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基于PC/Linux的核酸序列分析系统的构建及其应用
被引量:
15
1
作者
张成岗
欧阳曙光
+5 位作者
张绍文
瞿祥虎
鱼咏涛
周钢桥
吴松锋
贺福初
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2001年第2期263-266,共4页
基于PC机和Linux操作系统 ,利用Phred/Phrap/Consed软件和Blast软件 ,构建了核酸序列大规模自动分析系统 .该套系统可自动完成从测序峰图向核酸序列的转化、载体序列去除、序列自动拼接、重复序列鉴定以及序列的相似性分析 ,可加速对大...
基于PC机和Linux操作系统 ,利用Phred/Phrap/Consed软件和Blast软件 ,构建了核酸序列大规模自动分析系统 .该套系统可自动完成从测序峰图向核酸序列的转化、载体序列去除、序列自动拼接、重复序列鉴定以及序列的相似性分析 ,可加速对大规模测序数据的分析和利用 .
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关键词
PC机
LINUX操作系统
软件
生物信息学
大规模测序
核酸序列
下载PDF
职称材料
基于unix的cDNA序列自动分析系统的构建和应用
被引量:
1
2
作者
符志彦
卢阳
+2 位作者
叶兰汀
何智良
徐安龙
《中山大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2002年第5期60-63,共4页
基于unix/linux操作系统和mysql数据库 ,利用phred/phrap ,stackpack ,blast软件 ,对cDNA和EST序列进行大规模自动分析。它可以完成从测序峰图文件向核酸序列的转化 ,去除载体污染和重复序列 ,序列聚类 ,拼接 ,分析可变剪切 ,数据库搜...
基于unix/linux操作系统和mysql数据库 ,利用phred/phrap ,stackpack ,blast软件 ,对cDNA和EST序列进行大规模自动分析。它可以完成从测序峰图文件向核酸序列的转化 ,去除载体污染和重复序列 ,序列聚类 ,拼接 ,分析可变剪切 ,数据库搜索进行相似性分析。该系统可以加速大规模EST测序的分析速度。
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关键词
cDNA序列自动分析系统
大规模测序
unix/linux操作系统
phred/
phrap
软件
stackpack软件
blast软件
系统开发
MYSQL数据库
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职称材料
基于测序软件进行生物信息学中数据分析
3
作者
徐燕
田晓
《武汉生物工程学院学报》
2007年第4期216-219,共4页
概述了生物信息学中的一些研究方向及分析方法,介绍了用于大规模DNA测序的分析软件系统——Phred/Phrap/Consed。通过利用Phred/Phrap/Consed等各种分析软件,时基因组学、蛋白质组学和基因芯片研究中巨量原始实验数据进行分析、处理,使...
概述了生物信息学中的一些研究方向及分析方法,介绍了用于大规模DNA测序的分析软件系统——Phred/Phrap/Consed。通过利用Phred/Phrap/Consed等各种分析软件,时基因组学、蛋白质组学和基因芯片研究中巨量原始实验数据进行分析、处理,使之成为具有明确生物学意义的生物信息。
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关键词
生物信息学
基因组学
蛋白质组学
phred/
phrap
/Consed
原文传递
题名
基于PC/Linux的核酸序列分析系统的构建及其应用
被引量:
15
1
作者
张成岗
欧阳曙光
张绍文
瞿祥虎
鱼咏涛
周钢桥
吴松锋
贺福初
机构
军事医学科学院放射医学研究所基因组学与蛋白质组学研究室
出处
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2001年第2期263-266,共4页
基金
军事医学科学院科技创新研究启动基金! (990 5 10 5 )
国家"86 3"项目! (86 3 10 2 10 0 4 0 4)
国家杰出青年科学基金!(396 2
文摘
基于PC机和Linux操作系统 ,利用Phred/Phrap/Consed软件和Blast软件 ,构建了核酸序列大规模自动分析系统 .该套系统可自动完成从测序峰图向核酸序列的转化、载体序列去除、序列自动拼接、重复序列鉴定以及序列的相似性分析 ,可加速对大规模测序数据的分析和利用 .
关键词
PC机
LINUX操作系统
软件
生物信息学
大规模测序
核酸序列
Keywords
personal computer
Linux operating system
phred/
phrap
/Consed
software
Blast
software
bioinformatics
large-scale DNA sequencing
分类号
Q520.3 [生物学—生物化学]
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职称材料
题名
基于unix的cDNA序列自动分析系统的构建和应用
被引量:
1
2
作者
符志彦
卢阳
叶兰汀
何智良
徐安龙
机构
中山大学生命科学学院
出处
《中山大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2002年第5期60-63,共4页
基金
国家自然科学基金资助项目 (3980 0 0 73)
国家自然科学基金重点资助项目 (6 9935 0 2 0 )
文摘
基于unix/linux操作系统和mysql数据库 ,利用phred/phrap ,stackpack ,blast软件 ,对cDNA和EST序列进行大规模自动分析。它可以完成从测序峰图文件向核酸序列的转化 ,去除载体污染和重复序列 ,序列聚类 ,拼接 ,分析可变剪切 ,数据库搜索进行相似性分析。该系统可以加速大规模EST测序的分析速度。
关键词
cDNA序列自动分析系统
大规模测序
unix/linux操作系统
phred/
phrap
软件
stackpack软件
blast软件
系统开发
MYSQL数据库
Keywords
cDNA analysis system
large_scale DNA sequencing
unix/linux operating system
phred/phrap software
stackpack
software
blast
software
分类号
TP392 [自动化与计算机技术—计算机应用技术]
Q754 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
基于测序软件进行生物信息学中数据分析
3
作者
徐燕
田晓
机构
武汉生物工程学院计算机系
出处
《武汉生物工程学院学报》
2007年第4期216-219,共4页
文摘
概述了生物信息学中的一些研究方向及分析方法,介绍了用于大规模DNA测序的分析软件系统——Phred/Phrap/Consed。通过利用Phred/Phrap/Consed等各种分析软件,时基因组学、蛋白质组学和基因芯片研究中巨量原始实验数据进行分析、处理,使之成为具有明确生物学意义的生物信息。
关键词
生物信息学
基因组学
蛋白质组学
phred/
phrap
/Consed
Keywords
bioinformatics
genomics
proteomics
phred/
phrap
/Consed
分类号
TP319 [自动化与计算机技术—计算机软件与理论]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于PC/Linux的核酸序列分析系统的构建及其应用
张成岗
欧阳曙光
张绍文
瞿祥虎
鱼咏涛
周钢桥
吴松锋
贺福初
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2001
15
下载PDF
职称材料
2
基于unix的cDNA序列自动分析系统的构建和应用
符志彦
卢阳
叶兰汀
何智良
徐安龙
《中山大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2002
1
下载PDF
职称材料
3
基于测序软件进行生物信息学中数据分析
徐燕
田晓
《武汉生物工程学院学报》
2007
0
原文传递
已选择
0
条
导出题录
引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
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