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Regulation of RNA binding proteins in trypanosomatid protozoan parasites
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作者 María Albertina Romaniuk Gabriela Cervini Alejandro Cassola 《World Journal of Biological Chemistry》 CAS 2016年第1期146-157,共12页
Posttranscriptional mechanisms have a critical role in the overall outcome of gene expression. These mechanisms are especially relevant in protozoa from the genus Trypanosoma, which is composed by death threatening pa... Posttranscriptional mechanisms have a critical role in the overall outcome of gene expression. These mechanisms are especially relevant in protozoa from the genus Trypanosoma, which is composed by death threatening parasites affecting people in Sub-saharan Africa or in the Americas. In these parasites the classic view of regulation of transcription initiation to modulate the products of a given gene cannot be applied. This is due to the presence of transcription start sites that give rise to long polycistronic units that need to be processed costranscriptionally by trans-splicing and polyadenylation to give mature monocistronic mRNAs. Posttranscriptional mechanisms such as mRNA degradation and translational repression are responsible for the final synthesis of the required protein products. In this context, RNA-binding proteins(RBPs) in trypanosomes have a relevant role as modulators of mRNA abundance and translational repression by associating to the 3' untranslated regions in mRNA. Many different RBPs have been proposed to modulate cohorts of mRNAs in trypanosomes. However, the current understanding of their functions lacks a dynamic view on the different steps at which these RBPs are regulated. Here, we discuss different evidences to propose regulatory events for different RBPs in these parasites. These events vary from regulated developmental expression, to biogenesis of cytoplasmic ribonucleoprotein complexes in the nucleus, and condensation of RBPs and mRNA into large cytoplasmic granules. Finally, we discuss how newly identified posttranslational modifications of RBPs and mRNA metabolism-related proteins could have an enormous impact on the modulation of m RNA abundance. To understand these modifications is especially relevant in these parasites due to the fact that the enzymes involved could be interesting targets for drug therapy. 展开更多
关键词 TRYPANOSOMA posttranscriptional gene expression RIBONUCLEOprotein complexes rna-binding protein Developmental regulation Sleeping sickness Posttranslational modification Phosphorylation CHAGAS disease
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RNA binding proteins in spermatogenesis: an in depth focus on the Musashi family 被引量:4
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作者 Jessie M Sutherland Nicole A Siddall +1 位作者 Gary R Hime Eileen A McLaughlin 《Asian Journal of Andrology》 SCIE CAS CSCD 2015年第4期529-536,共8页
