基于SourceTracker分析牧场环境对乳房炎乳菌群的影响

乳房炎是奶牛常见的疾病之一,通常是由牧场环境中的病原微生物引起,因此,开展乳房炎病原微生物溯源研究对乳房炎防治具有重要意义。本研究从中国天津某牧场收集了乳房炎乳、牧场环境(空气、饮用水、饲料、粪便、垫料、新垫料及喷淋水)和挤奶厅(前药浴液、后药浴液、前药浴杯、后药浴杯、奶杯、乳头皮肤)样品共计74份,提取可培养微生物DNA和总DNA,进行16S rDNA扩增测序和SourceTracker分析。在采集的74份样品中,共检测到50个不同科水平上的细菌。Beta多样性和ANOSIM分析表明,样品间细菌群落相似性低。乳房炎乳和乳头皮肤及卧床样品的细菌群落结构相似。此外,SourceTracker结果发现,乳头皮肤是奶牛乳房炎的主要污染源,其次是空气、奶杯和粪便,这表明牧场管理会影响奶牛感染乳房炎的情况。因此,牧场应加强管理控制措施,减少或消除牧场中病原微生物的传播风险。