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不相关多子集零相关区序列集的构造
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作者 崔莉 许成谦 《系统工程与电子技术》 EI CSCD 北大核心 2024年第10期3577-3585,共9页
在多小区环境下的准同步码分多址(quasi-synchronous code-division multiple-access,QS-CDMA)系统中,不相关多子集零相关区(zero correlation zone,ZCZ)序列集不仅可以消除一定时延内来自相同小区的信号干扰,而且可以完全消除来自相邻... 在多小区环境下的准同步码分多址(quasi-synchronous code-division multiple-access,QS-CDMA)系统中,不相关多子集零相关区(zero correlation zone,ZCZ)序列集不仅可以消除一定时延内来自相同小区的信号干扰,而且可以完全消除来自相邻小区的信号干扰。针对如何基于仿酉矩阵构造多子集ZCZ序列集的问题,设计了两种构造方法。具体地,通过构造具有一定特性的多个初始矩阵,再结合仿酉矩阵,进而利用不同的初始矩阵产生不同的ZCZ序列集,且序列集间互不相关。所提方法的核心是多个初始矩阵的设计,方法1通过对离散傅里叶变换(discrete Fourier transform,DFT)矩阵进行分块与叠加实现,方法2利用已有的不相关多子集ZCZ序列集实现。由两种方法得到的构造结果,其参数趋近于最优,为解决多小区环境下的干扰抑制问题提供了新的序列设计方法。 展开更多
关键词 准同步码分多址系统 零相关 多子集零相关序列 仿酉矩阵
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低相关区互补序列集的构造方法研究
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作者 刘涛 王玉含 李玉博 《电子与信息学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2024年第8期3410-3418,共9页
完备互补序列是一类具有理想相关函数性质的信号,在多址接入通信系统、雷达波形设计等领域具有广泛的应用。然而完备互补序列集合大小不超过其子序列数目。为扩展互补序列数目,该文研究了非周期低相关区互补序列集的构造方法,首先提出... 完备互补序列是一类具有理想相关函数性质的信号,在多址接入通信系统、雷达波形设计等领域具有广泛的应用。然而完备互补序列集合大小不超过其子序列数目。为扩展互补序列数目,该文研究了非周期低相关区互补序列集的构造方法,首先提出了两类有限域上的映射函数,进而得到两类参数渐近达到最优的低相关区互补序列集。该类低相关区互补序列集相比完备互补序列集具有更多的序列数目,在通信系统中可支持更多的用户。 展开更多
关键词 完备互补序列 非周期 低相关 渐近最优
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出租车OD序列聚类的城市功能区识别算法研究
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作者 高蕴灵 李英冰 +2 位作者 何阳 栾梦杰 李欣然 《地理空间信息》 2024年第2期8-12,共5页
提出一种由添加窗口约束的规整路径距离改进的K中心聚类算法(LDTW-K-medoids),通过构造时间序列、动态时间规整、时间序列聚类、聚类结果解读的流程来识别城市功能区。将算法应用在纽约市城市功能区识别中,对50万条出租车OD数据进行处理... 提出一种由添加窗口约束的规整路径距离改进的K中心聚类算法(LDTW-K-medoids),通过构造时间序列、动态时间规整、时间序列聚类、聚类结果解读的流程来识别城市功能区。将算法应用在纽约市城市功能区识别中,对50万条出租车OD数据进行处理,将265个交通小区划分为五大功能区,并结合出租车全局流动模式、建筑物面积指数和富集指数来定量识别功能性质。与谷歌地图和卫星影像对比的结果表明,算法能够有效识别城市功能区,总体精度为83.8%。 展开更多
关键词 城市功能 OD序列 动态时间规整 规整路径距离 K中心聚类 建筑物数据
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基于有限Zak变换的零相关区序列集构造
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作者 刘珍珍 李旭东 《成都信息工程大学学报》 2024年第3期382-388,共7页
