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猪hsp70和hsp90荧光定量RT-PCR检测方法的建立 被引量:2
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作者 李玉保 鲍恩东 +1 位作者 赵茹茜 王志亮 《南京农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第2期116-120,共5页
根据hsp70、hsp90和GAPDH基因mRNA序列,设计并合成3对引物,将PCR扩增的基因片段克隆到pGEM-T载体,重组质粒经筛选、鉴定,体外转录出RNA,系列稀释作为阳性标准品,用于标准曲线的绘制和样品检测,并用持家蛋白GAPDH基因对样品进行归一化,... 根据hsp70、hsp90和GAPDH基因mRNA序列,设计并合成3对引物,将PCR扩增的基因片段克隆到pGEM-T载体,重组质粒经筛选、鉴定,体外转录出RNA,系列稀释作为阳性标准品,用于标准曲线的绘制和样品检测,并用持家蛋白GAPDH基因对样品进行归一化,建立了一步法实时荧光定量RT-PCR技术平台,并对其扩增效率、敏感性、特异性进行了检测。结果证明,建立的一步法荧光定量RT-PCR技术可以真实地反映反应管中模板的数量,可用于猪hsp70、hsp90和GAPDH基因mRNA水平的检测。 展开更多
关键词 HSP70 HSP90 GAPDH 荧光定量rt-pcr
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猪瘟病毒和猪流行性腹泻病毒双重RT-PCR方法的建立 被引量:3
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作者 谭飞 马士博 +6 位作者 王瑞翀 张希 姜艳平 崔文 孟柳 尹纪元 乔薪瑗 《中国兽医杂志》 CAS 北大核心 2015年第10期28-30,共3页
本研究根据GenBank中发表的猪瘟病毒(CSFV)和猪流行性腹泻病毒(PEDV)的基因组序列,设计筛选出两对用于双重RT-PCR反应的特异性引物,通过对特异性、灵敏性和稳定性等试验,建立了检测猪流行性腹泻病毒和猪瘟病毒的双重RT-PCR核酸检测技术... 本研究根据GenBank中发表的猪瘟病毒(CSFV)和猪流行性腹泻病毒(PEDV)的基因组序列,设计筛选出两对用于双重RT-PCR反应的特异性引物,通过对特异性、灵敏性和稳定性等试验,建立了检测猪流行性腹泻病毒和猪瘟病毒的双重RT-PCR核酸检测技术。利用建立的CSFV-PEDV双重RT-PCR核酸检测技术,对某规模化猪场病料进行检测,结果表明,扩增出大小约311 bp和501 bp大小的特异性条带,为猪瘟与猪流行性腹泻病毒混合感染。建立的CSFVPEDV双重RT-PCR核酸检测技术具有良好的特异性、灵敏性和稳定性,该方法的建立为CSFV和PEDV的快速诊断、疫情监测及流行病学研究奠定了基础。 展开更多
关键词 双重rt-pcr 猪瘟 猪流行性腹泻
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应用SYBR荧光实时定量RT-PCR法检测TGF-β1诱导瘢痕疙瘩成纤维细胞中PAI-1mRNA表达 被引量:2
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作者 何淑芳 杨林 +6 位作者 黄维娟 杨雁 周伏圣 方巧云 张安平 杨森 张学军 《中国药理学通报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第1期64-67,共4页
目的应用SYBR荧光实时定量RT—PCR法检测转化生长因子-β1(transforming growth factor betal,TGF-β1)诱导瘢痕疙瘩成纤维细胞(keloid fibroblasts,KFS)中纤溶酶原激活物抑制剂-1(plasminogen activator inhibitor1,PAI-1)mRN... 目的应用SYBR荧光实时定量RT—PCR法检测转化生长因子-β1(transforming growth factor betal,TGF-β1)诱导瘢痕疙瘩成纤维细胞(keloid fibroblasts,KFS)中纤溶酶原激活物抑制剂-1(plasminogen activator inhibitor1,PAI-1)mRNA的表达。