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SEQUENCE VARIABILITY OF HUMAN CYTOMEGALOVIRUS UL144 OPEN READING FRAME IN LOW-PASSAGE CLINICAL ISOLATES 被引量:6
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作者 RongHe QiangRuan ChangXia Lan-qingLiu Sheng-minLǔ YingLu YingQi Yan-pingMa QingLiu Yao-huaJi 《Chinese Medical Sciences Journal》 CAS CSCD 2004年第4期293-297,共5页
Objective To explore the relationship between human cytomegalovirus (HCMV) UL144 sequence variability and clinical disease. Methods HCMV UL144 open reading frame (ORF) was amplified by PCR assay in 72 lowpassage isola... Objective To explore the relationship between human cytomegalovirus (HCMV) UL144 sequence variability and clinical disease. Methods HCMV UL144 open reading frame (ORF) was amplified by PCR assay in 72 lowpassage isolates [65 con-genitally infective children and 7 healthy children who were HCMV-DNA positive by quantitative PCR (qPCR)]. All positive PCR products were analyzed by heteroduplex mobility assay and single-stranded conformation polymorphism (HMA-SSCP) and 32 of them were sequenced. Results Fifty-five patient isolates and five healthy children isolates were HCMV-UL144 positive by PCR. Sequencing and HMA-SSCP analysis showed that significant strain-specific variability was present in the UL144 ORF. Phylogenetic analysis indicated that the nucleotide sequences could be separated into 3 major genotypes. Comparing between UL144 se-quences and the corresponding symptoms showed that genotype 2 did not exist in megacolon isolates. And genotype 1 and 3 were the major types among microcephaly and jaundice isolates respectively. Conclusions HCMV-UL144 existed in most of low passage isolates and sequences were hypervariable. The UL144 ORF and its predicted product with the high level of sequence variability in different kinds of isolates suggest that UL144 ORF might play a role in HCMV infectivity and subsequent diseases. 展开更多
关键词 human cytomegalovirus UL144 open reading frame VARIABILITY
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开放式创新视角下少数民族地区阅读推广团队组织模式与发展策略探析
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作者 张颖 金秋萍 《大学图书情报学刊》 2024年第6期40-46,82,共8页
阅读推广的高质量开展离不开人才队伍的支撑。文章关注阅读推广团队的组织模式,采用多案例研究方法,基于开放式创新理论,结合少数民族地区阅读推广实践情况,对比分析自主创新、合作创新、主导创新三种创新范式下阅读推广团队的组织模式... 阅读推广的高质量开展离不开人才队伍的支撑。文章关注阅读推广团队的组织模式,采用多案例研究方法,基于开放式创新理论,结合少数民族地区阅读推广实践情况,对比分析自主创新、合作创新、主导创新三种创新范式下阅读推广团队的组织模式,归纳总结其运行的关键要素,提出少数民族地区阅读推广团队建设策略,即明确团队建设目标,构建人才培育体系;厘清团队职能分工,促进高效协作、优势互补;搭建交流平台,构建合理、高效的团队运营机制;持续建设和凝练团队品牌,做好优质资源建设与积累。 展开更多
