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藏猪源细环病毒的全基因组测序和分析
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作者 杨丹娇 范燕迪 +9 位作者 张敏 刘怡雯 叶忠明 吴建平 且华敏 王靖皓 周菡 蓝岚 周泷 汤承 《中国兽医杂志》 CAS 北大核心 2024年第10期32-39,共8页
为了解四川省甘孜藏族自治州藏猪群体内猪细环病毒(TTSuV)的流行情况和遗传变异特点,本试验从该地区17个藏猪养殖场采集呼吸道症状明显的猪鼻拭子、肺脏组织和肺泡灌洗液样本共计101份进行宏基因组测序、TTSuV PCR检测和鉴定、全基因组... 为了解四川省甘孜藏族自治州藏猪群体内猪细环病毒(TTSuV)的流行情况和遗传变异特点,本试验从该地区17个藏猪养殖场采集呼吸道症状明显的猪鼻拭子、肺脏组织和肺泡灌洗液样本共计101份进行宏基因组测序、TTSuV PCR检测和鉴定、全基因组和ORF1基因遗传演化和遗传变异分析以及ORF1蛋白氨基酸遗传变异分析和ORF1蛋白预测分析。结果显示,TTSuV总阳性率为19.8%(20/101),其中,TTSuV1总阳性率为6.93%(7/101),TTSuVk2总阳性率为15.84%(16/101),TTSuV1和TTSuVk2混合阳性率为2.97%(3/101);获得3株TTSuV全基因组序列,分别命名为Scgz-1(2 815 bp)、Scgz-2(2 578 bp)和Scgz-3(2 757 bp);3株毒株均属于TTSuVk2型,其中Scgz-1毒株属于TTSuVk2b亚型,Scgz-2和Scgz-3毒株属于TTSuVk2a亚型;3株毒株全基因组序列彼此之间的相似性为56.2%~74.9%,其中ORF1基因核苷酸序列相似性为53.6%~73.6%;3株毒株ORF1蛋白氨基酸序列与参考毒株氨基酸序列相似性为43.2%~98.5%,序列之间差异性均较大;3株毒株的ORF1蛋白均为不稳定蛋白且复杂。本试验对川西高原地区藏猪的TTSuV开展调查分析,发现藏猪群中流行TTSuV毒株基因变异较大,可为该地区藏猪呼吸道疾病的防控提供参考。 展开更多
关键词 藏猪 猪细环病毒 流行性 序列分析 蛋白预测分析
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Distribution of H-FABP mRNA in Hybrids of Songliao Black Pig×Sus scrofa
2
作者 秦莹 张永宏 +6 位作者 刘同欣 马倩 朱银莉 孙博兴 赵志辉 张嘉保 高妍 《Agricultural Science & Technology》 CAS 2009年第4期65-67,71,共4页
[ Objective] This study was to investigate the distribution of H-FABP mRNA in hybrids of Songliao black pig x Sus scrofa, so as to provide references for revealing the physiological functions of this gene. [Method] Wi... [ Objective] This study was to investigate the distribution of H-FABP mRNA in hybrids of Songliao black pig x Sus scrofa, so as to provide references for revealing the physiological functions of this gene. [Method] With the mRNA from different tissues as template, RT-PCR amplification was carried out for cloning cDNA of hybrid pig, which was then used for PCR reaction using specific primers; the amplification products were separated by gel electrophoresis and analyzed by sequencing for detecting the distribution pattern of H-FABP mRNA in hybrids of Songliao