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Prevalence and genetic diversity of grapevine fabavirus isolates from different grapevine cultivars and regions in China 被引量:1
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作者 FAN Xu-dong ZHANG meng-yan +3 位作者 ZHANG Zun-ping REN Fang HU Guo-jun DONG Ya-feng 《Journal of Integrative Agriculture》 SCIE CAS CSCD 2020年第3期768-774,共7页
A total of 288 grapevine samples of 61 different grapevine cultivars,collected from 22 provinces and regions,were analyzed by reverse transcription-PCR(RT-PCR) for the presence of grapevine fabavirus(GFabV).PCR detect... A total of 288 grapevine samples of 61 different grapevine cultivars,collected from 22 provinces and regions,were analyzed by reverse transcription-PCR(RT-PCR) for the presence of grapevine fabavirus(GFabV).PCR detection results showed the incidences of GFabV were 12.8%(30/235) and 48.1%(25/52) in the asymptomatic and symptomatic vines,respectively.The genetic diversity of GFabV isolates was analyzed based on partial nucleotide and encoded amino acid sequences of the RNA1 and RNA2 polyprotein genes.Phylogenetic analyses of the RNA1 and RNA2 gene sequences divided the GFabV isolates into five well-defined groups.Groups 1,2,and 4 comprised only Chinese isolates.This article represents the first report for the prevalence and genetic diversity of GFabV in grapevines grown in China. 展开更多
关键词 GFabV RT-PCR polyprotein gene phylogenetic analysis
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鸡白细胞介素2增强传染性法氏囊病病毒多聚蛋白DNA疫苗免疫原性的研究 被引量:36
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作者 于涟 李建荣 +2 位作者 黄耀伟 梁雪芽 孟松树 《生物工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2001年第6期652-657,共6页
鸡白细胞介素 2 (IL 2 )基因是新近被确定的非哺乳类IL 2基因。将鸡白细胞介素 2 (IL 2 )基因和传染性法氏囊病病毒 (IBDV)多聚蛋白基因 (VP2 VP4 VP3 )分别插入真核表达载体pCI的CMV启动子下游 ,制备DNA疫苗 ,免疫 14日龄SPF鸡 ,14d... 鸡白细胞介素 2 (IL 2 )基因是新近被确定的非哺乳类IL 2基因。将鸡白细胞介素 2 (IL 2 )基因和传染性法氏囊病病毒 (IBDV)多聚蛋白基因 (VP2 VP4 VP3 )分别插入真核表达载体pCI的CMV启动子下游 ,制备DNA疫苗 ,免疫 14日龄SPF鸡 ,14d后二免 ,二免后 3d攻击标准强毒株。结果表明共注射鸡IL 2质粒能明显增强DNA疫苗对强毒攻击 ,保护率达 80 % ;能增强DNA疫苗诱导的中和抗体效价 (P <0 0 5 ) ;能显著促进鸡胸腺、脾脏和外周血液T淋巴细胞及法氏囊B淋巴细胞增殖反应 (P <0 0 5 )。这些结果提示鸡IL 2能明显增强IBDV多聚蛋白DNA疫苗的免疫原性 ,是一种优良的禽类DNA疫苗佐剂。 展开更多
关键词 鸡白细胞介素2 IL-2 传染性法氏囊病病毒 多聚蛋白基因 DNA疫苗 免疫原性
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重庆中华蜜蜂囊状幼虫病病毒多聚蛋白基因分子特性分析 被引量:4
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作者 沈克飞 曹兰 +3 位作者 郑华 杨柳 张邑帆 张素辉 《昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第9期959-965,共7页
