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The red/far-red light photoreceptor FvePhyB regulates tissue elongation and anthocyanin accumulation in woodland strawberry
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作者 Qi Gao Shaoqiang Hu +4 位作者 Xiaoli Wang Fu Han Huifeng Luo Zhongchi Liu Chunying Kang 《Horticulture Research》 SCIE CSCD 2023年第12期204-216,共13页
Light is an important environmental signal that influences plant growth and development.Among the photoreceptors,phytochromes can sense red/far-red light to coordinate various biological processes.However,their functi... Light is an important environmental signal that influences plant growth and development.Among the photoreceptors,phytochromes can sense red/far-red light to coordinate various biological processes.However,their functions in strawberry are not yet known.In this study,we identified an EMS mutant,named P8,in woodland strawberry(Fragaria vesca)that showed greatly increased plant height and reduced anthocyanin content.Mapping-by-sequencing revealed that the causal mutation in FvePhyB leads to premature termination of translation.The light treatment assay revealed that FvePhyB is a bona fide red/far-red light photoreceptor,as it specifically inhibits hypocotyl length under red light.Transcriptome analysis showed that the FvePhyB mutation affects the expression levels of genes involved in hormone synthesis and signaling and anthocyanin biosynthesis in petioles and fruits.The srl mutant with a longer internode is caused by a mutation in the DELLA gene FveRGA1(Repressor of GA1)in the gibberellin pathway.We found that the P8 srl double mutant has much longer internodes than srl,suggesting a synergistic role of FvePhyB and FveRGA1 in this process.Taken together,these results demonstrate the important role of FvePhyB in regulating plant architecture and anthocyanin content in woodland strawberry. 展开更多
关键词 STRAW phyb light
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不同光周期条件下PhyB和ABA对不同苜蓿品种的秋眠性调控 被引量:22
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作者 王成章 韩锦峰 +3 位作者 胡喜峰 张春梅 何云 刘圈炜 《草业学报》 CSCD 2006年第6期56-63,共8页
短日照和低温是导致苜蓿秋眠的主要环境因子。本研究检测了3个不同秋眠型苜蓿在8,12和16 h光照光周期条件下叶片和顶芽中PhyB和ABA的含量,并探讨其对秋眠的影响机制。结果表明,1)和非秋眠苜蓿相比,秋眠苜蓿叶片中PhyB含量高,PhyB作为绿... 短日照和低温是导致苜蓿秋眠的主要环境因子。本研究检测了3个不同秋眠型苜蓿在8,12和16 h光照光周期条件下叶片和顶芽中PhyB和ABA的含量,并探讨其对秋眠的影响机制。结果表明,1)和非秋眠苜蓿相比,秋眠苜蓿叶片中PhyB含量高,PhyB作为绿色植物主要光受体可能通过光周期调控或参与了苜蓿的秋眠;并且3个品种均是在8 h光照下PhyB合成量高,暗示长暗期利于其合成。2)和12,16 h光照相比,8 h处理顶芽和第一展开叶中ABA含量最高,显然短日照利于ABA的合成;8 h光照处理时,秋眠型苜蓿品种Vernal ABA含量分别比半秋眠型CW5 0 2和非秋眠型CUF1 0 1高2.1 2和2.0 3倍,1 2 h光照处理ABA含量Vernal比CW5 0 2和CUF1 0 1分别高3 6.2 4%和46.46%,但16 h光照处理ABA含量并不表现上述规律,说明8和12 h光照程度不同地为苜蓿创造了逆境效应,ABA可能是调控或诱导秋眠的激素。3)8 h光照下苜蓿秋眠特征明显,生长严重受抑,不开花;12 h光照下苜蓿秋眠特征比8 h光照处理轻,生长受抑但抑制程度低于8 h光照处理,不开花;16 h光照下3个品种生长、开花正常。可能是PhyB含量多寡程度不同地调控了光周期反应,进而影响了ABA合成,而ABA在不同光周期诱导下通过合成量不同调控了不同秋眠基因表达,诱发了秋眠。 展开更多