方法体外分离培养KFs,应用不同浓度(1.25~20pmol·L-1)TGF-β1刺激KFs3h或TGF-β1(10pmol·L-1)刺激KFs不同时间(0.5~6h),采用SYBRGreenI荧光实时定量RT—PCR法检测,以B—actin基因作为内参,计算各组PAI-1mRNA的相对表达量。结果与空白对照组相比,TGF-β1能明显诱导KFs中PAI-1mRNA的表达,10、20pmol·L-1浓度组表达比值分别增至4.19及4.44倍(P〈0.01);TGF-β1(10pmol·L。)的1、2h时问组表达比值分别增至2.29及2.41倍(P〈0.05),3、6h时间组分别增至4.19及5.83倍(P〈0.01)。提示,TGF-β1诱导KFs中PAI=1mRNA表达的最适浓度为10pmol·L-1、最适时间为3h。结论利用SYBR荧光实时定量RT—PCR法检测TGF-β1诱导KFs中PAI-1mRNA的表达,为进一步研究瘢痕疙瘩中TGF-β1信号通路的靶基因调控机制,以及开发治疗瘢痕疙瘩的新药提供了基础。 展开更多
关键词 瘢痕疙瘩 转化生长因子-β1 纤溶酶原激活物抑制剂-1 荧光实时定量rtpcr
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竞争RT-PCR方法检测Ctr1基因mRNA变化的内参构建 被引量:3
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作者 付世新 王玮 王哲 《中国兽医科技》 CSCD 北大核心 2003年第8期39-41,共3页
构建定量逆转录 聚合酶链反应 (RT PCR)的内参标准 ,用以检测铜代谢过程中Ctr1基因mRNA表达的变化情况。采用双引物 ,经 2次克隆将 4 0 0bp左右的外源基因片段插入到 5 30bp目的片段的单酶切位点中 ,构建成突变型DNA阳性竞争重组质粒... 构建定量逆转录 聚合酶链反应 (RT PCR)的内参标准 ,用以检测铜代谢过程中Ctr1基因mRNA表达的变化情况。采用双引物 ,经 2次克隆将 4 0 0bp左右的外源基因片段插入到 5 30bp目的片段的单酶切位点中 ,构建成突变型DNA阳性竞争重组质粒。结果 ,成功构建了 930bp左右的竞争模板重组质粒。 展开更多
关键词 铜代谢 Ctrl基因 MRNA表达 定量逆转录-聚合酶链反应 rtpcr 竞争重组质粒
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半定量RT-PCR法分析猪肌肉组织细胞谷胱甘肽过氧化物酶mRNA表达水平 被引量:4
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作者 徐春兰 汪以真 《中国兽药杂志》 2005年第8期3-6,23,共5页
细胞谷胱甘肽过氧化物酶(cGPX)是动物体内一种重要的抗氧化酶。本实验室构建一优化的半定量RTPCR法,以18srRNA为内标,研究猪肌肉组织中cGPX基因mRNA表达水平。提取猪肌肉组织总RNA,经反转录后进行扩增,先寻求PCR线性扩增范围,确定RTPCR... 细胞谷胱甘肽过氧化物酶(cGPX)是动物体内一种重要的抗氧化酶。本实验室构建一优化的半定量RTPCR法,以18srRNA为内标,研究猪肌肉组织中cGPX基因mRNA表达水平。提取猪肌肉组织总RNA,经反转录后进行扩增,先寻求PCR线性扩增范围,确定RTPCR的最佳循环次数和Mg2+浓度,扩增后用VDS摄像系统扫描PCR扩增产物的电泳条带灰度。通过cGPXPCR产物的灰度与18srRNAPCR产物的灰度之比,即可计算出cGPXmRNA的相对含量。 展开更多
关键词 rt-pcr cGPX 肌肉
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RT-PCR检测乳腺癌患者外周血表皮生长因子受体和细胞角质蛋白-19mRNA的表达 被引量:2
6
作者 李锋 任军 +6 位作者 贾军 尤向辉 汪海丹 张燕军 郭晓彤 贠军 斯晓明 《现代肿瘤医学》 CAS 2005年第2期154-158,共5页