【目的】分析地处中国南方的重庆地区中华蜜蜂Apis cerana cerana(简称"中蜂")囊状幼虫病病毒(sacbrood virus,SBV)(Ac SBV-S.Chn-CQ)的遗传特性。【方法】采用RT-PCR法对采自重庆23个区县的阳性中蜂幼虫进行SBV多聚蛋白基因... 【目的】分析地处中国南方的重庆地区中华蜜蜂Apis cerana cerana(简称"中蜂")囊状幼虫病病毒(sacbrood virus,SBV)(Ac SBV-S.Chn-CQ)的遗传特性。【方法】采用RT-PCR法对采自重庆23个区县的阳性中蜂幼虫进行SBV多聚蛋白基因扩增、序列测定和序列分析,采用邻接法(neighbor-joining method)基于基因组和基因组片段SB11-SB12构建系统进化树,使用RDP3检测SBV的基因重组。【结果】Ac SBV-S.Chn-CQ与中国南方中蜂SBV(Ac SBV-S.Chn)其他分离株、越南北部东方蜜蜂A.cerana SBV(Ac SBV-N.Vie)、越南北部西方蜜蜂A.mellifera SBV(Am SBV-N.Vie)、韩国东方蜜蜂SBV(Ac SBV-S.Kor)的同源性较高。Ac SBV-S.Chn-CQ在结构蛋白编码区域存在连续51个核苷酸缺失,在非结构蛋白编码区域有3个不连续的核苷酸缺失,与Ac SBV-N.Vie,Am SBV-N.Vie和Ac SBV-S.Kor核苷酸缺失相同。Ac SBV-S.Chn-CQ与Ac SBV-S.Chn-FZ,Ac SBV-N.Vie,Am SBV-N.Vie和Ac SBV-S.Kor在亚洲基因型中形成一亚型,亚型内检测到重组事件。【结论】推测Ac SBV-S.Chn-CQ与SBV-N.Vie和Ac SBVS.Kor可能来自一个共同祖先。 展开更多
关键词 中华蜜蜂 囊状幼虫病病毒 多聚蛋白基因 核苷酸缺失 系统进化
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一步法克隆传染性法氏囊病病毒前体多聚蛋白基因 被引量:1
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作者 刘存仁 梁志清 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2001年第2期180-182,共3页
Very virulent infectious bursal disease virus(vvIBDV)was isolated from chicken bursa and then the virus double stranded RNA was extracted After denaturation of dsRNA by heat in the presence of primers,the cDNA was syn... Very virulent infectious bursal disease virus(vvIBDV)was isolated from chicken bursa and then the virus double stranded RNA was extracted After denaturation of dsRNA by heat in the presence of primers,the cDNA was synthesized by use of a reverse transcriptase lacking RNase H activity The RNA component of RNA cDNA hybrids was digested by RNase H By using an optimized PCR,a 3 05kb DNA fragment coding for precursor polyprotein of IBDV was produced in one step,which was inserted into pcDNA3 1(+) vector Two recombinant plasmids (pPP1 and pPP2)were screened and identified from eight XL1 blue colonies Partial sequencing for pPP1 plasmid indicated that the precursor polyprotein gene for IBDV was cloned successfully The method can simplify greatly the procedure to clone precursor polyprotein gene of IBDV 展开更多
关键词 传染性法氏囊病病毒 前体多聚蛋白 基因 克隆
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鸭肝炎病毒GD-B株生物学特性测定及多聚蛋白基因序列分析
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作者 黄良宗 刘鳗仪 +2 位作者 王淑敏 司兴奎 顾万军 《动物医学进展》 CSCD 北大核心 2011年第11期58-60,共3页
根据Ⅰ型鸭肝炎病毒(DHV-Ⅰ)基因组序列设计并合成引物,通过RT-PCR方法分段扩增鸭肝炎病毒GD-B株多聚蛋白基因并克隆测序,构建多聚蛋白核苷酸系统进化树,并测定GD-B株部分生物学特性。结果表明,GD-B株多聚蛋白基因核苷酸序列与DHV-Ⅰ型G... 根据Ⅰ型鸭肝炎病毒(DHV-Ⅰ)基因组序列设计并合成引物,通过RT-PCR方法分段扩增鸭肝炎病毒GD-B株多聚蛋白基因并克隆测序,构建多聚蛋白核苷酸系统进化树,并测定GD-B株部分生物学特性。结果表明,GD-B株多聚蛋白基因核苷酸序列与DHV-Ⅰ型GFS99广东株同源性最高(99.5%),属Ⅰ型鸭肝炎病毒,其EID50为10-4.62/0.2mL,LD50为10-4.13/0.3mL,与标准DHV-Ⅰ中和指数为23,提示GD-B株发生了抗原变异。 展开更多
关键词 鸭肝炎病毒 生物学特性 多聚蛋白基因 序列分析
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南极eelpout(Lycodichthys dearborni)多聚体Ⅲ型抗冻蛋白基因的克隆及进化分析 被引量:4