black pig x Sus scrofa. [ Result] H-FABP expressed in all the twelve tissues including subcutaneous fat, abdominal fat, mammary gland, Iongissimus dorsi muscle, dorsal deltoid muscle, heart, liver, spleen, lung, kidney, ileum and duodenum. [ Conclusion] The wide distribution of H-FABP gene suggests that its functions are important and multiple. 展开更多
关键词 Hybrids of Songliao black pig x sus scrofa H-FABP mRNA Tissue distribution
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A New Subspecies of Wild Pig (Sus scrofa)in Hainan Island, China
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《中山大学学报论丛》 1995年第3期152-152,共1页
关键词 WILD sus scrofa)in Hainan Island China A New Subspecies of Wild Pig
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猪WTAP基因的生物信息学分析
4
作者 漆亮 彭英河 +1 位作者 龙晓蓉 杜海波 《现代畜牧科技》 2023年第8期106-109,共4页
本试验通过生物信息学方法对猪WTAP基因进行分析,分析的内容包括开放阅读框、理化性质、亲水性/疏水性、蛋白质二级结构、磷酸化位点和N-糖基化位点等内容。结果表明,猪WTAP基因编码178个氨基酸,等电点5.54,不稳定指数59.85,为不稳定蛋... 本试验通过生物信息学方法对猪WTAP基因进行分析,分析的内容包括开放阅读框、理化性质、亲水性/疏水性、蛋白质二级结构、磷酸化位点和N-糖基化位点等内容。结果表明,猪WTAP基因编码178个氨基酸,等电点5.54,不稳定指数59.85,为不稳定蛋白;亲疏水平均值-1.207,属于亲水蛋白;二级结构以无规则卷曲为主,含有25个α螺旋、28个延伸链、125个无规则卷曲,49个潜在的磷酸化位点,2个N-糖基化位点。 展开更多
关键词 WTAP基因 生物信息学
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大白×梅山杂交组合肉质性状的数量性状位点定位分析(英文) 被引量:7
5
作者 苏玉虹 熊远著 +4 位作者 蒋思文 张勤 雷明刚 郑嵘 邓昌彦 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2004年第2期132-136,共5页
为寻找影响猪肉质数量性状基因位点的染色体区域 ,以 3头英系大白公猪和 7头梅山母猪建立F2 资源家系。随机选留 14 7头F2 代个体 (1998年 81头 ,2 0 0 0年 66头 ) ,经检测均获得肉质性状表型数据。对资源家系内的所有个体位于染色体 1... 为寻找影响猪肉质数量性状基因位点的染色体区域 ,以 3头英系大白公猪和 7头梅山母猪建立F2 资源家系。随机选留 14 7头F2 代个体 (1998年 81头 ,2 0 0 0年 66头 ) ,经检测均获得肉质性状表型数据。对资源家系内的所有个体位于染色体 1、2、3、4、6和 7上的 48个微卫星位点进行扩增。利用线性模型最小二乘法分别对各年度及两年综合后的肉质性状进行数量性状位点 (QTL)区间定位 ,利用置换法确定显著性阈值。研究结果表明 :在 2 0 0 0年群体中 ,猪 4号染色体 (SSC4)上定位了肌内脂肪QTL ,达到染色体极显著水平 (P <0 0 1)和基因组显著水平 (P <0 0 5) ,解释表型变异为 5 2 4% ,梅山猪具有增加肌内脂肪QTL ;两年度群体综合后 ,在上述 4号染色体同一区间 ,肌内脂肪QTL接近染色体显著水平 ;股二头肌pH值和半棘肌pH值QTL分别定位在SSC1和 3上 ;在 1998年和 2 0 0 0年群体中分别发现 1个和 3个达染色体显著水平 (P <0 0 5)的系水力QTL ;在 1998年群体中 ,肌肉含水量QTL位于SSC6;两年综合群体中 ,SSC2、6和 7上定位了肌肉含水量QTL ,达到染色体显著水平 ,含水量QTL均有印迹效应 。 展开更多