关键词 苜蓿秋眠性 短日照 phyb ABA
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光周期与温度对紫花苜蓿phyA和phyB mRNA表达的影响 被引量:7
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作者 樊文娜 严学兵 +1 位作者 史莹华 王成章 《草地学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第6期975-982,共8页
通过探讨不同温度和不同光周期对紫花苜蓿(Medicago sativa L.)phyA和phyB mRNA含量的影响,以期为揭示调控苜蓿秋眠性的分子机理提供科学依据。试验采用FQ-PCR SYBR-Green I方法,测定了每天8,12和16h光照处理条件下3种秋眠类型苜蓿WL-2... 通过探讨不同温度和不同光周期对紫花苜蓿(Medicago sativa L.)phyA和phyB mRNA含量的影响,以期为揭示调控苜蓿秋眠性的分子机理提供科学依据。试验采用FQ-PCR SYBR-Green I方法,测定了每天8,12和16h光照处理条件下3种秋眠类型苜蓿WL-232(秋眠型,FD2)、ArcherⅡ(半秋眠型,FD5)、WL-525(非秋眠型,FD8)的phyA和phyB mRNA表达水平;采用半定量RT-PCR,测定了5℃,15℃,25℃和35℃条件下秋眠型苜蓿Vernal(FD2)的phyA和phyB mRNA表达水平。结果表明:苜蓿存在光周期效应,短日照条件下秋眠型苜蓿phyB mR-NA表达量最大,相同光照条件下不同秋眠型苜蓿的表达规律为秋眠型>半秋眠型>非秋眠型,且相对于phyA,在紫花苜蓿绿叶中phyB对光周期的变化反应更敏感。在不同温度条件下秋眠型苜蓿Vernal的phyA和phyB合成规律不一致,低温条件下,phyB表达量较高,phyA表达量较低;高温条件下,phyA表达量较高,phyB表达量较低。上述结果表明phyB在调控苜蓿秋眠中发挥了更重要的作用。 展开更多
关键词 光周期 温度 苜蓿 PHYA phyb MRNA表达
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农杆菌介导phyB基因转化枳壳研究 被引量:4
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作者 谢玉明 郭琛 +3 位作者 张家银 韩健 袁飞荣 邓子牛 《湖南农业大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2008年第1期68-72,共5页
以枳壳(Poncirus trifoliate(L.)Raf.)实生苗上胚轴为试材,利用农杆菌介导法将光敏色素基因phyB导入其中,建立了枳壳实生苗的遗传转化体系,共获得27株抗性植株,PCR检测结果表明其中有5株扩增出phyB基因的特异目的带;RT-PCR分析结果表明p... 以枳壳(Poncirus trifoliate(L.)Raf.)实生苗上胚轴为试材,利用农杆菌介导法将光敏色素基因phyB导入其中,建立了枳壳实生苗的遗传转化体系,共获得27株抗性植株,PCR检测结果表明其中有5株扩增出phyB基因的特异目的带;RT-PCR分析结果表明phyB基因在phyB3,phyB4株系枳壳基因组中能表达;Li-6400光合测定仪对转基因枳壳进行的光合特性测定结果显示,转基因枳壳光合效率高于对照;转phyB基因枳壳植株在形态上与对照也存在差异,表现出植株矮化、节间缩短、叶面积变小. 展开更多
关键词 农杆菌介导法 phyb基因 遗传转化 枳壳
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水稻长日抑制基因PhyB的多样性及区域适应性初探 被引量:2
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作者 刘莎 郑晓明 +11 位作者 冯雳 乔卫华 王君瑞 公婷婷 梁新霞 齐兰 苏龙 丁膺宾 许睿 张丽芳 程云连 杨庆文 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第2期283-289,共7页
Phy 是在长日照条件下抑制水稻开花的关键基因,但目前对水稻PhyB基因的遗传基础还不清楚,研究其分子遗传机制,对于培育光周期适应性广的品种以及扩大水稻种植区域具有重要意义。本研究选择78份亚洲栽培稻(34份籼稻和44份粳稻)及47份野... Phy 是在长日照条件下抑制水稻开花的关键基因,但目前对水稻PhyB基因的遗传基础还不清楚,研究其分子遗传机制,对于培育光周期适应性广的品种以及扩大水稻种植区域具有重要意义。本研究选择78份亚洲栽培稻(34份籼稻和44份粳稻)及47份野生稻进行测序,对Phy B基因的核苷酸多态性、单倍型进行分析,计算籼稻、粳稻和野生稻的遗传多样性。结果表明,Phy B基因共有28个单倍型,其中有2个高频率的单倍型分别存在于2个栽培稻亚种中。从Network图可以看出栽培稻分为2组(A组和B组),A组栽培稻包括全部的籼稻和4个粳稻个体,B组栽培稻全是粳稻品种。亲缘地理学分析发现,A、B两组栽培稻具有明显不同的地理分布格局,且A组和B组开花时间差异显著,说明Phy B基因的2个高频率单倍型在2个栽培稻亚种中具有区域适应性,Phy B基因在栽培稻中具有明显的驯化信号,随着水稻种植区域的扩大,进化出适应不同地域特有的等位基因,导致开花时间对不同地区的区域适应性及多样性。 展开更多