Controlled gene regulation during gamete development is vital for maintaining reproductive potential. During the complex process of mammalian spermatogenesis, male germ cells experience extended periods of the inactiv... Controlled gene regulation during gamete development is vital for maintaining reproductive potential. During the complex process of mammalian spermatogenesis, male germ cells experience extended periods of the inactive transcription despite heavy translational requirements for continued growth and differentiation. Hence, spermatogenesis is highly reliant on mechanisms of posttranscriptional regulation of gene expression, facilitated by RNA binding proteins (RBPs), which remain abundantly expressed throughout this process. One such group of proteins is the Musashi family, previously identified as critical regulators of testis germ cell development and meiosis in Drosophila, and also shown to be vital to sperm development and reproductive potential in the mouse. This review describes the role and function of RBPs our recent knowledge of the Musashi proteins in spermatogenesis. within the scope of male germ cell development, focusing on The functional mechanisms utilized by RBPs within the cell are outlined in depth, and the significance of sub-cellular localization and stage-specific expression in relation to the mode and impact of posttranscriptional regulation is also highlighted. We emphasize the historical role of the Musashi family of RBPs in stem cell function and cell fate determination, as originally characterized in Drosophila and Xenopus, and conclude with our current understanding of the differential roles and functions of the mammalian Musashi proteins, Musashi-1 and Musashi-2, with a primary focus on our findings in spermatogenesis. This review highlights both the essential contribution of RBPs to posttranscriptional regulation and the importance of the Musashi family as master regulators of male gamete development. 展开更多
关键词 gene regulation Musashi MUSASHI-1 Musashi-2 posttranscriptional control rna binding proteins SPERMATOGENESIS SPLICING TESTIS translation
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RRM RNA结合蛋白的结构与功能 被引量:8
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作者 杜光伟 周严 +1 位作者 袁建刚 强伯勤 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 1999年第4期305-307,共3页
R R M R N A 结合蛋白是一类含一个或数个 R R M 结构域及附属结构域的 R N A 结合蛋白, 参与 R N A 前体的剪接、 R N A 的细胞定位、 R N A 的稳定性等多种转录后调控过程. 在 R R M 基序中含有许多保守... R R M R N A 结合蛋白是一类含一个或数个 R R M 结构域及附属结构域的 R N A 结合蛋白, 参与 R N A 前体的剪接、 R N A 的细胞定位、 R N A 的稳定性等多种转录后调控过程. 在 R R M 基序中含有许多保守的氨基酸以保证对 R N A 的结合活性, 但是这一家族的不同蛋白质却能特异地结合各种不同的 R N A 分子. R R M R N A 展开更多
关键词 转录后调控 rna结合蛋白 rrm基序
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植物RNA结合蛋白的研究进展 被引量:7
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作者 唐蜻 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2010年第1期38-41,共4页
从RNA结合蛋白的鉴定方法,RNA结合蛋白的基序,以及植物RNA结合蛋白在调控叶绿素mRNA的稳定和转录、植物抗逆反应、开花和激素信号传导等过程中的作用等方面介绍了植物RNA结合蛋白的研究进展。
关键词 rna结合蛋白 基因转录后调控 rna识别基序
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Emerging roles of lncRNAs in the post-transcriptional regulation in cancer 被引量:16