关键词 数量性状位点(QTL) 肉质性状 微卫星标记
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家猪Atrn基因与微卫星标记遗传连锁及对经济性状效应的分析 被引量:2
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作者 曾昭顺 杨仕柳 +3 位作者 施启顺 吴晓林 彭英林 左剑波 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2004年第12期1375-1380,共6页
以杂种近交培育的丹麦资源家系 0~ 5世代中的 174头猪为实验材料 ,以杂交合成的湘黄猪第 9世代的12 9头猪为对照 ,采用PCR RFLP技术 ,检测家猪Atrn基因多态性并分析其对生长和体组成性状的影响。结果表明 :PCR产物经TaqⅠ限制酶消化 ,... 以杂种近交培育的丹麦资源家系 0~ 5世代中的 174头猪为实验材料 ,以杂交合成的湘黄猪第 9世代的12 9头猪为对照 ,采用PCR RFLP技术 ,检测家猪Atrn基因多态性并分析其对生长和体组成性状的影响。结果表明 :PCR产物经TaqⅠ限制酶消化 ,两猪种均能得到AA、AB、BB 3种基因型 ,基因型频率在猪种间存在极显著差异 (P <0 0 1)。资源家系资料经CRI MAPV2 4软件作连锁分析 ,发现Atrn基因座与 17号染色体SW10 31位点连锁 ,重组率和LOD值分别为 0 2 1和 3 19。应用多变量最小二乘分析模型 ,资源家系的日均屠宰重、背膘厚和湘黄猪的日增重、背膘厚、瘦肉率等性状基因型间均差异显著 (P <0 0 5或P <0 0 1) ,主要为BB基因型个体优于AA和AB基因型个体。由此可见 ,等位基因B对重要经济性状会产生良好效应或选择BB基因型会获得对重要经济性状的良好效应 。 展开更多
关键词 家猪 Atrn基因 遗传连锁 经济性状
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小兴安岭地区野猪冬季卧息地选择的初步研究 被引量:57
7
作者 高中信 张明海 胡瑞滨 《兽类学报》 CAS CSCD 北大核心 1995年第1期25-30,共6页
应用聚类分析的方法,对小兴安岭地区野猪冬季卧息地选择进行了研究。结果表明,对其影响的主要因子是人为干扰、坡向和隐蔽条件。其次是植被类型、食物丰盛度、坡度和水源。坡位和海拔也有一定影响。其最适卧息地生坑条件的选择依次为... 应用聚类分析的方法,对小兴安岭地区野猪冬季卧息地选择进行了研究。结果表明,对其影响的主要因子是人为干扰、坡向和隐蔽条件。其次是植被类型、食物丰盛度、坡度和水源。坡位和海拔也有一定影响。其最适卧息地生坑条件的选择依次为:草甸沟塘或阔叶林植被,食物丰盛度中等以上,隐蔽级≥0.5.阳坡,卧息地距人为干扰源>1000m和距水源<1000m。 展开更多
关键词 野猪 卧息地 冬季 小兴安岭 资源 生态
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三组麻醉药物对小型猪麻醉效果的比较 被引量:7
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作者 杨同涛 胡魁 +3 位作者 张昊 王立军 范宏刚 王洪斌 《中国兽医杂志》 CAS 北大核心 2013年第3期58-61,共4页
本试验将小型猪特异性麻醉剂(XFM)、氯胺酮复合安定及速眠新Ⅱ联合戊巴比妥钠三组麻醉药,对小型猪麻醉效果进行比较,将18头中国试验用小型猪随机分成3组,第一组肌肉注射猪小型猪复合麻醉剂(XFM)0.15mL/kg体重;第二组氯胺酮(8mg/kg体重)... 本试验将小型猪特异性麻醉剂(XFM)、氯胺酮复合安定及速眠新Ⅱ联合戊巴比妥钠三组麻醉药,对小型猪麻醉效果进行比较,将18头中国试验用小型猪随机分成3组,第一组肌肉注射猪小型猪复合麻醉剂(XFM)0.15mL/kg体重;第二组氯胺酮(8mg/kg体重)复合安定(1mg/kg体重),肌肉注射;第三组速眠新Ⅱ0.1mL/kg体重、戊巴比妥钠10.5mg/kg体重,联合肌肉注射。试验结果表明,XFM组和速眠新Ⅱ组与氯胺酮组相比对体温和呼吸影响小;XFM组与其他两组比较麻醉诱导时间短,麻醉时间长,苏醒期短;氯胺酮组和XFM组与速眠新Ⅱ组相比麻醉镇痛、镇静、肌松效果好。综合评价XFM组与其他两组比具有对小型猪体温(T)、心率(HR)、呼吸频率(RR)影响小,麻醉时间适中,麻醉效果确实,镇静、镇痛、肌松效果均衡等优点。 展开更多
