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基于AFLP遗传多样性和功能成分含量的葛资源特性研究
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作者 彭斯文 龙世平 +5 位作者 朱校奇 唐汉军 谢进 徐瑞 黄艳宁 曹亮 《中国野生植物资源》 CSCD 2024年第10期9-16,共8页
目的:研究葛资源的遗传多样性和品质特征。方法:提取葛幼嫩叶片基因组DNA,使用扩增片段长度多态性(AFLP)分子标记技术对各样品进行扩增,并应用GeneMapper分析软件对AFLP扩增结果进行分析;采用高效液相色谱(HPLC)对葛根中异黄酮类化合物... 目的:研究葛资源的遗传多样性和品质特征。方法:提取葛幼嫩叶片基因组DNA,使用扩增片段长度多态性(AFLP)分子标记技术对各样品进行扩增,并应用GeneMapper分析软件对AFLP扩增结果进行分析;采用高效液相色谱(HPLC)对葛根中异黄酮类化合物葛根素、大豆苷、大豆甙元等主要成分进行含量测定,并利用SPSS软件进行成分含量的聚类分析。结果:5对AFLP荧光引物扩增获得1113条多态性条带,多态性比率达到100%。非加权组平均法(UPGMA)聚类分析结果显示,20号样品(湖南茶陵野葛)与其它葛资源差异较大,在相关系数为0.35时与其它样品分开,剩余样品在0.48的相关系数处分为两大类群,其中一类主要为野葛(云南、重庆),但有17号(湖南武冈粉葛)、18号样品(湖南江背粉葛)与该类聚集为一群,其遗传背景与野葛相似;而另一个类群主要为粉葛(广东、广西、湖南)和湖南的野葛资源,湖南野葛资源与云南等地区野葛差异较大。成分含量聚类分析结果表明所有样品可分属野葛与粉葛2个群,其中野葛的成分含量比粉葛高,但17号样品(湖南武冈粉葛)聚集在野葛群。结论:综合分析发现AFLP分子标记技术能揭示葛的遗传多样性,野葛及粉葛在成分含量方面存在明显差异,其中17号样品(湖南武冈粉葛)成分含量与野葛相近,为优异的粉葛资源。 展开更多
关键词 粉葛 遗传多样性 aflp 葛根素
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Theoretical Framework for a Polymorphic Network Environment
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作者 Jiangxing Wu Junfei Li +2 位作者 Penghao Sun Yuxiang Hu Ziyong Li 《Engineering》 SCIE EI CAS CSCD 2024年第8期222-234,共13页
The question of whether an ideal network exists with global scalability in its full life cycle has always been a first-principles problem in the research of network systems and architectures.Thus far,it has not been p... The question of whether an ideal network exists with global scalability in its full life cycle has always been a first-principles problem in the research of network systems and architectures.Thus far,it has not been possible to scientifically practice the design criteria of an ideal network in a unimorphic network system,making it difficult to adapt to known services with clear application scenarios while supporting the ever-growing future services with unexpected characteristics.Here,we theoretically prove that no unimorphic network system can simultaneously meet the scalability requirement in a full cycle in three dimensions—the service-level agreement(S),multiplexity(M),and variousness(V)—which we name as the“impossible SMV