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作者 Rong-Zhang He Di-Xian Luo Yin-Yuan Mo 《Genes & Diseases》 SCIE 2019年第1期6-15,共10页
Accumulating evidence indicates that long non-coding RNAs(lncRNAs)can play a pivotal role in regulation of diverse cellular processes.In particular,lncRNAs can serve as master gene regulators at transcriptional and po... Accumulating evidence indicates that long non-coding RNAs(lncRNAs)can play a pivotal role in regulation of diverse cellular processes.In particular,lncRNAs can serve as master gene regulators at transcriptional and posttranscriptional levels,leading to tumorigenesis.In this review,we discuss latest developments in lncRNA-meditated gene expression at the post-transcriptional level,including gene splicing,mRNA stability,protein stability and nuclear trafficking. 展开更多
关键词 Alternative splicing Lncrna posttranscriptional regulation protein stability rna binding proteins rna stability
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牦牛RBM3的基因克隆及其在不同繁殖时期卵巢、输卵管、子宫中的表达定位 被引量:3
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作者 张晖 潘阳阳 +4 位作者 王靖雷 张瑞 黄嘉馨 余四九 崔燕 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第7期2202-2214,共13页
旨在研究RBM3在牦牛(Bos grunniens)生殖相关调控中的作用。本研究以卵泡期、黄体期和妊娠期4~6岁健康雌性牦牛各3头为采集对象,采集其卵巢、子宫和输卵管共9组试验样品,每组设置3个生物学重复。利用基因克隆技术克隆牦牛RBM3基因并进... 旨在研究RBM3在牦牛(Bos grunniens)生殖相关调控中的作用。本研究以卵泡期、黄体期和妊娠期4~6岁健康雌性牦牛各3头为采集对象,采集其卵巢、子宫和输卵管共9组试验样品,每组设置3个生物学重复。利用基因克隆技术克隆牦牛RBM3基因并进行生物信息学分析;利用实时荧光定量PCR(quantitative real-time PCR,qRT-PCR)和蛋白免疫印迹(Western blot,WB)分别在基因层面和蛋白层面检测RBM3在牦牛子宫、卵巢和输卵管中的相对表达量;利用免疫组织化学(immunocytochemistry,IHC)方法检测RBM3蛋白在试验样品中的分布定位。牦牛RBM3基因(GenBank No.:MF142258.1)被成功克隆并预测出二、三级结构,发现其与野牦牛亲缘性最近,基因编码区第51位、98位核苷酸不同于常见哺乳动物,生物信息学分析预测其编码的蛋白质为稳定的非跨膜蛋白。RBM3蛋白在本试验9组样品的表达量有如下差异:在卵巢中,黄体期显著高于卵泡期和妊娠期(P<0.05);输卵管中,卵泡期显著低于黄体期和妊娠期(P<0.05);子宫上,卵泡期显著高于黄体期和妊娠期(P<0.05)。免疫组织化学结果显示,RBM3在卵巢中的主要表达位置是卵泡膜、颗粒层和黄体细胞;在输卵管的表达位置是黏膜上皮;子宫上的表达主要以子宫内膜和子宫腺为主。本研究结果提示,RBM3可能参与牦牛个体发情周期和妊娠过程的调控以及妊娠识别等过程,为RBM3这一冷应激调节因子参与牦牛对高原环境的适应性生理机制方面的研究提供参考。 展开更多
关键词 牦牛 生殖调控 rna结合基序蛋白3 冷应激
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大黄鱼(Larimichthys crocea)Tristetraprolin基因的克隆与功能分析 被引量:1
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作者 汪慧娟 何志巧 +3 位作者 石戈 周素明 张晓林 申望 《海洋与湖沼》 CAS CSCD 北大核心 2023年第6期1786-1796,共11页
Tristetraprolin(TTP)是广泛存在于真核生物的RNA结合蛋白。TTP通过促进mRNA降解或抑制翻译在转录后水平抑制炎症因子表达,是炎症性疾病的潜在治疗靶点。采用RACE技术获取了大黄鱼(Larimichthys crocea)TTP(命名为LcTTP)cDNA的全长序列... Tristetraprolin(TTP)是广泛存在于真核生物的RNA结合蛋白。TTP通过促进mRNA降解或抑制翻译在转录后水平抑制炎症因子表达,是炎症性疾病的潜在治疗靶点。采用RACE技术获取了大黄鱼(Larimichthys crocea)TTP(命名为LcTTP)cDNA的全长序列。LcTTP全长cDNA 1508 bp,包括77 bp的5′-非编码区(5’-UTR)、183 bp的3’-UTR和1248 bp的开放阅读框(ORF),编码418个氨基酸残基。推导的LcTTP理论分子量44897.78 Da,预测等电点pI 8.37;哺乳动物TTP的重要功能结构域:N-端核输出序列(NES)、中央串联锌指结构域(TZF)、C-端NOT1-结合结构域(NOT1-BD)也在LcTTP中保守存在;系统发育分析显示LcTTP和其他脊椎动物TTP聚为一支,并与哺乳动物ZFP36家族其他成员ZFP36L1、ZFP36L2和ZFP36L3的进化支分离。组织表达特异性分析显示检测的9个组织均表达LcTTP mRNA,但不同组织间表达水平差异大,其中肌肉组织表达水平最高。大黄鱼头肾细胞系LYC-hK细胞中过表达LcTTP上调LPS诱导早期(1 h)TNF-αmRNA表达量,之后TNF-αmRNA表达量快速下调至接近对照组水平(1.5 h);放线菌D抑制转录后过表达LcTTP上调TNF-αmRNA降解速率,表明LcTTP可通过促进TNF-αmRNA降解调节TNF-α表达。以上研究结果提示LcTTP可能是大黄鱼炎症反应平衡关键调控蛋白,在大黄鱼感染性病害防治策略开发中有潜在应用价值。 展开更多