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作者 於静 Chi Hing C.Cheng +1 位作者 Arthur L.DeVries 陈良标 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2005年第8期789-794,共6页
冰冻海洋中生存的南极eelpout(Lycodichthysdearborni)体内能合成高浓度的Ⅲ型抗冻蛋白(AFPⅢ)。为了寻找新的AFPⅢ基因,构建了L.dearborni肝脏cDNA文库。通过斑点杂交筛选此文库,发现一个2.87kb 的cDNA克隆,LD12。序列分析采用DNAssist... 冰冻海洋中生存的南极eelpout(Lycodichthysdearborni)体内能合成高浓度的Ⅲ型抗冻蛋白(AFPⅢ)。为了寻找新的AFPⅢ基因,构建了L.dearborni肝脏cDNA文库。通过斑点杂交筛选此文库,发现一个2.87kb 的cDNA克隆,LD12。序列分析采用DNAssist2.0和ClustalX1.8软件。结果显示,LD12分子由12个串联重复的片段构成,每一个片段编码一个61个氨基酸(aa)的Ⅲ型抗冻蛋白分子和一个9aa的连接子。这是第一次在合成AFPⅢ的极地鱼类中发现这样的多聚蛋白结构基因。有趣的是,组成、结构和起源都不相同的抗冻糖蛋白AF GP,其基因也呈现类似的多聚蛋白结构的现象。因此,这种独特的多聚基因结构可能是鱼类基因组在适应极端寒冷的环境中采取的一种普遍方式。 展开更多
关键词 南极eel pout Ⅲ型抗冻蛋白 串联重复 多聚体蛋白基因 基因家族进化
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IBDV VP2/4/3-ChIL-2融合基因真核表达载体的构建及其在Vero细胞中的表达 被引量:1
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作者 万旺军 谢荣辉 +2 位作者 李龙 许健 于涟 《浙江大学学报(农业与生命科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2005年第3期255-262,共8页
构建含有传染性法氏囊病病毒(InfectiousBursalDiseaseVirus,IBDV)VP2/4/3和鸡白细胞介素2(ChickenInterleukin2,ChIL2)融合基因的真核表达载体pCIVP2/4/3IL2、pCIIL2VP2/4/3,并在Vero细胞中进行表达.应用重叠延伸剪切技术(splicingbyov... 构建含有传染性法氏囊病病毒(InfectiousBursalDiseaseVirus,IBDV)VP2/4/3和鸡白细胞介素2(ChickenInterleukin2,ChIL2)融合基因的真核表达载体pCIVP2/4/3IL2、pCIIL2VP2/4/3,并在Vero细胞中进行表达.应用重叠延伸剪切技术(splicingbyoverlappingextension),分别经3次PCR获得融合基因片段VP2/4/3IL2、IL2VP2/4/3,定向插入真核表达载体pCI中,获得重组质粒pCIVP2/4/3IL2、pCIIL2VP2/4/3,在脂质体介导下,分别转染Vero细胞.RTPCR检测证实导入的外源基因在Vero细胞中得到了转录;间接免疫荧光试验(IFA)和Westernblot检测证实重组质粒在Vero细胞中正确表达了插入的外源基因编码的融合蛋白,且表达的融合蛋白具有免疫反应性.重组真核表达载体pCIVP2/4/3IL2、pCIIL2VP2/4/3的成功构建及其在Vero细胞中的有效表达,为进一步探讨ChIL2作为分子免疫佐剂对IBDVDNA疫苗的特异性免疫增强作用奠定了基础. 展开更多
关键词 传染性法氏囊病病毒 多聚蛋白 鸡白细胞介素2 融合基因 真核表达
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西方蜜蜂囊状幼虫病病毒云南毒株的多聚蛋白基因扩增及序列分析
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作者 曹兰 沈克飞 +4 位作者 王瑞生 张邑帆 高丽娇 张祖芸 曹联飞 《中国生物制品学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2021年第6期688-693,共6页
目的扩增云南地区西方蜜蜂(Apis mellifera)自然感染囊状幼虫病病毒(sacbrood virus,SBV)的多聚蛋白(polyprotein)基因,并进行序列分析。方法采用RT-PCR方法分别从云南3份感染SBV的西方蜜蜂幼虫样本中扩增SBV的多聚蛋白基因,进行序列测... 目的扩增云南地区西方蜜蜂(Apis mellifera)自然感染囊状幼虫病病毒(sacbrood virus,SBV)的多聚蛋白(polyprotein)基因,并进行序列分析。方法采用RT-PCR方法分别从云南3份感染SBV的西方蜜蜂幼虫样本中扩增SBV的多聚蛋白基因,进行序列测定、拼接、序列比对、基因重组及分子进化分析。结果通过序列拼接得到3条云南西方蜜蜂的SBV(AmSBV-YN)序列,占SBV基因组长度的97%,包含完整的多聚蛋白基因。3条AmSBV-YN序列间的同源性大于99%,与GenBank上已知SBV序列的同源性为91%~93%。AmSBV-YN与韩国西方蜜蜂的SBV(AmSBV-Kor)_KP296800可能在5′端发生重组。多聚蛋白基因构建的进化树显示,AmSBV-YN单独构成云南基因型,在RNA依赖的RNA聚合酶(RNA-dependent RNA polymerase,RdRp)基因进化树中显示,AmSBV-YN与其他感染中国西方蜜蜂的SBV(AmSBV-Chn)聚集成云南基因型。结论成功扩增出SBV云南毒株的多聚蛋白基AmSBV-YN,SBV具有丰富的遗传多样性,AmSBV-YN可能是感染我国西方蜜蜂SBV的代表株。 展开更多
关键词 蜜蜂 囊状幼虫病病毒 多聚蛋白基因 同源性 进化树
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