triangle”dilemma.It is only by transforming the current network development paradigm that the contradiction between global scalability and a unified network infrastructure can be resolved from the perspectives of thinking,methodology,and practice norms.In this paper,we propose a theoretical framework called the polymorphic network environment(PNE),the first principle of which is to separate or decouple application network systems from the infrastructure environment and,under the given resource conditions,use core technologies such as the elementization of network baselines,the dynamic aggregation of resources,and collaborative software and hardware arrangements to generate the capability of the“network of networks.”This makes it possible to construct an ideal network system that is designed for change and capable of symbiosis and coexistence with the generative network morpha in the spatiotemporal dimensions.An environment test for principle verification shows that the generated representative application network modalities can not only coexist without mutual influence but also independently match well-defined multimedia services or custom services under the constraints of technical and economic indicators. 展开更多
关键词 polymorphic network environment Impossible triangle Network development paradigm Future network
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用AFLP技术分析紫茎泽兰的遗传多样性 被引量:45
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作者 段惠 强胜 +3 位作者 苏秀红 吴海荣 朱云枝 刘琳莉 《生态学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第8期2109-2114,共6页
利用AFLP技术,选择EcoRI/MesI这一酶切组合,应用6对E+3/M+3引物组合进行选择性扩增,检测了24个地区的紫茎泽兰种群的基因组DNA多态性。共扩增出509个遗传位点,其中392个多态位点,多态率为77.01%。有效等位基因数(Ne)为1.50,Nei’s基因... 利用AFLP技术,选择EcoRI/MesI这一酶切组合,应用6对E+3/M+3引物组合进行选择性扩增,检测了24个地区的紫茎泽兰种群的基因组DNA多态性。共扩增出509个遗传位点,其中392个多态位点,多态率为77.01%。有效等位基因数(Ne)为1.50,Nei’s基因多样性指数(H)为0.29,Shannon信息指数(I)为0.42。并通过Jaccard的方法将电泳带矩阵转化为遗传相似性系数矩阵,进行了UPGMA聚类分析。结果表明:被检测的24个紫茎泽兰种群遗传多样性丰富;丰富程度与入侵定植时间有关,最早受紫茎泽兰入侵的云南省遗传多样性最丰富,变异最大,大致分为9个类群,紫茎泽兰的遗传基因可能对该省多样的气候条件或生境产生了明显的适应性变化;新入侵地区的则遗传多样性相对较低,并与云南省临近地区具有明显的种源地的地源性亲缘关系。子实的风媒传播是紫茎泽兰入侵的主要途径,样点间均具有明显的地源性亲缘关系;水媒也可能是该草传播的途径之一。紫茎泽兰可能首先从缅甸、越南、老挝经风媒入侵我国云南南部,逐渐扩散入侵中北部,又从云南北部和东部传入四川、贵州、广西、湖北等省。 展开更多
