Translocation of Biopolymer Chain Through a Nanopore： Coil-Helix Transition

The translocation dynamics of a single biopolymer chain through a nanopore in a membrane is investigated by taking the coil-helix transition into account. Based on the changing of the free energy due to the coil-helix transition, the mean first passage time T is obtained, and then the corresponding numerical simulations are presented under different conditions. It is shown that the coil--helix transition can significantly shorten the translocation time of the biopolymer chain. In addition, we also discuss the scaling behaviour for T with the chain length N and some related problems.

TREM2缺失加重小鼠肺缺血再灌注损伤的机制研究

目的:探讨2型髓系细胞触发受体(TREM2)对肺缺血再灌注损伤(LIRI)的影响及其可能的调控机制。方法:将C57BL/6J雄性小鼠(WT)及TREM2敲除鼠(TREM2 KO)各12只,随机分成WT小鼠假手术组(WT组)、TREM2 KO小鼠假手术组(TREM2 KO组)、WT小鼠LIRI组(WT+LIRI组)、TREM2 KO小鼠LIRI组(TREM2 KO+LIRI组),每组6只。WT+LIRI组和TREM2 KO+LIRI组采用夹闭左肺肺门1 h,再灌注24 h的方法制备小鼠LIRI模型,WT组和TREM2 KO组仅开胸不夹闭肺门;通过蛋白免疫印迹(western blotting)、免疫荧光、实时荧光定量PCR(RT-qPCR)、苏木精—伊红(HE)染色、测定肺湿干质量比值(W/D)实验,评价敲除TREM2对小鼠肺缺血再灌注后组织损伤、炎症反应以及肺内巨噬细胞焦亡情况的影响。结果:TREM2敲除明显加重了LIRI后肺组织形态学改变,增加肺损伤评分(P<0.05),升高肺组织湿干质量比值(P<0.05),促进肺组织炎症因子白细胞介素-1β(IL-1β)和白细胞介素-18(IL-18)表达(P<0.05),增加LIRI后肺组织巨噬细胞焦亡标志物天冬氨酸特异性半胱氨酸蛋白酶-1(caspase-1)和成孔蛋白Gasdermin-D(GSDMD)表达(P<0.05)。结论:TREM2敲除加重LIRI,其机制可能与TREM2缺失引发caspase-1介导的肺内巨噬细胞焦亡有关。

琼脂糖－DEAE离子交换介质的配基密度和孔径对BSA吸附的影响

离子交换色谱是蛋白质分离纯化的有效方法之一,配基密度和介质孔径是影响蛋白质吸附的关键因素。采用3种不同琼脂糖浓度的凝胶为基质,具有不同的平均孔径,分别偶联上阴离子交换配基DEAE,通过调控反应条件,包括反应温度、反应时间、碱浓度和DEAE浓度,得到了不同配基密度和介质孔径的系列DEAE离子交换介质。考察了牛血清白蛋白(BSA)的静态和动态吸附性能,发现随配基密度增加或介质孔径减小,BSA饱和吸附容量有所增大;对于吸附动力学,介质孔径显著影响有效扩散系数。结果表明,配基密度和介质孔径共同决定了蛋白质的吸附性能,介质孔径主导蛋白质的孔内扩散,而配基密度则影响配基-蛋白质间的相互作用。

湖泊沉积物中蛋白质和氨基酸的动态变化

测定了阿哈湖和百花湖沉积物孔隙水中蛋白质和氨基酸的含量。蛋白质含量分别在 0 .3 2～ 1 .71mg/ml和 0 .2 2～ 1 .3 8mg/ml之间 ,氨基酸含量分别在 1 .1 5～ 5.0 1 μg/ml(以含N量计 )和1 .4 1～ 4 .1 6μg/ml之间。两湖沉积物蛋白质含量峰出现在表层 1 0cm内 ,说明表层沉积物有利于蛋白质的释放。从悬浮层到表层 6或 7cm的沉积物氨基酸含量逐渐增高 ,表明扩散作用的存在。随着时间的推移 ,蛋白质在沉积物各层中得到了很好的保存 ,说明它的分解比较有限。沉积物孔隙水中氨基酸含量和微生物活动有关 ,氨基酸在2 7cm以后的阿哈湖沉积物中明显积累 。