关键词 栽培稻 phyb基因 单倍型 开花时间 多样性 区域适应性
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转phyB基因枳橙生物学特性分析 被引量:2
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作者 胡新喜 袁飞荣 +2 位作者 邓子牛 甘德欣 熊兴耀 《热带作物学报》 CSCD 2010年第3期440-445,共6页
对转phyB基因枳橙进行分子检测和部分生物学特性研究。PCR、RT-PCR和PCR Southern杂交结果表明:phyB基因已整合到枳橙的基因组,并得到了转录;转phyB基因枳橙表现出植株矮化、分枝角度加大、叶片变小、比叶干重增加,其叶绿素含量比对照高... 对转phyB基因枳橙进行分子检测和部分生物学特性研究。PCR、RT-PCR和PCR Southern杂交结果表明:phyB基因已整合到枳橙的基因组,并得到了转录;转phyB基因枳橙表现出植株矮化、分枝角度加大、叶片变小、比叶干重增加,其叶绿素含量比对照高29.1%。对枳橙叶片光合特性分析结果表明,转phyB基因枳橙光合作用增强,其净光合速率对有效辐射强度和CO2浓度响应值显著高于对照,对强光和高浓度CO2的利用能力显著高于对照。利用高效液相色谱法测定转phyB基因枳橙叶片的内源激素含量,结果表明,其GA1、GA4、ABA、Z分别比对照高32.7%、50%、121%、17.8%,而IAA的含量比对照低,生长类激素与抑制类激素的比值差异显著,(GA1+GA4)/ABA,Z/ABA分别比对照低38.4%和43.2%。 展开更多
关键词 枳橙 phyb基因 生物学特性
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植酸酶基因PhyB_1的克隆及序列分析 被引量:1
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作者 柯晓静 郭润芳 +1 位作者 于宏伟 贾英民 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2007年第2期14-17,共4页
为了进一步研究多种植酸酶之间的相互作用,利用PCR技术,从黑曲霉WP1中克隆出植酸酶PhyB基因,该基因长1 560 bp,含有3段内含子,共编码460个氨基酸,与已报道的ALKO243的植酸酶Aph基因(GeneBank Acces-sion:L02420)相比较,编码的氨基酸序... 为了进一步研究多种植酸酶之间的相互作用,利用PCR技术,从黑曲霉WP1中克隆出植酸酶PhyB基因,该基因长1 560 bp,含有3段内含子,共编码460个氨基酸,与已报道的ALKO243的植酸酶Aph基因(GeneBank Acces-sion:L02420)相比较,编码的氨基酸序列同源性为99.13%,因此将其命名为PhyB1。该基因含有植酸酶保守序列“RHGXRXP”和“HD”。黑曲霉WP1植酸酶PhyB1基因序列已在国际基因库中注册,注册号为:DQ836360。 展开更多
关键词 黑曲霉 phyb基因 PCR 序列分析
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陆地棉PHYB基因生物信息学分析(英文)
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作者 沙琴 杨建红 +4 位作者 巩元勇 郭书巧 束红梅 蒋璐 倪万潮 《Agricultural Science & Technology》 CAS 2016年第10期2256-2261,2353,共7页
[目的]对陆地棉PHYB基因有一个全面的认识和生物信息学分析。[方法]在陆地棉异源四倍体标准系TM-1基因组数据库中共鉴定获得2个PHYB基因,这2个基因分别分布在A10和D10亚基因组。利用生物信息学方法对这两个基因进行初步分析。[结果]棉花... [目的]对陆地棉PHYB基因有一个全面的认识和生物信息学分析。[方法]在陆地棉异源四倍体标准系TM-1基因组数据库中共鉴定获得2个PHYB基因,这2个基因分别分布在A10和D10亚基因组。利用生物信息学方法对这两个基因进行初步分析。[结果]棉花的PHYB具有其他植物PHYB相同的基序和结构域,不管是数目还是分部位置都比较一致;不同植物的PHYB氨基酸序列同源性比对及构建的进化树都显示棉花的PHYB同可可的在同源性和进化关系上都是最高的,同水稻、玉米等单子叶植物的同源性及进化关系较低;基因结构的比对结果同样显示植物PHYB基因在进化上比较保守;棉花PHYB存在几十个可能磷酸化的位点,这些位点的磷酸化作用可能影响光敏色素的功能及其介导的信号通路。[结论]该研究结果为陆地棉PHYB基因的克隆和功能研究提供了理论基础。 展开更多
关键词 陆地棉 陆地棉基因组 phyb基因 生物信息学
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建立紫花苜蓿PHYA和PHYB mRNA表达水平FQ-PCR检测方法
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作者 樊文娜 严学兵 王成章 《江西农业学报》 CAS 2011年第4期96-100,共5页
