藤椒精油抗芽孢杆菌生物被膜关键组分的分子对接虚拟筛选与活性评价

为探讨藤椒精油抗腐败解淀粉芽孢杆菌生物被膜的关键活性组分及其胞内作用靶点,根据文献报道构建藤椒精油组分数据库和芽孢杆菌生物被膜形成相关靶蛋白分子结构集,采用CB-DOCK2进行藤椒精油组分与生物被膜形成相关靶蛋白的分子对接,根据分子亲和能力筛选精油抗细菌生物被膜的关键组分及潜在作用靶点。最后通过离体培养结合结晶紫染色法进行藤椒精油关键活性组分石竹烯和氧化石竹烯的抗生物被膜实验验证。分子对接结果表明,藤椒精油的24种挥发性成分与58个解淀粉芽孢杆菌生物被膜形成相关的靶点具有不同的亲和能力,其中氧化石竹烯和β-石竹烯可通过超共轭效应和疏水相互作用、范德华力等分子间作用力与ComP、RapC紧密结合并形成稳定构象。离体生物被膜培养验证实验表明,氧化石竹烯和β-石竹烯对解淀粉芽孢杆菌的最小生物被膜抑制质量浓度分别为6.0 mg/mL和2.0 mg/mL。此外,氧化石竹烯和β-石竹烯还能干扰菌体泳动能力,降低细胞初始黏附和自聚集能力,改变细胞表面疏水性。研究结果揭示了藤椒精油抗细菌生物被膜的关键活性组分及其潜在作用靶点,并为解析植物精油生物活性相关胞内分子机理提供了可行的辅助策略。

基于网络药理学和分子对接探讨复羽叶栾树种仁油治疗脂肪肝的作用机制

为了探究复羽叶栾树种仁油活性成分可能作用于脂肪肝治疗的药效物质基础、潜在靶标及作用机制,基于网络药理学手段和分子对接,获得复羽叶栾树种仁油中6种核心有效成分花生一烯酸、棕榈酸、亚油酸、油酸、芥酸、花生酸,筛选出治疗脂肪肝相关靶点69个,预测可能作用于ALB、IGF1、PPARα、PPARγ、SRC 5个核心靶点蛋白,通过活性成分与靶点相互作用发挥治疗脂肪肝的作用。复羽叶栾树种仁油治疗脂肪肝具有多成分、多靶点、多通路的作用特点。

基于网络药理学-分子对接的藤椒精油抗解淀粉芽孢杆菌生物被膜机理

为探讨藤椒精油抗解淀粉芽孢杆菌生物被膜的关键活性分子及其胞内作用机理,采用PharmMapper数据库进行靶点预测,结合基因组注释信息对筛选后的靶点进行清洗过滤,预测筛选藤椒精油关键活性组分及抗生物被膜的作用靶点,并应用Cytoscape软件构建藤椒精油活性分子-潜在靶点互作网络,通过String数据库对潜在靶点进行GO与KEGG通路富集分析。应用STITCH数据库获得潜在靶点互作关系,Cytoscape软件进行网络拓扑分析,筛选关键核心靶点。采用CB-DOCK2在线分子对接服务器进行藤椒精油活性分子与核心靶点的分子对接。最后通过离体培养结合结晶紫染色法、细菌运动能力实验验证藤椒精油关键活性分子的抗生物被膜活性。结果表明,通过网络药理学方法共筛选获得了21种藤椒精油活性组分,133个潜在作用靶点,8个核心靶点。GO富集分析共获得17个GO二级条目,包括生物学过程条目6个、分子功能条目8个和细胞组分条目3个。KEGG通路富集分析共获得8条信号通路,涉及次级代谢产物的生物合成、氨基酸的生物合成等通路。分子对接结果表明,藤椒精油关键活性组分中桉叶醇、金合欢醇乙酸酯、反式法尼醇可通过氢键和疏水相互作用等分子间作用力与核心靶点OdhA、CarB、PurF紧密结合并形成稳定构象。离体生物被膜培养验证实验结果表明,0.32~1.28μL/mL的金合欢醇乙酸酯、反式法尼醇对解淀粉芽孢杆菌均有显著的抗生物被膜活性。研究结果旨在为藤椒精油抗细菌生物被膜的胞内分子机理提供新的研究思路。

