人类pax-5基因外显子1B的5′侧翼区碱基序列分析(英文)

pax 5基因是B细胞生成和B细胞发育中的重要转录因子。为了更好的理解 pax 5基因表达的调节机制 ,对 pax 5基因外显子 1B的 5′侧翼区进行了分离克隆及序列测定。整段碱基序列 (6 6 71bp)分析表明 ,无TATAbox共同序列存在 ,近侧启动子包括 3CATboxs,1SP1和 1Ebox ,上游进一步推测的调节位点显示 6LMO2 COM ,5NFAT ,2LPOLYA B ,3GATA1,2AP4 ,10MZF1,1ETS1 B ,1GATA3,1NKX2 5 ,2RORA1,1LYF1,2Ikaros2 ,2TCF11,1GATA C和 1FREAC7,并确定在序列上。因此 ,pax 5基因外显子 1B的 5′侧翼区与 pax 5表达的调节有关 。

GDF5基因突变导致1B型近端指/趾关节粘连的基因诊断研究

目的本研究旨在通过基因诊断、分析和鉴定1个疑似近端指/趾关节粘连家系的致病基因突变位点,从而辅助临床确诊该疑难杂症。方法先证者及其家系居住于浙江省杭州市。首先收集先证者和家系的临床资料并分析其遗传方式。采集家系成员的静脉抗凝外周血5 mL,纯化基因组DNA,对先证者进行全外显子组测序(WES)。将WES结果与国内外权威的人类基因组数据库,包括国外的gnomAD、The International Genome Sample Resource(IGSR)、ClinVar、OMIM,国内的神州基因组数据库等的DNA序列进行比对和生物信息学分析,筛选和确定潜在的突变基因位点。之后再通过聚合酶链反应(PCR)、Sanger DNA测序技术分析验证候选基因。用SIFT、Polyphen2和MutationTaster等生物信息学软件预测突变蛋白的可能致病性。结果本研究涉及的疑似近端指/趾关节粘连家系有2例患者,分别为先证者(男性)和其父。研究结果发现,2例患者均存在生长/分化因子5基因(GDF5)第2外显子的杂合性错义突变:c.1277C>T杂合突变,导致其生长/分化因子5分子第423位的氨基酸由丙氨酸突变为缬氨酸(p.Ala423Val)。家系中的正常个体均不存在该位点的突变。该突变在正常健康个体中的分布频率尚未见报道。经SIFT、Polyphen2、MutationTaster、M-CAP、FATHMM和PROVEAN等多个软件分析预测蛋白功能,结果显示均为有害。结合患者的临床特征,确诊为1B型近端指/趾关节粘连。结论GDF5基因的杂合性错义突变c.1277C>T(p.Ala423Val)可导致1B型近端指/趾关节粘连。用WES技术结合患者的骨影像学资料和临床特征,可确诊疑难的骨科单基因病,临床实用性强。