针对Brodzik在2011年和2013年文中的完备序列和零相关区序列构造中参数的限制问题,分别提出完备序列和零相关区序列的新构造方法。首先,基于有限Zak变换,提出没有“参数为奇素数”限制的完备序列构造结构,并且用同余理论论证。其次,提... 针对Brodzik在2011年和2013年文中的完备序列和零相关区序列构造中参数的限制问题,分别提出完备序列和零相关区序列的新构造方法。首先,基于有限Zak变换,提出没有“参数为奇素数”限制的完备序列构造结构,并且用同余理论论证。其次,提出一种具有稀疏性、结构化特点的L×KL的零相关区序列集的Zak空间结构,从而得到零相关区序列集,用有限Zak变换和同余理论论证。相比Brodzik 2013年文中的零相关区序列集,新构造的零相关区序列集的零相关区的长度更长,序列的数量更多。 展开更多
关键词 应用数学 数学与通信 有限Zak变换 完备序列 零相关 零互相关序列
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红螯螯虾核糖体DNA-ITS区序列特征 被引量:1
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作者 刘士力 刘一诺 +6 位作者 蒋文枰 郑建波 程顺 迟美丽 杭小英 彭苗 李飞 《浙江农业科学》 2023年第6期1357-1362,共6页
红螯螯虾(Cherax quadricarinatus)是一种原产于澳大利亚的淡水螯虾,具有良好的养殖前景。为了从多角度提高对红螯螯虾群体遗传多样性的认识,通过PCR扩增了其内转录间隔区(internal transcribed spacer,ITS)并进行了克隆测序,采用生物... 红螯螯虾(Cherax quadricarinatus)是一种原产于澳大利亚的淡水螯虾,具有良好的养殖前景。为了从多角度提高对红螯螯虾群体遗传多样性的认识,通过PCR扩增了其内转录间隔区(internal transcribed spacer,ITS)并进行了克隆测序,采用生物信息学软件对其序列进行了比较分析。结果表明,红螯螯虾ITS序列长度为722~942 bp,ITS1长度短于ITS2,5.8S和ITS2的GC含量较高。其中ITS1长度为157~166 bp,平均GC含量为42.3%~42.9%,是迄今为止甲壳类中发现的最短的ITS1序列;5.8S除了有一条序列长度为159 bp外,其余479条序列均为165 bp,平均GC含量为55.6%~55.9%;ITS2长度为394~614 bp,GC含量为53.6%~54.0%。序列比对显示,整个ITS中微卫星序列(simple sequence repeat,SSR)共有4处,其中ITS1中有1处,为(CAT)n类型;ITS2中有3处,分别为(AGGC)n、(TGC)n和(TAA)n。个体内差异分析表明,红螯螯虾ITS个体内存在SNP位点,而且由于SSR重复数不同在长度上存在个体内差异。相似性分析表明,红螯螯虾ITS1和ITS2与其他甲壳动物相似性较低;5.8S与其他甲壳动物有着极高的相似性,其中与中华绒螯蟹相似性达到88%。基于5.8S构建的NJ树显示,红螯螯虾与中华绒螯蟹亲缘关系最近聚为一支,然后与克氏原螯虾聚为一支。这可能是目前螯虾属ITS序列较少的原因。当采用ITS进行红螯螯虾种质分析时,需要在每个群体中取少量个体测定多个克隆的方法进行预实验。本研究结果补充了螯虾类ITS的序列资源,为ITS在红螯螯虾遗传多样性分析中的应用提供了理论依据。 展开更多
关键词 红螯螯虾 内转录间隔 微卫星 序列分析
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采用融合遗传算法的高速公路服务区综合能源系统优化调度研究 被引量:1
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作者 李杰 高爽 +1 位作者 袁博兴 张懿璞 《西安交通大学学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2024年第5期200-211,共12页
