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p53活性四聚体全原子分子动力学分析
1
作者
周晗
耿轶钊
晏世伟
《物理学报》
SCIE
EI
CAS
CSCD
北大核心
2024年第4期300-313,共14页
p53是一种肿瘤抑制蛋白,对阻碍癌症发展、维持遗传完整性起着至关重要的作用.在细胞核内,4个p53分子通过高度协同的方式、通过DNA结合域与DNA结合,形成稳定的四聚体活性结构,并转录激活或抑制其靶向基因.然而,大多数肿瘤细胞中存在大量...
p53是一种肿瘤抑制蛋白,对阻碍癌症发展、维持遗传完整性起着至关重要的作用.在细胞核内,4个p53分子通过高度协同的方式、通过DNA结合域与DNA结合,形成稳定的四聚体活性结构,并转录激活或抑制其靶向基因.然而,大多数肿瘤细胞中存在大量p53的突变,其中绝大部分突变发生在p53的DNA结合域,而p53的DNA结合域又是p53形成四聚体活性结构、调控下游靶基因转录的重要区域.本文通过全原子分子动力学模拟,研究了野生型p53四聚体内分子间的相互作用机制.结果表明,位于DNA两侧的对称二聚体是一个稳定的二聚体,在与DNA结合前后都能维持稳定的结构.位于DNA同侧的两个单体依靠两个接触面提供的蛋白-蛋白相互作用和DNA的骨架作用使四聚体活性结构保持稳定,这些相互作用为四聚体的形成机制提供了重要支撑.该工作厘清了p53四聚体在动力学过程中的内部相互作用机制和关键残基,揭示了四聚化过程中各个相互作用界面的关键位点,对于理解p53的抑癌机制、探索有效治癌策略、发展治癌药物具有重要意义.
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关键词
p53核心四聚体
p
53
核心
结构域
蛋白-蛋白相互作用
分子动力学模拟
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职称材料
题名
p53活性四聚体全原子分子动力学分析
1
作者
周晗
耿轶钊
晏世伟
机构
北京师范大学物理学系
河北工业大学理学院
北京师范大学文理学院
出处
《物理学报》
SCIE
EI
CAS
CSCD
北大核心
2024年第4期300-313,共14页
基金
国家自然科学基金(批准号:11675018,11735005)资助的课题.
文摘
p53是一种肿瘤抑制蛋白,对阻碍癌症发展、维持遗传完整性起着至关重要的作用.在细胞核内,4个p53分子通过高度协同的方式、通过DNA结合域与DNA结合,形成稳定的四聚体活性结构,并转录激活或抑制其靶向基因.然而,大多数肿瘤细胞中存在大量p53的突变,其中绝大部分突变发生在p53的DNA结合域,而p53的DNA结合域又是p53形成四聚体活性结构、调控下游靶基因转录的重要区域.本文通过全原子分子动力学模拟,研究了野生型p53四聚体内分子间的相互作用机制.结果表明,位于DNA两侧的对称二聚体是一个稳定的二聚体,在与DNA结合前后都能维持稳定的结构.位于DNA同侧的两个单体依靠两个接触面提供的蛋白-蛋白相互作用和DNA的骨架作用使四聚体活性结构保持稳定,这些相互作用为四聚体的形成机制提供了重要支撑.该工作厘清了p53四聚体在动力学过程中的内部相互作用机制和关键残基,揭示了四聚化过程中各个相互作用界面的关键位点,对于理解p53的抑癌机制、探索有效治癌策略、发展治癌药物具有重要意义.
关键词
p53核心四聚体
p
53
核心
结构域
蛋白-蛋白相互作用
分子动力学模拟
Keywords
p
53
core tetramer
p
53
core domain
p
rotein-
p
rotein interaction
molecular dynamics simulation
分类号
R730 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
p53活性四聚体全原子分子动力学分析
周晗
耿轶钊
晏世伟
《物理学报》
SCIE
EI
CAS
CSCD
北大核心
2024
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