目的 探讨逆转录聚合酶链式反应(RT-PCR )方法检测乳腺癌患者外周血表皮生长因子受体(EGFR)mRNA作为乳腺癌循环肿瘤细胞标志的可能性及意义。方法 以转录聚合酶链式反应(RT-PCR)方法,分别对40例乳腺癌患者和30例健康人静脉血进行EGFRm... 目的 探讨逆转录聚合酶链式反应(RT-PCR )方法检测乳腺癌患者外周血表皮生长因子受体(EGFR)mRNA作为乳腺癌循环肿瘤细胞标志的可能性及意义。方法 以转录聚合酶链式反应(RT-PCR)方法,分别对40例乳腺癌患者和30例健康人静脉血进行EGFRmRNA检测,同时与目前研究较多的循环上皮细胞标志:细胞角质蛋白CK-19的mRNA做比较。结果 在30例健康人外周静脉血中没有发现EGFRmR NA的表达( 0% ),但有8例CK-19阳性( 26. 7% )。而40例乳腺癌患者检测出13例EGFRmRNA阳性(32. 5% ),与正常人相比P<0. 01,两组间存在显著性差异;CK-19的mRNA阳性例数为14 (35. 0% ),与正常人相比P>0. 05,两组间无统计学差异。通过免疫组化检测到25例( 62. 5% )的肿瘤组织中EGFR阳性,所有外周血中EGFRmRNA阳性的病例,相应的原发肿瘤病灶中EGFR蛋白均为阳性,组织中EGFR蛋白高表达的患者外周血EGFRmRNA检出率也高(P<0. 01)。26例初治患者中5例EGFRmRNA阳性(19. 2% ),14例复治患者中8例EGFRmRNA阳性(57. 1% ),两组相比P<0. 05,存在显著性差异。6例曾使用过紫杉醇类药物挽救化疗的转移性患者中1例EGFRmRNA阳性(16. 7% ), 8例未使用过紫杉醇类药物挽救化疗的转移性患者中7例EGFRmRNA阳性(87. 5% ),两组相比P<0. 05,存在显著性差异。 展开更多
关键词 乳腺癌 表皮生长因子受体(EGFR) 细胞角质蛋白-19(CK-19) 信使RNA(mRNA) 逆转录聚合酶链式反应(rtpcr) 循环肿瘤细胞 微转移 紫杉醇
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应用TaqMan荧光定量RT-PCR方法检测PRRSV变异株在莱芜黑猪体内动态分布 被引量:1
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作者 王辉 李井新 +5 位作者 孙振 谢之景 姜运良 成子强 周恩民 姜世金 《中国动物传染病学报》 CAS 2013年第3期63-68,共6页
为了检测猪繁殖与呼吸综合征病毒(Reproductive and respiratory syndrome virus,PRRSV)接种莱芜黑猪后病毒在体内的增殖分布规律,将15头PRRSV阴性的莱芜黑猪仔猪随机分成两组,试验组10头,对照组5头。分别于攻毒后3、7、14、21、28 d... 为了检测猪繁殖与呼吸综合征病毒(Reproductive and respiratory syndrome virus,PRRSV)接种莱芜黑猪后病毒在体内的增殖分布规律,将15头PRRSV阴性的莱芜黑猪仔猪随机分成两组,试验组10头,对照组5头。分别于攻毒后3、7、14、21、28 d各剖杀试验组2头,对照组1头,采集脾脏、肺脏、心脏、肝脏、肾脏、扁桃体、颌下淋巴结、腹股沟淋巴结和肠系膜淋巴结等组织,并应用建立的荧光定量RT-PCR方法对各组织中病毒进行定量。结果表明,PRRSV攻毒后d 3感染组猪的各组织中均检测到低拷贝病毒核酸存在,攻毒后7~21 d,各种组织中的病毒载量维持在较高水平,而攻毒后d 28时,多数组织中的PRRSV含量明显下降。扁桃体及各种淋巴结中的病毒载量要明显高于其他脏器,显示PRRSV在感染莱芜黑猪后对淋巴组织具有组织嗜性。 展开更多
关键词 莱芜黑猪 猪繁殖与呼吸综合征病毒 病毒载量检测 TaqMan荧光定量rt-pcr
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晶状体上皮细胞mRNA定量分析中内部参照标准β-肌动蛋白RT-PCR反应条件的研究 被引量:1
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作者 熊新春 苗娟 +3 位作者 席祖莲 张海江 胡义珍 魏厚仁 《临床眼科杂志》 2005年第5期469-471,共3页
目的 探讨晶状体上皮细胞mRNA定量分析中内部参照标准β-肌动蛋白RT-PC反应条件。方法 从培养的人晶状体上皮细胞中提取mRNA,应用设计的引物RT-PCR检测β-肌动蛋白,电泳分析53.2℃、53.9℃、55℃、56.2℃、57.4℃、58.6℃、59.8℃、6... 目的 探讨晶状体上皮细胞mRNA定量分析中内部参照标准β-肌动蛋白RT-PC反应条件。方法 从培养的人晶状体上皮细胞中提取mRNA,应用设计的引物RT-PCR检测β-肌动蛋白,电泳分析53.2℃、53.9℃、55℃、56.2℃、57.4℃、58.6℃、59.8℃、60℃、62℃、62.7℃不同的退火温度的扩增产物。结果 各退火温度条件下,β-actin扩增产物均形成长度为302bp片段,且未见非特异性扩增产物条带。退火温度为58.6℃时,β-actin扩增产物的条带最清晰。结论 采用本实验中所设计的引物联合58.6℃退火温度等实验条件所扩增的长度为302bp片段,清晰稳定,是晶状体上皮细胞mRNA定量分析中良好的内部参照标准。 展开更多