关键词 紫茎泽兰 aflp 遗传多样性 多态性
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AFLP法构建人参、西洋参基因组DNA指纹图谱 被引量:105
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作者 罗志勇 周钢 +3 位作者 周肆清 陈湘晖 罗建清 胡维新 《药学学报》 CAS CSCD 北大核心 2000年第8期626-629,共4页
目的 采用扩增片段长度多态性DNA(AFLP)分子遗传标志技术 ,分析人参、西洋参基因组DNA多态性。方法 人参、西洋参干燥根基因组DNA ,经EcoRI/MseI酶切并与其相应的人工接头连接后 ,使用选择性引物进行PCR扩增。结果 经变性聚丙烯酰胺... 目的 采用扩增片段长度多态性DNA(AFLP)分子遗传标志技术 ,分析人参、西洋参基因组DNA多态性。方法 人参、西洋参干燥根基因组DNA ,经EcoRI/MseI酶切并与其相应的人工接头连接后 ,使用选择性引物进行PCR扩增。结果 经变性聚丙烯酰胺凝胶电泳检测 ,成功构建出多态性丰富和重复性好的人参、西洋参DNA指纹图谱。结论 AFLP法有望成为一种独立的切实可行的手段 ,将在人参、西洋参等药用植物的鉴定、生物进化、系统发育研究及指导道地性药材的科学栽培等方面发挥重要作用。 展开更多
关键词 人参 西洋参 aflp DNA指纹图谱
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黄姑鱼群体遗传多样性的AFLP分析 被引量:54
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作者 韩志强 高天翔 +2 位作者 王志勇 庄志猛 苏天凤 《水产学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第5期640-646,共7页
对青岛和厦门黄姑鱼群体的遗传多样性进行了AFLP分析,5对选择性引物在两个群体47个个体中,共扩增出461个位点,多态位点265个。青岛和厦门群体的多态位点比例、Nei遗传多样性指数和Shannon遗传多样性指数分别为51.70%、51.99%,0.1022、0.... 对青岛和厦门黄姑鱼群体的遗传多样性进行了AFLP分析,5对选择性引物在两个群体47个个体中,共扩增出461个位点,多态位点265个。青岛和厦门群体的多态位点比例、Nei遗传多样性指数和Shannon遗传多样性指数分别为51.70%、51.99%,0.1022、0.0996,0.1643、0.1622;两个群体遗传多样性在同一水平上。基因分化系数Gst、Shannon遗传多样性指数和AMOVA分析均显示黄姑鱼的遗传变异主要来源于群体内个体间,而群体间无明显的遗传分化。群体的显性基因型频率分布和位点差异数分布显示两个群体有基本相同的群体遗传结构。结果表明,黄姑鱼青岛和厦门群体间无明显的遗传差异,群体间有明显的基因交流。 展开更多
关键词 黄姑鱼 aflp 遗传多样性
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利用SRAP、SSR和AFLP标记构建甘蓝型油菜遗传连锁图谱 被引量:89
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作者 李媛媛 沈金雄 +2 位作者 王同华 傅廷栋 马朝芝 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2007年第6期1118-1126,共9页
【目的】建立甘蓝型油菜的高质量遗传图谱,为在分子水平上研究复杂性状打下基础并提供保证。【方法】以甘蓝型油菜自交不亲和系“SI-1300”及其恢复系“Eagle”组配得到的184个F2单株为群体,利用SRAP、SSR和AFLP标记技术构建甘蓝型油菜... 【目的】建立甘蓝型油菜的高质量遗传图谱,为在分子水平上研究复杂性状打下基础并提供保证。【方法】以甘蓝型油菜自交不亲和系“SI-1300”及其恢复系“Eagle”组配得到的184个F2单株为群体,利用SRAP、SSR和AFLP标记技术构建甘蓝型油菜遗传图谱。【结果】该图谱共包含21个连锁群,涉及137个SRAP标记、143个SSR标记和118个AFLP标记。图谱总长1949.8cM,标记间平均图距为4.9cM。以SSR标记为锚定标记,该图谱与国际标准图谱进行了初步对应。研究共发现了8个偏分离区域。【结论】根据对标记分布的均匀程度,图谱覆盖程度以及标记密度等方面的分析,本研究构建的甘蓝型油菜分子遗传图谱质量较高,并且SRAP标记可能是比AFLP标记更适合于图谱构建的标记体系。 展开更多
关键词 油菜 遗传图谱 aflp SRAP SSR
