FS2M01.pl,转换片段大小表为0/1矩阵的Perl脚本

用Perl语言编写了一个脚本———FS2M01.pl来实现片段大小表向0/1矩阵的转换,解决了由人工方法将遗传图谱的位点信息转换成0/1矩阵的问题。

pep_pattern．Pl，搜索蛋白质序列模体的Perl脚本

用Perl语言编写了一个pep_pattern．pl脚本，可从一组相关序列中搜索非常相似的序列片段，通过匹配所有可能的氨基酸片段的排列，统计每个匹配模体在序列中的出现频率和位置，搜索蛋白质序列中的2～4个多肽的模体。

ChooseMaterials.pl,控制变量挑选实验材料的perl脚本

用Perl语言编写了一个脚本—ChooseMaterials.pl,通过计算两个材料特定某几列数据之间增加或减少的百分数水平,达到控制变量突出关键因子的作用,方便生物学工作者选取材料,做进一步的实验或分析。

Enrich＿analysis.pl,差异表达基因富集分析的perl脚本

如何从庞大的基因表达数据库里挖掘出有价值的信息,并做出科学的生物学诠释,是基因表达分析领域的重要挑战。富集分析为解决这一问题提出了合理的方案。用Perl语言写了一个脚本——Enrich_analysis.pl,可根据基因注释信息进行基因富集分析,并利用Fisher's Exact Test做检验。富集分析先根据生物学知识将基因归类,然后进行基因差异表达分析,提高数据的可解释性。并利用3篇SCI文章的差异基因数据,对本perl脚本进行了对比测试,证明本perl脚本算法正确可靠。

基于Perl脚本在NCBI网站自动或批量获取物种信息

根据物种学名、分类号、任意一段核酸或蛋白质的序列,判定其属于什么物种及其详细分类的信息如何,是生物信息分析的最为基础且重要的环节,但该过程的分析及结果的获取均为手动,费时费力且容易出错。本研究旨在解决如何在NCBI网站上自动或批量获取物种信息。通过解析NCBI在线BLAST结果及其网页源程序特点,利用Perl语言编写自动化脚本,以达到批量获取查询或比对结果的物种分类信息。本研究编写的Perl语言脚本可解决序列在NCBI在线比对后自动或批量获取物种的分类信息问题,适用于细菌、真菌、动物、植物等物种学名、分类号、核酸或蛋白质的任意序列,可以为同行生物数据分析提供参考。

基于Perl脚本的自动化测试系统的设计与实现

近些年来,软件重写越来越普遍。但是如何高效的测试重写软件使其具备原软件的效率与准确率是测试所面临的一项挑战。传统的手工测试法既耗费人力,又浪费时间,还可能存在人为疏忽所引起的错误。为了能良好的解决上述问题,本文提出了基于Perl脚本的自动化测试系统的设计与现实,从而有效地提高了测试工作的效率。

Perl脚本在试验数据解析中的应用

数据解析是型号试验的重要环节。简介Perl语言,设计用于解析试验数据的Perl脚本。

基于动态链接库自动查找的软件发布方案

针对传统的软件发布过程中人工定位主程序依赖动态链接库的问题,提出了一个基于动态链接库自动查找的软件发布方案。该方案利用perl脚本对程序所依赖的动态链接库文件进行自动查找,解决了多路径下同名动态链接库无法正确定位的问题,并使用开源工具Inno Setup实现了大型软件系统的发布。该方案避免了手动查找依赖库的繁琐过程,减少了人工干预,降低了开发人员的系统维护成本,为软件发布提供了一种快速有效的途径,提高了软件发布的效率和稳定性。

编程语言规范检查模型的设计与实现——C语言规范

研究编程语言规范，设计编程语言规范检查模型，运用该模型进行编程语言代码的规范检查，以提高代码维护效率为目标，实现在软件维护过程中的自动代码走查。分析C语言编程规范，对C程序进行规范检查与修改，设计实现C语言编程规范检查系统，完成自动代码走查。采用编程语言词法分析正则表达式，构造匹配各类不规范代码的正则表达式，完成对C程序标识符、头文件、源程序语法格式和语句代码行的不规范代码检查，运用Perl脚本语言实现本系统。该模型及其实现可应用于软件自动维护过程。

Mac OS X密技

我们这些Mac的用户长时间以来都非常地自豪,因为我们完全不需要在使用机器的时候输入命令。现在还是这样,但是现在Mac OS X已经开放了Unix的命令行(Unix的指令功能),我们有了所有必须的工具来改进程序的编写和脚本的兼容性,所以,我们的Mac机能做更多令我们“厌烦”的工作,当然。