关键词 晶状体上皮 MRNA Β-肌动蛋白 逆转录-聚合酶链反应 人晶状体上皮细胞 pcr检测 参照标准 定量分析 反应条件 rt
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猪场蚊子中乙型脑炎病毒的RT-PCR检测 被引量:1
9
作者 魏燕鸣 《湖北农业科学》 北大核心 2012年第14期3104-3106,共3页
收集湖北省与安徽省部分猪场的蚊子样本,用RT-PCR检测蚊子样本是否携带有乙型脑炎病毒,并对猪群乙型脑炎病毒抗体进行了检测。结果表明,53份蚊子样品中乙型脑炎病毒阳性样品为44份,表明这些猪场的蚊子广泛携带有乙型脑炎病毒。从阳性PC... 收集湖北省与安徽省部分猪场的蚊子样本,用RT-PCR检测蚊子样本是否携带有乙型脑炎病毒,并对猪群乙型脑炎病毒抗体进行了检测。结果表明,53份蚊子样品中乙型脑炎病毒阳性样品为44份,表明这些猪场的蚊子广泛携带有乙型脑炎病毒。从阳性PCR产物中随机选出8个,并将其克隆到pEASY-T1载体中,得到5个阳性重组质粒,进行序列测定和进化树分析,结果表明阳性蚊子样本携带的都是基因Ⅲ型乙型脑炎病毒。猪场的1 401份血清样品的乙型脑炎病毒抗体阳性率为57.7%,说明这些猪场猪群的乙型脑炎病毒感染率较高。 展开更多
关键词 猪场 蚊子 乙型脑炎病毒 rt-pcr
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颌骨肿瘤中骨形成蛋白-2基因扩增的RT-PCR研究
10
作者 平飞云 黄宏杰 彭加萍 《口腔医学》 CAS 2006年第4期253-256,共4页
目的探讨颌骨肿瘤中骨形成蛋白(BMP)-2基因的扩增与颌骨肿瘤的发生、发展及生物学行为之间的关系。方法采用反转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)技术检测9类87例新鲜颌骨肿瘤标本中BMP-2基因扩增结果。结果含肿瘤性硬组织的全部42例颌骨肿瘤... 目的探讨颌骨肿瘤中骨形成蛋白(BMP)-2基因的扩增与颌骨肿瘤的发生、发展及生物学行为之间的关系。方法采用反转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)技术检测9类87例新鲜颌骨肿瘤标本中BMP-2基因扩增结果。结果含肿瘤性硬组织的全部42例颌骨肿瘤(骨肉瘤、软骨肉瘤、牙源性纤维瘤、骨化性纤维瘤、化牙骨质纤维瘤)和部分颌骨成釉细胞瘤(27/31)均显示人BMP-2特异性扩增条带,而不含肿瘤性硬组织的其他颌骨肿瘤(牙源性钙化上皮瘤、纤维肉瘤、脂肪肉瘤)均未见特异性扩增条带。结论颌骨肿瘤中BMP-2基因扩增存在差异,BMP-2基因扩增与肿瘤性硬组织的形成有关,与某些颌骨肿瘤的发生、发展及生物学行为之间存在一定关系。 展开更多
关键词 颌骨肿瘤 骨形成蛋白-2 基因扩增 rtpcr
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鹌鹑肝组织胱硫醚β-合酶基因RT-PCR的实验研究
11
作者 李丽帆 彭义 吴芳 《广西中医学院学报》 2007年第4期6-9,共4页
[目的]建立一种有效的鹌鹑肝组织胱硫醚β-合酶(CBS)RT-PCR,为实现CBS Real-time PCR提供条件。[方法]采取一步法,改进一步法,异硫氰酸胍法(重复抽提)和异硫氰酸胍法(一步法)四种方法提取总RNA,以CBS cDNA共有序列设计鹌鹑CBS引物,进行C... [目的]建立一种有效的鹌鹑肝组织胱硫醚β-合酶(CBS)RT-PCR,为实现CBS Real-time PCR提供条件。[方法]采取一步法,改进一步法,异硫氰酸胍法(重复抽提)和异硫氰酸胍法(一步法)四种方法提取总RNA,以CBS cDNA共有序列设计鹌鹑CBS引物,进行CBS RT-PCR引物筛选。[结果]除改进一步法外,其他三种方法提取的总RNA完整性好;除异硫氰酸胍法(一步法)外,其他三种方法提取的总RNA的A260/A280都在1.8以上纯度。异硫氰酸胍法(重复抽提)提取的总RNA极少残留DNA。[结论]四种方法都能较好地扩增CBS片段,一步法最省时。但异硫氰酸胍法(重复抽提)抽提得到的RNA质量较好. 展开更多
关键词 胱硫醚Β-合酶 rtpcr 总RNA 鹌鹑 动脉粥样硬化
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比格犬IFN-α和IFN-β mRNA SYBR GreenⅠ荧光定量RT-PCR检测方法的建立 被引量:3
