牛源结核分枝杆菌pknB基因生物信息学分析

为了解牛源结核分枝杆菌关键蛋白的生物学功能,应用生物信息学方法对丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶pknB蛋白的结构及生物学特性进行了预测。结果显示:牛源结核分枝杆菌pknB蛋白是一类Ⅱ型跨膜蛋白,其跨膜区位于蛋白中部,亲水性强但缺乏能够分泌表达的信号肽;高级结构中无规则卷曲和α螺旋占比较高,分别为44.73%和32.27%,延伸链和β转角含量较少;pknB蛋白定位在细胞内质网的可能性最高,其次为细胞质,而定位在细胞核、高尔基体和线粒体的可能性最低;存在多个优势抗原表位,其中B细胞抗原表位有12个,分值大于25分的T细胞表位有8个;存在65个潜在的磷酸化修饰位点,它们可能与MRA_3902、MRA_3400、cfp17等多种蛋白发生相互作用。结果说明:pknB蛋白作为一种跨膜蛋白具有良好的免疫原性,并参与宿主的NF-κB信号通路进而影响细菌增殖,可以作为抗结核病疫苗研发及快速诊断试剂盒研制的候选靶标蛋白。