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国产堇菜属的分子系统学研究
被引量:
3
1
作者
龚琴
周劲松
+3 位作者
张永夏
梁冠欣
陈红锋
邢福武
《热带亚热带植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第6期633-642,共10页
利用基于ITS序列的分子系统学对国产堇菜属(Viola L.)进行了系统发育重建,选择Hybanthus concolor和鳞隔堇(Scyphellandra pierrei)作为外类群,对国产堇菜属植物54种1亚种共66个序列进行分析。分子系统树中获得强烈支持的中国堇菜属属...
利用基于ITS序列的分子系统学对国产堇菜属(Viola L.)进行了系统发育重建,选择Hybanthus concolor和鳞隔堇(Scyphellandra pierrei)作为外类群,对国产堇菜属植物54种1亚种共66个序列进行分析。分子系统树中获得强烈支持的中国堇菜属属下组级分类群有Sect.Viola、Sect.Diffusae、Sect.Bilobatae、Sect.Vaginatae。Subgen.Melanium与Sect.Viola和Sect.Trigonocarpae聚在一起,说明它们的亲缘关系较近,但Sect.Trigonocarpae支获得的支持率较低。分子系统树证实了Subgen.Dischidium与Subgen.Chamaemelanium的近缘关系,但不支持根据距的长短将Subgen.Dischidium划分为Sect.Longicalcaratae和Sect.Brevicalcaratae的处理。而Pinnatae类群应该作为Sect.Adnatae下的一个亚组处理。根据分子系统发育和形态学特征对V.lucens、V.magnifica、V.dissecta、V.yunnanensis等的分类地位进行了重新评价。
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关键词
堇菜属
分子系统学
nrits序列
下载PDF
职称材料
基于GenBank数据探讨兜兰属植物DNA条形码
被引量:
1
2
作者
杨鹏
关萍
+4 位作者
陈兴银
张凯凯
彭昌琴
成宇
石建明
《山地农业生物学报》
2017年第4期21-26,54,共7页
为筛选出适合兜兰属植物的DNA条形码序列。本研究基于GenBank中下载的29种兜兰属植物的253条序列,利用遗传距离法及分子系统学方法分析兜兰属植物候选条形码。结果表明,在选取的3个候选序列片段中对兜兰属植物鉴定的成功率最高的是核糖...
为筛选出适合兜兰属植物的DNA条形码序列。本研究基于GenBank中下载的29种兜兰属植物的253条序列,利用遗传距离法及分子系统学方法分析兜兰属植物候选条形码。结果表明,在选取的3个候选序列片段中对兜兰属植物鉴定的成功率最高的是核糖体ITS(nrITS)序列,分辨率为62.96%,其次是叶绿体matK序列,分辨率为50%,最后是叶绿体rbcL序列,分辨率仅为21.43%,因此,本研究推荐nrITS序列作为兜兰属植物的DNA条形码候选序列,叶绿体matK序列作为补充序列。
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关键词
兜兰
DNA条形码
nrits序列
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职称材料
题名
国产堇菜属的分子系统学研究
被引量:
3
1
作者
龚琴
周劲松
张永夏
梁冠欣
陈红锋
邢福武
机构
中国科学院华南植物园
中国科学院研究生院
北京师范大学香港浸会大学联合国际学院
广州中医药大学中药学院
深圳大学生命科学学院
出处
《热带亚热带植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第6期633-642,共10页
基金
国家自然科学基金项目(30870153
30470137)资助
文摘
利用基于ITS序列的分子系统学对国产堇菜属(Viola L.)进行了系统发育重建,选择Hybanthus concolor和鳞隔堇(Scyphellandra pierrei)作为外类群,对国产堇菜属植物54种1亚种共66个序列进行分析。分子系统树中获得强烈支持的中国堇菜属属下组级分类群有Sect.Viola、Sect.Diffusae、Sect.Bilobatae、Sect.Vaginatae。Subgen.Melanium与Sect.Viola和Sect.Trigonocarpae聚在一起,说明它们的亲缘关系较近,但Sect.Trigonocarpae支获得的支持率较低。分子系统树证实了Subgen.Dischidium与Subgen.Chamaemelanium的近缘关系,但不支持根据距的长短将Subgen.Dischidium划分为Sect.Longicalcaratae和Sect.Brevicalcaratae的处理。而Pinnatae类群应该作为Sect.Adnatae下的一个亚组处理。根据分子系统发育和形态学特征对V.lucens、V.magnifica、V.dissecta、V.yunnanensis等的分类地位进行了重新评价。
关键词
堇菜属
分子系统学
nrits序列
Keywords
Viola L.
Molecular systematics
nrits
分类号
Q949.759.2 [生物学—植物学]
下载PDF
职称材料
题名
基于GenBank数据探讨兜兰属植物DNA条形码
被引量:
1
2
作者
杨鹏
关萍
陈兴银
张凯凯
彭昌琴
成宇
石建明
机构
贵州大学生命科学学院
出处
《山地农业生物学报》
2017年第4期21-26,54,共7页
基金
贵州省自然科学基金资助项目([2013]2124)
文摘
为筛选出适合兜兰属植物的DNA条形码序列。本研究基于GenBank中下载的29种兜兰属植物的253条序列,利用遗传距离法及分子系统学方法分析兜兰属植物候选条形码。结果表明,在选取的3个候选序列片段中对兜兰属植物鉴定的成功率最高的是核糖体ITS(nrITS)序列,分辨率为62.96%,其次是叶绿体matK序列,分辨率为50%,最后是叶绿体rbcL序列,分辨率仅为21.43%,因此,本研究推荐nrITS序列作为兜兰属植物的DNA条形码候选序列,叶绿体matK序列作为补充序列。
关键词
兜兰
DNA条形码
nrits序列
Keywords
Paphiopedilum
DNA barcode
nrlTS sequence
分类号
Q949.718.43 [生物学—植物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
国产堇菜属的分子系统学研究
龚琴
周劲松
张永夏
梁冠欣
陈红锋
邢福武
《热带亚热带植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2010
3
下载PDF
职称材料
2
基于GenBank数据探讨兜兰属植物DNA条形码
杨鹏
关萍
陈兴银
张凯凯
彭昌琴
成宇
石建明
《山地农业生物学报》
2017
1
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职称材料
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