牛POMC基因多态性及其与南阳牛生长性状的相关分析

为研究阿片黑皮质素前体（POMC）在动物采食和能量平衡调控中发挥重要作用，文章采用PCR—SSCP结合DNA测序方法，对秦川牛、南阳牛、郏县红牛、晋南牛、鲁西牛、安格斯牛和荷斯坦奶牛共计480头个体POMC基因的多态性进行研究，并分析了多态位点与南阳牛生长性状的相关性。结果表明，牛POMC基因3个位点中，在3’侧翼区P3位点新发现3个连锁存在的SNP（811845C〉T、811821T〉C和811797A〉G与NW_928357对照）。POMC基因3’侧翼区多态位点与南阳牛6月龄体重和0-6月龄平均日增重显著相关，BB型个体显著大于AA型（P〈0．05）。

关岭黄牛POMC基因多态性及其与生长性状的关联性分析

为研究阿片黑皮质素前体(POMC)在动物采食和能量平衡中的作用,采用DNA测序技术,对关岭黄牛92头个体的POMC基因的多态性进行研究,并分析多态位点与关岭黄牛生长性状的相关性。结果表明:在扩增片段为870 bp的产物中,发现位点138,430,644,668 C→T突变,位点693 A→G突变。多态性结果显示,除430 C→T突变位点处于哈代-温伯格不平衡状态(HWE)(P<0.05),其余突变位点均处于HWE平衡状态(P>0.05),5个突变位点的多肽信息含量(PIC)均为中度多态。相关性分析结果表明,644 C→T和668 C→T突变位点的不同基因型与关岭黄牛体斜长表现出差异性显著。

刀鲚POMC基因的cDNA克隆及其应激应答

为了研究刀鲚(Coilia nasus)阿黑皮素原(proopiomelanocortin,POMC)基因的应激应答及调控,克隆了刀鲚POMC基因的c DNA全长。刀鲚POMC基因的c DNA全长2030 bp,编码区699 bp,编码232个氨基酸。二级结构预测显示,刀鲚POMC包括信号肽(signal peptide)、N末端区(N-terminal region,NPP)、促肾上腺皮质激素结构域(adrenocorticotropic hormone,ACTH)、β-脂解素(β-LPH)、α-促黑素(α-MSH)、促肾上腺皮质激素样垂体中叶多肽(CLIP)、γ-脂解素(γ-LPH)、β-促黑素(β-MSH)和β-内咖肽(β-EP)结构域。运用荧光定量的方法检测了该基因在刀鲚不同组织中的表达分布。结果显示,POMC在健康刀鲚的脑高表达,鳃、肾、精巢相对高表达,肝、脾、肠、头肾、肌肉和卵巢中微量表达。运输胁迫后,POMC基因的表达量显著下降(P<0.05);10‰ NaCl组4 h和6 h POMC基因的表达量显著上调(P<0.05),6 h的表达量恢复至应激前。POMC基因在脂肪代谢及应激调控中发挥重要的功能,本研究结果可为该基因在刀鲚后续育种及应激调控工作提供重要基础。

4个不同地理群体中华鳖pomc基因PCR-RFLP分析

为探讨不同地理群中华鳖的pomc基因的多态性,建立区分中华鳖不同地理群的分子遗传标记,采用PCR-RFLP的方法扩增得到4个不同地理群(太湖鳖群体、沙鳖群体、台湾鳖群体和黄河鳖群体)中华鳖的pomc基因,比较4个地理群中华鳖的pomc基因的同源性,构建遗传进化树,对其亲缘关系进行分析,并用AccⅡ、BscBⅠ、AsuⅠ和TscⅠ4种限制性内切酶对pomc基因进行酶切分析。结果显示:4个不同地理群的中华鳖均能扩增出786 bp的pomc基因。亲缘关系分析表明:在遗传上台湾鳖和沙鳖亲缘关系较近,而太湖鳖与黄河鳖亲缘关系较近。用酶切分析pomc基因扩增产物,结果表明:用AccⅡ内切酶对4种中华鳖pomc基因进行酶切,其中沙鳖切出303 bp和483 bp 2个条带,而其他3个种属的中华鳖只有1个786 bp的条带。用BscBⅠ酶对4种中华鳖pomc基因进行酶切,其中台湾鳖和沙鳖切出351 bp和435 bp 2个条带,而其他2个种属的中华鳖只有1个786bp的条带。用AsuⅠ酶对4种中华鳖pomc基因进行酶切,其中台湾鳖和黄河鳖切出349 bp和437 bp 2个条带,而其他2个种属的中华鳖只有1个786 bp的条带。用TscⅠ酶对中华鳖pomc基因进行酶切,其中黄河鳖和太湖鳖切出349 bp和437 bp 2个条带,而其他2个种属的中华鳖只有1个786 bp的条带。这4个限制性内切酶的联合使用分析,可使这4个地理群的中华鳖在分子水平都得到明确的鉴定。从这4个地理群的中华鳖pomc基因核苷酸序列的显著差异和酶切位点的变化,进一步证明pomc基因可以作为区分这4个不同地理群中华鳖的分子遗传标记。

