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基于PC/Linux蛋白序列分析系统的构建及应用
被引量:
2
1
作者
寸树健
邓百煌
+2 位作者
邓日强
杨彦臻
吴文言
《中山大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2004年第5期80-82,共3页
介绍利用常见的x86PC,Linux操作系统配合BLAST、PHYLIB和EMBOSS等常见的生物分析软件构建可以完成多种蛋白数据分析的大规模自动分析系统。该系统可自动完成从DNA序列中获取读码框、核酸序列向蛋白序列的转化、在蛋白序列数据库中查找...
介绍利用常见的x86PC,Linux操作系统配合BLAST、PHYLIB和EMBOSS等常见的生物分析软件构建可以完成多种蛋白数据分析的大规模自动分析系统。该系统可自动完成从DNA序列中获取读码框、核酸序列向蛋白序列的转化、在蛋白序列数据库中查找同源序列、序列录入数据库以及蛋白序列的等电点、亲 疏水位点、二级结构等性质的分析、多个序列之间相似度和进化地位的分析,并对输出的结果数据利用Web服务器进行发布。与传统的序列分析模式相比,此分析系统大大加速了对大规模数据信息的分析和利用。
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关键词
LINUX
BLAST
emboss
phylib
生物信息学工作站
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职称材料
题名
基于PC/Linux蛋白序列分析系统的构建及应用
被引量:
2
1
作者
寸树健
邓百煌
邓日强
杨彦臻
吴文言
机构
中山大学生命科学学院∥生物防治国家重点实验室∥海洋生物功能基因组开放实验室
出处
《中山大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2004年第5期80-82,共3页
基金
国家自然科学基金资助项目(39970583
30271580)
+4 种基金
973资助项目(G1999012002)
广东省自然科学基金资助项目(001216)
广东省科技计划重点资助项目(A3050303
2003C104003)
广州市科技计划资助项目(2003J1-C0061)
文摘
介绍利用常见的x86PC,Linux操作系统配合BLAST、PHYLIB和EMBOSS等常见的生物分析软件构建可以完成多种蛋白数据分析的大规模自动分析系统。该系统可自动完成从DNA序列中获取读码框、核酸序列向蛋白序列的转化、在蛋白序列数据库中查找同源序列、序列录入数据库以及蛋白序列的等电点、亲 疏水位点、二级结构等性质的分析、多个序列之间相似度和进化地位的分析,并对输出的结果数据利用Web服务器进行发布。与传统的序列分析模式相比,此分析系统大大加速了对大规模数据信息的分析和利用。
关键词
LINUX
BLAST
emboss
phylib
生物信息学工作站
Keywords
linux
blast
emboss
phylib
bioinformatics workstation
分类号
Q754 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于PC/Linux蛋白序列分析系统的构建及应用
寸树健
邓百煌
邓日强
杨彦臻
吴文言
《中山大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2004
2
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参考文献
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