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水域生境好氧不产氧光合细菌(AAPB)研究进展
被引量:
5
1
作者
张海涵
王燕
+7 位作者
刘凯文
黄廷林
李楠
杨尚业
司凡
苗雨甜
黄鑫
张梦瑶
《湖泊科学》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2020年第6期1585-1598,共14页
好氧不产氧光合细菌(aerobic anoxygenic photosynthesis bacteria,AAPB)是广泛分布于海洋、湖泊及河流等典型水域生境中的异养原核生物,能够以环境中有机物为营养物质来获取细胞生长及代谢所需的能量,同时借助自身独特的菌绿素完成光...
好氧不产氧光合细菌(aerobic anoxygenic photosynthesis bacteria,AAPB)是广泛分布于海洋、湖泊及河流等典型水域生境中的异养原核生物,能够以环境中有机物为营养物质来获取细胞生长及代谢所需的能量,同时借助自身独特的菌绿素完成光合作用产能但不合成氧气,在物质循环与能量流动中扮演着重要角色.近年,越来越多的AAPB种属被陆续报道,基于光合基因,例如光合反应中心M亚基(pufM)的分子系统发育分析显示,大部分AAPB属于α-、β-及γ-变形菌,且丰度及多样性随生境的不同而呈现时空地理格局异质性.本文对AAPB的栖息环境与生长特性、丰度与分布、生态功能以及环境驱动因子等方面的研究进展进行了回顾和综述.目前,针对水库生态系统AAPB的研究鲜见报道,作者建议开展水库生境中AAPB多样性分布、环境驱动因素及生态功能研究,丰富对于水生生态系统中功能微生物种群生态结构与代谢功能的认识.
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关键词
好氧不产氧光合细菌(AAPB)
水域生境
丰度与分布
pufm基因
驱动因子
下载PDF
职称材料
一株新属紫色非硫光合细菌的初步鉴定
2
作者
王龙刚
潘志崇
张德民
《宁波大学学报(理工版)》
CAS
2008年第2期186-189,共4页
利用特异性培养基对采自宁波象山地区养殖虾池底泥样品进行富集、分离和纯化,得到了一株紫色非硫细菌(PNSB),依据形态特征观察、无机碳源利用、活细胞吸收光谱测定、pufM基因检测及16S rRNA基因序列分析等实验,初步鉴定其为comamonadac...
利用特异性培养基对采自宁波象山地区养殖虾池底泥样品进行富集、分离和纯化,得到了一株紫色非硫细菌(PNSB),依据形态特征观察、无机碳源利用、活细胞吸收光谱测定、pufM基因检测及16S rRNA基因序列分析等实验,初步鉴定其为comamonadaceae科中一新属.
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关键词
紫色非硫光合细菌
pufm基因
16S
RDNA
下载PDF
职称材料
分层型水库水体好氧不产氧光合细菌时空演替特征
被引量:
1
3
作者
张海涵
王燕
+7 位作者
黄廷林
王晨旭
路林超
司凡
李楠
刘凯文
闫苗苗
苗雨甜
《环境科学》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2020年第5期2188-2197,共10页
好氧不产氧光合细菌(aerobic anoxygenic photosynthesis bacteria,AAPB)以多样的群落结构及独特的代谢功能在水体物质循环中扮演着重要角色.基于实时荧光定量PCR及Illumina MiSeq高通量DNA测序技术研究金盆水库水体中AAPB丰度及群落结...
