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新冠病毒Nsp1蛋白结构与功能的生物信息学分析及原核表达 被引量:4
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作者 刘玲 李璟 +7 位作者 范蕾 宣焱 杜淼 张德玖 李卓禧 陈晓聪 杨娅男 徐本锦 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第7期566-576,共11页
目的Nsp1是新冠病毒的主要毒力因子,介导了病毒在宿主细胞中的免疫逃逸,扩大了病毒感染范围。本研究对Nsp1进行系统生信分析及原核表达,有助于全面理解该蛋白在新冠病毒侵染宿主细胞中的分子机理。方法采用Pfam、TMHMM、ProtScale、ExP... 目的Nsp1是新冠病毒的主要毒力因子,介导了病毒在宿主细胞中的免疫逃逸,扩大了病毒感染范围。本研究对Nsp1进行系统生信分析及原核表达,有助于全面理解该蛋白在新冠病毒侵染宿主细胞中的分子机理。方法采用Pfam、TMHMM、ProtScale、ExPASy和SignalP 4.0等工具对Nsp1的翻译后修饰、理化性质、跨膜螺旋、相互作用网络、同源性及进化特点等进行系统分析;利用分子克隆技术构建重组表达载体pET-22b-Nsp1并进行原核表达。结果Nsp1由180个氨基酸组成,分子量19.78 kDa,等电点为5.36,不稳定指数28.83,在哺乳动物中的半衰期约30 h,在大肠杆菌内超过10 h,有12个可能的磷酸化位点和3个O-糖基化位点,无信号肽和跨膜螺旋,亲水性较强;二级结构分析显示,Nsp1中无规则卷曲占比最高(45.00%),其次是α螺旋(25.56%)和延伸链(20.56%),β-转角占比最低(8.89%);序列对比和进化分析显示,与SARS-CoV-2 Nsp1序列一致性最高的是蝙蝠非典型冠状病毒WIV1(85.0%);原核表达发现Nsp1主要在沉淀中表达,经质谱鉴定目的蛋白就是Nsp1。结论本研究为新冠病毒Nsp1的表达、纯化及功能分析提供了重要借鉴,有助于进一步揭示Nsp1的生物学功能及开展相关抑制剂和抗病毒药物的研发。 展开更多
关键词 新冠病毒 nsp1蛋白 生信分析 结构与功能 进化分析
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猪流行性腹泻病毒nsp1蛋白对IFN-β激活的JAK/STAT信号通路的影响 被引量:3
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作者 施开创 尹彦文 +1 位作者 陆文俊 屈素洁 《中国兽医科学》 CAS CSCD 北大核心 2021年第5期629-637,共9页
为探索猪流行性腹泻病毒(PEDV)非结构蛋白nsp1对干扰素(IFN)激活的Janus激酶/信号转导和转录激活因子(JAK/STAT)信号通路的影响,将PEDV nsp1蛋白表达质粒转染HeLa细胞,并用IFN-β处理,应用Western-blot对STAT1、STAT2磷酸化以及早幼粒... 为探索猪流行性腹泻病毒(PEDV)非结构蛋白nsp1对干扰素(IFN)激活的Janus激酶/信号转导和转录激活因子(JAK/STAT)信号通路的影响,将PEDV nsp1蛋白表达质粒转染HeLa细胞,并用IFN-β处理,应用Western-blot对STAT1、STAT2磷酸化以及早幼粒细胞白血病蛋白(PML)表达水平进行检测,应用IFA试验对STAT1、STAT2核移位以及PML蛋白表达水平进行检测,应用双荧光素酶分析系统对干扰素刺激反应元件(ISRE)-Luc进行检测,应用荧光定量RT-PCR(qRT-PCR)对IFN刺激基因15(ISG15)、ISG56以及PML转录水平进行检测。结果显示,nsp1蛋白过表达细胞内STAT1和STAT2的蛋白表达水平、磷酸化作用以及磷酸化STAT1(pSTAT1)、pSTAT2的核移位不受影响,而ISRE启动子的表达水平受到显著抑制,ISG15、ISG56转录水平显著下调,PML转录水平和蛋白表达水平显著降低。结果表明,PEDV nsp1蛋白可以抑制IFN-β激活的JAK/STAT信号通路。 展开更多
关键词 猪流行性腹泻病毒 nsp1蛋白 Janus激酶/信号转导和转录激活因子信号通路 抑制
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百脉根结瘤信号通道蛋白NSP1和NSP2的相互作用 被引量:4
