定 被引量:3
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作者 吴巧雯 崔洪志 郭三堆 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2004年第10期1439-1443,共5页
根据透明颤菌血红蛋白(VHb)的氨基酸序列,按照植物偏爱密码子,对透明颤菌血红蛋白基因(vgb)进行优化改造,同时考虑到可实现分别克隆拼接的酶切位点,设计并合成了22条单链DNA短片段,通过拼接获得了全长450bp的透明颤菌血红蛋白基因vgbM,... 根据透明颤菌血红蛋白(VHb)的氨基酸序列,按照植物偏爱密码子,对透明颤菌血红蛋白基因(vgb)进行优化改造,同时考虑到可实现分别克隆拼接的酶切位点,设计并合成了22条单链DNA短片段,通过拼接获得了全长450bp的透明颤菌血红蛋白基因vgbM,并将其克隆至pUC19上,获得重组质粒pGSVHB。利用设计的引物,通过PCR在vgbM基因的5′端引入NcoⅠ位点,将其克隆到原核生物高效表达载体pBV221上,获得质粒pBV221SVHB。转化E.coli.BL21并经热激诱导表达后,在培养物中检测到了约16kD的VHb蛋白。经CO差示光谱分析测定,该蛋白具有生物活性。为透明颤菌血红蛋白基因vgbM在植物基因工程研究中的应用奠定了基础。 展开更多
关键词 透明颤菌血红蛋白基因 酶切位点 偏爱密码子 克隆 植物基因工程 原核生物 诱导表达 BV UC 大肠杆菌
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大肠杆菌非偏爱密码子的数量及位置对外源蛋白表达的影响 被引量:5
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作者 陈明杰 高明明 +1 位作者 姚文兵 高向东 《中国药科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第6期553-556,共4页
目的:研究大肠杆菌非偏爱密码子GGG在目的蛋白中的数量及位置对原核表达体系的影响。方法:以内皮抑素为研究对象,利用Overlapping-PCR定点突变内皮抑素中部密码子为GGG,构建到载体pET28a中,研究内皮抑素表达水平。结果:一个GGG密码子存... 目的:研究大肠杆菌非偏爱密码子GGG在目的蛋白中的数量及位置对原核表达体系的影响。方法:以内皮抑素为研究对象,利用Overlapping-PCR定点突变内皮抑素中部密码子为GGG,构建到载体pET28a中,研究内皮抑素表达水平。结果:一个GGG密码子存在并不会降低或者阻止内皮抑素的表达,两个GGG存在并且距离很近时可显著降低内皮抑素的表达,当3个GGG串联存在时可阻止内皮抑素的表达。结论:GGG数量以及位置的不同可对外源目的蛋白的表达水平造成显著影响。 展开更多
关键词 大肠杆菌非偏爱密码子 内皮抑素 原核表达体系
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大肠杆菌同义密码子重复序列中密码子的使用 被引量:3
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作者 李永香 李宏 王芳平 《内蒙古工业大学学报(自然科学版)》 2006年第1期5-11,共7页
以大肠杆菌基因组为样本,研究同义密码子重复序列与ORF全序列中各密码子相对使用频率的差异,分析同义密码子重复序列中密码子重复的偏好.结果表明部分密码子的使用与ORF全序列中的使用不同,并非所有密码子的使用与基因表达水平正相关;... 以大肠杆菌基因组为样本,研究同义密码子重复序列与ORF全序列中各密码子相对使用频率的差异,分析同义密码子重复序列中密码子重复的偏好.结果表明部分密码子的使用与ORF全序列中的使用不同,并非所有密码子的使用与基因表达水平正相关;同义密码子重复序列中密码子重复具有偏好性,部分密码子重复在四联体中有位置偏好.同义密码子重复的最大长度与所编码的氨基酸亲疏水性质、简并度及构成密码子的碱基性质有关. 展开更多
关键词 大肠杆菌基因组 同义密码子重复序列 同义密码子相对使用 偏好
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β_2肾上腺素受体基因的改造及在无细胞合成体系中的表达
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作者 王健 刘媛 +5 位作者 王玮 刘洋 韩正政 曲丽洁 杨立亭 王若敏 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2018年第12期179-184,共6页
依据大肠杆菌密码子偏好性,设计合成β_2肾上腺素受体(β_2 adrenergic receptor,β_2AR)基因序列,应用大肠杆菌无细胞系统对其进行高效表达,经负载镍离子的顺磁颗粒Magne His?Ni-Particles纯化后,对受体蛋白进行十二烷基硫酸钠-聚丙烯... 依据大肠杆菌密码子偏好性,设计合成β_2肾上腺素受体(β_2 adrenergic receptor,β_2AR)基因序列,应用大肠杆菌无细胞系统对其进行高效表达,经负载镍离子的顺磁颗粒Magne His?Ni-Particles纯化后,对受体蛋白进行十二烷基硫酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳(sodium dodecyl sulfate-polyacrylamide gel electrophoresis,SDS-PAGE)和活性鉴定。结果表明:改造后的β_2AR基因密码子适应指数(codon adaptation index,CAI)为0.96,GC含量从58%降低到46.17%,更有利于该基因在大肠杆菌系统中的表达。表达体系中优化后的Mg^(2+)浓度为22 mmol/L,此时表达量为1 250μg/mL。SDS-PAGE分析显示,纯化蛋白在47 k Da左右出现清晰的特异性条带,与预期结果一致,纯度大于90%。直接酶受体分析检测结果显示,当纯化受体蛋白1∶500稀释包被时,该重组受体与盐酸克伦特罗、沙丁胺醇及莱克多巴胺的酶标记物结合的OD值分别为0.976、0.836和0.728,亲和活性依次降低。β_2AR蛋白在无细胞体系中的成功表达,为研发基于受体的β激动剂多残留快速检测技术提供了理论支持。 展开更多
关键词 Β2肾上腺素受体 密码子优化 大肠杆菌无细胞合成体系 表达 β激动剂检测
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人胰岛素原基因在大肠杆菌中的表达和纯化
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作者 张晓玮 彭振英 +4 位作者 陈高 郑玲 于金慧 毕玉平 边斐 《山东大学学报(理学版)》 CAS CSCD 北大核心 2015年第11期8-15,22,共9页
将人胰岛素原基因序列(human proinsulin,PI)经密码子优化后与Trx A蛋白融合表达,构建原核表达载体Trx A-PI转入不同大肠杆菌表达菌株BL21(DE3)、Trans B(DE3)和Rosetta-gami(DE3)中。SDS-PAGE显示融合蛋白在3种表达菌株中均有表达,在Ro... 将人胰岛素原基因序列(human proinsulin,PI)经密码子优化后与Trx A蛋白融合表达,构建原核表达载体Trx A-PI转入不同大肠杆菌表达菌株BL21(DE3)、Trans B(DE3)和Rosetta-gami(DE3)中。SDS-PAGE显示融合蛋白在3种表达菌株中均有表达,在Rosetta-gami(DE3)中表达量最高,是普通大肠杆菌BL21(DE3)表达量的10倍。通过优化诱导温度等发酵条件,可溶性重组融合蛋白Trx A-PI在Rosetta-gami(DE3)菌株中表达量为3.5 g/L,比未优化时提高约10倍。Trx A-PI用肠激酶酶切后,利用His Trap FF柱分离纯化PI,经Western-blot检测重组PI具有免疫原性。 展开更多
关键词 胰岛素原 密码子优化 大肠杆菌表达
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