基于GC-MS技术结合网络药理学和分子对接探究扎冲十三挥发油治疗缺血性脑卒中的成分及作用机制

目的基于气相色谱-质谱联用(GC-MS)技术对扎冲十三方剂中8味植物药挥发油的主要化学成分进行分析,并运用网络药理学方法探究其成分对缺血性脑卒中可能作用机制。方法利用GC-MS技术分析挥发油后,借助多个数据库预测分析化学成分作用靶点和疾病靶点,构建“化学成分-作用靶点”网络并由共同靶点得到蛋白质-蛋白质相互作用关系,将其可视化,根据筛选到的关键作用靶点完成基因本体(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析;在Discovery Studio软件上实施关键靶点与活性成分的分子对接验证。结果GC-MS确认出44个化合物,占总含量的94.14%,含量最高的为丁香酚;检索出扎冲十三挥发油关于缺血性脑卒中的42个活性成分,159个潜在作用靶点;得到369个GO功能条目,126个KEGG信号通路条目,涉及癌症通路、脂质和动脉粥样硬化等。分子对接数据显示丁香酚等活性成分与缺氧诱导因子1α、基质金属蛋白酶9、信号转导与转录激活因子3等关键靶点具备较强的结合性能。结论该实验探究了扎冲十三挥发油通过多成分、多靶点、多途径协同用于治疗缺血性脑卒中的可能作用机制,为进一步研究扎冲十三挥发油对缺血性脑卒中的作用提供一定参考。

基于GC-MS技术结合网络药理学探究石菖蒲挥发油抗阿尔兹海默症的作用机制

目的:通过气相色谱-质谱(GC-MS)技术分析石菖蒲挥发油的化学成分并结合网络药理学研究石菖蒲挥发油抗阿尔兹海默症(AD)的作用机制。方法:采用GC-MS技术对石菖蒲挥发油成分进行精准鉴定,运用TCMSP、Swiss Target Prediction数据库对石菖蒲挥发油成分的作用靶点进行预测。利用Genecards、OMIM数据库获得AD疾病靶点。绘制韦恩图并提取交集靶点,随后对其进行PPI网络构建和拓扑分析、GO富集分析和KEGG通路富集分析,建立“成分-靶点-疾病-通路”网络图;并采用分子对接技术进行验证。结果:经GC-MS分析共得到74个挥发油成分。获得成分疾病交集靶点138个,经PPI网络拓扑分析发现ALB、ACTB、TNF和IL-6 4个核心靶点。GO结果显示,石菖蒲挥发油可能通过激素的反应、对外源性物质刺激的反应和激素水平调节等来发挥抗AD的作用。KEGG结果表明,石菖蒲挥发油可作用于PI3K-Akt、cGMP-PKG、NF-κB和cAMP等信号通路对AD进行干预。分子对接结果表明,石菖蒲挥发油中有效成分与核心靶点具有较好的结合活性。结论:石菖蒲挥发油可通过多靶点和多通路抑制神经炎症和减少氧化应激发挥其抗AD的作用。

加拿大某矿石出运港口平面布置方案设计要点

以加拿大北极地区某铁矿石出运港口工程为例,针对其水上交通及运量受到海域冰冻限制的特点,根据自然条件和场地现状,通过前期模拟分析,提出不同季节的设计船型组合,因地制宜确定矿石码头、堆场、临时施工码头、货运码头以及油库区的平面设计方案,并通过修建道路、引堤及连接堤将各功能区有序顺畅衔接。此外,针对本工程工艺设备成品通过模块车运输上岸的特点,通过分析不同设备模块的规格及走向,对模块车的运输路径进行合理规划。

基于网络药理学和分子对接探究文旦柚皮精油的主要功效

利用网络药理学和分子对接探究文旦柚皮精油的主要功效。首先,通过文献和数据库进行活性成分的收集与筛选、靶点的预测,构建成分-靶点数据集,导入Cytoscape 3.7.2软件构建网络,获取靶点信息;然后,筛选出主要靶点,利用Metascape系统进行富集和通路分析,利用Sybyl-x 2.0软件进行分子对接试验。最后,筛选得到文旦柚皮精油有效活性成分28个,共621个靶点,主要涉及化学致癌、雌激素信号、癌症和神经退行性等生物学过程中的多条信号通路。初步揭示了文旦柚皮精油的主要药理学机制和功效,为其进一步开发提供了理论参考。

自安装采油平台坞修期间的项目安全管理

自安装式采油平台服务于渤海油田可以实现勘探、采油、处理、储油、外输等功能,能满足渤海海域75%的油田不同工况的工艺处理要求,依据《海上移动平台入级规范(2020)》及《海上移动平台法定检验技术规则(2016)》,自安装采油平台每5年应进行一次特检坞修工作,以保证平台入级证书的有效性,为此全面阐述了自安装平台在特检坞修期间的安全管理办法。

