水稻叶绿体基因组中一个编码psbL和psbJ基因cDNA的克隆与分析

A 505 bp cDNA was cloned from the leaves of rice (Oryza sativa L.) Shanyou 63 combination. DNA sequence analysis showed that it is a part of rice chloroplast genome. Its homology comparison with those known in GenBank found that it encodes 38 amino acid peptide deduced from psbL gene and 40 amino acid peptide deduced from psbJ gene in rice chloroplast PSⅡ. Northern hybridization showed that the cDNA was differentially displayed in hybrid F 1 and its parental lines.

几个中国大麦属物种叶绿体psbL和psbJ基因序列分析

对8份来源于中国和2份来自国外的不同大麦属物种或亚种叶绿体基因组psbL-psbJ区进行了序列测定。结果表明,10份大麦属材料的psbL-psbJ区序列长度均为365bp,且无变异位点。同时,将大麦属psbL-psbJ区序列与已报道的黑麦(Secalecereale L.)、小麦(Triticumaestivum L.)、水稻(Oryza sativa L.)和玉米(Zea mays L.)的相同序列比较,发现所有物种的psbL基因序列长度均为117bp,且无核酸变异位点;psbJ基因序列长度均为123bp,共检测到6个核酸变异位点。除水稻外,所有物种psbL和psbJ基因间区长度均为125bp,水稻psbL和psbJ基因间区为126bp。在psbL和psbJ基因间区,除水稻具有1个插入位点外,还发现8个核酸变异位点。psbL-psbJ区揭示的大麦属物种、黑麦、小麦、水稻和玉米的遗传分化距离变化范围为0.0055-0.0426。以玉米为外类群,采用邻接法进行系统发育关系分析发现,同属于小麦族的大麦属植物、黑麦和小麦间亲缘关系较近,而水稻与玉米则相对较近。

胡椒属植物DNA条形码初步研究

为筛选胡椒属DNA条形码最佳片段,研究了ITS、rbcL、psbJ-petA和matK基因片段的有效使用性、种内种间变异和barcoding gap,并评估了序列鉴定效率。结果显示:ITS和matK的barcoding gap图相对较好,matK物种水平鉴定成功率高,ITS种间变异较大,而其他2个候选序列不能进行有效鉴定。为此,推荐matK和ITS作为胡椒属植物潜在的DNA条形码序列,并依此探索建立该属的DNA条形码鉴定方法。