好氧不产氧光合细菌(aerobic anoxygenic photosynthesis bacteria,AAPB)以多样的群落结构及独特的代谢功能在水体物质循环中扮演着重要角色.基于实时荧光定量PCR及Illumina MiSeq高通量DNA测序技术研究金盆水库水体中AAPB丰度及群落结构时空演替特征,结合冗余分析揭示环境因子对其群落结构影响规律.结果表明,金盆水库水体AAPB丰度(以pufM基因计)变化范围为(6.70±0.43)×10^3^(2.69±0.15)×10^4 copies·mL^-1,最大值出现于10月,且随水深增加而减小.样本主要归为19个属(除未分类菌属外),优势AAPB菌属包括慢生根瘤菌属(Bradyrhizobium sp.)和甲烷菌属(Methylobacterium sp.),两者隶属α-变形菌(α-Proteobacteria),其中慢生根瘤菌属(Bradyrhizobium sp.)占比于11月最高,高达60%以上(除10 m外),此外也发现了以低比例存在的红长命菌属(Rubrivivax sp.),隶属β-变形菌(β-Proteobacteria).AAPB不同属间存在较强的互作关系,如红杆菌属(Rhodobacter sp.)与小红卵菌属(Rhodovulum sp.)呈正相关,噬氢菌属(Hydrogenophaga sp.)与慢生根瘤菌属(Bradyrhizobium sp.)呈负相关等.AAPB种群结构组成及分布差异显著,主要受T、 TN、 NO-3-N和光照强度影响,且由环境因素综合调控.如10月水深0、 5和15 m水体AAPB种群结构受水温(T)、总氮(TN)和总磷(TP)显著影响, 12月水深5 m水体AAPB种群结构受光照强度、pH、溶解氧(DO)和叶绿素a(Chla)显著影响等.研究结果对解析分层型水库水体AAPB丰度和多样性的时空变化特征具有指导意义,并为探索AAPB种群结构的水环境驱动因素提供理论依据.
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关键词
分层型水库
好氧不产氧光合细菌(AAPB)
pufm基因
qPCR
高通量测序
种群结构
原文传递
题名
水域生境好氧不产氧光合细菌(AAPB)研究进展
被引量:
5
1
作者
张海涵
王燕
刘凯文
黄廷林
李楠
杨尚业
司凡
苗雨甜
黄鑫
张梦瑶
机构
西安建筑科技大学
出处
《湖泊科学》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2020年第6期1585-1598,共14页
基金
国家自然科学基金项目(51978561,51979217)
陕西省重点研发计划项目(2018ZDXM-SF-020,2018KW-011,2018ZDXM-SF-029,2019ZDLSF06-02)
+1 种基金
陕西省基金项目(2019JLM-61)
陕西高校青年创新团队项目联合资助.
文摘
好氧不产氧光合细菌(aerobic anoxygenic photosynthesis bacteria,AAPB)是广泛分布于海洋、湖泊及河流等典型水域生境中的异养原核生物,能够以环境中有机物为营养物质来获取细胞生长及代谢所需的能量,同时借助自身独特的菌绿素完成光合作用产能但不合成氧气,在物质循环与能量流动中扮演着重要角色.近年,越来越多的AAPB种属被陆续报道,基于光合基因,例如光合反应中心M亚基(pufM)的分子系统发育分析显示,大部分AAPB属于α-、β-及γ-变形菌,且丰度及多样性随生境的不同而呈现时空地理格局异质性.本文对AAPB的栖息环境与生长特性、丰度与分布、生态功能以及环境驱动因子等方面的研究进展进行了回顾和综述.目前,针对水库生态系统AAPB的研究鲜见报道,作者建议开展水库生境中AAPB多样性分布、环境驱动因素及生态功能研究,丰富对于水生生态系统中功能微生物种群生态结构与代谢功能的认识.
关键词
好氧不产氧光合细菌(AAPB)
水域生境
丰度与分布
pufm基因
驱动因子
Keywords
Aerobic anoxygenic photosynthesis bacteria(AAPB)
aquatic ecosystems
abundance and distribution
pufm
gene
driving factors
分类号
Q938.8 [生物学—微生物学]
下载PDF
职称材料
题名
一株新属紫色非硫光合细菌的初步鉴定
2
作者
王龙刚
潘志崇
张德民
机构
宁波大学生命科学与生物工程学院
出处
《宁波大学学报(理工版)》
CAS
2008年第2期186-189,共4页
基金
浙江省自然科学基金人才培养项目(R305333)
浙江省教育厅专项(20051696)
+1 种基金
宁波市科技项目(2004A610026
2005C100097)
文摘
利用特异性培养基对采自宁波象山地区养殖虾池底泥样品进行富集、分离和纯化,得到了一株紫色非硫细菌(PNSB),依据形态特征观察、无机碳源利用、活细胞吸收光谱测定、pufM基因检测及16S rRNA基因序列分析等实验,初步鉴定其为comamonadaceae科中一新属.