为达成“碳中和”目标愿景、促进公路交通系统与新能源的融合,以高速公路服务区为研究对象,考虑服务区内电、冷、热、气共4种负荷需求,构建了包含风光发电的新能源发电方式和电转气设备的高速公路服务区综合能源系统。在此基础上,以风... 为达成“碳中和”目标愿景、促进公路交通系统与新能源的融合,以高速公路服务区为研究对象,考虑服务区内电、冷、热、气共4种负荷需求,构建了包含风光发电的新能源发电方式和电转气设备的高速公路服务区综合能源系统。在此基础上,以风电、光伏出力日前预测和多能负荷日前消耗为输入,各能源设备出力及购能分配为输出,以总成本最低为目标函数,考虑能量平衡、设备安全、运行状态等约束,建立了高速公路服务区综合能源系统优化调度模型。针对高速公路服务区综合能源系统调度问题,设计了遗传-序列二次规划融合优化算法,并以某服务区夏季典型日为例进行验证。结果表明:所构建的调度系统能够有效消纳可再生能源出力,协调外部购电、购气的比例,最终达到降低成本的效果;所提融合算法的调度结果与传统遗传算法、传统序列二次规划算法相比,在成本上分别降低了11.52%、0.70%,求解耗时仅为传统遗传算法的6.7%,独立性相比传统序列二次规划算法得到了提高。 展开更多
关键词 高速公路服务 新能源 遗传-序列二次规划算法 优化调度 电转气
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基于混沌序列的无碰撞区跳频序列构造方法
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作者 马鹏飞 侯娟 关磊 《无线电通信技术》 2023年第2期300-305,共6页
为了提升多用户跳频系统在复杂场景下的顽存能力,提出了一种基于成熟的混沌序列构造性能优良的无碰撞区跳频序列集的方法。与已有的无碰撞区跳频序列构造方法相比,该方法能够利用已有混沌序列在高复杂度和长周期性能方面的良好性质,构... 为了提升多用户跳频系统在复杂场景下的顽存能力,提出了一种基于成熟的混沌序列构造性能优良的无碰撞区跳频序列集的方法。与已有的无碰撞区跳频序列构造方法相比,该方法能够利用已有混沌序列在高复杂度和长周期性能方面的良好性质,构造的序列集能够达到非汉明相关的理论界。理论分析和仿真结果表明,该方法构造的序列具有更好的均匀性、随机性、复杂度等统计特性,为跳频通信系统在多用户组网通信应用时提供更强的安全可靠性。 展开更多
关键词 无碰撞 跳频序列 跳频通信 序列设计 统计特性 汉明相关
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云南省昭通地区结核分枝杆菌临床分离株遗传多样性和耐药分子特征
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作者 钱源 范怀艳 +1 位作者 何志坚 王梅 《传染病信息》 2024年第1期35-40,共6页
目的调查云南省昭通地区结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,MTB)临床分离株的遗传多样性和耐药分子特征。方法2022年9月—2023年8月从昆明医科大学附属昭通医院收治的298例涂阳肺结核患者中共采集了MTB 298株,用MeltPro TB测定... 目的调查云南省昭通地区结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,MTB)临床分离株的遗传多样性和耐药分子特征。方法2022年9月—2023年8月从昆明医科大学附属昭通医院收治的298例涂阳肺结核患者中共采集了MTB 298株,用MeltPro TB测定法通过荧光聚合酶链反应(polymerase chain reaction,PCR)熔解曲线法鉴定所有分离株。用多色熔解曲线分析技术进行间隔区寡核苷酸分型(interval oligonucleotide typing,Spoligotyping)。用分枝杆菌散布重复单元(mycobcterial interspersed repetitive units,MIRU)-可变数目串联重复序列分型(variable number of tandem repeat typing,VNTR)(MIRU-VNTR)24位点分型法进行基因分型。使用PCR和靶向测序检测耐药基因突变。结果北京菌株占所有MTB菌株的69.80%(208/298)。其他谱系包括T、LAM、MANU2、CAS、NEW-1和SITVITWEB数据库中未发现的孤儿型,分别占5.70%(17/298)、3.36%(10/298)、0.67%(2/298)、0.34%(1/298)、8.39%(25/298)及11.74%(35/298)。北京菌株对左氧氟沙星的耐药率略高于非北京菌株(P=0.042),而北京菌株与非北京菌株2种基因型菌株对异烟肼、利福平、乙胺丁醇、链霉素、吡嗪酰胺、卡那霉素耐药率差异无统计学意义(P>0.05)。MIRU-VNTR 24位点分型分析结果显示,33个菌株可分为13株聚类,其聚类率为39.39%。每个等位基因的Hunter-Gaston指数在0~0.814之间,其中18个位点对非北京菌株具有中高鉴别能力。但只有10个位点对北京菌株具有中高鉴别能力。结论MTB菌株在中国云南省昭通地区表现出较高的遗传多样性,北京菌株是MTB和耐药结核病菌株的优势谱系。 展开更多