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作者 胡晓晶 储晓洁 +2 位作者 康恒 朱辉 张忠明 《华中农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第2期132-137,共6页
豆科植物百脉根是研究共生固氮体系的模式植物之一,对其根瘤菌共生信号转导途径和作用机制的研究,有助于揭示根瘤菌与豆科植物共生关系建立和共生体形成的奥秘。本研究利用酵母双杂交系统和体外蛋白质相互作用技术,证明百脉根GARS类家... 豆科植物百脉根是研究共生固氮体系的模式植物之一,对其根瘤菌共生信号转导途径和作用机制的研究,有助于揭示根瘤菌与豆科植物共生关系建立和共生体形成的奥秘。本研究利用酵母双杂交系统和体外蛋白质相互作用技术,证明百脉根GARS类家族转录因子结瘤信号通道蛋白NSP1和NSP2在体外体内均可以相互作用,并将相互作用的位点定位在NSP1的GRAS结构域的LHRII区域和NSP2的LHRI区内。 展开更多
关键词 百脉根 结瘤信号通道蛋白nsp1 结瘤信号通道蛋白nsp2 共生信号转导 酵母双杂交
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通过猪繁殖与呼吸综合征病毒非结构蛋白Nsp1β的晶体结构揭示了一种新的金属依赖核酸酶
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作者 Xue F 胡小华 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2010年第6期98-98,共1页
猪繁殖与呼吸综合征病毒(porcine reproductiveand respiratory syndrome virus,PRRSV)属于套式病毒目(Nidovirales),动脉炎病毒科(Arteriviridae),是猪繁殖与呼吸综合征(porcine reproductive and respiratory syndrom,PRRS)的病原,PRR... 猪繁殖与呼吸综合征病毒(porcine reproductiveand respiratory syndrome virus,PRRSV)属于套式病毒目(Nidovirales),动脉炎病毒科(Arteriviridae),是猪繁殖与呼吸综合征(porcine reproductive and respiratory syndrom,PRRS)的病原,PRRS的流行给养猪业造成了巨大的经济损失。作为PRRSV基因组编码的第2个蛋白质,Nsp1可以通过C末端的木瓜蛋白酶样半胱氨酸蛋白酶(papain-likecysteine protease,PCP)将自己从Nsp2下游切割下来。虽然已知Nsp1与病毒毒力有关,但其在病毒感染过程的确切作用仍不清楚。本试验描述了PRRSV Nsp1天然的同型二聚体晶体结构,通过采用一个类似组装了几个已知核酸酶的折叠(其在体外用锰离子可激发较强的核酸酶活性)来研究了PRRSV Nsp1N末端的体系结构。通过标记的核酸酶,识别Nsp1的关键特性:具有C端木瓜蛋白酶样半胱氨酸蛋白酶区域(负责将Nsp1β从Nsp2上自行解离下来),连接NTD和PCP的接头(LKD),以及C末端的延展区(CTE),推测其位于PCPβ区域的结合位点相对较稳定。综合以往关于核定位的报道,多关注于Nsp1β的自处理模式及预测生物学功能,本研究为开发多靶位新药提供了模板。 展开更多
关键词 猪繁殖与呼吸综合征病毒 非结构蛋白nsp 核酸酶 晶体结构
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基孔肯雅病毒nsP1单克隆抗体制备及其在快速检测中的应用
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作者 周婷婷 杨展 +3 位作者 常永和 周东明 朱进 郑峰 《医学研究生学报》 CAS 北大核心 2022年第2期136-140,共5页
目的基孔肯雅病毒(CHIKV)广泛分布于非洲、南亚以及东南亚地区。文章拟制备抗CHIKV nsP1蛋白单克隆抗体,建立CHIKV的现场快速检测方法。方法合成nsP1编码基因序列,构建原核表达载体pET28a-nsP1,大肠埃希菌表达并纯化获得重组nsP1蛋白,... 目的基孔肯雅病毒(CHIKV)广泛分布于非洲、南亚以及东南亚地区。文章拟制备抗CHIKV nsP1蛋白单克隆抗体,建立CHIKV的现场快速检测方法。方法合成nsP1编码基因序列,构建原核表达载体pET28a-nsP1,大肠埃希菌表达并纯化获得重组nsP1蛋白,免疫小鼠后用常规方法制备筛选可稳定分泌nsP1单克隆抗体的杂交瘤细胞株.SDS-PAGE和ELISA鉴定抗体特异性,并建立免疫学检测方法。结果成功获得了6株阳性细胞株,纯化和筛选得到特异性良好的抗nsP1配对单克隆抗体,建立的双抗夹心ELISA法能特异性检测nsP1抗原,并在此基础上建立了可快速检测CHIKV的胶体金免疫层析方法。结论成功建立了针对CHIKV抗原的免疫学检测方法,为CHIKV感染早期诊断增加了技术储备。 展开更多