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AFLP分析中多态性扩增产物的回收、克隆及鉴定 被引量:31
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作者 李传友 伏健民 +2 位作者 金德敏 翁曼丽 王斌 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 1998年第4期1-4,共4页
本研究在摸索和优化了水稻AFLP分析体系的基础上,发展了多态性AFLP产物的高效克隆方法。特异AFLP扩增产物直接从变性聚丙烯酰胺凝胶上分离纯化,再经过一至二轮PCR扩增,即可高效地克隆于pGEM-Teasyvect... 本研究在摸索和优化了水稻AFLP分析体系的基础上,发展了多态性AFLP产物的高效克隆方法。特异AFLP扩增产物直接从变性聚丙烯酰胺凝胶上分离纯化,再经过一至二轮PCR扩增,即可高效地克隆于pGEM-Teasyvector系统中。本实验利用该方法成功地克隆了水稻温敏核不育等位突变系5460S和5460F间的4个多态性AFLP产物,Southernbloting分析证明其中3个产物在水稻基因组中为单拷贝序列,另一个为低拷贝序列。AFLP技术强有力的多态性检出能力再结合多态性扩增产物的高效克隆方法,为寻找与目标基因紧密连锁的分子标记提供了有力工具。 展开更多
关键词 水稻 aflp 分子标记
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光敏核不育水稻等位突变系的AFLP分析 被引量:25
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作者 李传友 郑洪刚 +4 位作者 翁曼丽 贾建航 牟同敏 HenryT.Nguyen 王斌 《生物工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2000年第1期91-95,共5页
通过对NK58S和NK58F这一对光敏核不育水稻等位突变系的AFLP分析,比较了AFLP,RAPD及RFLP检测DNA多态性的相对效率。结果表明,这三种分子标记的DNA多态性检出效率依次为AFLP>RAPD>RFLP;找出了水稻AFLP分析的最适反应条件;通过AFLP... 通过对NK58S和NK58F这一对光敏核不育水稻等位突变系的AFLP分析,比较了AFLP,RAPD及RFLP检测DNA多态性的相对效率。结果表明,这三种分子标记的DNA多态性检出效率依次为AFLP>RAPD>RFLP;找出了水稻AFLP分析的最适反应条件;通过AFLP和集群混合分析(Bulkedsegregatinganalysis,BSA),筛选出了一批与水稻光敏核不育(PGMS)基因连锁的多态性AFLP产物,已完成了对4个多态性AFLP产物的克隆,Southern杂交证明其中2个为单拷贝顺序,另外2个为低拷贝顺序。对上述三种分子标记各自的优缺点及它们在DNA多态性检测中的适用之处进行了分析探讨。 展开更多
关键词 aflp 水稻 多态性检测效率 光敏核不育基因
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粉蕉、大蕉和龙牙蕉的AFLP分类研究 被引量:37
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作者 易干军 余晓英 +4 位作者 霍合强 谭卫萍 黄自然 陈大成 黄秉智 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2002年第5期413-417,共5页
应用AFLP技术 ,对 32个粉蕉、大蕉、龙牙蕉品种进行了遗传多样性分析及分类研究。在分子水平上 ,可将供试品种聚为 6个独立群体 ,其中包括 3个分别由单一品种组成的群体 (群体Ⅳ :酸大蕉 ;群体Ⅴ :孟变 ;群体Ⅵ :千旁培 ) ;可以将群体... 应用AFLP技术 ,对 32个粉蕉、大蕉、龙牙蕉品种进行了遗传多样性分析及分类研究。在分子水平上 ,可将供试品种聚为 6个独立群体 ,其中包括 3个分别由单一品种组成的群体 (群体Ⅳ :酸大蕉 ;群体Ⅴ :孟变 ;群体Ⅵ :千旁培 ) ;可以将群体Ⅰ (大蕉 )和群体Ⅱ (粉蕉 )分别划分为 3个品种群 ,将群体Ⅲ (龙牙蕉 )划分为 2个品种群。参照Simmonds的形态学分类方法 ,研究结果显示粉蕉、大蕉以及龙牙蕉各个品种之间存在丰富的遗传多样性 ,将其划分为AAB或ABB等类型 ,不能反映品种间的亲缘关系 ;粉蕉与大蕉两个类群之间遗传距离差异明显 ,将其简单的归为ABB类型是不妥当的。 展开更多
关键词 粉蕉 大蕉 龙牙蕉 aflp分类 香蕉 遗传多样性
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福建官井洋大黄鱼AFLP指纹多态性的研究 被引量:86
