Optimization of SSR-PCR Non-denatured Polyacrylamide Gel Electrophoresis Conditions in Kernelled Apricot

[Objective] The aim was to optimize the SSR-PCR non-denatured polyacrylamide gel electrophoresis conditions in kernelled apricot.[Method]25 accessions of kernelled apricot and three accessions of edible apricot were selected as experimental materials to screen the repeatable SSR loci with high polymorphism by the use of SSR markers combined with non-denatured polyacrylamide gel electrophoresis.And the effect of different factors on electrophoresis conditions was compared to explore the optimal SSR-PCR non-denatured polyacrylamide gel electrophoresis conditions in kernelled apricot.[Result]The optimal non-denatured polyacrylamide gel electrophoresis conditions for SSR-PCR were established as follows：polyacrylamide gel concentration 6%,the ratio of acrylamide to bisacrylamide 29∶1,electrophoresis at 1 000 V for 2-3 h,and staining for 15 min within 0.1% AgNO3.[Conclusion]The optimum electrophoresis system has provided some technical foundations to further study the phylogenetic relationship of kernelled apricots by SSR markers.

Taq DNA聚合酶的制备和纯化

Taq DNA聚合酶是分子生物学研究中最常用的热稳定DNA聚合酶之一。试验利用含Taq DNA聚合酶基因的pTaq表达质粒转化大肠杆菌E.coli菌株,用异丙基硫代-β-D-乳糖苷(IPTG)诱导表达耐热Taq DNA聚合酶;采用热变性沉淀杂蛋白,SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)检测纯度,Bio-Rex 70柱层析纯化蛋白,PCR反应检测Taq DNA聚合酶的浓度和活性。结果表明:分离纯化制备的Taq DNA聚合酶,其纯度、酶活性和酶特异性均达到市售的Taq DNA聚合酶水平。

乳及乳制品中乳铁蛋白含量的快速SDS-PAGE荧光检测方法

该研究采用新型的Chromeo P503(P503)染料替代考马斯亮蓝染色方法,以克服脱色染色步骤繁琐、耗时长(≥5 h)的不足,建立一种乳及乳制品中乳铁蛋白的快速简便十二烷基硫酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳(Sodium Dodecyl Sulfate-Polyacrylamide Gel Electrophoresis,SDS-PAGE)检测方法。P503染料标记蛋白产生强烈的红色荧光发射,在30 min内一步操作即可完成,并且进行脱铁处理后消除乳铁蛋白铁饱和度对于荧光信号的干扰,保证定量的准确性。根据凝胶成像图中78 ku蛋白条带是否存在及其灰度值的大小,实现乳铁蛋白的定性与定量检测。在优化的实验条件下,线性范围为15~75μg/mL,检出限为5.11μg/mL,加标回收率在75.79%~108.09%之间,表明该方法具有较高的灵敏度和准确性。SDS-PAGE和P503结合无需进行肝素亲和柱前处理,便可直接应用于乳及乳制品中乳铁蛋白快速简便的准确定量检测,P503染料标记还可以用于其它乳蛋白的SDS-PAGE快速低成本定量检测,从而为乳品质量控制和营养评价及加工工艺研究提供有力工具。

体细胞克隆山羊微卫星DNA分析

用 10对山羊微卫星DNA多态性引物对 2只体细胞克隆济宁青山羊、青山羊供体细胞、受体奶山羊母羊以及具有亲缘关系的 3只对照济宁青山羊进行微卫星DNA分析 .结果表明有 5对山羊微卫星DNA多态性引物 ,即SR CRSP1,SR CRSP5 ,SR CRSP6 ,SR CRSP7和SR CRSP2 4 ,扩增产物有明显的多态性 .扩增产物经过 6 %变性聚丙烯酰胺凝胶电泳后银染 ,结果 2只体细胞克隆山羊的微卫星DNA指纹与供体细胞完全相同 ,而且不同于其受体母亲也不同于其他所有同品种不同个体的对照青山羊 .证明体细胞克隆山羊基因组来源于供体细胞 .

DNA聚丙烯酰胺凝胶电泳三种银染方法比较

目的 探讨DNA聚丙烯酰胺凝胶电泳 (PAGE)三种银染方法的特点及其适用性。方法 采用非变性PAGE垂直板对不同稀释度的 pBR 32 2MspⅠ分子量标准进行电泳分离 ,利用二种硝酸银染色法和一种银氨染色法染色 ,分析其灵敏度和噪声。结果 分子量Marker的所有条带都能染出灵敏度均为 2 5ng。在至少一个条带能染出的灵敏度方面 ,银氨染色法 ( 6 .2 5ng)低于其他两种方法。结论 时间方面Carlos等所建立的银染方法最快 ,仅需 2 0min。银氨法的噪声最低 ,结果易于保存。