关键词 云南省昭通地 结核分枝杆菌 基因多样性 分枝杆菌散布重复单元-可变数目串联重复序列分型24位点分型 MTB间隔寡核苷酸分型
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湖南铲子坪-大坪金矿区变形序列及控矿构造 被引量:3
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作者 柏道远 李彬 +2 位作者 曾广乾 董裕军 曹进良 《地质力学学报》 CSCD 北大核心 2023年第6期801-823,共23页
湖南铲子坪-大坪金矿区位于雪峰弧形构造带西南段,金矿脉主要呈北西西向—北北西向,其次为北北东向。尽管现有研究表明北东向断裂为导矿和容矿构造、北西向断裂为容矿构造,但对控矿断裂的性质和形成时代缺乏明确可靠的认识。文章根据对... 湖南铲子坪-大坪金矿区位于雪峰弧形构造带西南段,金矿脉主要呈北西西向—北北西向,其次为北北东向。尽管现有研究表明北东向断裂为导矿和容矿构造、北西向断裂为容矿构造,但对控矿断裂的性质和形成时代缺乏明确可靠的认识。文章根据对地表露头构造和矿化蚀变的观测、解析,结合区域构造特征、构造演化和测年资料等,厘定了铲子坪-大坪金矿区构造变形序列及其时代背景,确定了控矿构造类型及其属性。研究认为,研究区自早至晚经历了6期主要变形事件:志留纪晚期受到北西西向挤压,形成北北东走向的褶皱、板劈理和脆韧性剪切带;中三叠世晚期受到北北西向挤压,形成北西西向—北西向右行走滑断裂和剪切破裂、南北向左行剪切破裂、北西向和北北东向共轭剪切破裂、北东东向的逆断裂和叠加褶皱;晚三叠世早期受到南北向挤压,形成北西向—北北西向右行走滑断裂和剪切破裂、北北东向—北东向左行剪切破裂和断裂、北东东向左行膝折构造;中侏罗世晚期受到北西西—近东西向挤压,形成南北向—北北东向逆断裂、北西向—北西西向左行剪切破裂、北东向右行逆冲剪切破裂、北北东向—近南北向的破劈理、面理褶皱和石香肠;古近纪中晚期受到北东向挤压,形成北北东向—南北向右行剪切破裂和断裂、北东东向左行剪切破裂、北西向的逆断裂和破劈理;古近纪晚期—新近纪初期受到北西向挤压,形成北东向逆冲剪切破裂、北西西向右行剪切破裂。研究区北北东向矿脉形成于志留纪晚期和晚三叠世,北西西向—北北西向矿脉形成于晚三叠世晚期。志留纪晚期成矿与断裂运动导致的构造活化作用有关,晚三叠世晚期成矿与同期大规模花岗质岩浆活动有关。导矿构造主要为志留纪晚期北西西向挤压形成的北北东向大断裂即脆韧性剪切带。主要容矿构造为中三叠世晚期北北西向挤压形成的北西西向—北西向右行走滑断裂、晚三叠世早期南北向挤压形成的北西向—北北西向右行走滑断裂,其次为志留纪晚期北西西向挤压形成的北北东向脆韧性剪切带。 展开更多
关键词 变形序列 成矿时代 控矿构造 铲子坪-大坪金矿 湖南
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青海野生与栽培麻花艽psbA-trnH序列的比较 被引量:3
10
作者 张得钧 高庆波 +2 位作者 李福安 李永平 俞科贤 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2011年第10期5780-5781,共2页
[目的]分析野生与栽培麻花艽(Gentiana straminea Maxim.)psbA-trnH序列的差异,为麻花艽的基源鉴定和品质评价提供分子依据。[方法]采用PCR扩增纯化后直接测序的方法,测定野生与栽培麻花艽cpDNA psbA-trnH核苷酸序列并作序列同源性分析... [目的]分析野生与栽培麻花艽(Gentiana straminea Maxim.)psbA-trnH序列的差异,为麻花艽的基源鉴定和品质评价提供分子依据。[方法]采用PCR扩增纯化后直接测序的方法,测定野生与栽培麻花艽cpDNA psbA-trnH核苷酸序列并作序列同源性分析。[结果]野生与栽培麻花艽的cpDNA psbA-trnH片段长度分别为316和317 bp,两者之间有4个碱基的变异。[结论]利用psbA-trnH区序列的差异可以鉴别野生与栽培麻花艽。 展开更多
关键词 麻花艽(Gentiana straminea Maxim.) psba-trnh区序列 聚合醇链反应 同源性分析
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跳频序列设计:研究现状与未来发展
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作者 宋东坡 王世练 《电讯技术》 北大核心 2024年第9期1516-1524,共9页