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作者 王志勇 王艺磊 +2 位作者 林利民 邱淑贞 本信明 《中国水产科学》 CAS CSCD 北大核心 2002年第3期198-202,共5页
对福建官井洋大黄鱼(Pseudosciaenacrocea)野生种群和2个养殖群体进行5对选择性引物(共37个标本)的AFLP分析。结果表明,共检出503个不同的扩增片段(50~450bp),每对引物扩增出的片段数目为76~155个;在5对引物检出的扩增片段中,101个(20... 对福建官井洋大黄鱼(Pseudosciaenacrocea)野生种群和2个养殖群体进行5对选择性引物(共37个标本)的AFLP分析。结果表明,共检出503个不同的扩增片段(50~450bp),每对引物扩增出的片段数目为76~155个;在5对引物检出的扩增片段中,101个(20.1%)为全部37个受试个体共有,312个(62.0%)为部分野生与养殖个体共有,53个(10.5%)仅见于野生个体,37个(7.4%)仅见于养殖个体,养殖群体中出现野生种群所没有的扩增片段;野生种群、养殖1、养殖2多态片段比例分别为76.6%、70.6%、69.2%,遗传差异度分别为0.2464、0.2322、0.2299,养殖群体多态片段比例与个体间的遗传差异度均低于野生种群。养殖群体的遗传多样性水平较低,遗传变异相对贫乏。 展开更多
关键词 大黄鱼 野生种群 养殖群体 aflp 种质鉴别 指纹多态性
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用RAPD和AFLP的方法对中国卤虫 (Artemia)种及亲缘关系的研究 被引量:35
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作者 孙易 宋文芹 +2 位作者 钟贻诚 张闰生 陈瑞阳 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 2000年第3期210-218,共9页
利用RAPD(随机扩增多态DNA)和AFLP(扩增片段长度多态性)技术对不同种及种群卤虫的关系进行分析。 101个随机引物对4种卤虫Afranciscana、A urmiana、A sinica和A.parthenog... 利用RAPD(随机扩增多态DNA)和AFLP(扩增片段长度多态性)技术对不同种及种群卤虫的关系进行分析。 101个随机引物对4种卤虫Afranciscana、A urmiana、A sinica和A.parthenogenelica基因组DNA进行扩增,平均每个种获得751条带,其中458条带为多态性标记,每个引物提供平均74个标记信息,聚类结果表明A.sinica是不同于其他旧大陆两性生殖卤虫的一个独立的种。对来自 15个种及品系的卤虫的 AFLP分析显示了非常好的遗传多态性,采用 12对引物检测到 594条带,其中 480个为多态性标记。聚类结果表明来自西藏的两性生殖卤虫为不同于中国内陆两性生殖卤虫的新种。而孤雌生殖卤虫在进化过程中可能是多源的,中国内陆和沿海的孤雌生殖卤虫是沿着不同的途径进化的,内陆和沿海的孤雌生殖卤虫可能为不同的种。 展开更多
关键词 卤虫 RAPD aflp 亲缘关系
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基于AFLP分子标记的核桃核心种质的构建 被引量:28
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作者 王红霞 赵书岗 +2 位作者 高仪 玄立春 张志华 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2013年第23期4985-4995,共11页
【目的】构建核桃核心种质以便更好地保存、评价和利用丰富的核桃种质资源。【方法】利用AFLP分子标记,对131份核桃原始种质采用逐步聚类法建立候选核心种质,比较不同候选核心种质的多态性位点数、多态性位点百分率,结合形态学指标及地... 【目的】构建核桃核心种质以便更好地保存、评价和利用丰富的核桃种质资源。【方法】利用AFLP分子标记,对131份核桃原始种质采用逐步聚类法建立候选核心种质,比较不同候选核心种质的多态性位点数、多态性位点百分率,结合形态学指标及地理来源,最终确定核桃核心种质,并进行评价。【结果】建立的核桃核心种质保留了原始种质10%的样品,分别为河北的天桥1号、陕西的西洛2号和西林1号、山西的晋龙1号、山东的丰辉、辽宁的辽宁8号和辽73013、新疆的温185、河南的绿波、北京的北京746、美国引进品种维纳、日本引进品种清香和朝鲜的品种安边1号。根据遗传多样性评价结果,与原始种质相比,核心种质的多态性位点保留率为75.4%。【结论】构建的核桃核心种质能较大程度地代表原始种质的遗传信息,符合核心种质要求。 展开更多
关键词 核桃 核心种质 aflp 遗传多样性