DNA聚丙烯酰胺凝胶电泳银染方法的选择

目的比较4种聚丙烯酰胺凝胶银染方法,为初次使用者选择方法时提供参考。方法用24 mer的引物作为上样样本,分别采用氨水法、低浓度硝酸银法、0.1%及0.2%硝酸银法染色。后2种配合不同的显色剂显色。结果前2种未显色,0.1%及0.2%硝酸银可显色。结论0.2%的硝酸银与氢氧化钠显色剂相结合具有最高的灵敏度;0.2%的硝酸银与碳酸钠显色剂相结合具有最佳的显像效果。

芝麻DNA高效提取及PAGE快速银染方法

为了快速、低成本获得高质量的芝麻基因组DNA,在借鉴其他作物DNA常规提取方法基础上,简化了提取步骤,减少了试剂用量,DNA经琼脂糖电泳检测无拖尾,且OD260/OD280在1.8~2.0之间,表明质量、纯度均较高,摸索了一套芝麻DNA高效提取方法。在常规变性聚丙烯酰胺凝胶（PAGE）银染程序基础上进行改良,减少了固定环节和试剂用量,缩短了染色和显影时间等,优化建立了芝麻PAGE快速银染方法。

检测植物DNA扩增多态性方法的比较和改进

以辽东栎(Quercus liaotungensis Koidz.)、锦鸡儿(Cargagana ssp.)和野大豆(Glycine soja(L.)Sieb.etZucc.)为材料,比较了随机扩增多态DNA(RAPD)和DNA扩增指纹(DAF)方法。用RAPD的琼脂糖胶电泳和溴乙锭染色,RAPD和DAF谱一般不足10条带。用DAF的变性聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)和银染,极大地提高了RAPD的灵敏度和分辨率,多达20～40个产物。用3＇末端完全相同的引物,RAPD和DAF有同样的扩增谱,说明两种方法有相似的机理。降低胶的浓度可提高RAPD和DAF的分辨率,达40～80条带。琼脂糖电泳分离的溴乙锭显示的单荧光带,用PAGE和银染可分辨出多个片段。分子克隆证实单荧光带的分子量异质性。在用Taq DNA多聚酶的条件下,RAPD和DAF的再现性均良好。

聚丙烯酰胺凝胶中DNA的银染方法

The methods of Ultrasensitive silver staining for DNA in Polyacrylamide gels were described. In contrast to traditional radioisotopic methods, these silver -staining protocols are simple, quick and safety. The developmpnt and application are reviewed in this paper.

微卫星DNA非变性PAGE银染法的分析探讨

微卫星DNA非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE),是一种常用的DNA检测手段,具有很好的分离微小差异DNA片段的能力,而银染法使该方法得到了广大科研工作者的青睐,但是,在染色过程中,常可能出现一些问题,令结果的判断难以达到满意的效果。为此,对该方法进行了一系列的分析和探讨。

试剂盒配合琼脂糖EB染色法和PAGE银染法分析线粒体DNA A1555G突变的比较研究

目的通过比较试剂盒配合琼脂糖EB染色法和PAGE银染法分析线粒体DNAA1555G突变的不同特点,探索应用标准试剂盒和PAGE银染方法检测线粒体DNAA1555G突变的快速筛查和诊断方法。方法采用线粒体DNAA1555G突变诊断试剂盒配合PAGE胶电泳银染法检测线粒体DNA1555位点正常者229例,A>G突变阳性者17例,验证此试剂盒配合PAGE银染法检测的有效性和准确性。结果线粒体DNAA1555G突变诊断试剂盒配合PAGE胶电泳银染法检测结果与酶切EB染色和测序结果完全吻合。结论线粒体DNAA1555G突变诊断试剂盒配合PAGE胶电泳银染法和试剂盒配合EB检测法较前者更为灵敏和清晰,在分析线粒体DNAA1555G突变方面具有简单、价廉、结果直观的特点,适合在中国用于进行此突变的大规模筛查或预防性检查。

从凝胶中回收银染DNA条带的研究

目的 比较常规克隆测序与从凝胶中回收银染DNA条带进行直接测序和克隆测序的特点。方法 用单链构像多态法分离杂合性突变DNA样品 ,然后从凝胶中回收变异的银染DNA条带进行直接测序和克隆测序 ,并与常规克隆测序进行比较。结果 从凝胶中回收DNA片段直接测序的正确率超过 97% ,回收片段克隆测序的正确率与常规克隆测序相同 ,达10 0 %。结论 从凝胶中回收DNA片段直接测序和克隆测序较常规克隆测序简便实用 ,在基因克隆、突变鉴定等工作中有一定实用价值。

大豆DNA导入水稻引起后代种子贮藏蛋白变异

以大豆为外源DNA供体，用浸种及幼苗浇灌法和花粉管通道法直接将大豆总DNA导人受体水稻，经常规栽培获得水稻后代种子。采用薄层等电聚焦电泳和十二烷基硫酸钠-聚丙烯酸胺凝胶电泳法，分析了经大豆总DNA处理得到的水稻后代种子中的清蛋白、球蛋白、醇溶蛋白和谷蛋白。结果显示，大豆DNA可能引起水稻种子贮藏蛋白的变异。变异现象主要表现在两个方面；一是总条带数不变，但部分条带的迁移年与对照相比出现差异；再则就是出现了球蛋白、醇溶蛋白和谷蛋白条带增加的现象。