跳频序列设计是跳频通信系统的关键组成部分之一,其研究包括理论界的推导和构造方法的探索。宽间隔跳频序列能够很好地抵抗窄带干扰,低/无碰撞区跳频序列能够实现高效的多址组网。介绍了宽间隔跳频序列和低/无碰撞区跳频序列的定义和性... 跳频序列设计是跳频通信系统的关键组成部分之一,其研究包括理论界的推导和构造方法的探索。宽间隔跳频序列能够很好地抵抗窄带干扰,低/无碰撞区跳频序列能够实现高效的多址组网。介绍了宽间隔跳频序列和低/无碰撞区跳频序列的定义和性质,综述了其理论界和构造方法的研究进展,最后指出,具备宽间隔和低/无碰撞区特性的跳频序列是未来研究的重点方向。 展开更多
关键词 跳频序列设计 理论界 构造方法 宽间隔跳频序列 低/无碰撞跳频序列
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基于有限域理论的最优低碰撞区跳频序列集构造
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作者 张秀杰 牛宪华 《西华大学学报(自然科学版)》 CAS 2023年第2期45-52,共8页
跳频技术广泛应用于军方无线电通信、移动通信和数据链网络等领域。跳频序列是跳频通信技术的重要一环,影响着通信系统的性能表现。文章基于有限域上的加法群和乘法群,构造一类具有大序列数目的低碰撞区跳频序列集,并证明该序列集在一... 跳频技术广泛应用于军方无线电通信、移动通信和数据链网络等领域。跳频序列是跳频通信技术的重要一环,影响着通信系统的性能表现。文章基于有限域上的加法群和乘法群,构造一类具有大序列数目的低碰撞区跳频序列集,并证明该序列集在一定条件下关于Peng-Fan-Lee界是最优的。该跳频序列集能有效地消除多址干扰,提升准同步多址通信系统的性能。 展开更多
关键词 跳频序列 低碰撞 序列数目 Peng-Fan-Lee界
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新疆托里县阿克塔木金矿区原生晕垂直分带研究
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作者 王帅 张广平 +2 位作者 时光辉 宋利睿 杨世权 《四川地质学报》 2024年第2期224-227,共4页
新疆托里县阿克塔木金矿区位于达拉布特—卡拉麦里铬金成矿亚带,是一个重要的金矿化集中区。河南省地质矿产勘查开发局测绘地理信息院在区内进行了大量勘查工作,本次研究应用格里戈良分带指数法对以往地质工作中的岩石化探分析结果进行... 新疆托里县阿克塔木金矿区位于达拉布特—卡拉麦里铬金成矿亚带,是一个重要的金矿化集中区。河南省地质矿产勘查开发局测绘地理信息院在区内进行了大量勘查工作,本次研究应用格里戈良分带指数法对以往地质工作中的岩石化探分析结果进行处理分析,对Au、Ag、Cu、Pb、Zn、As、Sb、Bi、W、Mo、Sn共11个元素进行垂直分带排序,得出新疆托里县阿克塔木金矿区原生晕垂直分带序列,通过与中国金矿床原生晕综合轴(垂)向分带序列的对比分析,推断矿区深部仍有盲矿体存在,深部找矿潜力较大。 展开更多
关键词 分带指数法 原生晕 垂直分带序列 阿克塔木金矿 深部找矿
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中国不同地区蛇床的rDNA ITS序列分析 被引量:47
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作者 蔡金娜 周开亚 +4 位作者 徐珞珊 王峥涛 沈曦 王义权 李晓波 《药学学报》 CAS CSCD 北大核心 2000年第1期56-59,共4页
目的:探讨不同分布区的蛇床Cnidium monnieri 的ITS序列变异与其地理分布和化学成分的相关性。方法:设计2 对引物,Pf+ Pb 及P5-8SITS1+ P5-8SITS2 ,PCR扩增产物纯化后用银染法或A... 目的:探讨不同分布区的蛇床Cnidium monnieri 的ITS序列变异与其地理分布和化学成分的相关性。方法:设计2 对引物,Pf+ Pb 及P5-8SITS1+ P5-8SITS2 ,PCR扩增产物纯化后用银染法或ABI310 测序。结果:得到核糖体DNA中的ITS及5-8SrDNA 完全序列,18S和26SrDNA 部分序列,共约700 bp 。5 个地点样品的ITS1及ITS2 的序列大小分别为210~217 bp 和219 ~224 bp。ITS1 碱基序列的遗传距离0-00 ~1-93% ,ITS2 碱基序列的遗传距离0-46 ~2-34% ,ITS1 较为保守。以NJ法根据ITS2 序列数据重建系统发生树。哈尔滨样品聚为一组,衡水与德州样品和郑州与高淳样品各自聚为一组。结论:ITS2 序列的变异与中国产蛇床的纬度分布相关,而其与蛇床化学型的关系尚需作进一步研究。 展开更多
