一株副溶血弧菌噬菌体生物学特性、全基因组特征及其在食品中的应用

目的:分析1株副溶血性弧菌噬菌体474x1的生物学特性、全基因组及在食品中的抑菌效果。方法:以副溶血性弧菌474菌株为宿主菌,从海鲜市场基围虾分离噬菌体474x1,利用透射电镜观察其形态,并绘制一步生长曲线,分析474x1对温度及pH的敏感性。分析474x1全基因组序列,根据474x1末端酶大亚基构建系统进化树。通过测定菌落总数评价噬菌体对虾肉中副溶血弧菌的抑制效果。结果:分离到1株新型的副溶血弧菌噬菌体,命名为474x1,该噬菌体能够裂解23株副溶血弧菌中的19株(19/23=82.61%)。电镜观察474x1具有典型的短尾病毒科病毒形态特征。最佳感染复数(MOI)为0.01,一步生长曲线显示474x1的潜伏期为10 min,裂解量为115 PFU/cell。该噬菌体能够在较大的温度范围(30~60℃)和pH(4~11)范围内维持活性。474x1全基因组长47830 bp,包含69个开放阅读框(open reading frames,ORFs),其中14个具有特定功能的基因。比较基因组学分析474x1与短尾噬菌体科弧菌属噬菌体Vp41s3基因组具有较高同源性,进化分析表明474x1与副溶血弧菌噬菌体Vp41s3亲缘性最高。在应用实验中,在4℃下MOI=1000的实验组在第3 h相较对照组菌量下降了0.39 lgCFU/mL。MOI=10000的实验组在第12 h相较对照组菌量下降了0.92 lgCFU/mL,在25℃下MOI=1000,MOI=10000的实验组相较对照组在第6 h时菌量分别下降1.04、1.82 lgCFU/mL,表明噬菌体474x1能够显著抑制虾肉中宿主菌的生长。结论:从基围虾中分离鉴定1株新的副溶血性弧菌噬菌体,该噬菌体裂解量大,潜伏期短,在60℃以下表现出较好的稳定性,pH耐受范围宽,在食品中也有良好的抑菌效果,为防控水产品副溶血性弧菌的致病株奠定了基础。

明永冰川三株黄杆菌低温噬菌体的生物学特性研究

对分离自明永冰川地区的3株黄杆菌低温噬菌体(MYSP03、MYSP08和MYTP08)的生物学特征开展了研究,采用氯化铯密度梯度离心法对3株低温噬菌体进行了纯化并系统比较了3株低温噬菌体的形态、宿主专一性、吸附速率、最佳感染复数及一步生长曲线等生物学特性。虽然3株低温噬菌体的宿主均为黄杆菌,但它们在形态及生物学特性上均表现不同。低温噬菌体MYSP03和08为头尾型噬菌体,呈复合结构,二者头部直径与尾管长度明显不同;噬菌体MYTP08与MYSP08形态差异较大,但它们都能感染同一宿主菌,MYTP08为复层噬菌体,衣壳直径为58 nm。噬菌体MYSP03、MYSP08和MYTP08分别在MOI为0.1、10和1时所产生的子代噬菌体数量最多,3株噬菌体的裂解量显著不同,其中MYTP08最大为137。

Multiplication of the Recombinant Strain Re-7 of Avian Influenza Virus Subtype H5 in MDCK Cells

This study was conducted to explore the multiplication pattern of the recombinant strain Re-7 of avian influenza virus subtype H5 in Madin Darby Canine Kidney （MDCK） cells and to determine the optimal multiplicity of infection （MOI） and the optimal time for virus harvest. The recombinant strain Re-7 was inoculated at different MOIs into MDCK cells grown in serum-free medium in 100 L bioreactors for replication. Then, the hemagglutination（HA） titer, 50% tissue culture infectious dose （TCID50） and 50% embryo infectious dose （EID50） of culture medium were measured once every 12 h from 24 h after virus inoculation to determine the optimal MOI. After that, virus was inoculated at the optimal MOI determined above into MDCK cells for large-scale virus replication to determine the optimal time for virus harvest. The results showed that the optimal MOI was 10 2, and the optimal time for virus harvest was 60 h after inoculation. Under these conditions, the HA titer, TCIDso per 1 mL and EIDso per 0.1 mL were increased to 1：102 4, 10^7.33 and 10^6.83, respectively. This study provides relatively stable parameters for large-scale production of the recombinant strain Re-7 of avian influenza virus subtype H5.

传染病防控下的市民慢性病药品现场购药需求的周期优化

呼吸道传染疾病在人群间的传播,容易引发大规模的公共卫生事件。在疫情防控期间,通过限制购药周期可以有效控制和降低因购药聚集而产生的感染风险。本文聚焦传染病疫情防控中封闭与复工初期慢性病患者的购药需求,针对到店购药场景,提出一个慢性病患者购药周期的优化方法。首先,依据武汉市疫情防控期间"不得跨区购药"的原则,通过复杂网络模型,构建药店与小区之间可能的服务关系;然后基于共享单车订单数据提取购药人流量随距离的衰减规律,在此基础上建立小区购药人流在为其提供服务的各药店间的分配机制,进而确定药店侧的顾客到达速率,实现小区和药店的空间分布特征与排队论模型的耦合;接着采用离散事件仿真方法对不同购药周期下的系统状态进行仿真;最后基于仿真结果,以最大程度地兼顾患者的购药需求和药店的使用率为优化目标,通过二分法查找购药周期的最优解。实验以武汉市中心城区为例,首先通过条件概率估算各类慢性病患者的数量,再通过上述方法求解得到最优购药周期为28 d。该周期下,患者的人均等待时长为8.55 min,接近最佳的排队容忍时长,绝大多数的购药需求能够被满足,且药店资源能够得到充分利用(达到繁忙状态的药店比例达到87%以上),药店的日均备货量不超过100(瓶或盒),处于药店备货能力范围之内。本文的方法和结论,可用于指导慢性病患者的购药决策及药店的慢性病备药。