关键词 全民阅读推广 开放式创新 阅读推广团队 少数民族地区 团队组织模式 团队品牌
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棉花CMS-D2和CMS-D8不育系线粒体全基因组比较分析
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作者 葛李爽 冯娟娟 +8 位作者 张梦 郭立平 戚廷香 张学贤 李永旗 唐会妮 乔秀琴 邢朝柱 吴建勇 《棉花学报》 CSCD 北大核心 2024年第1期28-38,共11页
【目的】探究哈克尼西棉不育胞质(CMS-D2)和三裂棉不育胞质(CMS-D8)的不育系线粒体基因组之间的序列结构差异,为筛选鉴定不育相关基因奠定基础。【方法】根据D2A和D8A这2个不育系的线粒体基因组测序组装结果,使用Synteny and Rearrangem... 【目的】探究哈克尼西棉不育胞质(CMS-D2)和三裂棉不育胞质(CMS-D8)的不育系线粒体基因组之间的序列结构差异,为筛选鉴定不育相关基因奠定基础。【方法】根据D2A和D8A这2个不育系的线粒体基因组测序组装结果,使用Synteny and Rearrangement Identifier(Sy RI)软件鉴定结构变异,用Plotsr可视化分析包含共线性及非共线性区域的重组变异位点。以D8A线粒体基因组注释结果为参考,用D2A线粒体基因组注释的开放阅读框(open reading frame,ORF)编码的氨基酸序列进行tblastn比对,筛选出D2A线粒体基因组中特有的ORF,并进行聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)验证、相对表达量分析和生物信息学分析。【结果】D2A和D8A这2个不育系线粒体基因组之间存在2个部分重叠且相邻的倒易位区域。在D2A中发现17个特异的ORF,PCR验证了D2A中存在的6个特异ORF(orf114e、orf121b-1、orf121b-2、orf138b-2、orf186a-2和orf317a-2)。3~4 mm花蕾中orf121b-1和orf121b-2的相对表达量较高。orf114e、orf186a-2和orf317a-2具有典型的跨膜结构域和嵌合基因结构,符合不育基因的部分特征。【结论】D2A和D8A线粒体基因组间存在2个相邻的倒易位区域。D2A中存在6个特异的ORF,其中orf114e、orf186a-2和orf317a-2可能与棉花CMS-D2孢子体败育有关。 展开更多
关键词 棉花 细胞质雄性不育 线粒体基因组 孢子体不育 配子体不育 开放阅读框
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三角梅品种‘绿叶樱花’4,5-多巴双加氧酶开放阅读框克隆与分析
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作者 李建运 姚国琼 +4 位作者 王飞 朱文 李子涵 孙正海 辛培尧 《中南林业科技大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第7期153-164,共12页
【目的】多巴双加氧酶(4,5-DOPA dioxygenase extradiol)是甜菜色素生物合成途径的关键酶之一,能催化多巴分解形成甜菜醛氨酸,也是最可能与三角梅最终的花色形成相关的酶蛋白。克隆三角梅多巴双加氧酶基因的开放阅读框(ORF),对其编码的... 【目的】多巴双加氧酶(4,5-DOPA dioxygenase extradiol)是甜菜色素生物合成途径的关键酶之一,能催化多巴分解形成甜菜醛氨酸,也是最可能与三角梅最终的花色形成相关的酶蛋白。克隆三角梅多巴双加氧酶基因的开放阅读框(ORF),对其编码的氨基酸序列进行生物信息学分析,探讨三角梅花色变化机理和甜菜色素代谢途径。【方法】以三角梅品种‘绿叶樱花’的苞片为材料,提取其RNA,并进行逆转录,之后快速转化完成基因的克隆和基因PCR扩增,最后对其编码的氨基酸序列进行保守区预测、信号肽分析、磷酸化位点预测、跨膜信号预测、同源性比对、构建系统进化树以及二、三级结构预测,研究其氨基酸序列的结构和功能。【结果】‘绿叶樱花’的多巴双加氧酶基因ORF序列长801 bp,编码266个氨基酸。ORF序列所编码的氨基酸序列具有cd07363保守结构域,其编码蛋白是一种稳定的酸性亲水蛋白,分子量为29 734.76 kD,等电点为6.26,二级结构包含了11个α螺旋、7个β转角、20个β折叠结构,具有4个磷酸化位点,没有跨膜结构,可能只在细胞质内发挥作用。该序列还与66个序列高度同源,与同科的‘金心双色’、胶果木和梭房叶子花有着相同的进化分支,符合自然进化规律。【结论】‘绿叶樱花’多巴双加氧酶开放阅读框ORF的氨基酸序列属于第三类雌二醇双加氧基因家族,具有该基因家族具有的保守氨基酸序列,表明多巴双加氧酶基因在生成甜菜色素植物中具有独特的保守性,且属于稳定、酸性的亲水蛋白,没有跨膜结构,可能只在细胞质内发挥作用。三角梅中控制花色变化的主要是甜菜色素,研究三角梅甜菜色素合成途径中的关键酶,解析其甜菜色素的合成代谢机制,可为三角梅花色形成机制提供理论参考,有望在今后的工作中,利用转基因手段丰富三角梅花色。 展开更多