基于UPLC-MS/MS和分子对接技术考察聚乙二醇400对辛夷挥发油药物动力学与抗炎作用的影响

目的基于超高效液相色谱-串联质谱法(UPLC-MS/MS)和分子对接技术考察聚乙二醇400对辛夷挥发油药物动力学与抗炎作用的影响。方法采取小鼠耳肿胀及足肿胀炎症模型对PEG400与辛夷挥发油共同给药后的抗炎效果进行分析,应用UPLC-MS/MS,以血浆中代谢物桉叶油醇作为关键活性成分,探究肿瘤坏死因子(tumor necrosis factor,TNF)-α、白细胞介素(interleulein,IL)-6、IL-1β、前列腺素E2(PGE2)及核因子(nuclear factor,NF)-κB在内的炎症因子情况,初步分析辛夷挥发油及桉叶油醇的抗炎作用。结果药代动力学研究结果证实,与辛夷挥发油+水组相比,辛夷挥发油+PEG400组中辛夷挥发油与桉叶油醇的AUC0-t别提升2.37、1.98倍,证实PEG400能使辛夷挥发油及桉叶油醇的血药浓度提升;小鼠耳肿胀级足肿胀炎症模型证实小鼠灌胃辛夷挥发油PEG400溶液后抗炎效果升高增强;经多靶点蛋白观察可见辛夷挥发油与桉叶油醇能与TNF-α、IL-6、L-1β、PGE2、NF-κB等多位点结合,应用存在较高亲和力,结合性优于阿司匹林。结论PEG400能够提高辛夷挥发油及桉叶油醇的血药浓度,抗炎能力强,且能与多种炎症因子、靶点蛋白形成氢键,推测可能通过上述因子与辛夷挥发油、桉叶油醇发挥协同作用。

某5万吨级油码头工程职业病危害预评价

目的识别、分析与评价拟建项目可能产生的职业病危害因素,确定危害类别,为卫生行政部门审批提供技术依据。方法采用类比法和检查表法。结果该拟建项目选址、总体布局、职业病危害防护措施、卫生辅助用室、个体防护措施、职业卫生管理和应急救援措施等内容基本符合卫生学要求。该项目运转过程中存在的职业病危害因素浓度、强度符合国家卫生标准要求。按照《建设项目职业病危害分类管理办法》,该项目定性为职业病危害一般的建设项目。结论该项目运转过程中可能存在的职业病危害因素可以预防和控制,项目建设可行。

水下液压油路对接装置的结构及精度研究

为解决遥控潜水器(ROV)与水下作业机具机械结构联接和油路对接的难题,根据深水海底油气管道回接作业需求,提出了一套ROV与水下作业机具液压油路对接装置的设计方案.设计了具有滑台座的柔顺液压接头,以补偿对接装置初定位误差,降低对初定位精度的要求,从机械结构上保证了液压油路的精确对接.基于概率理论建立了油路对接成功概率模型,得到了对接成功概率与油路插头的尺寸精度、位置精度的关系.利用Matlab软件对油路插头精度进行数值计算,结果表明,该装置的油路对接成功率可达94.81%,验证了油路对接成功概率模型的合理性.

舟山海域油品码头布局与溢油风险评估

提出了一个基于不确定性分析理论的区域油品码头空间布局的溢油风险模拟与评估方法。该方法可系统分析沿海区域油品码头空间布局及其产生的海域溢油风险的空间分布规律,能够满足我国当前近海高强度开发形势下战略环评和环境风险评估的技术需求。以舟山海域为研究对象,通过油品码头布局模型和不确定性分析,对舟山海域进行综合溢油风险评估,结果表明该方法可以用于综合评估某一海区的溢油风险水平;基于溢油风险概率和污染损害的时空分布,依据风险值集中度最大及风险总值最小的原则,能够实现多种码头布局方案下的海域溢油风险水平的综合比较,并得到最优油品码头布局方案。