紫花苜蓿的秋眠与光敏色素基因的表达紧密相关。为了建立一种快速、灵敏检测紫花苜蓿PHYA和PHYB基因mRNA表达水平的实时逆转录聚合酶链反应(FQ-PCR)体系,本研究提取紫花苜蓿叶片总RNA,PCR扩增Actin、PHYA和PHYB基因片段,将其克隆入pMD1... 紫花苜蓿的秋眠与光敏色素基因的表达紧密相关。为了建立一种快速、灵敏检测紫花苜蓿PHYA和PHYB基因mRNA表达水平的实时逆转录聚合酶链反应(FQ-PCR)体系,本研究提取紫花苜蓿叶片总RNA,PCR扩增Actin、PHYA和PHYB基因片段,将其克隆入pMD18-T载体进行测序。基于SYBR Green I双链嵌合染料建立检测紫花苜蓿PHYA和PHYB基因mRNA表达水平方法,对PCR产物的熔解曲线进行分析评价其特异性,经测序鉴定目的片段已插入pMD18-T载体内,重组质粒的构建非常成功。为验证其准确性,我们检测紫花苜蓿WL-232 PHYA、PHYB mRNA表达量,结果证明:所建立的测定PHYA和PHYB基因mRNA水平的方法准确,适用于紫花苜蓿的各种组织的大量样本检测。 展开更多
关键词 SYBR GreenI 紫花苜蓿 PHYA phyb MRNA表达量 秋眠
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裸子植物PHYP和被子植物PHYB光感受区适应性进化的研究
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作者 王静 李万昌 《北方园艺》 CAS 北大核心 2012年第14期123-126,共4页
光敏色素是一类红光/远红光受体,在植物从萌发到成熟的整个生长发育过程中都起重要的调节作用。光敏色素N端的光感受区是发色团结合的部位,高度保守。该区域的保守性是确保光敏色素光逆转和光信号转导等功能正常运行的先决条件之一。裸... 光敏色素是一类红光/远红光受体,在植物从萌发到成熟的整个生长发育过程中都起重要的调节作用。光敏色素N端的光感受区是发色团结合的部位,高度保守。该区域的保守性是确保光敏色素光逆转和光信号转导等功能正常运行的先决条件之一。裸子植物的PHYP基因对应于被子植物的PHYB基因,都属于B类光敏色素基因。为了研究这2个基因的光感受区是否经历选择压力以及是否经历同样的选择压力,基于分支模型,位点模型以及分支-位点模型对裸子植物中8条,被子植物8条共16条序列进行适应性进化分析。结果表明:在该区域构建的系统发育树中,强烈的正选择压力趋向于发生在裸子植物的近期分化的属内种间的谱系中,而在相对距离较远的古老谱系中缺少这种压力,然而,通过目前的模型并未检测到具体的适应性进化的位点;被子植物的PHYB基因中检测出6个发生适应性进化的位点。 展开更多
关键词 裸子植物 被子植物 PHYP phyb 适应性进化
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生菜Ls PHYB可变剪接体的克隆与高温诱导表达模式 被引量:1
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作者 隋心意 赵小刚 +2 位作者 陈鹏宇 李亚灵 温祥珍 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2022年第9期1822-1830,共9页
【目的】光敏色素B(phytochrome,PHYB)是光和温度的受体。通过克隆光敏色素B基因(PHYB)可变剪接体并分析其在高温诱导下的表达模式,探究LsPHYB可变剪接体在生菜响应环境高温中的生物学功能,为培育耐热性生菜提供理论依据。【方法】采用... 【目的】光敏色素B(phytochrome,PHYB)是光和温度的受体。通过克隆光敏色素B基因(PHYB)可变剪接体并分析其在高温诱导下的表达模式,探究LsPHYB可变剪接体在生菜响应环境高温中的生物学功能,为培育耐热性生菜提供理论依据。【方法】采用生物信息学方法在生菜的基因组数据库搜索获得LsPHYB的cDNA序列的相关信息;对克隆得到的3个可变剪接体LsPHYB1、LsPHYB2和LsPHYB3进行多序列比对、可变剪接方式分析及系统进化树分析;通过在线软件预测PHYB1、PHYB2和PHYB3蛋白分子量、等电点和亲水性、疏水性等蛋白质理化性质,并通过生物信息学软件预测三者的二级结构、三级结构和保守结构域;采用荧光定量PCR(qRT-PCR)检测PHYB1、PHYB2和PHYB3在高温处理后的表达特征。【结果】克隆获得的生菜LsPHYB的3个可变剪接体LsPHYB1、LsPHYB2和LsPHYB3的CDS长度分别为3509、3877和2690 bp,编码氨基酸长度分别为1094、960和853 aa。其中LsPHYB1发生可变3′端位点和外显子跳跃类型可变剪接,LsPHYB2发生选择性保留polyA尾和内含子保留型可变剪接,LsPHYB3发生外显子跳跃类型可变剪接。保守结构域分析表明PHYB2的N端缺少PAS和PHY功能域;PHYB3的N端缺少PAS和PHY功能域,C端缺少HisKA功能域;系统进化树分析表明,3个可变剪接体聚为一支。qRT-PCR分析表明在高温处理第1天,LsPHYB3的表达量最高;在高温处理第5—9天,LsPHYB2的表达量高于LsPHYB1和LsPHYB3;在高温处理第11天,LsPHYB1的表达量高于LsPHYB2和LsPHYB3,处理11 d内三者表达量达到峰值的时间不同。【结论】高温下生菜LsPHYB的转录本存在3个可变剪接体LsPHYB1、LsPHYB2和LsPHYB3。LsPHYB3在高温处理前期高表达,LsPHYB2、LsPHYB1分别在高温处理中期、后期高表达,推测生菜3个LsPHYB可变剪接体在抗高温胁迫中发挥不同的作用。 展开更多
关键词 生菜 Lsphyb 可变剪接体 高温胁迫 响应
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酸性植酸酶phyB在毕赤酵母GS115中的表达