关键词 三角梅 多巴双加氧酶 开放阅读框 氨基酸序列 克隆
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C12ORF66对MYCN扩增的高危神经母细胞瘤细胞的活性调控
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作者 贾安娜 战世佳 +4 位作者 张璇 郭金鑫 于永波 郭永丽 常艳 《基础医学与临床》 2024年第3期288-294,共7页
目的探究12号染色体开放阅读框66(C12ORF66)对MYCN扩增神经母细胞瘤(NB)细胞系活性的调控效应。方法通过R2数据库GSE16476和GSE49710数据集,分析MYCN扩增和MYCN非扩增NB细胞中C12ORF66表达量,以及C12ORF66表达量与患儿预后的相关性。RT-... 目的探究12号染色体开放阅读框66(C12ORF66)对MYCN扩增神经母细胞瘤(NB)细胞系活性的调控效应。方法通过R2数据库GSE16476和GSE49710数据集,分析MYCN扩增和MYCN非扩增NB细胞中C12ORF66表达量,以及C12ORF66表达量与患儿预后的相关性。RT-qRCR检测正常组织永生化细胞系、MYCN扩增及MYCN非扩增细胞系中C12ORF66 mRNA表达差异。构建瞬时敲低和稳定敲低C12ORF66的MYCN扩增细胞株,对照组和敲低组细胞进行实时无标记动态细胞分析(RTCA)、集落形成能力检测及Ki67免疫荧光染色。结果R2数据库分析显示MYCN扩增NB患儿样本中C12ORF66表达显著高于MYCN非扩增NB患儿样本,并且C12ORF66表达与患儿预后负相关(P<0.05)。细胞实验表明,与MYCN非扩增细胞系CHLA-255和SH-SY5Y相比,C12ORF66在MYCN扩增细胞系BE(2)-C和SK-N-BE(2)中表达显著升高(P<0.001)。瞬时或稳定敲低C12ORF66,MYCN扩增NB细胞增殖显著减缓(P<0.001),集落形成能力显著降低(P<0.001),Ki67阳性细胞比例显著减少(P<0.05)。结论C12ORF66在MYCN扩增NB患儿样本和细胞系中高表达,且与患儿预后负相关,敲低C12ORF66显著抑制NB细胞活性。 展开更多
关键词 12号染色体开放阅读框66 SK-N-BE(2)细胞 MYCN扩增 细胞增殖
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长链非编码RNA及其编码的微蛋白在乳腺癌中的功能及其研究进展
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作者 温子靖 杜俊 +1 位作者 陈雪 刘文 《厦门大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期799-812,共14页
[背景]乳腺癌发生发展过程相关药物靶点的发现及其分子机制研究一直是乳腺癌防治领域的前沿问题.近年来,长链非编码RNA(lncRNA)作为表观遗传调控的关键参与者受到广泛关注.部分lncRNA存在开放阅读框(ORF)并可编码功能性蛋白.越来越多研... [背景]乳腺癌发生发展过程相关药物靶点的发现及其分子机制研究一直是乳腺癌防治领域的前沿问题.近年来,长链非编码RNA(lncRNA)作为表观遗传调控的关键参与者受到广泛关注.部分lncRNA存在开放阅读框(ORF)并可编码功能性蛋白.越来越多研究表明,lncRNA及其编码的微蛋白在细胞分裂、钙及线粒体代谢等生物学过程中发挥重要作用,且在多种疾病尤其是肿瘤的发生发展过程中发挥关键调控作用,可参与多种癌症信号通路并调控肿瘤进程,调控肿瘤的生长增殖、侵袭转移与耐药,并与患者的预后相关,暗示其可能应用于癌症的诊断与治疗中.[进展]本文系统综述了lncRNA及其编码的微蛋白在乳腺癌中的功能和分子机制.作为lncRNA分子,lncRNA可以在转录或转录后水平调控基因表达、mRNA稳定性、蛋白翻译和蛋白稳定性,从而调控乳腺癌细胞增殖、分化、侵袭和转移及免疫应答等恶性进程.lncRNA的表达特征和存在形式也赋予其作为临床诊断标志物与治疗靶点的可能性.作为编码微蛋白的载体,lncRNA可以进一步翻译产生长度小于100个氨基酸的微蛋白,并在细胞的正常生理活动及癌症的发生发展中发挥关键调控作用.在乳腺癌中也发现lncRNA来源的微蛋白可以参与乳腺癌细胞的生长、转移和侵袭及耐药等恶性病变进程,并可能应用于癌症的诊断与治疗中.[展望]lncRNA及其编码的微蛋白被证明具有作为新治疗靶点和抗肿瘤药物的巨大潜力.然而,验证lncRNA的编码潜力是后续微蛋白功能研究的前提.如何从真核生物基因组数以万计的ORF中准确识别可编码的ORF,区分其与真正的转录或翻译“噪声”面临挑战;同时,这些微蛋白的具体结构、定位、表达水平仍待进一步研究,其作为新药靶点或肿瘤标志物的临床实用性也需更深入的探索和评估. 展开更多
关键词 乳腺癌 长链非编码RNA 短开放阅读框 微蛋白
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Pathogenesis and clinical features of severe hepatitis E virus infection