硫辛酸对2型糖尿病肾病患者氧化应激、足细胞指标和炎性因子水平的影响

目的观察2型糖尿病肾病患者应用硫辛酸治疗后氧化应激和足细胞标志蛋白(PCX)、明胶酶相关载脂蛋白(NGAI)、足细胞裂孔膜蛋白(nephrin)水平的变化。方法选取2016年3月—2019年3月河北大学附属医院肾内二科诊治2型糖尿病肾病患者80例作为研究对象,应用奇、偶数法分为2组。对照组40例予常规药物方案治疗,观察组40例在对照组治疗方案基础上予以硫辛酸治疗,比较2组PCX、NGAI、nephrin水平以及肾功能指标、氧化应激指标、炎性因子水平差异。结果治疗后,观察组血清肌酐(SCr)和尿白蛋白排泄率(UAFR)低于对照组(t=5.583、19.738,P均=0.000);F2-异前列腺素类化合物(PGF2)、丙二醛(MDA)、硝基酪氨酸(NT)水平低于对照组(t=29.316、35.976、9.125,P均=0.000);治疗后2组PCX和nephrin均升高,NGAI均降低,且观察组升高/降低幅度大于对照组(t=4.339、8.102、13.440,P均=0.000);治疗后2组高敏C反应蛋白(hs-CRP)、肿瘤坏死因子-α(TNF-α)、白介素-6(IL-6)水平均降低,且观察组低于对照组(t=6.010、8.751、3.835,P均=0.000)。结论2型糖尿病肾病患者在接受常规方案治疗的同时辅以硫辛酸治疗,能够促进肾功能恢复,减轻氧化应激反应、炎性反应及足细胞损伤,效果显著。

铜绿假单胞菌碳青霉烯耐药的机制研究

目的分析159株临床分离的非重复碳青霉烯耐药铜绿假单胞菌对抗菌药物的耐药性,探究体外联合药敏试验对碳青霉烯耐药铜绿假单胞菌表现不同作用的机制。方法收集来自不同患者的铜绿假单胞菌159株,亚胺培南及美罗培南耐药。采用三维水解试验检测β-内酰胺酶、聚合酶链式反应(PCR)等方法检测多重耐药菌可能存在的耐药机制。结果 159株临床分离的非重复碳青霉烯耐药铜绿假单胞菌,通过三维实验检测,其中15株产MBL、13株产AmpC酶。体外联合药物敏感试验,加入MC-207,110后约38%的菌株对碳青霉烯类抗生素的MIC下降4个梯度。检测试验菌株,21株携带IMP基因,18株携带ampC基因;检测OprD2通道蛋白,159株中约有48%的菌株OprD2丢失。结论北京友谊医院碳青霉烯耐药铜绿假单胞菌对碳青霉烯类抗生素耐药的主要原因不是IMP、AmpC水解酶;碳青霉烯耐药铜绿假单胞菌对碳青霉烯类抗生素耐药的重要原因可能是外排泵及外膜孔道蛋白。

细胞凋亡机制研究进展

细胞凋亡是细胞生命活动中的基本现象,是当今生命科学研究的热点。文章通过检索国内外主要数据库,对细胞死亡受体途径、线粒体途径及交织旁路途径进行简要综述。文章可为后续该领域研究提供借鉴,更好的解决实际问题。

Nup88在结直肠癌组织中的表达及意义

目的研究核孔蛋白复合体蛋白88(Nup88)蛋白和mRNA在结直肠癌组织中的表达及其与临床病理特征的关系。方法免疫组化方法检测181例结直肠癌标本、18例淋巴结转移癌及84例匹配的癌旁无瘤黏膜组织中Nup88蛋白表达;RT-PCR法检测Nup88 mRNA在29例结直肠癌标本及配对的癌旁2 cm组织、切缘黏膜中的表达水平。结果结直肠癌组织和淋巴结转移癌中Nup88蛋白阳性率均高于癌旁无瘤黏膜组织(P<0.01);Nup88蛋白的表达与结直肠癌组织分化程度有关。Nup88 mRNA在肿瘤组织中的表达水平高于癌旁无瘤黏膜和切缘黏膜(P均<0.01)。结论 Nup88蛋白及mRNA与结直肠癌的发生发展有关,其蛋白表达可作为评估结直肠癌生物学行为的指标之一。

蛋白质入核转运的机制和研究进展

细胞核膜是由外膜和内膜组成的磷脂双分子层结构,同时镶嵌一些核孔复合体(NPC).核孔复合体是胞浆和胞核之间主动和被动转运的生理屏障.核内功能蛋白在胞浆内合成后通过核孔复合体进入胞核,这个过程除了需要NPC上核孔蛋白、胞浆内核转运受体和RanGTP等蛋白的参与外,货物蛋白本身的结构特征在其入核转运过程中亦发挥重要作用.本文着重就蛋白入核转运的机制及近年来取得的相关进展进行综述.