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杧果主要品种遗传多态性的AFLP标记研究 被引量:29
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作者 雷新涛 王家保 +1 位作者 徐雪荣 林顺权 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第4期725-730,共6页
采用扩增片段长度多态性AFLP标记对国内外31个杧果主要品种进行分类与亲缘关系研究。结果表明:筛选出的14对引物组合在31份杧果种质中共扩增出了1761条带,其中多态性带的比例为97%。平均每对引物产生125·8条带和121·6条多态性... 采用扩增片段长度多态性AFLP标记对国内外31个杧果主要品种进行分类与亲缘关系研究。结果表明:筛选出的14对引物组合在31份杧果种质中共扩增出了1761条带,其中多态性带的比例为97%。平均每对引物产生125·8条带和121·6条多态性带,总的多态性带率为97%;基于AFLP标记,以0·48的相似系数为阈值,所有供试杧果材料被分为7大组群,第一组群内以0·52为阈值,又可分为6组。与形态标记相比,基于AFLP标记的杧果分类体系更能反映杧果品种间的亲缘关系。 展开更多
关键词 杧果 遗传多态性 aflp
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98份甘蔗种质资源遗传多样性的AFLP分析 被引量:41
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作者 昝逢刚 应雄美 +5 位作者 吴才文 赵培方 陈学宽 马丽 苏火生 刘家勇 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2015年第5期1002-1010,共9页
【目的】甘蔗蔗糖产量约占中国食糖总量的92%。具有遗传多样性的甘蔗种质资源是甘蔗杂交育种的基础,杂交亲本的选择和组合的选配是杂交育种成败的关键,研究98份种质的遗传多样性及亲缘关系,为甘蔗杂交组合选配和种质创新提供参考依据。... 【目的】甘蔗蔗糖产量约占中国食糖总量的92%。具有遗传多样性的甘蔗种质资源是甘蔗杂交育种的基础,杂交亲本的选择和组合的选配是杂交育种成败的关键,研究98份种质的遗传多样性及亲缘关系,为甘蔗杂交组合选配和种质创新提供参考依据。【方法】采用CTAB法提取甘蔗幼叶基因组DNA,利用扩增片段长度多态性(amplified fragment length polymorphism,AFLP)分子标记技术,对来源于10个国家的98份种质资源的基因组DNA进行酶切、连接、预扩增、选择性扩增,选择性扩增产物在5%变性聚丙烯酰胺凝胶上电泳分离,银染显色。电泳结果得到"0,1"矩阵,使用POPGENE 32软件计算每对引物的多态性条带数、多态性比率、多态信息量、有效等位基因数、遗传多样性指数等指标,同时使用NTSYS pc-V.2.1计算种质间遗传相似系数,根据相似性系数进行UPGMA(unweighted pair group method analysis)聚类分析和PCA(principal component analysis)主效应分析,对甘蔗种质资源进行分类。【结果】采用云南省甘蔗遗传改良重点实验室筛选出的10对引物组合共扩增出1 392条谱带,其中多态性条带为1 344条,多态性条带比率为96.55%,平均每对引物扩增出139.2个位点和134.4个多态性位点。98份种质的相似性系数在0.484—0.929,平均为0.734,多态信息量为0.2495,每个位点的有效等位基因数为1.4092,平均多样性指数为0.3890,遗传相似性系数最高的是KN90-418和KN90-455,达到0.929,最低的是云蔗94-375和IS76-126,为0.484。根据遗传相似性系数进行聚类分析,在遗传相似性系数0.64处切割时,可划分为4个类群,第I类群有5份澳大利亚种质,包括IK76-48、IS76-126、IK76-22、SES309和E.SARPET;第II类群有1份澳大利亚种质是IS76-199;第III类群有3份种质,包括KN93-06、90-110-9和BURMA;第IV类群有89份种质,在遗传相似性系数0.79处切割时,可将第Ⅳ类群划分为9个亚群(A、B、C、D、E、F、G、H和I)。基于Jaccard系数用PCA法对98份甘蔗种质AFLP标记结果进行主效应分析,主效应分析显示了不同种质的分类位置,分子主效应分析结果与分子聚类结果一致,集中在一个区域的种质亲缘关系较为紧密,澳大利亚种质位置较为分散,最分散材料为蔗茅属和细茎野生种。【结论】98份种质资源的遗传基础差异较小,亲缘关系较近,其中,澳大利亚种质遗传多样性相对较丰富。90-110-9、KN93-06和粤糖00-236较为特殊,在杂交组合选配中应给予重点关注。 展开更多
关键词 甘蔗 种质 aflp 遗传多样性
