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湖南省不同宿主犬弓首蛔虫线粒体pcox1和pnad1基因序列遗传变异的研究
被引量:
5
1
作者
谢雯琴
唐伟
+3 位作者
王先坤
邱启官
龚腾芳
刘伟
《中国预防兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第11期1223-1227,共5页
为探究湖南省不同宿主来源犬弓首蛔虫的种内遗传变异情况,本研究利用PCR法对14株分离自湖南省部分地区不同宿主(犬和狼)源犬弓首蛔虫分离株线粒体细胞色素c氧化酶第I亚基(cox1)基因部分序列(pcox1)和烟酰胺腺嘌呤二核苷酸脱氢酶亚单位I(...
为探究湖南省不同宿主来源犬弓首蛔虫的种内遗传变异情况,本研究利用PCR法对14株分离自湖南省部分地区不同宿主(犬和狼)源犬弓首蛔虫分离株线粒体细胞色素c氧化酶第I亚基(cox1)基因部分序列(pcox1)和烟酰胺腺嘌呤二核苷酸脱氢酶亚单位I(nad1)基因部分序列(pnad1)进行PCR扩增与测序,分析该两个序列的同源性,并用pcox1和pnad1基因序列分别构建不同宿主源犬弓首蛔虫与其他蛔虫的种系发育树。结果显示,本研究获得的犬和狼源弓首蛔虫分离株pcox1和pnad1基因序列大小分别为442 bp和527 bp,其种内遗传变异率分别为0~1.7%和0.2%~2.2%,与已知不同宿主源(犬、人、狐狸等)弓首蛔虫分离株对应核苷酸序列同源性分别为94.6%~99.5%(pcox1)和98.4%~99.2%(pnad1);检测到二者的单倍型分别为13个和12个,单倍型多样性分别为0.989和0.967,核苷酸多样性分别为0.01675和0.00509。基于两种基因构建系统发育树的分析结果一致,本研究获得的14个不同宿主来源犬弓首蛔虫分离株与GenBank已有犬弓首蛔虫分离株位于同一分支,与猫弓首蛔虫和马来西亚弓首蛔虫分离株距离较近,与其他蛔虫所属分支距离较远。本研究结果表明,不同宿主源犬弓首蛔虫湖南分离株遗传变异程度较低,且pcox1基因较pnad1基因序列更适合作为犬弓首蛔虫分离株遗传变异研究的分子标记。本研究为不同宿主源弓首蛔虫的分子流行病学调查及种群遗传学研究奠定了基础。
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关键词
不同宿主
犬弓首蛔虫
pcox1基因
pnad1
基因
遗传变异
下载PDF
职称材料
题名
湖南省不同宿主犬弓首蛔虫线粒体pcox1和pnad1基因序列遗传变异的研究
被引量:
5
1
作者
谢雯琴
唐伟
王先坤
邱启官
龚腾芳
刘伟
机构
永州职业技术学院
娄底职业技术学院
长沙生态动物园
湖南农业大学动物医学院
出处
《中国预防兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第11期1223-1227,共5页
基金
湖南省自然科学基金(2021JJ30335)
湖南省财政厅农业专项养殖业项目(2130199)
湖南省教育厅科学研究项目(20C1856)
文摘
为探究湖南省不同宿主来源犬弓首蛔虫的种内遗传变异情况,本研究利用PCR法对14株分离自湖南省部分地区不同宿主(犬和狼)源犬弓首蛔虫分离株线粒体细胞色素c氧化酶第I亚基(cox1)基因部分序列(pcox1)和烟酰胺腺嘌呤二核苷酸脱氢酶亚单位I(nad1)基因部分序列(pnad1)进行PCR扩增与测序,分析该两个序列的同源性,并用pcox1和pnad1基因序列分别构建不同宿主源犬弓首蛔虫与其他蛔虫的种系发育树。结果显示,本研究获得的犬和狼源弓首蛔虫分离株pcox1和pnad1基因序列大小分别为442 bp和527 bp,其种内遗传变异率分别为0~1.7%和0.2%~2.2%,与已知不同宿主源(犬、人、狐狸等)弓首蛔虫分离株对应核苷酸序列同源性分别为94.6%~99.5%(pcox1)和98.4%~99.2%(pnad1);检测到二者的单倍型分别为13个和12个,单倍型多样性分别为0.989和0.967,核苷酸多样性分别为0.01675和0.00509。基于两种基因构建系统发育树的分析结果一致,本研究获得的14个不同宿主来源犬弓首蛔虫分离株与GenBank已有犬弓首蛔虫分离株位于同一分支,与猫弓首蛔虫和马来西亚弓首蛔虫分离株距离较近,与其他蛔虫所属分支距离较远。本研究结果表明,不同宿主源犬弓首蛔虫湖南分离株遗传变异程度较低,且pcox1基因较pnad1基因序列更适合作为犬弓首蛔虫分离株遗传变异研究的分子标记。本研究为不同宿主源弓首蛔虫的分子流行病学调查及种群遗传学研究奠定了基础。
关键词
不同宿主
犬弓首蛔虫
pcox1基因
pnad1
基因
遗传变异
Keywords
different hosts
Toxocara canis
pcox1
gene
pnad1 gene
gene
tic variation
分类号
S855.9 [农业科学—临床兽医学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
湖南省不同宿主犬弓首蛔虫线粒体pcox1和pnad1基因序列遗传变异的研究
谢雯琴
唐伟
王先坤
邱启官
龚腾芳
刘伟
《中国预防兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021
5
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