北方春糜子区糜子种质分子身份证的创建

为了高效鉴定和数字化管理糜子(Panicum miliaceum L.)资源,创建糜子种质分子身份证,以来源于北方春糜子区的21份糜子资源作为试验材料,用14个高基元(四碱基重复)SSR构建分子身份证,利用PowerMarker 3.25、PopGen 1.32软件计算遗传多样性参数,利用ID Analysis 4.0进行引物组合优化。结果表明,14对引物中8对可作为候选核心引物,8对引物共检测出等位变异24个;有效等位变异(Ne)为2.4845~2.9712,均值为2.7194;Shannon多样性指数(I)为0.9877~1.0937,均值为1.0437;观测杂合度(Ho)为0.5263~0.8333,均值为0.7306;期望观测杂合度(He)为0.6121~0.6814,均值为0.6483;Nei’s基因多样性指数(Nei)为0.5975~0.6634,均值为0.6310;多态性信息含量(PIC)为0.5933~0.7608,均值为0.6905。14对核心引物中剔除6对(RYW2、RYW3、RYW4、RYW7、RYW13和RYW14)与其他引物相似系数过高的引物,用8对引物组合(RYW9、RYW10、RYW8、RYW12、RYW6、RYW5、RYW11和RYW1)可将21份材料区分。8对核心引物构建了21份糜子资源的字符串和条形码,在线二维码生成器中输入各糜子的名称、统一编号、生态区、来源、字符串等信息得到糜子的二维码DNA分子身份证。