关键词 XFM 氯胺酮 安定 速眠新Ⅱ 戊巴比妥钠 小型猪 麻醉效果
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人与巴马香猪皮肤的比较生物学研究 被引量:21
9
作者 陈俊颖 胡俊西 魏泓 《中国比较医学杂志》 CAS 2006年第5期288-290,F0003,共4页
目的比较巴马香猪皮肤局部解剖结构和人体皮肤的相似和不同之处,为巴马香猪皮肤应用于创伤修复和药物渗透形成基础。方法通过对巴马香猪和人体皮肤进行大体、光镜以及免疫组织化学对比观察,比较研究巴马香猪与人体的皮肤结构特性异同。... 目的比较巴马香猪皮肤局部解剖结构和人体皮肤的相似和不同之处,为巴马香猪皮肤应用于创伤修复和药物渗透形成基础。方法通过对巴马香猪和人体皮肤进行大体、光镜以及免疫组织化学对比观察,比较研究巴马香猪与人体的皮肤结构特性异同。结果巴马香猪皮肤分层、各层厚度、真皮和表皮连接方式、真皮和表皮中细胞分布、胞外基质的排列结构均与人类皮肤相似;巴马香猪皮肤中多种抗原与人类抗血清具有交叉反应,且分布与人类皮肤接近。结论巴马香猪皮肤与人体皮肤结构特性非常相似,适宜作为创伤修复、药物渗透的动物模型以及用于制作创伤修复材料。 展开更多
关键词 巴马香猪 皮肤 免疫组化 生物学
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速眠新Ⅱ与戊巴比妥钠对实验用白香猪麻醉效果的观察 被引量:14
10
作者 吴曙光 巫全胜 +3 位作者 赵菊花 董小君 郭科男 钱宁 《实验动物科学》 2007年第2期24-26,共3页
目的观察速眠新Ⅱ对实验用白香猪的麻醉效果。方法将30头成年实验用白香猪随机分为三个组,A组为速眠新Ⅱ组,B组和C组为速眠新Ⅱ和戊巴比妥钠不同比例复合麻醉组。观察诱导期、维持期、苏醒期,监测动物体温、呼吸频率和心率。结果A、B、... 目的观察速眠新Ⅱ对实验用白香猪的麻醉效果。方法将30头成年实验用白香猪随机分为三个组,A组为速眠新Ⅱ组,B组和C组为速眠新Ⅱ和戊巴比妥钠不同比例复合麻醉组。观察诱导期、维持期、苏醒期,监测动物体温、呼吸频率和心率。结果A、B、C三个组的诱导期分别为(11.4±7.85)min(、122.7±42.82)min和(47.8±46.04)min;维持期(5.7±2.51)min(、104.4±27.68)min和(85.9±92.64)min;苏醒期分别为(4.7±2.83)min(、122.8±19.5)min和(102.1±59.62)min。三组动物体温从给药开始至苏醒在总体上均呈下降趋势;三组动物的呼吸频率均表现为给药后10 min至90 min缓慢升高、在苏醒期略下降的规律性变化;三组动物心率从给药开始至苏醒均在持续下降。结论实验用白香猪对速眠新Ⅱ的耐受高,单纯使用速眠新Ⅱ和与戊巴比妥钠复合使用能获得满意的麻醉深度。 展开更多
关键词 速眠新Ⅱ 速眠新Ⅱ与戊巴比妥钠联用 实验用白香猪 麻醉
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猪CACNA2D1基因定位及与相关遗传图谱的整合分析 被引量:3
11
作者 李建华 杨明生 徐宁迎 《西北农林科技大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2008年第1期49-53,共5页
【目的】定位猪CACNA2D1基因并分析该基因是否可作为影响猪某些生产性状的候选基因。【方法】扩增并测定猪CACNA2D1基因的部分序列,运用辐射杂种细胞系对其进行定位并将定位结果与相关遗传图谱进行整合分析。【结果】将猪cAcNA2D1基因... 【目的】定位猪CACNA2D1基因并分析该基因是否可作为影响猪某些生产性状的候选基因。【方法】扩增并测定猪CACNA2D1基因的部分序列,运用辐射杂种细胞系对其进行定位并将定位结果与相关遗传图谱进行整合分析。【结果】将猪cAcNA2D1基因定位在猪9号染色体79.3~86.7cM的位置上,发现在cACNA2D1基因定位区域有3个分别影响母猪发情期排卵数、胴体肩胛重以及10周龄体重的QTL,在定位区域附近有影响猪屠宰24h后肌肉pH值的QTL。【结论】猪CACNA2D1基因可作为猪繁殖性状、胴体性状、生长性状甚至肉质性状的候选基因进行进一步的研究。 展开更多
关键词 CACNA2D1基因 基因定位 候选基因
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速眠新Ⅱ复合戊巴比妥麻醉在猪高速投射物致伤模型制备中的应用 被引量:2
