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题名MicroRNAs在前列腺癌中的研究进展
被引量:5
- 1
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作者
吴兴成
严维刚
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机构
中国医学科学院北京协和医学院北京协和医院泌尿外科
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出处
《基础医学与临床》
CSCD
2016年第2期281-284,共4页
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文摘
前列腺癌是男性泌尿系常见的恶性肿瘤。miRNAs通过对靶基因的负性调控,参与调控肿瘤的发生和发展过程。近年来研究表明许多miRNAs扮演着癌基因或抑癌基因的角色,参与调控前列腺癌细胞增殖、凋亡、侵袭和迁移。
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关键词
MICRORNA
前列腺癌
致癌miRNA
肿瘤发生
肿瘤进展
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Keywords
microRNA
prostate cancer
onco-mirna
tumorigenesis
tumor progression
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分类号
R737.25
[医药卫生—肿瘤]
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题名肝细胞癌中促癌miRNA调控网络分析与验证
被引量:3
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作者
叶静静
徐文琴
陈天兵
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机构
皖南医学院弋矶山医院中心实验室
皖南医学院重大疾病非编码RNA转化研究安徽普通高校重点实验室
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出处
《南方医科大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第1期45-54,共10页
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基金
国家自然科学基金(81901519)
安徽省自然科学基金(1908085QH380)。
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文摘
目的构建肝细胞癌中生存相关的促癌miRNA与其靶基因的调控网络并对关键miRNA-靶基因进行实验验证。方法利用OncomiR和Oncolnc获取肝癌中生存相关的miRNA,并进行表达分析和生存分析;利用miRNet预测miRNA的靶基因,通过GEPIA2、Ualcan分别对靶基因进行生存和表达分析,通过Starbase进行miRNA-靶基因共表达分析,利用Cytoscape软件构建miRNA-靶基因网络,通过Enrichr进行靶基因富集分析,利用String数据库进行蛋白互作网络构建。将NC,hsa-miR-1226-3p的mimic或inhibitor,hsa-miR-221-5p的mimic或inhibitor分别转染HepG2细胞,利用CCK8检测转染后细胞活力的变化情况,另取转染后48 h样品利用Q-PCR检测靶基因表达情况;将NC,hsa-miR-221-5p的mimic或inhibitor分别转染HepG2细胞,48 h后用Werstern blot检测靶基因蛋白表达情况;将NC+p-GCDH-WT质粒,NC+p-GCDH-MUT质粒,hsa-miR-221-5p mimic+pGCDH-WT质粒,hsa-miR-221-5p mimic+p-GCDH-MUT质粒分别转染HepG2细胞,48 h后利用多功能酶标仪检测荧光素酶活性;将NC,hsa-miR-221-5p mimic,pEGFP N1-GCDH质粒,hsa-miR-221-5p mimic+pEGFP N1-GCDH质粒分别转染HepG2细胞,利用CCK8检测转染后细胞活力的变化情况,transwell实验检测细胞迁移和侵袭能力。结果从OncomiR和Oncolnc数据库中分别得到223个(P<0.05)和146个(P<0.05)在肝癌中与生存相关的miRNA,两者交集为131个;结合表达分析和生存分析的结果共鉴定出48个促癌miRNA;miRnet共预测出10 278个靶基因,通过生存和表达分析符合预期的为44个,miRNAmRNA共表达分析后的结果显示27个靶基因符合预期。通过Cytoscape软件构建的miRNA-靶基因网络包含了25个促癌miRNA和27个抑癌基因。富集分析结果显示靶基因集中作用于脂肪酸代谢通路。验证实验显示,转染hsa-miR-1226-3p的mimic和inhibitor,hsa-miR-221-5p的mimic和inhibitor后,其对应的靶基因mRNA或蛋白水平均显著改变(P<0.05);hsa-miR-221-5p mimic和p-GCDH-WT质粒共转可显著降低其荧光素酶的活性(P<0.05);pEGFP N1-GCDH质粒和hsa-miR-221-5p mimic共转可显著恢复其对细胞活力,以及细胞迁移、侵袭能力的影响(P<0.05)。结论通过综合分析鉴定了肝癌中的促癌miRNA并构建了其调控网络;脂肪酸代谢可能是肝细胞癌中促癌miRNA发挥作用的重要的靶标信号通路之一。hsa-miR-221-5p/GCDH轴是肝癌进展的重要分子机制。
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关键词
肝癌
促癌miRNA
调控网络
生信分析
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Keywords
hepatocellular carcinoma
onco-mirna
regulatory network
bioinformatic analysis
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分类号
R735.7
[医药卫生—肿瘤]
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