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题名与疾病相关的非同义单核苷酸多态性预测的研究进展
被引量:2
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作者
喻海燕
赵健
张珊珊
韩平
宋晓峰
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机构
南京航空航天大学生物医学工程系
南京医科大学第一附属医院
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出处
《现代生物医学进展》
CAS
2014年第35期6996-7000,6979,共6页
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基金
国家自然科学基金项目(61171191)
江苏省自然科学基金项目(BK2010500)
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文摘
单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNPs),即在基因组水平上由单个核苷酸的变异而引起的DNA序列多态性变化,具体是指在DNA序列中的单个碱基的变异,其是人类基因组变异种最常见的一种。SNP研究最主要的目的就是对人类表型变异遗传学的理解,尤其是关于人类遗传疾病的研究。而非同义单核苷酸多态性(nsSNPs)是SNPs中的一种,主要是指处于编码区会引起翻译后对应氨基酸序列变化的单核苷酸突变。因为nsSNPs可能会对蛋白质的功能造成影响,被认为是造成人类遗传病的主要原因。因此将与疾病相关的nsSNPs从中性的nsSNPs中区分出来是很重要的。本文根据国内外与疾病相关nsSNPs预测的研究,分析了预测中所涉及到的特征属性,总结了对这些特征进行优化的特征选择方法,并概述了在预测过程中使用的各种分类器。
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关键词
非同义单核苷酸多态性
nssnps预测
特征选择
分类器
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Keywords
Non-synonymous single nucleotide polymorphisms
Prediction of disease-associated nssnps
Attribute selection methods
Classifiers
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分类号
Q75
[生物学—分子生物学]
TP181
[自动化与计算机技术—控制理论与控制工程]
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