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作者 潘福星 王冬冬 +6 位作者 曹志伟 冯培祥 刘宏 齐娟 孙忠晟 王祖荣 尹燕博 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第4期297-300,共4页
为检测比格犬α和β-干扰素(CaIFN-α和CaIFN-β),本研究根据GenBank中登录的IFN-α和IFN-β基因序列,分别设计合成特异性引物,以犬3-磷酸甘油脱氢酶(GAPDH)mRNA为内参,建立SYBR Green I荧光定量RT-PCR检测方法。通过RT-PCR分别扩增IFN... 为检测比格犬α和β-干扰素(CaIFN-α和CaIFN-β),本研究根据GenBank中登录的IFN-α和IFN-β基因序列,分别设计合成特异性引物,以犬3-磷酸甘油脱氢酶(GAPDH)mRNA为内参,建立SYBR Green I荧光定量RT-PCR检测方法。通过RT-PCR分别扩增IFN-α、IFN-β和GAPDH的基因片段,并克隆于pMD19-T载体中制备标准品,建立荧光定量RT-PCR标准曲线。结果表明:IFN-α和IFN-β和GAPDH基因的Ct值与标准品稀释度在1×102拷贝/μL^1×108拷贝/μL内均呈良好的线性关系,相关系数均大于0.994。组内组间变异系数均小于3%,特异性和重复性较好。同时采用常规RT-PCR方法与本研究建立的方法对30份临床样品检测,结果显示IFN-α和IFN-β的阳性符合率分别为96.43%和96.55%。本研究建立的检测方法为比格犬IFN mRNA的定量分析提供了有效手段。 展开更多
关键词 SYBR Green 实时荧光定量rtpcr 比格犬 α-干扰素 Β-干扰素
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猪淋巴细胞趋化因子XCL1的电子克隆和编码区序列RT-PCR验证 被引量:2
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作者 宋豪 张德礼 《动物医学进展》 CSCD 2008年第12期11-16,共6页
淋巴细胞趋化因子(XCL1)是C族趋化因子的一员,可由CD8+T细胞、NK细胞、γδT细胞、肥大细胞等多种细胞产生,其趋化性主要作用于CD8+T细胞和NK细胞。根据猪的EST数据库中猪XCL1基因序列,设计引物采用RT—PCR的方法从猪胸腺中扩增... 淋巴细胞趋化因子(XCL1)是C族趋化因子的一员,可由CD8+T细胞、NK细胞、γδT细胞、肥大细胞等多种细胞产生,其趋化性主要作用于CD8+T细胞和NK细胞。根据猪的EST数据库中猪XCL1基因序列,设计引物采用RT—PCR的方法从猪胸腺中扩增猪XCL1全基因序列,将其连接到pMD-19T载体上并测序,得到猪XCLl基因(GenBank登录号为EU743945)。猪XCL1cDNA大小为333bp,编码由110个氨基酸残基组成的多肽。该多肽序列含Chemokine-C、Chemokine、Chemokine-CC和SCY等功能域,与羊和人的氨基酸序列相似率分别为81.6%和68.4%。预测分析其为分泌蛋白,信号肽剪切位点在21A和22V。猪XCL1基因定位于猪4号染色体(CU468871),基因结构与人XCL1的相似,都由3个外显子组成。该基因ORF翻译起始处基本符合Kozak规则,ORF起始密码子上游同一相位有终止密码子,ORF后有1个加尾信号,预测得到4个可能的启动子,可能性高达85%~98%。总之,通过电子克隆与试验验证,成功地克隆了猪新基因XCL1。 展开更多
关键词 电子克隆 淋巴细胞趋化因子 XCL1 反转录
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猪源牛病毒性腹泻病毒与猪瘟病毒一步法双重RT-PCR鉴别检测方法的建立及应用 被引量:5
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作者 梁洪 王怀禹 +1 位作者 粟元文 魏玲 《中国兽医杂志》 CAS 北大核心 2021年第10期25-29,共5页