关键词 基孔肯雅病毒 nsp1蛋白 单克隆抗体 胶体金
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人星状病毒I型非结构蛋白nsP1a及其C末端蛋白nsP1a/4的原核表达及鉴定 被引量:1
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作者 刘文慧 阚丽丽 +4 位作者 崔永胜 谭李倩 梁雪雪 李新 赵微 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第1期46-50,共5页
人星状病毒(Human Astrovirus,HastV)是导致婴幼儿腹泻的重要病原体。HastV非结构蛋白nsP1a及C末端蛋白nsP1a/4含有各种保守的功能结构域,在星状病毒的复制、转录,病毒与宿主的相互作用中起重要作用。为获得nsP1a及其nsP1a/4蛋白,为后... 人星状病毒(Human Astrovirus,HastV)是导致婴幼儿腹泻的重要病原体。HastV非结构蛋白nsP1a及C末端蛋白nsP1a/4含有各种保守的功能结构域,在星状病毒的复制、转录,病毒与宿主的相互作用中起重要作用。为获得nsP1a及其nsP1a/4蛋白,为后续蛋白相关研究提供平台,本研究在E.coli系统中进行人星状病毒非结构蛋白nsP1a及nsP1a/4蛋白的表达并对表达产物进行鉴定。首先将nsP1a及nsP1a/4基因克隆入原核表达载体PGEX-4T-1,构建nsP1a及nsP1a/4蛋白融合表达质粒;在E.coli BL21(DE3)中进行IPTG诱导表达,摸索两种融合蛋白表达的最优条件并对表达蛋白进行免疫印迹鉴定。结果表明nsP1a蛋白在30℃,1mM IPTG诱导12h时,蛋白表达量达到最高;nsP1a/4蛋白在20℃,0.5mM IPTG诱导8h时,蛋白表达量达到最高。Western blot结果显示两种融合蛋白既可与nsP1a蛋白免疫血清发生特异性反应,也可被GST标签抗体所识别。本研究成功利用原核系统表达并鉴定了人星状病毒非结构蛋白nsP1a及其C末端蛋白nsP1a/4,为进一步研究星状病毒非结构蛋白的功能及病毒的致病机制奠定基础。 展开更多
关键词 人星状病毒 非结构蛋白nsp1a nsp1a/4 原核表达 融合蛋白
原文传递
人星状病毒非结构蛋白nsP1a/1表达纯化及多克隆抗体的制备 被引量:1
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作者 苑荣亮 崔成成 +6 位作者 井敏敏 刘志成 汪玉婷 岳风先 张成 井申荣 毛小琴 《医学分子生物学杂志》 CAS 2016年第3期158-162,共5页
目的:表达纯化人星状体病毒( human astrovirus, HAstV)非结构蛋白nsP1a/1,免疫动物制备多克隆抗体。方法利用PCR技术扩增nsP1a/1基因序列,构建到大肠埃希菌原核表达系统中表达重组nsP1a/1蛋白,使用镍柱亲和层析法对重组蛋白... 目的:表达纯化人星状体病毒( human astrovirus, HAstV)非结构蛋白nsP1a/1,免疫动物制备多克隆抗体。方法利用PCR技术扩增nsP1a/1基因序列,构建到大肠埃希菌原核表达系统中表达重组nsP1a/1蛋白,使用镍柱亲和层析法对重组蛋白进行纯化,十二烷基磺酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳( SDS-PAGE)和二噻啉甲酸(BCA)实验对重组蛋白的纯度与浓度进行分析,以重组的nsP1a/1蛋白为抗原,免疫雄性SPF级SD 大鼠获得多抗血清,用 ELISA 测定抗体效价、 Western 印迹检测抗体特异性。结果nsP1a/1-pET28a原核表达载体构建成功,将其转化至大肠埃希菌BL21(DE3)细菌中诱导表达了重组蛋白,免疫大鼠获得的多抗血清几何平均效价达到1∶406374。结论本实验成功地运用原核表达系统表达并鉴定了人星状体病毒非结构蛋白nsP1a/1,为进一步研究人星状病毒的复制及病毒感染的临床诊断奠定基础。 展开更多
关键词 人星状病毒 非结构蛋白nsp1a/1 原核表达 多克隆抗体 NON-STRUCTURAL PROTEINS nsp1 a/1
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