水貂阿片黑皮质素前体POMC基因SNPs检测及其与生长性状的关联分析

检测阿片黑皮质素前体基因部分外显子区单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphisms,SNPs)在不同水貂品种中的分布,探讨该基因SNPs与水貂生长性状的相关性.以咖啡水貂和红眼白水貂共计179个样本的血液基因组DNA为模板,采用PCR扩增及直接测序技术对POMC基因SNPs进行检测,并将变异位点与水貂体重、体长进行关联分析.引物P1扩增片段存在g.171A>G、g.470T>G 2个SNPs;引物P2扩增片段存在g.514C>T 1个SNPs.3个SNPs在2个水貂品种中表现为中度多态(0.25<PIC<0.50),且均处于Hardy-Weinberg平衡状态.关联分析表明,g.171A>G位点与咖啡水貂体重显著相关(P<0.05);g.470T>G位点与咖啡水貂体长显著相关(P<0.05),与红眼白水貂体重显著相关(P<0.05);g.514C>T位点与红眼白水貂体长显著相关(P<0.05).POMC基因可能是影响水貂生长性状的关键基因.

4个不同地理种群中华鳖POMC基因全长cDNA克隆及其序列分析

为探讨中华鳖不同地理种群的POMC基因的多态性,建立区分中华鳖不同地理种群的分子遗传标记,采用RT-PCR的方法扩增得到4个不同地理种群(太湖鳖种群、沙鳖种群、台湾鳖种群和黄河鳖种群)中华鳖的POMC基因,对该基因进行克隆及序列测定,并对所测序列进行比较,分析其SNP位点,并对所得的SNP位点进行验证。结果显示:4个不同地理种群中华鳖所扩增的POMC基因的核苷酸序列均为786bp;以megalign软件比较分析4个不同地理种群中华鳖的POMC基因,发现该序列中共有15个多态性核苷酸位点,经过验证,第129位核苷酸的变异为台湾鳖种群不同于其他种群的变异,第441位核苷酸变异为太湖鳖种群不同于其他种群的变异,第168和396位核苷酸为黄河鳖种群不同于其他种群的变异,第531和618位核苷酸为沙鳖种群不同于其他种群的变异。结果表明,中华鳖的POMC基因存在多态性,不同地理种群中华鳖POMC基因均有各自特异的核苷酸序列,可以作为区分中华鳖的不同地理种群的分子遗传标记。

垂体内外POMC基因表达调控研究进展

综述了阿片黑素促皮质激素原 (POMC)基因表达调控及其组织细胞特异性表达的分子基础。研究表明POMC基因上游启动子不同长度及其不同调控元件的活性是其能否表达的根源 ,而细胞外因子和细胞内的传导介质、转录因子的作用 ,是POMC基因在不同组织细胞中特异表达的主要原因。这对了解内分泌激素的表达机制有较大帮助。

牦牛POMC基因的克隆及生物信息学分析

为探讨工布江达牦牛POMC基因的分子结构特征,通过分子克隆技术获得工布江达牦牛POMC基因全序列,采用生物信息学方法对该基因及其编码蛋白的基本理化性质、疏水性、信号肽、二级结构等进行预测与分析。结果表明,工布江达牦牛POMC基因包含1个798bp的开放阅读框,编码265个氨基酸,其编码蛋白属于亲水性蛋白,具有明显的信号肽,二级结构主要以无规卷曲和α-螺旋为主。以POMC基因构建的邻接系统发育树表明,工布江达牦牛POMC与野牦牛、普通黄牛、水牛和羊等品种的POMC遗传距离较近,具有高度同源性。

多浪羊POMC基因克隆及其在初情期不同组织中的表达研究

【目的】研究POMC基因在绵羊初情期时不同组织的表达水平及规律。【方法】对多浪羊进行初情期发情鉴定,采集初情期下丘脑、垂体、卵巢、输卵管、子宫、脾、肺、肾和大脑9种组织,提取其组织RNA,对POMC基因进行cDNA克隆和组织表达分析;对多浪羊POMC氨基酸与其他物种POMC氨基酸序列进行比较,制作系统发育树;应用qPCR技术检测POMC基因在下丘脑、垂体、卵巢、输卵管和子宫5种组织中的表达水平。【结果】获得多浪羊POMC基因两条cDNA序列,长度分别为1 078、1 108 bp,两条cDNA序列编码区(CDS)相同,均为792 bp,编码263个氨基酸。同源性比对分析得出多浪羊POMC氨基酸序列与绵羊、牛、山羊的同源性分别为99.62%、96.6%、96.3%,与猪、马、人的同源性分别为89.51%、83.08%、79.78%。qPCR和组织表达谱分析结果表明POMC基因在9种组织均有表达,其中在垂体和下丘脑中表达量比较高,显著高于其他组织(P<0.05)。【结论】试验结果对于进一步探索POMC基因与绵羊初情期之间的关系提供了理论依据。