关键词 大黄鱼 rna结合蛋白 Tristetraprolin蛋白 炎症反应 转录后调控
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功能与疾病中的RBFox蛋白家族 被引量:2
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作者 魏朝亮 夏明 谷明瑶 《深圳大学学报(理工版)》 EI CAS CSCD 北大核心 2020年第5期514-520,共7页
RNA结合蛋白(RNA binding proteins,RBPs)是细胞内一类能与单链或双链核糖核酸(ribonuleic acid,RNA)结合并形成核糖核蛋白复合体的一类蛋白.RBFox(RNA binding proteins feminine gene on X chromosome)蛋白是RNA结合蛋白家族中的重要... RNA结合蛋白(RNA binding proteins,RBPs)是细胞内一类能与单链或双链核糖核酸(ribonuleic acid,RNA)结合并形成核糖核蛋白复合体的一类蛋白.RBFox(RNA binding proteins feminine gene on X chromosome)蛋白是RNA结合蛋白家族中的重要成员,在多种动物体内的特定组织细胞中表达并发挥生物学功能.已发现的RBFox蛋白包括RBFox1、RBFox2和RBFox3,均含有进化上高度保守的RNA识别结构基序(RNA recognition motif,RRM),能特异性地与(U)GCAUG序列结合并发挥作用.目前研究揭示了RBFox蛋白是一类多功能蛋白,除了调控RNA加工过程中的经典功能可变剪接之外,还广泛参与基因转录、mRNA稳定性调节、miRNA代谢以及蛋白翻译等过程,在心脏疾病、神经系统疾病、糖尿病和癌症等疾病的发生发展过程中起重要调控作用.本文概述了目前RBFox家族在调节剪接、转录、miRNA代谢和mRNA稳定性的4个功能及其在心脏疾病、神经系统疾病、糖尿病和癌症等多种疾病方面的研究进展,为RBFox蛋白的作用机制及其对疾病调控的进一步研究提供借鉴. 展开更多
关键词 分子生物学 rna结合蛋白 RBFox rna识别结构域 多功能蛋白 疾病调控
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RNA结合蛋白HuR对肠道上皮稳态的转录后调控 被引量:1
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作者 刘向征 肖兰 汪建英 《生理学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第3期325-335,共11页
哺乳动物的肠上皮组织具备快速和强大的自我更新能力,以适应与肠内容物中众多有害物质和微生物的直接接触。基因的转录后调控是肠上皮组织维持稳态的重要机制之一。RNA结合蛋白HuR在细胞中的主要功能是调节靶向基因转录本的稳定性和翻译... 哺乳动物的肠上皮组织具备快速和强大的自我更新能力,以适应与肠内容物中众多有害物质和微生物的直接接触。基因的转录后调控是肠上皮组织维持稳态的重要机制之一。RNA结合蛋白HuR在细胞中的主要功能是调节靶向基因转录本的稳定性和翻译,密切参与肠道黏膜病理生理调节。本综述将重点介绍HuR在维持肠上皮完整性方面的生物学作用,尤其是HuR在调节肠上皮细胞更新、肠道黏膜修复以及肠壁通透性方面的最新发现和研究进展;并深入分析HuR与其它RNA结合蛋白以及非编码RNA (包含微小RNA和长链非编码RNA)之间的相互作用在肠上皮稳态调节中的共同作用。随着RNA结合蛋白和非编码RNA研究领域的不断深入,肠上皮组织稳态的转录后调控将为如何在特定病理条件下保护肠上皮的治疗提供新的线索。 展开更多
关键词 rna结合蛋白 非编码rna 肠上皮更新 黏膜修复 转录后调控
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RBMS3通过Wnt/β-catenin信号通路抑制胃癌细胞侵袭及其上皮-间质转化 被引量:10
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作者 赵鹏 刘冬 +1 位作者 张卉 宋扬 《肿瘤》 CAS CSCD 北大核心 2017年第10期1032-1040,共9页
目的:研究RNA结合基序单链相互作用蛋白3(RNA-binding motif,single-stranded-interacting protein 3,RBMS3)对胃癌细胞侵袭的影响,并探讨其可能的分子作用机制。方法:首先采用实时荧光定量PCR和蛋白质印迹法检测人正常胃黏膜上皮细胞GE... 目的:研究RNA结合基序单链相互作用蛋白3(RNA-binding motif,single-stranded-interacting protein 3,RBMS3)对胃癌细胞侵袭的影响,并探讨其可能的分子作用机制。方法:首先采用实时荧光定量PCR和蛋白质印迹法检测人正常胃黏膜上皮细胞GES-1以及胃癌细胞MKN-28、MKN-45、NCI-N87和SGC-7901中RBMS3的表达水平。然后采用脂质体转染法将RBMS3过表达载体[RBMS3-pcDNA3.1(+)]转染至胃癌MKN-45和SGC-7901细胞中,同时设置空白对照组和空载体转染的阴性对照组。采用实时荧光定量PCR和蛋白质印迹法验证RBMS3过表达效果后,Transwell小室法检测细胞侵袭能力的变化,实时荧光定量PCR和蛋白质印迹法检测细胞中上皮-间质转化相关蛋白以及Wnt信号通路中β-连环蛋白(β-catenin)的表达水平变化。最后,用Wnt通路激动剂氯化锂(lithium chloride,LiCl)处理RBMS3过表达的胃癌MKN-45和SGC-7901细胞后,再次采用Transwell小室法检测细胞侵袭能力的变化。结果:与正常胃黏膜细胞相比,4种胃癌细胞中RBMS3 mRNA和蛋白的表达水平均明显降低(P值均<0.05)。RBMS3过表达质粒转染后,胃癌MKN-45和SGC-7901细胞中RBMS 3基因过表达,2种细胞的侵袭能力随之明显降低(P值均<0.05)。在RBMS3过表达的胃癌MKN-45和SGC-7901细胞中,N-钙黏蛋白(N-cadherin)和β-catenin表达水平均明显降低(P值均<0.05),而E-钙黏蛋白(E-cadherin)表达水平明显升高(P值均<0.05)。用LiCl处理RBMS3过表达的MKN-45和SGC-7901细胞后,RBMS3对2种细胞侵袭的抑制作用均被部分抵消(P值均<0.05)。结论:RBMS3可能通过阻滞Wnt/β-catenin信号通路,抑制人胃癌细胞的侵袭和上皮-间质转化。 展开更多
关键词 胃肿瘤 基因表达调控 肿瘤侵润 上皮-间质转化 WNT信号通路 rna结合基序单链相互作用蛋白3
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