12
作者 王伍超 高志明 +5 位作者 王旭辉 张岫竹 代唯 刘大维 周继红 林井副 《西南国防医药》 CAS 2009年第6期564-566,共3页
目的:探讨速眠新Ⅱ复合戊巴比妥对实验小型家猪在高速投射物致伤模型制备中的麻醉效果。方法:小型家猪以速眠新Ⅱ0.1ml·kg-1肌注基础麻醉后,静脉复合0.3%戊巴比妥溶液0.5ml·kg-1诱导维持麻醉,观察麻醉后高速投射物致伤过程中... 目的:探讨速眠新Ⅱ复合戊巴比妥对实验小型家猪在高速投射物致伤模型制备中的麻醉效果。方法:小型家猪以速眠新Ⅱ0.1ml·kg-1肌注基础麻醉后,静脉复合0.3%戊巴比妥溶液0.5ml·kg-1诱导维持麻醉,观察麻醉后高速投射物致伤过程中猪的基本生命体征,判断麻醉效果。结果:动物麻醉平稳,致伤前后动物心率和呼吸等生命体征稳定;其中1例出现麻醉副作用。体温随着麻醉持续时间延长呈下降趋势,但不显著。结论:速眠新Ⅱ基础麻醉,静脉复合戊巴比妥诱导维持,此方法用于猪高速投射物致伤模型制备麻醉效果稳定延长,操作简便。 展开更多
关键词 麻醉 速眠新Ⅱ 戊巴比妥 高速投射物致伤 模型
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猪NPY受体Y1 cDNA的克隆及分析 被引量:1
13
作者 周春宝 倪黎纲 +1 位作者 丁家桐 包文斌 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2008年第36期15797-15798,共2页
[目的]研究猪NPY-Y1受体在猪激素分泌及发育生理功能中的调节作用。[方法]从初情期的苏姜猪母猪中提取下丘脑组织总RNA,RT-PCR扩增出NPY-Y1 cDNA,扩增产物克隆入pGEM-T easy载体中进行序列测定。[结果]试验扩增产物与GeneBank公布的猪NP... [目的]研究猪NPY-Y1受体在猪激素分泌及发育生理功能中的调节作用。[方法]从初情期的苏姜猪母猪中提取下丘脑组织总RNA,RT-PCR扩增出NPY-Y1 cDNA,扩增产物克隆入pGEM-T easy载体中进行序列测定。[结果]试验扩增产物与GeneBank公布的猪NPY-Y1序列比较,其同源性达到100%。[结论]为下一步研究猪NPY-Y1基因的生理功能和作用机理奠定了基础。 展开更多
关键词 苏姜猪 NPY-Y1基因 RT-PCR扩增 序列分析
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松辽黑猪×野猪杂交猪H-FABP mRNA基因的组织分布研究 被引量:1
14
作者 秦莹 高妍 +6 位作者 张永宏 刘同欣 马倩 朱银莉 孙博兴 赵志辉 张嘉保 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2009年第23期10902-10903,11043,共3页
[目的]研究松辽黑猪×野猪杂交猪H-FABP mRNA基因的组织分布,为探明该基因的生理功能提供依据。[方法]采用RT-PCR技术获得松野杂交猪的cDNA,经PCR扩增后对目的片段进行电泳鉴定和测序,检测H-FABP mRNA在松辽黑猪×野猪杂交猪组... [目的]研究松辽黑猪×野猪杂交猪H-FABP mRNA基因的组织分布,为探明该基因的生理功能提供依据。[方法]采用RT-PCR技术获得松野杂交猪的cDNA,经PCR扩增后对目的片段进行电泳鉴定和测序,检测H-FABP mRNA在松辽黑猪×野猪杂交猪组织中的分布情况。[结果]在选取的皮下脂肪、腹脂、乳腺、背最长肌、臂三头肌、心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、回肠、十二指肠共12种组织中,H-FABP mRNA均有表达。[结论]H-FABP基因在组织中广泛分布说明了其功能的重要性及多重性。 展开更多
关键词 松辽黑猪×野猪杂交猪 H-FABP MRNA 组织分布
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速眠新Ⅱ对幼龄贵州小型猪外科手术中的应用研究 被引量:13
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作者 吴曙光 佘小明 +5 位作者 田锟 赵菊花 巫全胜 郭科男 董小君 钱宁 《实验动物科学与管理》 2006年第4期21-23,共3页