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作者 唐升斌 矫庆华 谢达平 《湖南农业大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2006年第6期602-606,共5页
通过PCR方法扩增得到无信号肽无内含子的酸性植酸酶phyB基因,将此基因克隆至毕赤酵母表达载体pPIC9K上,并转化毕赤酵母GS115感受态细胞,获得重组毕赤酵母.在甲醇的诱导下,该植酸酶phyB基因在毕赤酵母中得到表达.经SDS-PAGE凝胶电泳分析... 通过PCR方法扩增得到无信号肽无内含子的酸性植酸酶phyB基因,将此基因克隆至毕赤酵母表达载体pPIC9K上,并转化毕赤酵母GS115感受态细胞,获得重组毕赤酵母.在甲醇的诱导下,该植酸酶phyB基因在毕赤酵母中得到表达.经SDS-PAGE凝胶电泳分析,该重组蛋白的相对分子质量为7.5×104,而该植酸酶在大肠杆菌DH5α表达系统中表达的相对分子质量为6.0×104,这可能是由于糖基化的结果.酶学性质检测发现,表达的植酸酶最适作用温度为65℃,比野生原始菌株的提高了10℃;诱导pH值为5.5时,蛋白的表达量最高,为10 528.6 U/mL,是野生菌株的2.8倍;最适作用pH值为2.5;在70℃条件下处理60 min,该酶的相对酶活力为40%,在75℃时处理10 min,该酶的相对酶活力为10%. 展开更多
关键词 酸性植酸酶phyb pPIC9K质粒 毕赤酵母GS115
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脯氨酸代谢途径在调控水稻phyB突变体干旱胁迫耐性中的作用 被引量:3
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作者 周晋军 刘蓬 +1 位作者 尹静静 谢先芝 《山东农业科学》 2014年第3期1-4,共4页
本研究分析了水稻野生型和phyB突变体中脯氨酸代谢途径关键基因的表达水平。结果显示,干旱处理能够诱导脯氨酸生物合成相关基因OsP5CS1和OsOAT的表达,抑制脯氨酸生物降解基因OsP5CDH的表达。且phyB突变体中OsP5CS1基因的表达水平明显高... 本研究分析了水稻野生型和phyB突变体中脯氨酸代谢途径关键基因的表达水平。结果显示,干旱处理能够诱导脯氨酸生物合成相关基因OsP5CS1和OsOAT的表达,抑制脯氨酸生物降解基因OsP5CDH的表达。且phyB突变体中OsP5CS1基因的表达水平明显高于野生型,据此推测phyB负调控OsP5CS1基因的表达。为了分析OsP5CS1基因的高水平表达是否与phyB突变体较强的干旱胁迫耐性有关,本研究进一步培育了转OsP5CS1基因烟草。离体叶片失水速率结果表明,转基因烟草的失水速率小于野生型;盐胁迫条件下,转基因烟草的分化率明显高于野生型。综上所述,phyB对脯氨酸代谢途径的调控是phyB突变体具有较强干旱胁迫耐性的重要因素之一。 展开更多
关键词 水稻 phyb突变体 脯氨酸 干旱 盐胁迫
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早/晚抽薹性大白菜自交系中光敏色素B及光周期关键基因的动态研究
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作者 刘栓桃 王树彬 +4 位作者 王荣花 王立华 李巧云 张志刚 赵智中 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2024年第2期11-18,共8页
光周期是影响植物抽薹开花最重要的环境因子之一,光周期信号通过植物的光敏色素蛋白调控植物的抽薹开花,其中PHYB介导的信号网络对植物抽薹开花有重要的抑制作用。前期研究发现,大白菜耐抽薹材料06-247与易抽薹材料He102的PHYB基因启动... 光周期是影响植物抽薹开花最重要的环境因子之一,光周期信号通过植物的光敏色素蛋白调控植物的抽薹开花,其中PHYB介导的信号网络对植物抽薹开花有重要的抑制作用。前期研究发现,大白菜耐抽薹材料06-247与易抽薹材料He102的PHYB基因启动子存在大片段插入/缺失差异,为了进一步研究启动子突变对PHYB及其下游途径关键基因的影响,以耐抽臺材料06-247与极易抽臺材料He102为试验材料,采用生物信息法分析了大白菜基因组中光敏色素基因的冗余特点,发现大白菜基因组包含6个光敏色素基因,其中PHYA有2个拷贝,PHYB、PHYC、PHYD和PHYE都仅有1个拷贝。进一步通过氨基酸序列比对筛选出了PHYB的特异序列、设计了抗原决定簇并制备了抗大白菜PHYB的特异抗体,采用荧光定量RT-PCR技术和Western Blot技术研究了06-247与He102中PHYB的相对含量,同时比较了PHYB下游光周期通路关键调控基因CCA1、FLC、CO和FT的动态变化。结果表明:启动子突变造成PHYB在06-247中表达水平显著升高并进而造成PHYB蛋白水平显著升高,同时下游调控基因CCA1、FLC、CO和FT均在06-247中高水平表达,这对06-247的耐抽薹特性有重要影响。 展开更多
关键词 大白菜 phyb 光周期 抽薹 蛋白质印迹
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芸薹属植物PHYB基因的鉴定与比较分析
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作者 岳智臣 陶鹏 +2 位作者 赵彦婷 雷娟利 李必元 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2020年第12期3871-3878,共8页
