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题名胡萝卜14-3-3基因家族的鉴定与分析
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作者
王瑞雪
郭杰
郝楠
朱丽君
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机构
兰州职业技术学院
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出处
《北方园艺》
CAS
北大核心
2024年第6期17-24,共8页
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基金
甘肃省高等学校创新基金资助项目(2022B-437)。
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文摘
以胡萝卜为试材,采用分子生物学和生物信息学方法对胡萝卜14-3-3基因家族各成员进行鉴定,研究分析其理化特性、基因结构、保守结构域、复制事件、系统进化及顺式作用元件,以期为进一步研究胡萝卜14-3-3蛋白的功能提供参考依据。结果表明:胡萝卜中共鉴定到11个14-3-3基因,不均匀分布在6条染色体上,含有3~7个外显子,其中1对基因发生片段复制事件;编码的蛋白序列长度为236~264 aa,分子量为26.64~30.14 kD,等电点为4.65~5.33,具有7个Motif,全部为酸性非分泌型蛋白,定位在细胞核。系统进化分析显示,胡萝卜14-3-3蛋白分为ε类(3个)与非ε(8个)类2个亚族。此外,顺式作用元件分析结果表明,胡萝卜14-3-3基因含有大量激素与逆境胁迫相关元件。
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关键词
胡萝卜
14-3-3基因家族
系统进化分析
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Keywords
carrot
14-3-3 gene family
phylogeny analysis分类号:s 631.2
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分类号
S631.2
[农业科学—蔬菜学]
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