关键词 蛇床 CDNA 内转录间隔 序列分析 ITS
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巴山榧树及近缘种的psbA-trnH序列分析 被引量:12
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作者 周先容 尚进 +2 位作者 陈发波 宋晓宏 江波 《西部林业科学》 CAS 2015年第1期16-21,共6页
采用PCR产物直接测序法对巴山榧树12个地理种群的叶绿体psb A-trn H序列进行了测定,并从Gen Bank搜索并下载巴山榧树近缘种的psb A-trn H序列,运用Clustal X和MEGA 4.1软件分析和构建系统发育树。结果表明,巴山榧树12个地理种群间的遗... 采用PCR产物直接测序法对巴山榧树12个地理种群的叶绿体psb A-trn H序列进行了测定,并从Gen Bank搜索并下载巴山榧树近缘种的psb A-trn H序列,运用Clustal X和MEGA 4.1软件分析和构建系统发育树。结果表明,巴山榧树12个地理种群间的遗传分化程度较低;巴山榧树与云南榧、日本榧树的亲缘关系较近,而与长叶榧、榧树、加州榧和佛罗里达榧的亲缘关系较远。研究结果为进一步探讨巴山榧树分子谱系地理学及榧树属的分子系统发育提供了理论依据。 展开更多
关键词 巴山榧树 地理种群 近缘种 psba-trnh序列 系统发育树
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F型、H型居群的铁皮石斛rDNAITS区序列差异及SNP现象的研究 被引量:63
16
作者 丁小余 王峥涛 +3 位作者 徐珞珊 徐红 周开亚 施国新 《中国中药杂志》 CAS CSCD 北大核心 2002年第2期85-89,共5页
目的 :研究铁皮石斛主产区F型和H型居群rDNAITS碱基序列的差异。方法 :运用PCR直接测序法对广西、贵州、云南铁皮石斛主要居群的rDNAITS区 (包括ITS1,5 .8SrDNA ,ITS2 )碱基序列进行了序列测定。结果 :在铁皮石斛各居群中 ,F型居群与H... 目的 :研究铁皮石斛主产区F型和H型居群rDNAITS碱基序列的差异。方法 :运用PCR直接测序法对广西、贵州、云南铁皮石斛主要居群的rDNAITS区 (包括ITS1,5 .8SrDNA ,ITS2 )碱基序列进行了序列测定。结果 :在铁皮石斛各居群中 ,F型居群与H型居群植株的rDNAITS区碱基序列有 2个位点差异 ,且变异分别发生在ITS1区及 5 .8S区内。研究表明 :铁皮石斛居群内部rDNAITS区的差异与植物生活型的差异呈一定的相关性 ,H型居群的铁皮石斛是F型的变种。在F型与H型居群间 ,其 5 .8SrDNA区存在单核苷酸多态 (SNP)现象。首次报道了铁皮石斛ITS区的碱基序列 ,ITS区总长度为 6 34bp ,其中ITS1为 2 31bp ,5 .8S为 16 3bp ,ITS2为 2 4 0bp。结论 :rDNAITS区碱基序列的比较分析进一步证明铁皮石斛F型居群与H型居群间具有显著的差异性。 展开更多
关键词 铁皮石斛 RDNA ITS DNA序列 单核苷酸多态 居群差异
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金荞麦内转录间隔区(ITS)的扩增及序列分析 被引量:20
17
作者 吴琦 曾子贤 +2 位作者 邵继荣 陈惠 唐宇 《草业学报》 CSCD 2007年第5期127-132,共6页
以2份金荞麦为材料,对其内转录间隔区ITS区序列进行PCR扩增,均获得长约700bp的特异性产物。测序结果表明,金荞麦1号样品包含ITS序列660bp,金荞麦2号样品包含ITS序列646bp,在Genebank中的登录号分别为DQ780602和DQ780600。对现有金... 以2份金荞麦为材料,对其内转录间隔区ITS区序列进行PCR扩增,均获得长约700bp的特异性产物。测序结果表明,金荞麦1号样品包含ITS序列660bp,金荞麦2号样品包含ITS序列646bp,在Genebank中的登录号分别为DQ780602和DQ780600。对现有金荞麦ITS的序列比对表明,其同源率为80.2%~93.1%,变异位点主要在ITS1,表现出较丰富的遗传多样性。采用邻接法构建了金荞麦的系统进化树。 展开更多
关键词 金荞麦 内转录间隔(ITS)序列 PCR 序列分析