吸附密度对蛋白质在离子交换吸附剂中孔扩散系数的影响

通过间歇吸附动力学实验 ,采用孔扩散模型研究了牛血清白蛋白和γ 球蛋白在阴离子交换剂中的扩散行为 ,考察了蛋白质初浓度和平均吸附密度对孔扩散系数的影响 .结果表明 ,随蛋白质初浓度和平均吸附密度增大 ,孔扩散系数均呈指数下降 。

碳青霉烯耐药的铜绿假单胞菌的耐药性研究

目的分析159株临床分离的非重复碳青霉烯耐药铜绿假单胞菌对抗菌药物的耐药性;为临床合理联合应用抗菌药物治疗碳青霉烯耐药铜绿假单胞菌感染提供实验室证据。方法收集2010年5月至2011年5月,首都医科大学附属北京友谊医院临床检验中心细菌室分离的来自不同患者的铜绿假单胞菌159株。测定单药的最低抑菌浓度(MIC),测定联合用药的MIC,计算部分抑菌指数(FIC),判断药物组合的效应。结果 159株临床分离的非重复碳青霉烯耐药铜绿假单胞菌,单药MIC显示铜绿假单胞菌对于美国临床实验室标准化委员会2010推荐和临床常用抗菌药物敏感率低,呈现多重耐药表型。不同药物组合对于碳青霉烯耐药铜绿假单胞菌的作用也有很大差异。全部菌株在亚胺培南单药耐药的情况下,亚胺培南+妥布霉素表现出53.3%的相加作用,美罗培南+妥布霉素的相加作用与此类似,接近50%。结论碳青霉烯耐药的铜绿假单胞菌通常情况下也会对头孢菌素类、β-内酰胺/β-内酰胺酶抑制剂、氨基糖甙类、氟喹诺酮类等产生多重耐药性。对于碳青霉烯耐药的铜绿假单胞菌,三代头孢菌素联合氨基糖甙类体外实验表现出较高比率的协同作用。

Nup88和PINCH在结直肠癌中表达的关系

目的:探讨核孔蛋白复合体蛋白(Nup88)和PINCH mRNA在结直肠癌组织和肿瘤细胞株中的表达水平及两者的类系。方法:利用RT-PCR的方法研究Nup88和PINCH mRNA在47例结直肠癌组织、44例癌旁无瘤黏膜、45例近端、44例远端黏膜及6个结肠癌细胞株中的表达水平,用Spearman法对Nup88和PINCH进行相关性分析。结果:Nup88和PINCH mRNA在结直肠癌组织中的表达水平高于癌旁无瘤黏膜、近端及远端黏膜,且两者在上述4组标本中表达水平均呈正相关(rs分别为0.31、0.35、0.46及0.48)。结论:Nup88和PINCH可能在结直肠癌发生发展过程中共同发挥作用。

电镜分析非晶状体βγ晶状体蛋白与三叶因子蛋白复合物在人红细胞膜上的孔道形成效应

非晶状体βγ晶状体蛋白与三叶因子蛋白复合物(non-lens βγ-crystallin and trefoil factor complex,βγ-CAT)是一个从大蹼铃蟾(Bombina maxima)皮肤分泌物中分离的天然分子量为72kDa的全新的蛋白复合物。本研究测定了βγ-CAT处理红细胞后引起细胞内钾离子外流与溶血效应的时效曲线,结合扫描电子显微镜和透射电子显微镜分析βγ-CAT处理红细胞引起的早期形态学变化。结果表明:βγ-CAT(3nmol/L)37℃处理红细胞5min,(93.31±5.89)%的细胞内钾离子迅速外流(P<0.01),相应溶解率为(13.12±1.92)%(P<0.05)。电子显微镜观察发现红细胞形态发生明显变化,细胞体积增加,肿胀。少数红细胞表面向外形成棘状异常突起,部分肿胀细胞内的血红蛋白通过棘状突起缺口向细胞外喷射血红蛋白。表明βγ-CAT通过在红细胞膜上形成孔道使细胞内钾离子迅速外流导致红细胞内渗透压改变而溶血。其结果为理解βγ-CAT的溶血机制提供了直接的形态学证据。

