猪鞭虫和斯氏鞭虫线粒体pnad4和pcox1基因的扩增与序列分析

以采自广东不同地区的猪鞭虫(Trichuris suis)和斯氏鞭虫(Trichuris skrjabini)为研究对象,扩增线粒体基因组的pnad4和pcox1基因,将扩增产物纯化后克隆至pMD18-T载体,对阳性菌落进行测序和序列分析。结果表明,来源于不同地区的鞭虫上述两个基因种内相对保守,差异性不大,但种间差异较大。猪鞭虫和斯氏鞭虫的pnad4长度均为468 bp,相互间有162个种间遗传标记位点;猪鞭虫和斯氏鞭虫的pcox1长度分别为600 bp与438 bp,相互间有156个种间遗传标记位点。两种鞭虫之间的pnad4基因差异率为45.1%-45.9%,pcox1基因差异率为44.1%-45.4%。上述线粒体两个基因均可作为区分两种线虫的种间遗传标记。

湖南省鸡蛔虫线粒体nad4基因序列的测定及分析

为阐明鸡蛔虫湖南分离株线粒体烟酰胺腺嘌呤二核苷酸(NADH)脱氢酶亚单位4(nad4)基因部分序列(pnad4)遗传变异情况,利用聚合酶链式反应(PCR)扩增鸡蛔虫的pnad4,并对序列进行比对。结果表明:所获得的pnad4序列长度均为408 bp。由于鸡蛔虫pnad4序列种内相对保守,种间差异较大,故可作为种间遗传变异研究的标记,从而为鸡蛔虫的分类鉴定及进一步的分子流行病学调查奠定基础。

鸡蛔虫COX2和NAD4rDNA的序列测定及分析

本试验旨在阐明湖南省鸡蛔虫分离株线粒体细胞色素C氧化酶第Ⅱ亚基(cox2)基因部分序列(pcox2)和烟酰胺腺嘌呤二核苷酸(NADH)脱氢酶亚单位IV基因(nad4)部分序列(pnad4)的遗传变异情况。利用聚合酶链式反应(PCR)扩增鸡蛔虫的pcox2and pnad4,应用clustalx1.81程序对序列进行比对,结果显示,所获得的cox2(pcox2)and nad4(pnad4)序列长度一致,为350bp(pcox2)and 400bp(pnad4)。由于鸡蛔虫pcox2and pnad4序列种内相对保守,种间差异较大,故可作为种间遗传变异研究的标记,从而为鸡蛔虫的分类鉴定及进一步的分子流行病学调查提供了基础。

猪克氏伪裸头绦虫线粒体pcox3、pcox4和pcytb基因的多态性

为阐明不同地区猪克氏伪裸头绦虫（Pseudanoplocephala crawfordi）分离株线粒体pcox3、pnad4、pcytb基因的部分序列的遗传变异情况，本研究首先扩增和测定了河南洛阳、济源和陕西杨凌地区猪的克氏伪裸头绦虫分离株pcox3、pnad4和pcytb基因的序列，然后通过合并pcox3、pnad4和pcytb3段序列重建了克氏伪裸头绦虫与其他绦虫的种群遗传关系。结果显示，克氏伪裸头绦虫pcox3、pnad4和pcytb扩增片段的长度分别为503，604和690bp；克氏伪裸头绦虫线粒体3段基因pcox3、pnad4和pcytb的不同地域种内序列差异分别为0．00％～1．83％，0．00％～1．52％和0．00％～1．51％；基于合并pcox3、pnad4和pcytb3段基因重构种系发育树发现，不同地区克氏伪裸头绦虫分离株聚在一起，并形成姊妹支，而所有的克氏伪裸头绦虫分离株又形成2个小的分支；表明克氏伪裸头绦虫可能存在2个种群，并且与缩小膜壳绦虫亲缘关系最近。