油码头管理措施

阐述了现阶段油码头存在的问题,着重介绍了航运公司的整改措施,简单介绍了海事管理部门的整改措施,以期减少油码头溢油风险概率,保护海洋环境。

油码头事故的易发部位及预防措施

介绍了石油码头发生事故的部位和危险点,针对不同部位的特点提出了相应的安全预防措施。

基于网络药理学-分子对接探究三黄地榆油治疗烧烫伤的作用机制研究

目的:通过网络药理学方法探讨三黄地榆油治疗烧烫伤的作用机制。方法:从中药系统药理学分析平台(TCMSP)中以口服利用度(OB)≥30%,类药性(DL)≥0.18,Alog P≤5作为化合物分子的筛选条件寻找与三黄地榆油中五味中药相关的所有化学成分和作用靶点,构建化合物靶点相互作用网络图;通过在线人类孟德尔遗传数据库(OMIM)数据库、PharmGkb数据库筛选烧烫伤相关的靶点,进而构建疾病与靶点关系网络图;应用R语言Cluster Profiler包对靶点进行基因本体(GO)及京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,并采用Discovery Studio 4.0软件进行分子对接,并进行生物活性验证。结果:筛选出三黄地榆油5个药物、80个化合物节点和236个靶点节点;通过度、介度中心度、接近中心度等网络拓扑特征评价筛选出与三黄地榆油在烧烫伤方面GO分析共包含803条富集结果。利用KEGG数据库对入选靶标进行相关通路富集,筛选出46条通路在烧烫伤方面具有作用,分子对接结果表明二氢黄芩素、卡文定碱、黄柏苷、儿茶素分别对"成分-疾病-靶点网络"中自由度排名前4个靶点PTGS2、NOS2、PPARG、IL-6分别具有较好的亲和力。结论:通过网络药理学证实了三黄地榆油多成分、多靶点、整体调节的作用特点,预测了三黄地榆油治疗烧烫伤的主要可能具有的作用机制,为其活性成分研究和实验研究提供理论依据。

基于网络药理学探讨山楂叶抗高脂血症的作用机制及初步验证

目的:利用网络药理学预测山楂叶中治疗高脂血症的潜在化合物、靶点及作用通路,采用靶酶和细胞实验对网络药理学的预测结果进行初步验证,为深入探讨山楂叶抗高脂血症的物质基础及其作用机制提供了依据。方法:通过中药系统药理学数据库分析平台和文献挖掘获得山楂叶的化学成分,利用相关数据库获得潜在靶点,对其进行GO和KEGG分析,构建“成分-靶点-通路”网络。通过ERK2激酶、油红O染色以及甘油三酯实验,对网络药理学预测的有效成分及潜在靶点进行了验证。结果:基于网络药理学方法,得到山楂叶的活性成分93个,相互作用的靶点蛋白40个,山楂叶化学成分对高脂血症的治疗作用主要是通过如下信号通路:代谢通路、AMPK信号通路、HIF-1信号通路、胰岛素抵抗、甲状腺激素信号通路;根据网络药理学预测结果,结合课题组分离得到的山楂叶代表性化合物,对牡荆素等6个化合物进行ERK2激酶活性测试,结果显示牡荆素对ERK2激酶的抑制率最高达到84%;通过构建高脂HepG2细胞模型,进行了油红O染色及定量实验,测定了TG含量,发现经牡荆素干预后,细胞内脂滴数量随牡荆素浓度增加而逐渐减少,且TG含量有所下降,说明牡荆素能降低细胞中的脂质积累及TG含量,进而验证了网络药理学预测山楂叶中化合物牡荆素抗高脂血症的结果。结论:本文运用网络药理学预测了山楂叶中化合物抗高血脂症的物质基础和作用机制,靶酶、油红O染色和TG定量实验初步证实了网络药理学的预测结果,同时提示牡荆素有望作为一种降低细胞内血脂含量的潜在治疗化合物。

海洋石油平台坞修项目中的安全管理

安全管理是工程项目安全管理的重要基础,海洋石油平台坞修项目中所涉及的作业均属于海洋石油十大高风险作业范畴。文章重点对海洋石油平台坞修项目中的安全管理工作方法和经验进行了总结,可供同行借鉴。

石油化工码头安全监控系统研究

本文提出了石油化工码头安全监控系统的总体架构,并分别提出了油库、危化品仓库、油品收发及危化品装卸作业、危化品运输车辆、输油管道等监控对象的监控方案及软件功能模块设计。

曹妃甸30万吨级原油码头工程钢管桩防腐蚀安全保护

介绍了曹妃甸原油码头钢管桩的腐蚀环境及特点、采取的防腐蚀安全措施、牺牲阳极安装以及钢管桩保护效果。

游艇加油码头设计

游艇产业近年来在我国蓬勃发展,游艇码头建设势头迅猛,加油码头作为游艇港重要的配套设施,常需在设计中予以考虑。本文对游艇加油码头的设计进行了研究,参考国内外相关的设计标准、规范、指南,分析了各种参数在加油码头设计中的适用性,结论可为具体工程设计提供参考。