IRPA对β-内酰胺酶类抗菌药物主要耐药机制研究

目的研究该院耐亚胺培南的铜绿假单胞菌β-内酰胺酶的基因分布、膜孔蛋白OprD2的缺失情况及外排泵MexAB-OprM的表达情况。方法收集该院2015年4月至2016年7月由全自动细菌鉴定仪筛选出来的耐亚胺培南的铜绿假单胞菌,采用K-B法进行耐药表型确认,采用聚合酶链反应(PCR)检测耐亚胺培南铜绿假单胞菌金属酶基因IMP、VIM、SIM、GIM、SPM,超广谱β-内酰胺酶基因TEM、VEB、SHV、PER、OXA-2、OXA-10;对扩增阳性产物进行基因测序,采用实时荧光定量PCR检测铜绿假单胞菌膜孔蛋白OprD2的缺失情况及mexA的表达水平。结果该院耐亚胺培南铜绿假单胞菌金属酶基因均未检出;超广谱β-内酰胺酶基因TEM阳性20株(83.3%),其他型未有检出;阳性产物基因测序经比对确认为TEM-1型;膜孔蛋白OprD2缺失6株(25%),外排泵MexAB-OprM过度表达6株(25%)。结论该院耐亚胺培南铜绿假单胞菌对β-内酰胺酶类的耐药机制主要以由超广谱β-内酰胺酶基因TEM-1型介导为主,膜孔蛋白OprD2缺失以及主动外排泵MexAB-OprM过度表达为辅。

肾衰饮对糖尿病肾病大鼠足细胞标志蛋白、足细胞裂孔膜蛋白影响

目的研究肾衰饮对糖尿病肾病(DKD)大鼠足细胞标志蛋白(PCX)、足细胞裂孔膜蛋白(Nephrin)的影响。方法选取SPF级雄性SD大鼠72只随机分为空白组、DKD组、厄贝沙坦组、肾衰饮低剂量组、肾衰饮中剂量组、肾衰饮高剂量组。采用高脂高糖饲料喂养联合链脲佐菌素腹腔注射建立DKD大鼠模型。厄贝沙坦组采用厄贝沙坦2.7 mg/mL灌胃;肾衰饮低、中、高剂量组分别采用肾衰饮2.79、5.58、11.16 g/mL灌胃;空白组、DKD组采用等体积生理盐水灌胃。连续给药8周后检测各组大鼠尿蛋白(PRO)、总胆固醇(TC)、血肌酐(Scr)、甘油三酯(TG)、血尿素氮(BUN)、高密度脂蛋白胆固醇(HDL-C)、葡萄糖(GLU)、谷丙转氨酶(ALT)、低密度脂蛋白胆固醇(LDL-C)、谷草转氨酶(AST)含量;苏木素-伊红(HE)染色观察肾脏组织病理形态学变化;酶联免疫吸附试验检测血清碱性纤维母细胞生长因子(bFGF)、胰岛素样生长因子(IGF)、单核细胞趋化蛋白-1(MCP-1)表达水平;蛋白免疫印迹法检测肾脏组织PCX、Nephrin蛋白表达水平。结果与空白组比较,DKD组大鼠GLU、ALT、AST、PRO、Scr、BUN、TC、TG、LDL-C水平显著升高,HDL-C水平显著下降(P<0.01);肾小球发生硬化性改变、上皮细胞颗粒样变性、囊腔明显变窄,肾小管周围大量炎性细胞浸润;血清bFGF、IGF、MCP-1表达水平显著升高(P<0.01);PCX、Nephrin水平显著降低(P<0.01)。与DKD组比较,厄贝沙坦组和肾衰饮各剂量组大鼠GLU、ALT、AST、PRO、Scr、BUN、TC、TG、LDL-C水平显著降低,HDL-C水平显著上升(P<0.05,P<0.01);肾脏病理损害不同程度减轻;厄贝沙坦组、肾衰饮高剂量组大鼠血清bFGF、IGF、MCP-1表达水平均有不同程度下降(P<0.01);厄贝沙坦组、肾衰饮高剂量组大鼠PCX、Nephrin水平均有不同程度上升(P<0.05,P<0.01)。结论肾衰饮能够有效降低DKD大鼠血糖、血脂、肝功能、肾功能、蛋白尿水平,抑制血清bFGF、IGF、MCP-1表达,改善肾组织病理改变,其机制可能与上调PCX、Nephrin蛋白表达以修复足细胞损伤有关。