目的研究速眠新Ⅱ在贵州小型猪幼龄猪外科手术中的麻醉效果和应用。方法将30头贵州小型猪幼龄猪分成两组,A组用速眠新Ⅱ0.15 mL/kg肌注麻醉;B组用0.1 mL/kg速眠新Ⅱ与3.5%戊巴比妥钠生理盐水溶液0.5 mL/kg同时肌注麻醉。两组动物均进行... 目的研究速眠新Ⅱ在贵州小型猪幼龄猪外科手术中的麻醉效果和应用。方法将30头贵州小型猪幼龄猪分成两组,A组用速眠新Ⅱ0.15 mL/kg肌注麻醉;B组用0.1 mL/kg速眠新Ⅱ与3.5%戊巴比妥钠生理盐水溶液0.5 mL/kg同时肌注麻醉。两组动物均进行腭裂造模术及腭裂修补术、器官切除术、腹腔探察术、清创术等手术。观察两组动物的麻醉诱导期、维持期、苏醒期及动物的体温、呼吸频率、心率变化。结果A、B两组的诱导期分别为(7.67±5.20)min、(3.58±3.20)min;维持期分别为(40.17±4.96)min(、60.50±17.3)min;苏醒期分别为(7.00±2.45)min(、56.27±33.60)min。体温变化:A组先下降,后上升;B组总体持续下降。两组动物呼吸频率和心率平稳。结论速眠新Ⅱ用于幼龄贵州小型猪外科手术中的麻醉、镇痛和镇静及肌松效果良好、与戊巴比妥钠复合麻醉效果良好。 展开更多
关键词 速眠新Ⅱ 贵州小型猪 幼龄 外科手术 麻醉
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猪肝脏总RNA快速提取方法 被引量:3
16
作者 喻晓丹 《湖北农业科学》 北大核心 2012年第3期621-623,共3页
采用CTAB法和改良的Trizol法提取贵州从江香猪(Sus scrofa domestica)新鲜肝脏的总RNA,通过紫外分光光度法和凝胶电泳检测RNA质量。结果表明,改良的Trizol法提取的总RNA的纯度高,完整性好,优于CTAB法。且改良的Trizol法提取的猪肝脏总RN... 采用CTAB法和改良的Trizol法提取贵州从江香猪(Sus scrofa domestica)新鲜肝脏的总RNA,通过紫外分光光度法和凝胶电泳检测RNA质量。结果表明,改良的Trizol法提取的总RNA的纯度高,完整性好,优于CTAB法。且改良的Trizol法提取的猪肝脏总RNA可用于RT-PCR等后续分子生物学操作。 展开更多
关键词 RNA提取 猪(sus scrofa domestica) 肝脏 CTAB法 TRIZOL法
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两类猪ADP-核糖基化因子的克隆分析与原核表达载体构建
17
作者 朱岩昆 余燕 +3 位作者 卢全伟 吴世秀 张建新 马金友 《河南师范大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2012年第4期103-106,共4页
哺乳动物小G结合蛋白——二磷酸腺苷-核糖基化因子(ADP-ribosylation factors,Arfs)除在囊泡运输、细胞骨架重排和调节细胞吞噬等方面起重要作用外,还与病毒的感染有关.前期研究发现猪繁殖与呼吸综合征病毒(Porcine reproductive and re... 哺乳动物小G结合蛋白——二磷酸腺苷-核糖基化因子(ADP-ribosylation factors,Arfs)除在囊泡运输、细胞骨架重排和调节细胞吞噬等方面起重要作用外,还与病毒的感染有关.前期研究发现猪繁殖与呼吸综合征病毒(Porcine reproductive and respiratory syndrome virus,PRRSV)感染早期ARFs基因表达明显上调,然而在猪只中ARFs与PRRSV的感染至今知之甚少.本研究中,猪ARF1和ARF4分别被克隆,序列分析发现:ARF1包含一个长度为546bp的开放阅读框(Open reading frame,ORF),预测编码181个氨基酸,理论分子质量为20.70kDa,pI为6.62;ARF4包含一个长度为543bp的开放阅读框,预测编码180个氨基酸,理论分子质量为20.50kDa,pI为5.46.蛋白序列结构分析显示猪ARF1和ARF4蛋白含有典型的p loop,switch区,interswitch区和N端疏水区的Hasp,在第二位都含有可被肉豆蔻酰基化的甘氨酸.猪ARF1和ARF4的原核表达载体也被构建,为进一步研究其在PRRSV感染过程中的调控提供基础. 展开更多
关键词 ARF1 ARF4 原核表达 PRRSV
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猪APOBEC3F基因电子克隆 被引量:1
18
作者 吴小霞 马义才 《生物信息学》 2008年第3期100-101,112,共3页
