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哺乳动物中不同表达丰度外显子的进化特征
1
作者
李洁
方林
+6 位作者
李昕
张晓妍
叶葭
胡卫红
郑冰蓉
俞海菁
肖春杰
《科学通报》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2010年第1期31-39,共9页
通过比较基因组学方法,利用哺乳动物基因组数据对不同表达丰度外显子的进化特征进行了研究.以非编码区和假基因为对照,对外显子进行序列相似度、phastCons和Ka/Ks分析,结果显示,高表达外显子十分保守而低表达和低表达的外显子也在物种...
通过比较基因组学方法,利用哺乳动物基因组数据对不同表达丰度外显子的进化特征进行了研究.以非编码区和假基因为对照,对外显子进行序列相似度、phastCons和Ka/Ks分析,结果显示,高表达外显子十分保守而低表达和低表达的外显子也在物种间表现出保守的进化特征.低表达丰度的外显子构成了物种转录组中大多数的转录本种类,结果显示它们的进化都受到功能限制,暗示它们可能在生物进化过程中为增加生物复杂度做出贡献.
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关键词
外显子
进化
序列相似度
phastcons
Ka/Ks
原文传递
题名
哺乳动物中不同表达丰度外显子的进化特征
1
作者
李洁
方林
李昕
张晓妍
叶葭
胡卫红
郑冰蓉
俞海菁
肖春杰
机构
云南大学生物资源保护与利用重点实验室
深圳-北京基因组研究所
中国科学院昆明动物研究所遗传资源与进化重点实验室
出处
《科学通报》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2010年第1期31-39,共9页
基金
国家自然科学基金(批准号:30871342
30663376和30740420553)
+2 种基金
"西部之光"项目和云南省中青年学术和技术带头人后备人才项目(编号:2008PY025)资助
国家基础科学人才培养基金(编号:J073652)
云南大学生命科学实验教学示范中心创新实验项目
文摘
通过比较基因组学方法,利用哺乳动物基因组数据对不同表达丰度外显子的进化特征进行了研究.以非编码区和假基因为对照,对外显子进行序列相似度、phastCons和Ka/Ks分析,结果显示,高表达外显子十分保守而低表达和低表达的外显子也在物种间表现出保守的进化特征.低表达丰度的外显子构成了物种转录组中大多数的转录本种类,结果显示它们的进化都受到功能限制,暗示它们可能在生物进化过程中为增加生物复杂度做出贡献.
关键词
外显子
进化
序列相似度
phastcons
Ka/Ks
分类号
Q75 [生物学—分子生物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
哺乳动物中不同表达丰度外显子的进化特征
李洁
方林
李昕
张晓妍
叶葭
胡卫红
郑冰蓉
俞海菁
肖春杰
《科学通报》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2010
0
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参考文献
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