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作者 László Orosz Károly Péter Sárvári +2 位作者 Áron Dernovics András Rosztóczy Klára Megyeri 《World Journal of Virology》 2024年第2期19-33,共15页
The hepatitis E virus(HEV),a member of the Hepeviridae family,is a small,non-enveloped icosahedral virus divided into eight distinct genotypes(HEV-1 to HEV-8).Only genotypes 1 to 4 are known to cause diseases in human... The hepatitis E virus(HEV),a member of the Hepeviridae family,is a small,non-enveloped icosahedral virus divided into eight distinct genotypes(HEV-1 to HEV-8).Only genotypes 1 to 4 are known to cause diseases in humans.Genotypes 1 and 2 commonly spread via fecal-oral transmission,often through the consum-ption of contaminated water.Genotypes 3 and 4 are known to infect pigs,deer,and wild boars,often transferring to humans through inadequately cooked meat.Acute hepatitis caused by HEV in healthy individuals is mostly asymptomatic or associated with minor symptoms,such as jaundice.However,in immunosup-pressed individuals,the disease can progress to chronic hepatitis and even escalate to cirrhosis.For pregnant women,an HEV infection can cause fulminant liver failure,with a potential mortality rate of 25%.Mortality rates also rise amongst cirrhotic patients when they contract an acute HEV infection,which can even trigger acute-on-chronic liver failure if layered onto pre-existing chronic liver disease.As the prevalence of HEV infection continues to rise worldwide,highlighting the particular risks associated with severe HEV infection is of major medical interest.This text offers a brief summary of the characteristics of hepatitis developed by patient groups at an elevated risk of severe HEV infection. 展开更多
关键词 Hepatitis E virus CIRRHOSIS Acute-on-chronic liver failure PREGNANCY Immune dysfunction open reading frames 1-4
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消失的白墙--维米尔《窗前读信的少女》新貌刍议
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作者 徐紫迪 《艺术设计研究》 CSSCI 北大核心 2024年第2期106-113,共8页
2017~2021年,德国的德累斯顿古代大师画廊对维米尔的早期名作《窗前读信的少女》展开了史无前例的修复活动,实验室的报告证明了该画背景中的“他人覆盖论”而颠覆了原有的“维米尔覆盖论”,经过修复师的清洗,丘比特画像显现出来,原本的... 2017~2021年,德国的德累斯顿古代大师画廊对维米尔的早期名作《窗前读信的少女》展开了史无前例的修复活动,实验室的报告证明了该画背景中的“他人覆盖论”而颠覆了原有的“维米尔覆盖论”,经过修复师的清洗,丘比特画像显现出来,原本的白墙消失瓦解,此画展现出前所未有的新貌。然而,我们能否依据现有证据判断白墙出自他人之手?覆盖丘比特的行为是否与维米尔本人的意愿违背?修复结果直接导致了维米尔本人与几百年来生成的“维米尔风格”的对立,我们应如何判定此画的“原貌”,又该如何在白墙与丘比特之间进行选择?众多问题值得反思,此画“新貌”为我们提供了进一步讨论的可能。 展开更多