从EST序列着手直接寻找新基因,即利用计算机进行同源性和一致性分析、寻找感兴趣的EST、构建包含着EST的重叠群,再进行ORF判定以及蛋白质同源性分析。最终利用生物信息学技术克隆获得了猪的APOBEC3F序列。
关键词 ESTS APOBEC3F 电子克隆
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猪Centaurin-α1的克隆分析与原核表达载体构建
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作者 马金友 余燕 +3 位作者 刘俊伟 徐之勇 朱岩昆 陈金山 《中国兽医杂志》 CAS 北大核心 2013年第3期9-13,共5页
Centaurin-α1是囊泡运输小G蛋白的重要调控因子,对病毒的入侵起着重要的调控作用。前期研究发现,猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)感染早期猪Centaurin-α1基因表达明显上调。猪Centaurin-α1基因克隆发现,其包含一个长度为1 125bp的开... Centaurin-α1是囊泡运输小G蛋白的重要调控因子,对病毒的入侵起着重要的调控作用。前期研究发现,猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)感染早期猪Centaurin-α1基因表达明显上调。猪Centaurin-α1基因克隆发现,其包含一个长度为1 125bp的开放阅读框(Open reading frame,ORF),预测编码374个氨基酸,理论分子质量为43.50kDa,pI为8.95。通过NCBI Blast和信号肽分析发现,其序列中包含一个Arf GAP和两个PH结构域,前22个氨基酸为其信号肽区域,氨基酸序列分子系统关系表明,猪Centaurin-α1与牛的亲缘关系较近。Centaurin-α1的原核表达载体也被构建,为进一步研究其在PRRSV感染过程中的调控提供基础。 展开更多
关键词 Centaurin-α1 原核表达 PRRSV
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川渝地区猪TTV血清流行病学调查及危险性因素分析
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作者 聂奎 周作勇 +1 位作者 曾政 黄奕兰 《西南大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2016年第1期14-18,共5页
该试验用ELISA和"病例-对照研究"方法,对四川、重庆共23个区县的养殖场和散养农户进行猪TTSuV感染的血清流行病学调查及危险性因素分析.试验共检测1 918头份猪血清,检出阳性血清341份,平均抗体阳性率为17.78%,其中种公猪的阳... 该试验用ELISA和"病例-对照研究"方法,对四川、重庆共23个区县的养殖场和散养农户进行猪TTSuV感染的血清流行病学调查及危险性因素分析.试验共检测1 918头份猪血清,检出阳性血清341份,平均抗体阳性率为17.78%,其中种公猪的阳性率为32.5%,种母猪31.4%,育肥猪19.6%和仔猪11.2%.四川地区猪的阳性率为15.98%(17.37%~23.26%);重庆地区为20.05%(12.22%~30.00%).试验结果表明,在四川、重庆地区存在TTSuV感染.调查发现,川渝两地的地理条件和养殖规模因素与猪发生TTSuV感染的关联程度很小(地理条件:OR=1.08,95%CI=0.49-1.58;养殖规模:OR=1.04,95%CI=1.01-1.47).生产期长或年龄大的种公猪、种母猪和育肥猪发生TTSuV感染的危险性则分别是仔猪的3.8,3.6和1.9倍(种公猪:OR=3.8,95%CI=1.878-7.752;种母猪:OR=3.6,95%CI=2.153-6.110;育肥猪:OR=1.9,95%CI=1.443-2.586),种公猪、种母猪发生TTSuV感染的危险性分别是育肥猪的2.0和1.9倍(种公猪:OR=2.0,95%CI=1.004-3.887;种母猪:OR=1.9,95%CI=1.165-3.026),表明饲养期或年龄这一暴露因素与猪发生TTSuV感染的危险性有较强或中等程度的关联. 展开更多
关键词 TORQUE Teno sus virus(TTSuV) 血清流行病学 危险性因素 病例-对照研究 四川 重庆
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