益气养阴汤治疗病毒性心肌炎的疗效及其对IL-2、PFP的影响鄢

目的探讨益气养阴汤治疗病毒性心肌炎的作用机制。方法收集60例病毒性心肌炎病例,随机分为对照组和治疗组,疗程3、4周,治疗前后检测心肌酶学(CK、CK-MB),心脏超声(EF、LVM、LVMI、SO、CO和CI),血清IL-2及淋巴细胞穿孔素表达水平(PFP)及疗效评价。结果应用益气养阴汤治疗病毒性心肌炎EF上升、LVM下降、LVMI下降有统计学意义(P<0.05);血清IL-2下降、外周血淋巴细胞穿孔素表达水平下降有统计学意义(P<0.05)。结论益气养阴汤治疗病毒性心肌炎有效,免疫作用机制可能与降低外周血IL-2、淋巴细胞穿孔素表达有关。

益心康对体外感染CVB_3病毒心肌细胞凋亡相关因子caspase-3 mRNA和颗粒酶B、穿孔素表达的影响

目的研究中药益心康对感染柯萨奇B_3病毒(Coxsackie virus B,CVB_3)新生乳鼠体外心肌细胞凋亡相关基因caspase-3 mRNA和颗粒酶B、穿孔素(PFP)表达的影响,探讨中药益心康治疗病毒性心肌炎的作用机制。方法原代培养SD大鼠乳鼠心肌细胞,建立体外感染CVB_3的心肌细胞模型,将心肌细胞分为4组:正常对照组、病毒组、中药益心康组及利巴韦林组。用RT-PCR法检测凋亡相关因子caspase-3 mRNA的表达,ELISA法检测颗粒酶B、PFP的表达。结果中药益心康组caspase-3 mRNA、PFP、颗粒酶B的相对表达量明显低于病毒组(P<0.01)和利巴韦林组(P<0.05)。结论中药益心康能降低大鼠心肌细胞caspase-3 mRNA、颗粒酶B、PFP表达,从而抑制CVB_3感染大鼠心肌细胞凋亡。

LA0202为钩端螺旋体中一孔形成溶血素蛋白(英文)

目的研究LA0202为孔形成溶血素。方法体外克隆表达LA0202蛋白。纯化的LA0202蛋白作用绵羊血细胞观察LA0202的溶血活性并用渗透压保护剂PEG6000添加到作用体系研究渗透压保护剂对LA0202溶血活性的影响。透射电镜及扫描电镜观察LA0202作用于体外培养的肝细胞后对细胞的毒性。结果渗透压保护剂PEG6000能够抑制LA0202的溶血活性。LA0202作用于肝细胞后引起肝细胞的毒性损伤。结论LA0202为一孔形成溶血素。

大鼠角膜移植术后植片内颗粒酶B和穿孔素的表达

目的观察大鼠角膜移植术后植片内穿孔素(PFP)和颗粒酶B(GrB)的表达情况。方法以Wister大鼠为供体,SD大鼠为受体,常规行穿透角膜移植术,裂隙灯观察移植排斥情况。分别于移植术后第3、7、14、21d取角膜植片,HE染色及免疫组织化学方法检测植片内PFP和GrB的表达。结果角膜移植术后(7.63±0.74)d出现排斥反应。免疫组织化学结果可见,PFP、GrB阳性染色为棕色,表达于淋巴细胞、中性粒细胞及单核吞噬细胞的胞浆。当被分泌出后多分布于角膜上皮细胞间隙和细胞膜,正常角膜无表达。角膜移植术后第3d,大部分植片未见PFP和GrB的表达,少数植片见植片植床交界处上皮少量表达,第7d起表达明显,第14d达高峰,第21d稍有下降。PFP与GrB的表达具有相关性。结论PFP与GrB在大鼠角膜排斥反应中起着重要的作用。

Nup88 mRNA在乳腺癌中的表达及其临床意义

目的:研究核孔蛋白复合体蛋白88(Nup88)mRNA在乳腺癌组织中的表达及其与临床病理特征的关系。方法:RT-PCR法检测40例乳腺癌及40例乳腺良性病变组织中Nup88mRNA的表达水平。结果:Nup88mRNA在乳腺癌组织中的表达水平显著高于乳腺良性病变(P<0.001);乳腺癌组织学分化越低、临床TNM分期越晚、淋巴结有转移,Nup88mRNA表达水平越高(均P<0.05);Nup88mRNA表达与cerbB-2蛋白表达呈显著正相关(P<0.05)。结论:Nup88与乳腺癌的发生发展有关,其表达可作为评估乳腺癌生物学行为的指标之一。