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AFLP和RFLP标记检测水稻亲本遗传多样性比较研究 被引量:46
15
作者 陈亮 梁春阳 +4 位作者 孙传清 金德敏 姜廷波 王斌 王象坤 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2002年第6期589-595,共7页
利用AFLP和RFLP技术对 2 0个水稻品种 (系 )进行了遗传多样性分析。在AFLP分析中 ,用 6 4对引物组合进行了初筛 ,然后用其中适合水稻的 15对引物进行了详细研究 ,每对AFLP引物组合扩增出了 4 7~ 118条带 ,其中多态性带为 5~ 32条 ,15... 利用AFLP和RFLP技术对 2 0个水稻品种 (系 )进行了遗传多样性分析。在AFLP分析中 ,用 6 4对引物组合进行了初筛 ,然后用其中适合水稻的 15对引物进行了详细研究 ,每对AFLP引物组合扩增出了 4 7~ 118条带 ,其中多态性带为 5~ 32条 ,15个引物组合共得到多态性条带 2 99条 ;在RFLP分析中 ,4 9个RFLP探针共检测出 10 7条多态性带。聚类分析表明 ,两种标记均能将 2 0个材料分成籼粳两大类群 ,但AFLP标记比RFLP标记更能反映品种间系谱亲缘和地理生态上的差异。两种标记检测出的遗传距离的趋势是一致的 ,但AFLP标记相对于RFLP而言提高了品种间的遗传距离的估计 ,降低了亚种间遗传距离的估计 ,因此 ,AFLP更适应于多样性的研究 。 展开更多
关键词 aflp RFLP标记 检测 水稻亲本 分子标记 聚类分析 遗传多样性
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中国白菜AFLP分子遗传图谱的构建 被引量:39
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作者 王美 张凤兰 +3 位作者 孟祥栋 刘秀村 赵岫云 樊治成 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2004年第1期28-33,共6页
以白菜高抗TuMV白心株系91 112和高感TuMV桔红心株系T12 91为亲本建立的小孢子DH系作为图谱构建群体,以AFLP标记来构建白菜连锁图谱。通过对64对AFLP引物组合的筛选,利用20对引物得到了263个AFLP多态性位点。经Mapmaker/EXP3.0软件处理... 以白菜高抗TuMV白心株系91 112和高感TuMV桔红心株系T12 91为亲本建立的小孢子DH系作为图谱构建群体,以AFLP标记来构建白菜连锁图谱。通过对64对AFLP引物组合的筛选,利用20对引物得到了263个AFLP多态性位点。经Mapmaker/EXP3.0软件处理,构建了1张含255个标记位点,10个连锁群,覆盖长度为883.7cM的连锁图。255个AFLP位点中偏离孟德尔遗传的比率(P<0.05)为15 0%和27 5%(P<0.01)。 展开更多
关键词 中国 白菜 aflp分子 遗传图谱 图谱构建 aflp引物
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银杏雌株种质遗传关系的AFLP分析 被引量:19
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作者 王利 邢世岩 +1 位作者 王芳 韩克杰 《林业科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2008年第4期48-53,共6页
从64对EcoRI/MseI引物(其中MseI引物为荧光标记物)中筛选出7对扩增产物多态性高、谱带清晰的引物,对来自日本、法国和中国的49个银杏雌株种质的遗传关系进行研究。结果表明:7对引物共产生1219条谱带,132个特异位点(其中缺失带11条、单态... 从64对EcoRI/MseI引物(其中MseI引物为荧光标记物)中筛选出7对扩增产物多态性高、谱带清晰的引物,对来自日本、法国和中国的49个银杏雌株种质的遗传关系进行研究。结果表明:7对引物共产生1219条谱带,132个特异位点(其中缺失带11条、单态带121条),多态带1200条,多态带的比例为98.44%;每对引物鉴别效率为100%。49个雌株种质之间相似系数为0.39~0.83,来自不同国家的雌株遗传变异程度不同。当相似系数为0.51时,供试种质可分为2类,来源地相同的种质并不单独聚成一类,山东大部分雌株种质聚为一类,它们与其他的雌株种质有显著的遗传差异,亲缘关系较远。叶籽银杏不是很原始的种质,而‘海阳’则比较原始。对雌株种质的特异位点、相似系数、聚类结果等的综合分析表明,法国的‘垂枝银杏’、日本的‘黄金丸’、中国的‘盘县1’、‘灵川’、‘安陆’、‘东安1’、‘西山大佛手’、‘荣城’、‘莒县’、‘郯城2’、‘泰安1’、‘泰安2’、‘泰安3’、‘崂山’、‘海阳’、‘灵岩’16个种质是银杏雌株中的重要特异种质。 展开更多