为了建立一种快速鉴别检测猪源牛病毒性腹泻病毒(猪源BVDV)和猪瘟病毒(CSFV)的方法,根据GenBank中猪源BVDV和CSFV 5′UTR基因序列分别设计合成特异性检测引物,经一步法双重RT-PCR反应条件的优化,建立了鉴别检测猪源BVDV和CSFV的一步法双... 为了建立一种快速鉴别检测猪源牛病毒性腹泻病毒(猪源BVDV)和猪瘟病毒(CSFV)的方法,根据GenBank中猪源BVDV和CSFV 5′UTR基因序列分别设计合成特异性检测引物,经一步法双重RT-PCR反应条件的优化,建立了鉴别检测猪源BVDV和CSFV的一步法双重PCR方法。该方法对猪源BVDV、CSFV、猪源BVDV/CSFV混合物可分别扩增出185、342、185 bp和342 bp的特异性条带,检测PRRSV、PRV、PPV、PCV-2、PEDV、JEV、TGEV均为阴性,对猪源BVDV、CSFV、BVDV/CSFV混合物的RNA检测灵敏度分别达0.95 ng、0.85 ng、8.0 ng,与猪源BVDV一步法RT-PCR检测方法、CSFV一步法RT-PCR检测方法的符合率均为100%。该方法在检测94份疑似CSFV感染病料样品的临床应用中,猪源BVDV阳性率为14.89%,CSFV阳性率为24.47%,猪源BVDV/CSFV混合感染率为5.32%。表明该一步法双重RT-PCR鉴别检测方法具有良好的特异性、敏感性、重复性、准确性和临床适用性,可用于临床病料样品中猪源BVDV和CSFV的快速鉴别检测,为基层兽医工作者开展猪源BVDV和CSFV的临床鉴别诊断和流行病学监测,提供了一种简单、有效的分子生物学鉴别检测方法。 展开更多
关键词 猪源牛病毒性腹泻病毒 猪瘟病毒 一步法 双重rt-pcr 鉴别检测
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半定量RT-PCR法分析猪肝脏中铜锌超氧化物歧化酶mRNA表达水平 被引量:2
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作者 胡迎利 徐春兰 汪以真 《中国兽药杂志》 2006年第4期20-24,共5页
细胞内铜锌超氧化物歧化酶(CuZnSOD)是动物体内一种重要的抗氧化酶。本实验室构建了优化的半定量RT-PCR法,以18S rRNA为内标,研究猪肝脏组织中CuZnSOD基因mRNA表达水平。提取猪肝脏组织总RNA,经反转录后进行扩增,先寻求PCR线性扩增范围... 细胞内铜锌超氧化物歧化酶(CuZnSOD)是动物体内一种重要的抗氧化酶。本实验室构建了优化的半定量RT-PCR法,以18S rRNA为内标,研究猪肝脏组织中CuZnSOD基因mRNA表达水平。提取猪肝脏组织总RNA,经反转录后进行扩增,先寻求PCR线性扩增范围,确定RT-PCR的最佳循环数和Mg2+浓度。扩增后用VDS摄像系统扫描PCR扩增产物的电泳条带灰度。通过CuZnSOD PCR产物的灰度与18S rRNA PCR产物的灰度之比,即可计算出CuZnSOD mRNA的相对含量。 展开更多
关键词 铜锌超氧化物歧化酶(CuZnSOD) rt-pcr 肝脏
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高通量实时荧光定量RT-PCR方法验证FL细胞对苯并(a)芘7,8-二氢二醇9,10-环氧化物处理的差异表达基因 被引量:1
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作者 卢翔云 李红娟 余应年 《中国药理学与毒理学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2007年第1期64-71,共8页
目的验证由寡核苷酸微阵列检出的FL细胞对苯并(a)芘7,8-二氢二醇9,10-环氧化物(BPDE)处理的差异表达基因。方法FL细胞分别经0.1%二甲亚砜(DMSO)和0.5μmol.L-1BPDE处理,以高通量实时荧光定量RT-PCR方法(TaqMan(低密度芯片)平行检测185... 目的验证由寡核苷酸微阵列检出的FL细胞对苯并(a)芘7,8-二氢二醇9,10-环氧化物(BPDE)处理的差异表达基因。方法FL细胞分别经0.1%二甲亚砜(DMSO)和0.5μmol.L-1BPDE处理,以高通量实时荧光定量RT-PCR方法(TaqMan(低密度芯片)平行检测185个目标基因的相对表达水平。结果BPDE处理组相对DMSO对照组,51个基因表达有差异,12个基因表达上调,39个基因表达下调,(n=3,P<0.05),涉及细胞增殖,分化,凋亡调控基因,转录调节基因和代谢酶基因等。结论高通量实时荧光定量RT-PCR可迅速对微阵列数据进行验证,差异表达谱有助于研究BPDE的毒理机制和细胞的应答反应。 展开更多
关键词 rtpcr 低密度芯片 苯并(a)芘7 8-二氢二醇9 10-环氧化物 差异基因表达