植物光敏色素B(PHYB)是一种可吸收红光/远红光的光受体,参与调控植物光形态建成、开花时间、种子萌发等生长发育过程。本研究在芸薹属白菜(AA)、甘蓝(CC)、甘蓝型油菜(AACC)、黑芥(BB)和芥菜(AABB)中鉴定了9个PHYB基因,其中芸薹属A基因... 植物光敏色素B(PHYB)是一种可吸收红光/远红光的光受体,参与调控植物光形态建成、开花时间、种子萌发等生长发育过程。本研究在芸薹属白菜(AA)、甘蓝(CC)、甘蓝型油菜(AACC)、黑芥(BB)和芥菜(AABB)中鉴定了9个PHYB基因,其中芸薹属A基因组和B基因组中均只有1个PHYB基因,而C基因组中有2个PHYB基因。C基因组中定位在MF2亚基因组上的BoPHYB2和BnCPHYB2有较多的片段缺失。比较分析芸薹属PHYB基因上游调控序列发现这些PHYB基因中均有多种光调控元件,每个PHYB基因上游均有2个保守的G-box元件,在其两侧至少有2个SORLIP2元件。基于转录组测序数据,显示白菜BrPHYB基因在根、茎、叶、花和角果中以及在不同胚胎发育阶段均有表达。通过对全基因组已测序的芸薹属植物PHYB基因的鉴定、进化关系、启动子基序及基因表达等分析,对进一步深入研究芸薹属植物PHYB基因提供了理论依据。 展开更多
关键词 芸薹属(Brassica) phyb 鉴定 比较分析
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Red-Light-Dependent Interaction of phyB with SPA1 Promotes COP1-SPA1 Dissociation and Photomorphogenic Development in Arabidopsis 被引量:23
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作者 Xue-Dan Lu Chuan-Miao Zhou +3 位作者 Peng-Bo Xu Qian Luo Hong-Li Lian Hong-Quan Yang 《Molecular Plant》 SCIE CAS CSCD 2015年第3期467-478,共12页
Arabidopsis phytochromes (phyA-phyE) are photoreceptors dedicated to sensing red/far-red light. Phyto- chromes promote photomorphogenic developments upon light irradiation via a signaling pathway that involves rapid... Arabidopsis phytochromes (phyA-phyE) are photoreceptors dedicated to sensing red/far-red light. Phyto- chromes promote photomorphogenic developments upon light irradiation via a signaling pathway that involves rapid degradation of PIFs (PHYTOCHROME INTERACTING FACTORS) and suppression of COP1 (CONSTITUTIVE PHOTOMORPHOGENIC 1) nuclear accumulation, through physical interactions with PIFs and COP1, respectively. Both phyA and phyB, the two best characterized phytochromes, regulate plant photomorphogenesis predominantly under far-red light and red light, respectively. It has been demonstrated that SPA1 (SUPPRESSOR OF PHYTOCHROME A 1) associates with COP1 to promote COP1 activity and suppress photomorphogenesis. Here, we report that the mechanism underlying phyB- promoted photomorphogenesis in red light involves direct physical and functional interactions between red-light-activated phyB and SPA1. We found that SPA1 acts genetically downstream of PHYB to repress photomorphogenesis in red light. Protein interaction studies in both yeast and Arabidopsis demonstrated that the photoactivated phyB represses the association of SPA1 with COP1, which is mediated, at least in part, through red-light-dependent interaction of phyB with SPA1. Moreover, we show that phyA physically interacts with SPA1 in a Pfr-form-dependent manner, and that SPA1 acts downstream of PHYA to regulate photomorphogenesis in far-red light. This study provides a genetic and biochemical model of how photo- activated phyB represses the activity of COP1-SPA1 complex through direct interaction with SPA1 to promote photomorphogenesis in red light. 展开更多