关键词 维米尔 《窗前读信的少女》 覆盖层 修复 图像
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开放式研究室键盘敲击声对中文文献阅读的影响研究
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作者 单晓霞 史晓峰 《噪声与振动控制》 CSCD 北大核心 2024年第6期230-235,302,共7页
键盘敲击声是开放式研究室内典型的声源之一。本文通过实验测试来研究不同声压级的键盘敲击声对开放式研究室人员专业文献阅读的影响。键盘敲击声以45、50、55 dB(A) 3个不同的声压级水平进行呈现,对参与者在3种声环境下阅读文献客观绩... 键盘敲击声是开放式研究室内典型的声源之一。本文通过实验测试来研究不同声压级的键盘敲击声对开放式研究室人员专业文献阅读的影响。键盘敲击声以45、50、55 dB(A) 3个不同的声压级水平进行呈现,对参与者在3种声环境下阅读文献客观绩效和主观感受进行分析。结果表明,参与者的客观绩效和主观感受都受到键盘敲击声的影响并与其声压级大小相关,且在键盘敲击声为50 dB(A)的测试环境中,参与者的主观感受和客观表现都达到最佳。此外还探讨个人因素(键盘使用类型、性别和噪声敏感度)对键盘敲击声环境下文献阅读任务的影响。 展开更多
关键词 振动与波 开放式研究室 文献阅读 键盘敲击声 工作效率
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基于生物信息数据分析C12ORF49在乳腺癌中的表达及其意义
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作者 马强 李慧娟 吕运成 《华夏医学》 CAS 2024年第2期103-110,共8页
目的通过在线数据库分析12号染色体开放阅读框49(C12ORF49)在乳腺癌中的表达情况、临床意义及互作蛋白功能,为乳腺癌防治和预后预测提供新思路。方法使用Oncomine数据库及人类蛋白质图谱(HPA)数据库分析C12ORF49基因和蛋白在乳腺癌不同... 目的通过在线数据库分析12号染色体开放阅读框49(C12ORF49)在乳腺癌中的表达情况、临床意义及互作蛋白功能,为乳腺癌防治和预后预测提供新思路。方法使用Oncomine数据库及人类蛋白质图谱(HPA)数据库分析C12ORF49基因和蛋白在乳腺癌不同组织中的表达差异性,然后应用Kaplan-Meier Plotter数据库分析C12ORF49表达水平与不同病理特征乳腺癌患者预后的相关性,最后利用STRING数据库绘制C12ORF49互相作用蛋白网络图,并通过KOBAS生物分析平台进行KEGG功能富集分析。结果乳腺癌中C12ORF49的表达高于正常组织,乳腺癌C12ORF49 mRNA高表达患者的总生存时间(OS)及无远处转移生存时间(DMFS)更短,差异有统计学意义(P<0.05);C12ORF49可预测luminal B型乳腺癌患者的不良DMFS预后(P<0.05);C12ORF49对乳腺癌不良DMFS预后的影响可能独立于乳腺癌受体表达状态。C12ORF49可能通过NF-κB信号通路、TCR信号通路、血小板激活等生理过程(P<0.01,Corrected-P<0.01),促进乳腺癌进展。结论C12ORF49在乳腺癌组织中表达上调,其高表达水平对预测乳腺癌患者不良预后有重要意义,需进一步深入研究。 展开更多
关键词 12号染色体开放阅读框49 乳腺癌 生物信息学
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钙黏蛋白家族成员3及11号染色体开放阅读框30基因多态性与支气管哮喘病儿易感性及糖皮质激素疗效的研究
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作者 吴彩云 凌娟 王晓丽 《安徽医药》 CAS 2024年第6期1226-1231,共6页
目的探讨钙黏蛋白家族成员3(CDHR3)及11号染色体开放阅读框30(C11orf30,EMSY)基因多态性与支气管哮喘病儿易感性及糖皮质激素疗效。方法前瞻性选取2020年5月至2021年10月于泰州市第二人民医院就诊的支气管哮喘病儿132例作为易感组。均... 目的探讨钙黏蛋白家族成员3(CDHR3)及11号染色体开放阅读框30(C11orf30,EMSY)基因多态性与支气管哮喘病儿易感性及糖皮质激素疗效。方法前瞻性选取2020年5月至2021年10月于泰州市第二人民医院就诊的支气管哮喘病儿132例作为易感组。均接受糖皮质激素吸入治疗,并根据疗效分为疗效良好组和疗效不良组。选取同期体检的48例儿童作为对照组,采用倾向性匹配方法对易感组和对照组性别、年龄等基线资料进行匹配;采用PCR检测CDHR3及EMSY基因的单核苷酸多态性,计算其基因型频率和等位基因频率,基因位点的多态性与儿童支气管哮喘易感风险间的关系采用多因素logistic回归分析。对比疗效良好组和疗效不良组不同基因型分布。结果易感组和对照组经倾向性评分匹配后有36组配对成功(每组36例),匹配后基线资料对比差异无统计学意义(P>0.05)。匹配后易感组和对照组CDHR3基因rs6967330位点、EMSY基因rs12278256位点基因型频率及A等位基因频率比较差异有统计学意义(P<0.05)。