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Expression of Eph-Ephrin A Molecules in Endometrium During Swine Embryo Implantation Examined Using Real-Time RT-PCR 被引量:7
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作者 FU Yan-feng FU Jin-luan YANG Lu TIAN Ming-ming CHEN Wen-cheng WANG Ai-guo 《Agricultural Sciences in China》 CAS CSCD 2011年第9期1445-1451,共7页
Erythropoietin-producing hepatocellular receptor and its membrane-bound ligands (Eph-Ephrin) system could regulate some mammalian blastocyst attachment and spreading. In order to investigate the involvement of the E... Erythropoietin-producing hepatocellular receptor and its membrane-bound ligands (Eph-Ephrin) system could regulate some mammalian blastocyst attachment and spreading. In order to investigate the involvement of the Eph-Ephrin system in swine embryo attachment, mRNA expression of Eph-Ephrin molecules in endometrium was examined by real-time RT- PCR during embryo implantation in pigs. The results indicated that mRNA expressions of Eph A5, A7 and Ephrin A5 all continually increased from pregnancy day 13 to 24. Ephrin A3 mRNA expression significantly increased from day 13 to 18 and decreased from day 18 to 24, and the expression was the lowest on pregnancy day l 3 and the highest on day 18. However, Ephrin A4 mRNA expression was the lowest on pregnancy day 18 and the highest on day 24, and the expression decreased from day 13 to 18 and increased from day 18 to 24. Furthermore, mRNA expressions of Eph A5 and A7 were both found in other tissues, such as brain, muscle, intestine, stomach, etc. These findings suggest that the Eph-Ephrin system may play an important role in regulating the contact between blastocysts and endometrium during swine embryo implantation. 展开更多
关键词 Eph-Ephrin real-time rt-pcr ENDOMETRIUM implantation pig
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脾源鸭γ-干扰素基因的RT-PCR扩增、序列分析及表达 被引量:2
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作者 张晓宇 李凤华 +6 位作者 邵钢 宋晓林 陈艳 康丽娟 江庆国 庄国宏 江国托 《中国家禽》 北大核心 2005年第11期14-16,共3页