关键词 phyb PHOTOACTIVATION SPA1 COP1 PHOTOMORPHOGENESIS PHYA
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Cold-Induced CBF–PIF3 Interaction Enhances Freezing Tolerance by Stabilizing the phyB Thermosensor in Arabidopsis 被引量:16
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作者 Bochen Jiang Yiting Shi +9 位作者 Yue Peng Yuxin Jia Yan Yan Xiaojing Dong Hui Li Jie Dong Jigang Li Zhizhong Gong Michael F.Thomashow Shuhua Yang 《Molecular Plant》 SCIE CAS CSCD 2020年第6期894-906,共13页
Growth inhibition and cold-acclimation strategies help plants withstand cold stress,which adversely affects growth and survival.PHYTOCHROME B(phyB)regulates plant growth through perceiving both light and ambient tempe... Growth inhibition and cold-acclimation strategies help plants withstand cold stress,which adversely affects growth and survival.PHYTOCHROME B(phyB)regulates plant growth through perceiving both light and ambient temperature signals.However,the mechanism by which phyB mediates the plant response to cold stress remains elusive.Here,we show that the key transcription factors mediating cold acclimation,C-REPEAT BINDING FACTORs(CBFs),interact with PHYTOCHROME-INTERACTING FACTOR 3(PIF3)under cold stress,thus attenuating the mutually assured destruction of PIF3–phyB.Cold-stabilized phyB acts downstream of CBFs to positively regulate freezing tolerance by modulating the expression of stress-responsive and growth-related genes.Consistent with this,phyB mutants exhibited a freezing-sensitive phenotype,whereas phyB-overexpression transgenic plants displayed enhanced freezing tolerance.Further analysis showed that the PIF1,PIF4,and PIF5 proteins,all of which negatively regulate plant freezing tolerance,were destabilized by cold stress in a phytochrome-dependent manner.Collectively,our study reveals that CBFs–PIF3–phyB serves as an important regulatory module for modulating plant response to cold stress. 展开更多
关键词 CBFs PIFs phyb freezing tolerance ARABIDOPSIS
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利用CRISPR/Cas9基因编辑技术创制水稻光敏色素PHYB基因突变体 被引量:3
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作者 陈会杰 李飞 +7 位作者 晏云 季新 孙红正 张静 李俊周 彭廷 杜彦修 赵全志 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2018年第23期7667-7675,共9页