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基于psbA-trnH序列对广藿香与藿香、广防风的分子鉴定 被引量:5
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作者 黄洁燕 卢慧娟 +1 位作者 谢晖 姬生国 《广东药学院学报》 CAS 2014年第6期683-687,共5页
目的采用叶绿体基因psb A-trn H间隔区序列探讨广藿香及其常见伪品的分子鉴定方法。方法分别提取广藿香及藿香、广防风植物的总DNA,经PCR扩增psb A-trn H间隔区序列,产物纯化后测序,采用Clustal_X 1.8和MEGA 5.05软件对序列进行分析。... 目的采用叶绿体基因psb A-trn H间隔区序列探讨广藿香及其常见伪品的分子鉴定方法。方法分别提取广藿香及藿香、广防风植物的总DNA,经PCR扩增psb A-trn H间隔区序列,产物纯化后测序,采用Clustal_X 1.8和MEGA 5.05软件对序列进行分析。结果广藿香与藿香、广防风的最小种间K2P距离(0.159 2)大于最大种内K2P距离(0.004 3),邻接树中广藿香9个不同产地来源样品聚为一支。广藿香与藿香、广防风之间存在多个特异性信息位点。结论 psb A-trn H序列可作为广藿香及藿香、广防风分子鉴定的依据。 展开更多
关键词 广藿香 藿香 广防风 psba-trnh序列 鉴定
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不同产区太子参的rDNA ITS区序列的比较 被引量:35
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作者 余永邦 秦民坚 +2 位作者 梁之桃 余国奠 谭宁华 《植物资源与环境学报》 CAS CSCD 2003年第4期1-5,共5页
使用1对引物18SP1和26SP2对采自14个产区的太子参〔Pseudostellariaheterophylla(Miq.)PaxexPaxetHoffm.〕进行ITS基因的PCR扩增和测序。序列分析结果表明,14个产区太子参的ITS1片段长度为219~222bp,ITS2片段长度为235~236bp,5.8S片... 使用1对引物18SP1和26SP2对采自14个产区的太子参〔Pseudostellariaheterophylla(Miq.)PaxexPaxetHoffm.〕进行ITS基因的PCR扩增和测序。序列分析结果表明,14个产区太子参的ITS1片段长度为219~222bp,ITS2片段长度为235~236bp,5.8S片段长度为155~157bp。除江苏宜兴,江苏句容马梗,江苏南京老鹰山和江苏溧阳等4个产区的ITS序列碱基完全一致外,其他10个产区的ITS序列则有不同的变异,碱基变异数目(包括5 8S编码区)为1~17个。使用UPGMA法重建系统发生树,从分子生物学角度说明了它们的变异程度,为利用ITS区序列的差异鉴别不同产区的太子参提供了依据。 展开更多
关键词 太子参 RDNA ITS序列 PCR扩增 石竹科
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中华鳖4个Sox基因保守区的序列分析 被引量:15
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作者 聂刘旺 单祥年 +2 位作者 汪鸣 郭超文 鲁晓萱 《水生生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2001年第3期245-250,共6页
采用PCR技术 ,扩增和克隆了中华鳖Sox基因 (TSSox)。经DNA序列分析显示 ,Sox基因在系统进化上十分保守 ,其中TSSox4与鸟类LF4基因编码的氨基酸序列完全相同、与人类SOX4和小鼠Sox4编码的序列仅一个氨基酸的差异 ;TSSox5与鸟类的LF5基因... 采用PCR技术 ,扩增和克隆了中华鳖Sox基因 (TSSox)。经DNA序列分析显示 ,Sox基因在系统进化上十分保守 ,其中TSSox4与鸟类LF4基因编码的氨基酸序列完全相同、与人类SOX4和小鼠Sox4编码的序列仅一个氨基酸的差异 ;TSSox5与鸟类的LF5基因的编码也仅一个氨基酸发生了改变 ;TSSox2与海龟的TSox2相似性最高。 4条TSSox序列中 ,TSSox与人SRY基因序列相似性最高 ,达 75% ; 展开更多
关键词 中华鳖 SOX基因 序列分析 PCR 保守 性别决定
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