单链DNA纯化对变性PAGE凝胶银染片段回收效率的提高

为了提高变性聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)银染后片段回收的效率,本实验在传统的煮沸法的基础上加入单链DNA纯化的步骤对水稻基因组CCGG为点甲基化敏感限制性酶切多态性(MSAP)分析片段进行回收,并对加入该步骤后的再扩增的效率与传统煮沸法进行了比较。实验结果显示,加入单链DNA纯化步骤后的回收效率比传统煮沸法提高了约6倍。改进后的方法可以有效地用于扩增片段长度多态性(AFLP)以及MSAP等差异显示PAGE凝胶银染DNA片段的回收。

微卫星DNA聚丙烯酰胺凝胶电泳和银染技术的探讨

采用PCR-非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳、硝酸银染色检测DNA片段。结果表明,该方法检测DNA具有灵敏度高、背景浅、条带清晰等突出特点。聚丙烯酰胺凝胶电泳后采用银染技术分析,方便快捷,易长期保存,且减小了对人体、环境的毒害作用。

一种新的微卫星PAGE的DNA显带方法

提出了一种新的微卫星聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)显带方法,即微卫星PAGE荧光染料显带法,与琼脂糖凝胶荧光染料显带法和PAGE银染显带法相比,该法具有简单易行、快速高效、分辨率高、背景清晰等特点,是一种成功的DNA显带技术。

克隆西农莎能奶山羊的微卫星DNA分析

目的利用微卫星DNA技术对通过体细胞克隆技术获得的两只西农莎能奶山羊进行鉴定。方法提取两只克隆西农莎能奶山羊、两只受体西农莎能奶山羊母羊、西农莎能奶山羊供体细胞和两只对照组西农莎能奶山羊母羊的基因组DNA,通过5对具有显著多态性差异的引物扩增微卫星DNA序列,并对其进行微卫星DNA分析。结果两只克隆西农莎能奶山羊和供体细胞的基因型完全一致,受体母羊和对照组母羊的微卫星DNA多态性则与前两者均不相同。结论两只克隆西农莎能奶山羊基因组DNA来源于供体细胞。

聚丙烯酰胺凝胶中DNA银染色检测方法的改进及其效果比较

目的:探索快速、经济的银染色方法。方法:本研究对前人文献所报道的一种银染检测方法的检测步骤和试剂用量进行了优化,省略了操作过程中的固定步骤,简化了停显液的组成成分。结果:优化后的方法在配制试剂时只需3种化学试剂,染色液中硝酸银的用量被减少至1.0 g/L,显影液中氢氧化钠的浓度被降低至10 g/L,DNA检测效果表明优化前后的两种检测方法的检测灵敏度均可达5 ng左右。结论:优化后的DNA银染色检测方法更加经济、快速。

散发性非息肉性大肠癌微卫星DNA不稳定性分析

为分析Ｄ２Ｓ４４１、Ｄ２Ｓ１１９和Ｄ２Ｓ１２３３个微卫星ＤＮＡ标记位点不稳定性，研究ＳＮＰＣＣ发生机理的分子基础。应用ＰＣＲ－ＳＳＬＰ扩增微卫星ＤＮＡ，聚丙烯酰胺凝胶电泳方法对３１例临床诊断为散发性非息肉性大肠癌的肿瘤组织及其相应的正常组织的Ｄ２Ｓ４４１、Ｄ２Ｓ１１９和Ｄ２Ｓ１２３３个微卫星ＤＮＡ标记位点进行分析。结果显示，３１例中，２例在所检测的３个位点均存在微卫星ＤＮＡ不稳定性。提示微卫星ＤＮＡ不稳定性与散发性非息肉性大肠癌发生有关，可通过检测微卫星ＤＮＡ不稳定性筛选大肠癌高危人群，以便早期预防。

基于水凝胶的基因组DNA固定法研究

目的:通过对人基因组DNA固定化的研究,探讨特异性高的单点共价固定方法,实现对人基因组DNA的反复利用。方法:选取Mirzabekov等发明的DNA-水凝胶共聚化学法作为基因组DNA固定方法,使用甲基丙烯酰胺凝胶作为固相支持载体,以(CH2)6-NH2氨基末端修饰的PCR产物及甲酸随机断裂修饰的pGEM-T-HLA-G质粒为模板,使用聚丙烯酰胺凝胶电泳检测其固定效率,并通过PCR法检测该固定方法的热稳定性。将该法初步应用于人类基因组DNA的固定和反复利用,对基因组DNA扩增的片段进行测序,排除突变可能。结果:使用甲基丙烯酰胺凝胶作为固相支持载体,实现了对质粒DNA以及人基因组DNA的固定和反复使用,该方法可以经受16轮的PCR扩增(每轮36个循环)。测序结果证实基因组DNA的扩增片段未发生突变。结论:甲基丙烯酰胺凝胶法固定DNA的热稳定性好,特异性高,可用于全基因组测序及SNP检测。