关键词
紫色非硫光合细菌
pufm基因
16S
RDNA
Keywords
purple non-sulfur bacteria(PNSB)
pufm
gene
16S rDNA
分类号
Q939 [生物学—微生物学]
下载PDF
职称材料
题名
分层型水库水体好氧不产氧光合细菌时空演替特征
被引量:
1
3
作者
张海涵
王燕
黄廷林
王晨旭
路林超
司凡
李楠
刘凯文
闫苗苗
苗雨甜
机构
西安建筑科技大学环境与市政工程学院
出处
《环境科学》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2020年第5期2188-2197,共10页
基金
国家自然科学基金项目(51978561,51979217)
陕西省重点研发计划项目(2018ZDXM-SF-020,2018KW-011)。
文摘
好氧不产氧光合细菌(aerobic anoxygenic photosynthesis bacteria,AAPB)以多样的群落结构及独特的代谢功能在水体物质循环中扮演着重要角色.基于实时荧光定量PCR及Illumina MiSeq高通量DNA测序技术研究金盆水库水体中AAPB丰度及群落结构时空演替特征,结合冗余分析揭示环境因子对其群落结构影响规律.结果表明,金盆水库水体AAPB丰度(以pufM基因计)变化范围为(6.70±0.43)×10^3^(2.69±0.15)×10^4 copies·mL^-1,最大值出现于10月,且随水深增加而减小.样本主要归为19个属(除未分类菌属外),优势AAPB菌属包括慢生根瘤菌属(Bradyrhizobium sp.)和甲烷菌属(Methylobacterium sp.),两者隶属α-变形菌(α-Proteobacteria),其中慢生根瘤菌属(Bradyrhizobium sp.)占比于11月最高,高达60%以上(除10 m外),此外也发现了以低比例存在的红长命菌属(Rubrivivax sp.),隶属β-变形菌(β-Proteobacteria).AAPB不同属间存在较强的互作关系,如红杆菌属(Rhodobacter sp.)与小红卵菌属(Rhodovulum sp.)呈正相关,噬氢菌属(Hydrogenophaga sp.)与慢生根瘤菌属(Bradyrhizobium sp.)呈负相关等.AAPB种群结构组成及分布差异显著,主要受T、 TN、 NO-3-N和光照强度影响,且由环境因素综合调控.如10月水深0、 5和15 m水体AAPB种群结构受水温(T)、总氮(TN)和总磷(TP)显著影响, 12月水深5 m水体AAPB种群结构受光照强度、pH、溶解氧(DO)和叶绿素a(Chla)显著影响等.研究结果对解析分层型水库水体AAPB丰度和多样性的时空变化特征具有指导意义,并为探索AAPB种群结构的水环境驱动因素提供理论依据.
关键词
分层型水库
好氧不产氧光合细菌(AAPB)
pufm基因
qPCR
高通量测序
种群结构
Keywords
stratified reservoir
aerobic anoxygenic photosynthesis bacteria(AAPB)
pufm
gene
qPCR
high-throughput sequencing
community structure
分类号
X172 [环境科学与工程—环境科学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
水域生境好氧不产氧光合细菌(AAPB)研究进展
张海涵
王燕
刘凯文
黄廷林
李楠
杨尚业
司凡
苗雨甜
黄鑫
张梦瑶
《湖泊科学》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2020
5
下载PDF
职称材料
2
一株新属紫色非硫光合细菌的初步鉴定
王龙刚
潘志崇
张德民
《宁波大学学报(理工版)》
CAS
2008
0
下载PDF
职称材料
3
分层型水库水体好氧不产氧光合细菌时空演替特征
张海涵
王燕
黄廷林
王晨旭
路林超
司凡
李楠
刘凯文
闫苗苗
苗雨甜
《环境科学》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2020
1
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