多因素logistic回归分析显示:EMSY基因rs12278256位点AA基因型[OR=9.91,95%CI:(1.02,96.65)]、CDHR3基因rs6967330位点AA基因型[OR=10.09,95%CI:(1.08,94.02)]是支气管哮喘易感的危险因素(均P<0.05)。治疗12周后,24例(66.67%)为疗效良好组,其余12例(33.33%)归为疗效不佳组,两组CDHR3基因rs6967330位点基因型分布对比差异无统计学意义(P>0.05);两组EMSY基因rs12278256位点基因型分布对比差异有统计学意义(P<0.05),其中疗效良好组AA基因型分布频率[37.50%(9/24)]明显高于疗效不良组[0(0/12)](P<0.05)。结论CDHR3基因rs3847076位点以及EMSY基因rs12278256位点与儿童支气管哮喘易感有关,EMSY基因rs12278256位点与糖皮质激素治疗疗效相关。 展开更多
关键词 哮喘 钙黏蛋白家族成员3 11号染色体开放阅读框30 基因多态性 糖皮质激素 倾向性评分匹配
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基于思维发展的语文阅读课堂追问刍论
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作者 付建宏 《成才之路》 2024年第29期89-92,共4页
培养学生的创造性思维是素质教育理念下的重要教学目标。语文阅读课堂是培养学生思维能力的有效载体,教师可借助阅读课堂的追问,激发学生的主动思考和探究动力,促进学生的语言表达能力、逻辑思维能力以及批判性思维能力和创新能力发展... 培养学生的创造性思维是素质教育理念下的重要教学目标。语文阅读课堂是培养学生思维能力的有效载体,教师可借助阅读课堂的追问,激发学生的主动思考和探究动力,促进学生的语言表达能力、逻辑思维能力以及批判性思维能力和创新能力发展。基于思维发展的语文阅读课堂追问策略有:设计开放性提问、分层性提问、反思性提问、细节性提问,并在角色扮演中设计问题,以预测与推测引导学生深入思考,以此提升教学效果,促进学生的思维发展。 展开更多
关键词 小学语文 阅读 追问 思维发展 分层 开放 反思 细节 角色 预测 推测
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鳡肌肉生长抑制素(MSTN)基因的克隆及其组织特异性表达分析 被引量:10
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作者 郁建锋 张营 +4 位作者 王星果 徐建荣 卢祥云 李建林 顾志良 《水产学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第10期1486-1494,共9页
以鳡肌肉总RNA为模板,采用RT-PCR和RACE的方法,获得了鳡肌肉生长抑制素(myostatin,MSTN)基因的3个重叠片段,测序后拼接得到2177bp全长cDNA序列,其包含了5′端非翻译区的89个核苷酸和3′端非翻译区1052个核苷酸以及1125个核苷酸的开放性... 以鳡肌肉总RNA为模板,采用RT-PCR和RACE的方法,获得了鳡肌肉生长抑制素(myostatin,MSTN)基因的3个重叠片段,测序后拼接得到2177bp全长cDNA序列,其包含了5′端非翻译区的89个核苷酸和3′端非翻译区1052个核苷酸以及1125个核苷酸的开放性阅读框,翻译编码375个氨基酸,其中前22个氨基酸为鳡MSTN的信号肽。鳡MSTN具有MSTN的共同特征,有蛋白酶水解位点RIRR和在C端生物活性区含9个保守的半胱氨酸残基。核苷酸和氨基酸同源性分析发现鳡MSTN与厚颌鲂、草鱼和鲤等鲤形目鱼类的同源性较高,与鲈形目的同源性较低,与哺乳动物和鸟类的同源性最低;系统发育分析表明鳡MSTN与厚颌鲂亲缘关系最近。半定量RT-PCR分析表明,该基因在肌肉和脑中表达量最高,在心肌中也有较高表达,在肝脏、肠、鳃和肾等组织中未见明显表达,此结果表明鳡MSTN基因除对肌肉生长发育有调控作用以外,可能还有其他功能。 展开更多
关键词 肌肉生长抑制素 开放性阅读框 表达
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OverDrive图书馆移动阅读解决方案及其特点 被引量:18
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作者 付跃安 黄晓斌 《图书馆杂志》 CSSCI 北大核心 2012年第2期64-68,共5页
OverDrive是国外最大的电子书和数字媒体传播商,针对图书馆业务,OverDrive成功开发了数字图书馆仓储,建立了有效的移动阅读解决方案。文章从发展概况、特点、不足与建议四个方面对OverDrive移动阅读解决方案进行了分析。文章讨论了OverD... OverDrive是国外最大的电子书和数字媒体传播商,针对图书馆业务,OverDrive成功开发了数字图书馆仓储,建立了有效的移动阅读解决方案。文章从发展概况、特点、不足与建议四个方面对OverDrive移动阅读解决方案进行了分析。文章讨论了OverDrive的三个特点:开放性、专业性和人性化,分析了OverDriver的不足,即过度开放带来的问题与OverDrive可用性方面的问题,并对我国图书馆开展移动阅读业务提出了建议。 展开更多
