大白菜热激转录因子基因家族鉴定及表达分析

本文以大白菜基因组数据为基础，利用生物信息学方法对大白菜热激转录因子（heatshocktranscriptionfactors，HSFs）进行了序列特征分析。结果表明，大白菜至少含有30个HSF基因成员，蛋白质序列长度在239～487氨基酸之间；序列多重比对发现，大白菜HSF基因具有高度保守的DBD结构域和广泛的保守基序；染色体定位揭示了除2个基因分布在Scaffold上，其余28个基因在大白菜的10条染色体上呈不均匀分布，Chr03上分布最多；此外，大白菜和拟南芥HSF基因的系统发育关系比较分析表明，这些HSF基因家族成员可以分为A、B、C三类，A类和B类可进一步分为8个和4个亚组，并且存在8对直系同源基因和4对旁系同源基因，表明HSF基因家族存在于芸薹属和拟南芥属分化之前。RT—qPCR分析表明，高温胁迫显著了诱导了大部分大白菜HSF转录因子基因的表达，表明这些基因广泛地参与了大白菜苗期叶片对高温热激反应。

不同种源太子参的RAPD分析

应用RAPD标记方法分析了15个太子参〔Pseudostellaria heterophylla(Miq.)Pax ex Pax et Hoffm.〕种源间的遗传多样性和亲缘关系。10条随机引物共扩增出65条带,其中多态性条带37条,多态性条带百分率达56.9%。用聚类分析方法可将15个太子参种源分为4类;地理分布越近,太子参种源间的遗传差异越小。来源于安徽宣城的太子参种源遗传变异明显,辽宁凤城的野生太子参与山东地区的太子参栽培种源间的亲缘关系较近,与江苏各地太子参种源的亲缘关系则较远,这些种源均可作为育种材料。自然环境,尤其是生态环境的变化,对太子参的遗传变异有一定的影响。

荞麦属植物脱落酸不敏感基因序列比较与亲缘关系研究

为了研究荞麦属不同种间植物脱落酸不敏感基因(ABA-insensitive,ABI)序列变异差异与亲缘关系,试验选用7个荞麦野生种,包括野甜荞、野苦荞、左贡野荞、毛野荞、大野荞、金荞麦、硬枝万年荞共30份种质材料,提取苗期幼嫩叶片的DNA,通过聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)扩增获得荞麦ABI基因,并对扩增片段进行基因测序与序列分析。结果发现,7个野生种共30份种质间ABI基因片段的多态位点数占20.28%,其中,14份野苦荞间ABI基因片段多态位点数占1.86%,5份野甜荞间多态位点数占1.81%,说明荞麦属植物种内ABI基因序列高度保守。对扩增序列进行遗传距离分析发现,左贡野荞与毛野荞种间遗传距离最大,硬枝万年荞与金荞麦种间遗传距离最小。聚类分析结果显示:野苦荞与大野荞、金荞麦和硬枝万年荞亲缘关系较近,与毛野荞亲缘关系次之;左贡野荞与野甜荞亲缘关系近;不同地区野苦荞和左贡野荞分别被单独聚为一类,说明生长环境对荞麦ABI基因序列变异具有影响。

中国明亮熊蜂复合种的分子鉴定及分布特性

【目的】为了探明中国境内明亮熊蜂复合种Bombus lucorum complex的物种组成及其分布特性。【方法】利用DNA条形码技术对来源于中国境内的明亮熊蜂复合种的223个标本进行了鉴定,并根据鉴定结果分析了各物种的分布特性。【结果】中国境内明亮熊蜂复合种包括地熊蜂B.terrestris、隐熊蜂B.cryptarum、明亮熊蜂B.lucorum和长翅熊蜂B.longipennis。4种熊蜂共获得160条DNA条形码序列,包含36个单倍型,其中B.longipennis单倍型最多,为14个;B.terrestris最少,为3个。B.terrestris和B.lucorum亲缘关系最远,其遗传距离为0.077;B.lucorum和B.longipennis亲缘关系最近,其遗传距离为0.034。系统进化分析(贝叶斯法和最大似然法)表明,4种熊蜂的分化先后顺序为B.terrestris,B.longipennis,B.lucorum和B.cryptarum。4种熊蜂的分布格局不同,平均分布海拔高度由高到低的顺序依次为B.longipennis,B.cryptarum,B.lucorum和B.terrestris。B.longipennis发现于高海拔的青藏高原东部及南部地区,而B.terrestris仅发现于低海拔的新疆西北部边界地带。【结论】本研究探明了中国境内明亮熊蜂复合种的分类地位及其分布特性,为深入研究该类群的资源保护和农业授粉利用奠定了基础。

越橘叶片转录组SSR发掘及其多态性研究

对高丛越橘品种‘布里吉塔’叶片转录组序列进行了简单重复序列(SSR)位点搜索和分析,发现了22 058个SSR位点,总发生频率为21.32%。SSR重复类型以二核苷酸发生频率最高(77.70%),三核苷酸次之(21.45%)。选用53对SSR引物在8个越橘属植物中进行PCR扩增,筛选出15对条带清晰且能稳定扩增的SSR核心引物。使用核心引物对39份越橘属种质进行分析,有效等位基因数最大值为7.11(Vc SSR19),最小值为1.41(Vc SSR41),平均值为3.90。香农多样性指数变化范围是0.64~2.31,平均值为1.55。观察杂合度和期望杂合度的变化范围分别是0.050~0.900和0.293~0.870,平均值分别为0.457和0.677。使用5对引物可以完全区分39份种质中的38份。南高丛越橘品种‘莱格西’和‘蓝雨’与蔓越橘品种、越橘属野生种具有更近的亲缘关系,是与野生种进行杂交育种的合适种质。