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库尔勒香梨9个新miRNA克隆鉴定
被引量:
1
1
作者
李陈静
牛建新
+2 位作者
裴茂松
曹福军
全绍文
《园艺学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第9期1803-1815,共13页
利用在小RNA高通量测序试验中筛选出的脱萼组与宿萼组差异表达新miRNA基因,采用Stem-loop法对总体表达量居前20位、在脱萼组和宿萼组中具有显著性差异表达、在子房和萼片组织中具有显著性差异表达的新miRNA进行成熟体的克隆鉴定、前体...
利用在小RNA高通量测序试验中筛选出的脱萼组与宿萼组差异表达新miRNA基因,采用Stem-loop法对总体表达量居前20位、在脱萼组和宿萼组中具有显著性差异表达、在子房和萼片组织中具有显著性差异表达的新miRNA进行成熟体的克隆鉴定、前体序列二级结构分析、qRT-PCR试验以及靶基因预测。结果显示,在不同的样本中有9个新miRNA(novel_miRNA)的成熟体序列以及4个novel_miRNA的表达量与高通量测序结果完全一致,并且预测得到大量具有生物学功能的靶基因。新发现的miRNA可能与‘库尔勒香梨’萼片脱落和宿存有密切关系。
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关键词
梨
novel_mirna
克隆鉴定
RNAfold
QRT-PCR
原文传递
题名
库尔勒香梨9个新miRNA克隆鉴定
被引量:
1
1
作者
李陈静
牛建新
裴茂松
曹福军
全绍文
机构
石河子大学农学院园艺系特色果蔬栽培生理与种质资源利用兵团重点实验室
出处
《园艺学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第9期1803-1815,共13页
基金
国家自然科学基金项目(31360474)
高等学校博士学科点专项科研基金博导类联合资助课题(2013651810002)
文摘
利用在小RNA高通量测序试验中筛选出的脱萼组与宿萼组差异表达新miRNA基因,采用Stem-loop法对总体表达量居前20位、在脱萼组和宿萼组中具有显著性差异表达、在子房和萼片组织中具有显著性差异表达的新miRNA进行成熟体的克隆鉴定、前体序列二级结构分析、qRT-PCR试验以及靶基因预测。结果显示,在不同的样本中有9个新miRNA(novel_miRNA)的成熟体序列以及4个novel_miRNA的表达量与高通量测序结果完全一致,并且预测得到大量具有生物学功能的靶基因。新发现的miRNA可能与‘库尔勒香梨’萼片脱落和宿存有密切关系。
关键词
梨
novel_mirna
克隆鉴定
RNAfold
QRT-PCR
Keywords
pear
novel_mirna
clone andidentification
RNAfold
qRT-PCR
分类号
S661.2 [农业科学—果树学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
库尔勒香梨9个新miRNA克隆鉴定
李陈静
牛建新
裴茂松
曹福军
全绍文
《园艺学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016
1
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