关键词 OVERDRIVE 移动阅读 特点 开放性
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痘苗病毒天坛株基因组旁侧区结构及开放读码框架的分析 被引量:8
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作者 金奇 陈南海 +2 位作者 姚二梅 黄静 侯云德 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 1997年第1期1-5,共5页
本文分析了我国痘苗病毒天坛株基因组两端的HindⅢ-C和-B片段所编码的多肽,并与其他痘苗病毒株和正痘病毒进行了比较。结果表明,天坛株基因组HindII-C和-B片段共有46个主要的开放读码框架(PRFs),其中一个... 本文分析了我国痘苗病毒天坛株基因组两端的HindⅢ-C和-B片段所编码的多肽,并与其他痘苗病毒株和正痘病毒进行了比较。结果表明,天坛株基因组HindII-C和-B片段共有46个主要的开放读码框架(PRFs),其中一个ORF属于痘苗病毒基因组中第一次发现的与天花病毒相似的基因编码区。此外,天坛株基因组丝氨酸蛋白酶抑制剂Ⅱ的编码区由于移码变异而分成两个不同ORFs。与其他痘苗病毒株相比,天坛株基因组有多个ORFs的缺失,以上现象提示,天坛株在生物学性状上与其他毒株的差异可能与此有关。 展开更多
关键词 痘苗病毒 天坛株 基因组 旁侧区 开放读码框架
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利用SRAP分子标记分析47份杂草稻样品遗传多样性 被引量:11
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作者 刘丹 孙健 +4 位作者 马殿荣 王嘉宇 唐亮 苗微 陈温福 《中国水稻科学》 CAS CSCD 北大核心 2012年第1期70-76,共7页
利用SRAP分子标记分析了采集于杂草稻多发地区的47份样本的遗传多样性,旨在从基因的开放式阅读框区域(ORFs)深入研究杂草稻的遗传背景,为进一步揭示其来源提供依据。结果表明,参试的我国杂草稻材料在110对引物组合中共扩增出845种类型... 利用SRAP分子标记分析了采集于杂草稻多发地区的47份样本的遗传多样性,旨在从基因的开放式阅读框区域(ORFs)深入研究杂草稻的遗传背景,为进一步揭示其来源提供依据。结果表明,参试的我国杂草稻材料在110对引物组合中共扩增出845种类型的谱带,多态性谱带590种,多态率为69.82%,平均每对引物可以检测到5.4条多态性谱带。说明SRAP分子标记对于杂草稻基因组开放式阅读框区域序列的多态性具有很高的检测效率,适用于遗传多样性研究。我国杂草稻材料Shannon-Weaver多样性指数(I)为0.63,且南北方杂草稻多样性指数(I)相当,分别为0.63和0.62。聚类分析结果表明,南方收集的杂草稻与北方收集杂草稻群体间遗传分化较大,遗传差异明显。程氏指数判定结果也表明杂草稻呈南籼北粳的分布状态。 展开更多
关键词 杂草稻 开放式阅读框 相关序列扩增多态性 遗传多样性
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基因表达式编程ORF过滤算子的设计和实现 被引量:4
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作者 段磊 唐常杰 +2 位作者 刘胤田 左劼 吴江 《四川大学学报(工程科学版)》 EI CAS CSCD 北大核心 2007年第6期102-106,共5页
基因表达式编程(GEP)的个体代表了问题的候选解。在缺乏先验知识的情况下,个体长度的设定是个"两难"问题,过长或过短都会降低GEP的效率。对此,分析了个体长度对GEP求解效率的影响;设计了开放阅读框(ORF)过滤算子根据最优个体... 基因表达式编程(GEP)的个体代表了问题的候选解。在缺乏先验知识的情况下,个体长度的设定是个"两难"问题,过长或过短都会降低GEP的效率。对此,分析了个体长度对GEP求解效率的影响;设计了开放阅读框(ORF)过滤算子根据最优个体的进化历程动态调节个体的有效编码区域;验证了ORF过滤算子的有效性,实验结果表明,在同样的进化代数内,引入ORF过滤算子,GEP能进化出更高适应度的最优解且减少平均运行时间17.0%。 展开更多
关键词 基因表达式编程 开放阅读框 个体
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江门株诺如病毒重组鉴定及分析 被引量:6
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作者 宋灿磊 戴迎春 +2 位作者 胡贵方 向文龙 聂军 《实用医学杂志》 CAS 北大核心 2010年第7期1104-1106,共3页