从丝裂原刺激的鸭脾淋巴细胞中提取基因组 RNA,采用 RT-PCR 扩增鸭干扰素γ基因并进行了序列分析。序列分析结果表明,鸭干扰素γ基因序列全长477bp,开放阅读框架内401个核苷酸,共编码132个氨基酸。将鸭γ-IFN 基因定向克隆到原核表达载... 从丝裂原刺激的鸭脾淋巴细胞中提取基因组 RNA,采用 RT-PCR 扩增鸭干扰素γ基因并进行了序列分析。序列分析结果表明,鸭干扰素γ基因序列全长477bp,开放阅读框架内401个核苷酸,共编码132个氨基酸。将鸭γ-IFN 基因定向克隆到原核表达载体pBV220中,重组质粒经酶切鉴定后,转化到宿主菌 DH5a 中,温度诱导表达,SDS-PAGE 分析,表达产物与标记抗鸡干扰素抗体出现 Dot-ELISA 阳性反应。 展开更多
关键词 pcr扩增 序列分析 Γ-干扰素基因 rt 开放阅读框架 PBV220 原核表达载体 脾淋巴细胞 ELISA 干扰素γ 分析结果 基因序列 定向克隆 酶切鉴定 重组质粒 诱导表达 PAGE 阳性反应 鸡干扰素 表达产物 RNA 基因组 丝裂原 核苷酸
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鸡PD-1及其配体实时荧光定量RT-PCR检测方法的建立与应用
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作者 孙国鹏 岳锋 +6 位作者 张艳芳 朱艳平 郭东光 王选年 王爱国 李博文 杨媛 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2014年第8期139-142,共4页
为了建立并应用鸡相关免疫抑制性受体及其配体的检测方法,试验根据GenBank中程序性死亡因子-1(PD—1)及其配体PD—Ls(PD—L1、PD—L2)的基因序列分别设计特异性引物,建立这3种基因的SYBRGreenI实时荧光定量RT—PCR检测方法,并对... 为了建立并应用鸡相关免疫抑制性受体及其配体的检测方法,试验根据GenBank中程序性死亡因子-1(PD—1)及其配体PD—Ls(PD—L1、PD—L2)的基因序列分别设计特异性引物,建立这3种基因的SYBRGreenI实时荧光定量RT—PCR检测方法,并对鸡法氏囊病毒(IBDV)感染雏鸡7d的外周血单核细胞(PBMC)中3种基因mRNA表达水平进行检测。结果表明:建立的检测方法在1×10^1~1×10^8copies/μL模板范围内具有良好的线性关系,相关系数均大于0.990,重复性试验的组内及组间变异系数均小于3%;应用所建立的方法对临床样品进行检测,IBDV感染组PBMC中PD-1、PD—L1和PD—L2mRNA表达量与对照组相比均显著升高(P〈0.05)。说明所建立的检测方法具有良好的敏感性、特异性和重复性。 展开更多
关键词 程序性死亡因子-1(PD—1) PD—L1 PD—L2 实时荧光定量rtpcr
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猪IGF-Ⅰ基因荧光定量PCR标准曲线的建立 被引量:1
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作者 肖书奇 张嘉保 +7 位作者 张树敏 赵志辉 刘保国 李爽 戴立胜 赵中利 高妍 李毅 《生物技术》 CAS CSCD 2006年第6期52-55,共4页
目的:建立用荧光定量PER方法检测猪IGF—I基因表达量的标准曲线。方法:根据自己克隆的猪IGF—I(GenBankNo.DQTS46s7)基因mRNA序列,设计合成引物和探针,采用Taqman探针荧光定量RT—PCR的检测方法,构建检测猪IGF—I基因表达量的... 目的:建立用荧光定量PER方法检测猪IGF—I基因表达量的标准曲线。方法:根据自己克隆的猪IGF—I(GenBankNo.DQTS46s7)基因mRNA序列,设计合成引物和探针,采用Taqman探针荧光定量RT—PCR的检测方法,构建检测猪IGF—I基因表达量的标准曲线。结果:由pMD-18TIGF—I所构建的标准曲线线性关系良好(反应体系中含1×102~1×10'拷贝猪IGF—I基因分子时,扩增反应ct值与拷贝数的对数呈线性关系)、灵敏度高(可检测出低于10个拷贝,肚的样品)、特异性强、准确可靠。结论:成功构建了用荧光定量RT—PCR方法检测猪IGF—I基因表达量的标准曲线。 展开更多
关键词 胰岛素样生长因子-I TAQMAN探针 荧光定量rtpcr 标准曲线
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