关键词 银杏 雌株种质 遗传关系 多态性 aflp
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龙眼品种(系)遗传多样性及亲缘关系的AFLP分析 被引量:62
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作者 易干军 谭卫萍 +3 位作者 霍合强 张秋明 李建光 周碧容 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2003年第3期272-276,共5页
选用两对引物组合EcoRⅠACT +MseⅠCTT和EcoRⅠACT +MseⅠCTC对 46份龙眼材料进行AFLP分析 ,共得到扩增位点 111个 ,其中多态性位点 10 3个 ,多态性比例达 92 6 9%,区分率达 10 0 %。对AFLP扩增结果进行聚类分析 ,根据相似系数 0 76... 选用两对引物组合EcoRⅠACT +MseⅠCTT和EcoRⅠACT +MseⅠCTC对 46份龙眼材料进行AFLP分析 ,共得到扩增位点 111个 ,其中多态性位点 10 3个 ,多态性比例达 92 6 9%,区分率达 10 0 %。对AFLP扩增结果进行聚类分析 ,根据相似系数 0 76的水平可将 46份龙眼品种 (系 )分为 11个品种群。供试各品种多态性比例介于 0 2 70 3和 0 4 95 5间。福建东壁与广东东壁应为不同品系 ;早熟一号为一个新的品系。 展开更多
关键词 龙眼 品种 遗传多样性 亲缘关系 aflp分析 扩增位点 多态性位点 区分率 相似系数
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利用AFLP鉴定柑橘变异 被引量:27
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作者 廖振坤 张秋明 +2 位作者 刘卫国 丁伟平 王春梅 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第3期486-488,共3页
利用AFLP分析鉴定了7个柑橘变异类型,从64对引物组合中筛选了8对引物组合,共得到334个扩增位点2099条带数据。7个变异类型与亲本品种之间多态性带为36至92条,变异类型的多态性带数与亲本品种总带数的比例为0.1721至0.4182。说明变异类... 利用AFLP分析鉴定了7个柑橘变异类型,从64对引物组合中筛选了8对引物组合,共得到334个扩增位点2099条带数据。7个变异类型与亲本品种之间多态性带为36至92条,变异类型的多态性带数与亲本品种总带数的比例为0.1721至0.4182。说明变异类型的遗传基础已经发生了不同程度的改变,7个柑橘变异类型应是芽变,具备了成为新品种的遗传基础,特别是红皮冰糖脐橙选育成功将填补高糖脐橙空白。研究同时表明,AFLP具有扩增谱带多,谱带清晰,扩增信息量大的特点。根据谱带位点差异即可鉴定柑橘变异是否遗传,多态性位点数也反映了性状变异程度。AFLP方法1次可同时鉴定多个变异类型,是柑橘新品种选育早期鉴定灵敏、可靠、有效的方法。 展开更多
关键词 柑橘 变异 aflp 鉴定
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用RAPD、ISSR和AFLP标记分析系谱关系明确的甘薯品种的亲缘关系 被引量:49
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作者 贺学勤 刘庆昌 +1 位作者 翟红 王玉萍 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第10期1300-1304,共5页
用RAPD、ISSR和AFLP标记对系谱关系明确的7个甘薯品种进行了亲缘关系分析。24个RAPD引物、14个ISSR引物和9对AFLP引物分别扩增出173、174和168条多态性带。3种分子标记在检测甘薯品种间遗传差异上相关程度高,其中RAPD与ISSR之间的相关... 用RAPD、ISSR和AFLP标记对系谱关系明确的7个甘薯品种进行了亲缘关系分析。24个RAPD引物、14个ISSR引物和9对AFLP引物分别扩增出173、174和168条多态性带。3种分子标记在检测甘薯品种间遗传差异上相关程度高,其中RAPD与ISSR之间的相关系数最大为0.9328。用ISSR标记估计的品种间遗传距离为0.1286~1.0932,平均0.4883.大于其余2个标记的估计值。3种分子标记皆可揭示甘薯品种的亲缘关系,其中ISSR标记产生的聚类图与系谱图最吻合,认为ISSR标记更适于分析甘薯品种的亲缘关系。 展开更多
关键词 甘薯 RAPD ISSR aflp 亲缘关系
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