目的:对诺如病毒(norovirus,NoV)NoV/Jiangmen056/2006/china和NoV/Jiangmen380/2006/china株进行重组鉴定分析。方法:用JV12Y/JV13I、COG2F/GⅡSKR、JV12Y/GⅡSKR三对引物对NoV基因组不同区域分别进行RT-PCR,PCR产物纯化回收、测序,利... 目的:对诺如病毒(norovirus,NoV)NoV/Jiangmen056/2006/china和NoV/Jiangmen380/2006/china株进行重组鉴定分析。方法:用JV12Y/JV13I、COG2F/GⅡSKR、JV12Y/GⅡSKR三对引物对NoV基因组不同区域分别进行RT-PCR,PCR产物纯化回收、测序,利用ClustalX、MEGA4.1、SimPlot3.5.1软件分析其基因序列。结果:NoV/Jiangmen056/2006/china株由Lordsdal株的RdRp区和Mexico株的capsid区重组而成,而NoV/Jiangmen380/2006/china株由NLV/VannesL169/2000株的RdRp区和SaKaeo-53株的capsid区重组而成。结论:NoV/Jiangmen056/2006/china和NoV/Jiangmen380/2006/china是两种不同型别NoV重组株,而后者是国内首次检出的新型GⅡ.bNoV重组株,上述结果丰富了我国重组NoV的研究资料。 展开更多
关键词 诺罗病毒 重组 RNA依赖RNA聚合酶 衣壳 开放阅读框架
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戊型肝炎病毒结构区ORF2蛋白在巴氏毕赤酵母中的胞内表达与纯化的初步研究 被引量:11
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作者 佟玉品 毕胜利 +1 位作者 江永珍 詹美云 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2001年第1期34-37,共4页
为寻求新型表达系统来研制戊型肝炎基因工程疫苗 ,利用甲醇营养型酵母 pichiapastoris表达系统表达戊型肝炎病毒 (HEV)结构区ORF2蛋白。采用PCR方法从HEVcDNA中扩增得到的ORF2基因克隆到酵母表达载体pPIC3.5K上 ,构建成重组质粒 pPIC3.5... 为寻求新型表达系统来研制戊型肝炎基因工程疫苗 ,利用甲醇营养型酵母 pichiapastoris表达系统表达戊型肝炎病毒 (HEV)结构区ORF2蛋白。采用PCR方法从HEVcDNA中扩增得到的ORF2基因克隆到酵母表达载体pPIC3.5K上 ,构建成重组质粒 pPIC3.5KORF2。该质粒转化酵母菌GS115 ,经G418筛选得到高拷贝转化子。转化菌株经Mut表型鉴定后 ,用含甲醇的培养基诱导表达 ,SDS PAGE及ELISA筛选高表达活性菌株 ,放大培养后进行亲合层析纯化。在该系统中成功地表达了高生物活性的HEVORF2蛋白 ,经亲和层析纯化后扫描分析重组蛋白分子量约为 5 9kD ,纯度可达 96 %。Westernblotting证实 ,它与HEVORF2单克隆抗体有特异性反应。HEV结构区ORF2蛋白在甲醇营养型酵母中的成功表达 ,以及初步纯化得到的具有强免疫学活性的重组蛋白 。 展开更多
关键词 戊型肝炎病毒 开放读码框架 异源基因表达 蛋白纯化 巴氏毕赤酵母 胞内表达
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LAIR基因的克隆、原核表达及免疫反应性鉴定 被引量:5
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作者 谢鑫 欧阳为明 +4 位作者 薛江楠 张新海 刘飞 庄然 金伯泉 《细胞与分子免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2003年第2期118-120,123,共4页
目的 :克隆和表达淋巴细胞相关免疫球蛋白样受体 (leuko cyte associatedimmunoglobulin likereceptor ,LAIR ) ,鉴定抗LAIR 1单克隆抗体 (mAb)与LAIR 2分子的免疫反应性。方法 :利用RT PCR ,从人外周血单个核细胞 (PBMC)及白血病细胞系... 目的 :克隆和表达淋巴细胞相关免疫球蛋白样受体 (leuko cyte associatedimmunoglobulin likereceptor ,LAIR ) ,鉴定抗LAIR 1单克隆抗体 (mAb)与LAIR 2分子的免疫反应性。方法 :利用RT PCR ,从人外周血单个核细胞 (PBMC)及白血病细胞系Jurkat和HL 6 0中克隆了LAIRcDNA。将LAIR 1的胞膜外区基因及LAIR 2cDNA ,克隆入GST融合蛋白表达载体pGEX 4T 3中。以其转化E .coliBL2 1菌株后 ,在IPTG诱导下进行表达 ,表达产物用谷胱甘肽交联的Sepharose 4B纯化。用间接ELISA法 ,鉴定抗LAIR 1mAb对表达蛋白的免疫反应性。结果 :克隆并表达了LAIR 1和LAIR 2cDNA。同时克隆了 5种新的LAIR 1异型 ,其中从HL 6 0细胞克隆的 2种包含LAIR 1开放读框 (ORF) ,从Ju rkat细胞中克隆的 3种为LAIR 1cDNA片段。mAb鉴定表明LAIR 1与LAIR 2的免疫反应性不同。结论 :LAIR基因的转录、转录后的加工及表达 ,可能与个体和疾病状态有关。LAIR 1和LAIR 展开更多
关键词 淋巴细胞相关免疫球蛋白样受体 单克隆抗体 免疫反应性 RT-PCR 基因转录
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