贵州关岭黄牛POMC基因多态性分析

为研究阿片黑皮质素前体(POMC)在动物采食和能量平衡中的作用,本研究采用DNA测序技术,对关岭黄牛92头个体的POMC基因的多态性进行研究。结果表明,在扩增片段为870 bp的产物中,发现138C>T,430C>T,644C>T,668C>T,693A>G 5个突变位点。多态性结果显示,除430C>T突变位点处于哈代-温伯格不平衡状态(HWE)(P<0.05),其余突变位点均处于HWE平衡状态(P>0.05),5个突变位点的多肽信息含量(PIC)均为中度多态。

POMC基因5′上游近端片段的转录调控作用初探

目的 建立阿片黑皮质素原 (POMC)基因 5′上游近端转录调控体系并初步探讨其作用特点。方法 采用 DNA重组技术构建一系列受大鼠 POMC基因 5′上游近端不同长度片段介导的荧光素酶报告基因质粒 ,以lipofectam ine 包裹质粒转染垂体 ACTH瘤细胞系 (At T2 0 ) ,然后测定荧光素酶活性。结果 成功地构建了含POMC基因 - 34 / +6 3bp、- 16 5 / +6 3bp、- 32 3/ +6 3bp和 - 480 / +6 3bp片段的 4种报告基因质粒 ,其荧光素酶相对表达活性分别为 1、2 .1± 0 .3、3.3± 0 .3和 3.7± 0 .5 ,阳性对照为 4.8± 0 .8。结论 POMC基因的核心启动子比较弱 ,提示 POMC基因可能存在多个转录起始位点 :At T2 0细胞中 POMC基因持续表达的近端组织特异性调控元件主要集中于 - 34 / - 16 5 bp范围内。

贵州黄牛POMC基因多态性检测

为了研究阿片黑皮质素前体(POMC)在动物采食和能量平衡中的作用,试验采用DNA测序技术对92头贵州黄牛个体POMC基因的多态性进行研究。结果表明:在扩增片段为870 bp的产物中发现138 C>T、430 C>T、644 C>T、668C>T、693A>G 5个突变位点。多态性结果表明,除430C>T突变位点处于Hardy-Weinberg不平衡状态(P<0.05)外,其余突变位点均处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05),5个突变位点的多肽信息含量(PIC)均为中度多态。

湖羊POMC基因多态性及其生长性状的关联分析

为了解阿黑皮素原(POMC)基因遗传多态性对湖羊生长性状的影响,笔者以100只湖羊为研究对象,采用PCR技术Sanger直接测序法对POMC候选基因进行单核苷酸多态性(SNP)检测。利用SPSS19.0软件分析POMC基因多态性与湖羊体重指标及4月龄体尺指标的关联性。结果发现,在湖羊POMC基因第2外显子(g.179)处检测到T/C突变,存在3种基因型,TT型占48%、TC型占40%、CC型最少占12%,TT为优势基因型;T和C基因频率分别为68%和32%,说明T为优势等位基因。通过POPGEN软件计算,POMC基因在湖羊群体中的遗传杂合度(He)较高,多态信息含量(PIC)为中度多态(0.250.05)。该研究结果表明,POMC基因第2外显子(g.179)T/C突变位点与湖羊生长性状相关,C等位基因对湖羊的体重及体尺性状影响最大。本研究为湖羊生长性状的改良和有效遗传标记基因的筛选提供了参考依据。

吗啡依赖和戒断大鼠行为及垂体阿黑皮源基因表达

目的 :结合行为学观察从分子水平上研究吗啡依赖和戒断机理及丁丙诺啡对吗啡戒断的影响。方法 :观察吗啡戒断大鼠的戒断体征及条件性位置偏爱情况 ;利用核酸分子杂交技术研究其垂体阿黑皮源 ( POMC)基因表达的变化。结果 :停用吗啡后 ,大鼠条件性位置偏爱的消失迟于戒断体征 ,吗啡依赖及戒断时垂体 POMC m RNA含量下降。结论 :垂体

前体基因阿片促黑素原基因在功能性肾上腺瘤旁组织中的表达及其意义

目的 检测肾上腺内前体基因阿片促黑素原(POMC)基因编码促肾上腺皮质激素(ACTH)的序列在功能性肾上腺瘤周围组织中的表达。方法 检测3 5例皮质醇瘤、3 1例原醛瘤瘤组织和瘤旁组织ACTH的表达,逆转录 聚合酶链反应(RT PCR)半定量检测编码ACTH的POMC基因的表达量,并测定其序列与Genebank中该基因进行同源性比较分析。结果 肾上腺皮质醇瘤瘤旁组织和瘤组织ACTH表达率分别为91.4%和17.1% ,肾上腺原醛瘤瘤旁组织和瘤组织ACTH表达率分别为90 .3 %和16.1% ,差异有统计学意义(P <0 .0 5 ) ;其前体基因POMCmRNA在皮质醇瘤周围和瘤组织表达分别为1.0 2±0 .10和0 .76±0 .0 3 ,原醛瘤瘤旁组织与瘤组织表达分别为0 .83±0 .0 6和0 .3 5±0 .0 1,差异有统计学意义(P <0 .0 5 ) ;肾上腺内编码ACTH的POMC基因序列与Genebank中完全相同。