光敏色素是植物感受外界环境变化的最重要光受体之一,为研究光敏色素在水稻生长发育中的作用,本研究利用CRISPR/Cas9技术原理,设计水稻光敏色素基因PHYB的靶点,并将目的靶位点连接转化至载体pBUN411,成功构制了PHYB的CRISPR/Cas9表达载... 光敏色素是植物感受外界环境变化的最重要光受体之一,为研究光敏色素在水稻生长发育中的作用,本研究利用CRISPR/Cas9技术原理,设计水稻光敏色素基因PHYB的靶点,并将目的靶位点连接转化至载体pBUN411,成功构制了PHYB的CRISPR/Cas9表达载体,转化粳稻品种日本晴。由酶切及测序分析显示,转基因阳性植株中有6株靶位点序列发生改变,获得了碱基插入“A”或“T”和碱基缺失1bp或2bp的4种突变基因型,且在T0代就获得了纯合突变体。同时,本研究对T1代水稻phyB突变体进行红光照射处理,发现2叶1心期phyB突变体红光照射5d后,第3节间长度相对于野生型极显著增长。本研究利用CRISPR/Cas9系统成功对水稻PHYB基因进行了定点编辑,为进一步研究PHYB在水稻中的功能提供了参考依据。 展开更多
关键词 水稻 CRISPR/Cas9 光敏色素 phyb 红光
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BBX11 promotes red light-mediated photomorphogenic development by modulating phyB-PIF4 signaling 被引量:2
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作者 Zhaoqing Song Yueqin Heng +6 位作者 Yeting Bian Yuntao Xiao Jiujie Liu Xianhai Zhao Yan Jiang Xing Wang Deng Dongqing Xu 《aBIOTECH》 CSCD 2021年第2期117-130,共14页
phytochrome B(phyB)acts as the red light photoreceptor and negatively regulates the growth-promoting factor PHYTOCHROME INTERACTING 4(PIF4)through a direct physical interaction,which in turn changes the expression of ... phytochrome B(phyB)acts as the red light photoreceptor and negatively regulates the growth-promoting factor PHYTOCHROME INTERACTING 4(PIF4)through a direct physical interaction,which in turn changes the expression of a large number of genes.phyB-PIF4 module regulates a variety of biological and developmental processes in plants.In this study,we demonstrate that B-BOX PROTEIN 11(BBX11)physically interacts with both phyB and PIF4.BBX11 negatively regulates PIF4 accumulation as well as its biochemical activity,consequently leading to the repression of PIF4-controlled genes’expression and promotion of photomorphogenesis in the prolonged red light.This study reveals a regulatory mechanism that mediates red light signal transduction and sheds a light on phyB-PIF4 module in promoting red light-dependent photomorphognenesis. 展开更多
关键词 phyb BBX PIF4 PHOTOMORPHOGENESIS Light signaling
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GhPHYB基因的基因组鉴定及进化分析
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作者 巩元勇 赵丽华 闫飞 《东北农业科学》 2022年第6期42-47,64,共7页
在陆地棉异源四倍体标准系TM-1基因组数据库中共鉴定获得2个PHYB基因,这2个基因分别分布在A10和D10亚基因组。利用生物信息学方法对这两个基因进行初步分析表明,棉花的PHYB具有其他植物PHYB相同的基序和结构域,不管是数目还是分部位置... 在陆地棉异源四倍体标准系TM-1基因组数据库中共鉴定获得2个PHYB基因,这2个基因分别分布在A10和D10亚基因组。利用生物信息学方法对这两个基因进行初步分析表明,棉花的PHYB具有其他植物PHYB相同的基序和结构域,不管是数目还是分部位置都比较一致;不同植物的PHYB氨基酸序列同源性比对及构建的进化树都显示棉花的PHYB同可可的在同源性和进化关系上都是最近,同水稻、玉米等单子叶植物的同源性及进化关系较低;基因结构的比对结果同样显示植物PHYB基因在进化上比较保守;棉花PHYB存在几十个可能磷酸化的位点,这些位点的磷酸化作用可能影响光敏色素的功能及其介导的信号通路;PHYB直系同源基因和旁系同源基因的Ka/Ks比值均小于1,说明这些基因在进化过程中受到纯化选择作用。本研究结果可为陆地棉PHYB基因的深入研究提供理论基础。 展开更多
关键词 陆地棉基因组 phyb基因 进化
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